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Schistosoma mansoni
cluster # 8888 cluster # 8888       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8888#0 length = 610 sequences # 7  

consensusID : consensus_8888#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 610
fasta sequence
                              [AGCCAAGATTCGGCACGAGGACGCTTTTCAAGTGAAAATTATTTATTGACTTTGAGTTCCAGTGGCTTGCCAATAATGATGTTTACTGCATGTGCAATATTTTCCAGCTTTCTTCTCTGTACATACGCTGTGACGCTGGAAGAAGGACTTAAGAACCCTTCCAAGTATATTCGTTATGACACAGCTCCAAATAATACTTGGATTCATGCTCTGATTTCTCTTTGCATAACGTACGGTACGCTTACTGGATTTATACTTTGCATACACCTAGTGGTATACCTATCAGGATCAAAGAAAAATCGTCGTTCTGCTTGATAAATCAACTAATTAGTATAAATGCTACATGTAGTTCTTCATGTTAACATTGTATTTTATTAGCCATATTTGCCTAATTCATCATATATTTATTCGGGGAAACATACATGTTCCAATAGCCAAAACAAACATCATTTCACCAAATTTTTTTAAAATGTCTCAGTGAATAGAAAACTATGTCACTTATTATGGTAGATGATGATATACTGTATAATTTTAATCTATGTTCACATGATTTTCACTGTTAAAATAAGATTTTACATGGATAATATCAGATCATACATAAATATACTGT]

[+] EMBL CD083187             [AGCCAAGATTCGGCACGAGGACGCTTTTCAAGTGAAAATTATTTATTGACTTTGAGTTCCAGTGGCTTGCCAATAATGATGTTTACTGCATGTGCAATATTTTCCAGCTTTCTTCTCTGTACATACGCTGTGACGCTGGAAGAAGGACTTAAGAACCCTTCCAAGTATATTCGTTATGACACAGCTCCAAATAATACTTGGATTCATGCTCTGATTTCTCTTTGCATAACGTACGGTACGCTTACTGGATTTATACTTTGCATACACCTAGTGGTATACCTATCAGGATCAAAGAAAAATCGTCGTTCTGCTTGATAAATCAACTAATTAGTATAAATGCTACATGTAGTTCTTCATGTTAACATTGTATTTTATTAGCCATATTTGCCTAATTCATCATATATTTATTCGGGGAAACATACATGTTCCAATAGCCAAAACAAACATCATTTCACCAAATTTTTTTAAAATGTCTCAGTGAATAGAAAACTATGTCACTTATTATGGTAGATGATGATATACTGTATAATTTTAATCTATGTTCACATGATTTTCACTGTTAAAATAAGATTTTACATGGATAATATCAGATCATACATAAATATACTGT]
[-] EMBL CD076761             [                      GCTTTTCAAGTGANAATTATTTATTGACTTTGAGTTCCAGTGGCTTGCCAATAATGATGTTTACTGCATGTGCAATATTTTCCAGCTTTCTTCTCTGTACATACGCTGTGACGCTGGAAGAAGGACTTAAGAACCCTTCCAAGTATATTCGTTATGACACAGCTCCAAATAATACTTGGATTCATGCTCTGATTTCTCTTTGCATAACGTACGGTACGCTTACTGGATTTATACTTTGCATACACCTAGTGGTATACCTATCAGGATCAAAGAAAAATCGTCGTTCTGCTTGATAAATCAACTAATTAGTATAAATGCTACATGTAGTTCTTCATGTTAACATTGTATTTTATTAGCCATATTTGCCTAATTCATCATATATTTATTCGGGGAAACATACATGTTCCAATAGCCAAAACAAACATCATTTCACCAAATTTTTTTAAAATGTCTCAGTGAATAGAAAACTATGTCACTTATTATGGTAGATGATGATATACTGTATAATTTTAATCTATGTTCACATGATTTTCACTGTTAAAATAAGATTTTACATGGATAATATCAGATCATACATAAATATACTGT]
[+] EMBL CD082819             [                                                             tgGGCTTGCCAATAATGATGTTTACTGCATGTGCAATATTTTCCAGCTTTCTTCTCTGTACATACGCTGTGACGCTGGAAGAAGGACTTAAGAACCCTTCCAAGTATATTCGTTATGACACAGCTCCAAATAATACTTGGATTCATGCTCTGATTTCTCTTTGCATAACGTACGGTACGCTTACTGGATTTATACTTTGCATACACCTAGTGGTATACCTATCAGGATCAAAGAAAAATCGTCGTTCTGCTTGATAAATCAACTAATTAGTATAAATGCTACATGTAGTTCTTCATGTTAACATTGTATTTTATTAGCCATATTTGCCTAATTCATCATATATTTATTCGGGGAAACATACATGTTCCAATAGCCAAAACAAACATCATTTCACCAAATTTTTTTAAAATGTCTCAGTGAATAGAAAACTATGTCACTTATTATGGTAGATGATGATATACTGTATAATTTTAATCTATGTTCACATGATTTTCACTGTTAAAATAAGATTTTACATGGATAATATCAGATCATACATAAATATACTG ]
[-] EMBL CD076408             [                                                               GGCTTGCCAATAATGATGTTTACTGCATGTGCAATATTTTCCAGCTTTCTTCTCTGTACATACGCTGTGACGCTGGAAGAAGGACTTAAGAACCCTTCCAAGTATATTCGTTATGACACAGCTCCAAATAATACTTGGATTCATGCTCTGATTTCTCTTTGCATAACGTACGGTACGCTTACTGGATTTATACTTTGCATACACCTAGTGGTATACCTATCAGGATCAAAGAAAAATCGTCGTTCTGCTTGATAAATCAACTAATTAGTATAAATGCTACATGTAGTTCTTCATGTTAACATTGTATTTTATTAGCCATATTTGCCTAATTCATCATATATTTATTCGGGGAAACATACATGTTCCAATAGCCAAAACAAACATCATTTCACCAAATTTTTTTAAAATGTCTCAGTGAATAGAAAACTATGTCACTTATTATGGTAGATGATGATATACTGTATAATTTTAATCTATGTTCACATGATTTTCACTGTTAAAATAAGATTTTACATGGATAATATCAGATCATACATAAATATACTGT]
[-] EMBL AA999597             [                                                                                                                                                                                                                   TGATTTCTCTTTGCATAACGTACGGTACGCTTACTGGATTTATACTTTGCATACCCCTAGTGGTATACCTATCAGGATCAAAGAAAAATCGTCGTTCTGCTTGATAAATCAACTAATTAGTATAAATGCTACATGTAGTTCTTCATGTTAACATTGTATTTTATTAGCCATATTTGCCTAATTCATCATATATTTATTCGGGGAAACATACATGTTCCAATAGCCAAAACAAACATCATTTCCGGGGATTTTTTAAAAATGTCTCAGTGAATAGAAAACTATGTCACTTATTATGGTAGATGATGACATACTGTATAATTTTAATCTATGTTCACATGATTTTCACTGTTAAAATAAGATTTTACATGGATAATATCAGATCATACATAAATATACTGT]
[-] EMBL AA999599             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TCGGCGTTCTGCTTGATAAATCAACTAATTTGTATAAATGCTACATGTAGTTCTTCATGTTAACATTGTATTTTATTACCCATATTTGCCTAATTCATCATATATTTATTC GGGAAACATACATGTTCCAATAGCCAAAACAAACATCATTTCCGGGGGTTTTTTAAAAATGTCTCAGTGAATAGAAAACTATGTCCCTTATTATGGTAGATGATGACATACTGTATAATTTTAATCTATGTTCACATGATTTTCACTGTTAAAATAAGATTTTACATGGATAATATCAGATCATACATAAATATACTGT]
[-] EMBL AA999605             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ACATCATTCCCCNAAATTTTTTAAAAATGTCTCAGTGAATAGAAAACTATGTCACTTATTATGGTAGATGATGACATACTGTATAATTTTAATCTATGTTCACATGATTTTCACTGTTAAAATAAGATTTTACATGGATAATATCAGATCATACATAAATATACTGT]


>consensus_8888#0 AGCCAAGATTCGGCACGAGGACGCTTTTCAAGTGAAAATTATTTATTGACTTTGAGTTCC AGTGGCTTGCCAATAATGATGTTTACTGCATGTGCAATATTTTCCAGCTTTCTTCTCTGT ACATACGCTGTGACGCTGGAAGAAGGACTTAAGAACCCTTCCAAGTATATTCGTTATGAC ACAGCTCCAAATAATACTTGGATTCATGCTCTGATTTCTCTTTGCATAACGTACGGTACG CTTACTGGATTTATACTTTGCATACACCTAGTGGTATACCTATCAGGATCAAAGAAAAAT CGTCGTTCTGCTTGATAAATCAACTAATTAGTATAAATGCTACATGTAGTTCTTCATGTT AACATTGTATTTTATTAGCCATATTTGCCTAATTCATCATATATTTATTCGGGGAAACAT ACATGTTCCAATAGCCAAAACAAACATCATTTCACCAAATTTTTTTAAAATGTCTCAGTG AATAGAAAACTATGTCACTTATTATGGTAGATGATGATATACTGTATAATTTTAATCTAT GTTCACATGATTTTCACTGTTAAAATAAGATTTTACATGGATAATATCAGATCATACATA AATATACTGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)