cluster # 89

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Schistosoma mansoni
cluster # 89 cluster # 89 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_89#0 length = 849 sequences # 2

consensusID : consensus_89#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 849
fasta sequence

                              [GGGGCTAGCGTATAGCACGTCGTGTATCAGTATTAGATTTGGGACACCACCTTTCATAACAGGTAATACCACTAAGTGTTTGTTAACATAACCTCATATATGATCAAATGGGATTCACTTGATGCATCAGAGAACTTCAATAGATAGTGATTTATCTTATCGGATTCTGCATAATAGATCATGGATTTTCCTATGTTTCTTGCAGTGTATGTAGTTTTAATGTTGTGAGGCGAATTACAAAAAACTAGTCCTCAAGTCTAGTCTGTGCAATATCAGGATTCATTTCAGCTGTTCTAAATACTAAAGTCAGGAATAATATACAACTACTGGTTTCTTGAATGAAATTTCCTAAAAGTGTATATCGTTTTAGGTCACTTAATTTCTAGTTCCATCAGATTTACACTTATTCTTTATAAGCTGTCATTATTTGTGGTTATCTTTTTCCATTCGGCATCTAAACAATTCGATACACTTGCTAGCGTTAACTTCCTCATGTGTAATTTCATTTCTCCGTTGCGGTGAGTCATATTGCGTTAATGTTGTTTGTGTTTATTTCATTTGATAGTTGAGCTTCATTTTCTCCTTGTTTAGATTTCTTGAAACTCGAGTAAAAGTGTAAATCATCAAAAAACCTAAACACATATTGTAACTCTTGACAGTTGATCCTTTTATTTTTACGACTTGTGAGTTCAGATGTTTTTGCTTAAAAACATGCTGACCACCTGTTAAACAGGATTCATAGAAAGATTTTGGTAAACTTCTGGTTTATATTTTTTATATGGAATACAATGAATTTATCATCAACCTATAAATATATTTCTACATTAGCTAAAAAAAAGGTTAAAAAAA]

[+] EMBL CD080283             [GGGGCTAGCGTATAGCACGTCGTGTATCAGTATTAGATTTGGGACACCACCTTTCATAACAGGTAATACCACTAAGTGTTTGTTAACATAACCTCATATATGATCAAATGGGATTCACTTGATGCATCAGAGAACTTCAATAGATAGTGATTTATCTTATCGGATTCTGCATAATAGATCATGGATTTTCCTATGTTTCTTGCAGTGTATGTAGTTTTAATGTTGTGAGGCGAATTACAAAAAACTAGTCCTCAAGTCTAGTCTGTGCAATATCAGGATTCATTTCAGCTGTTCTAAATACTAAAGTCAGGAATAATATACAACTACTGGTTTCTTGAATGAAATTTCCTAAAAGTGTATATCGTTTTAGGTCACTTAATTTCTAGTTCCATCAGATTTACACTTATTCTTTATAAGCTGTCATTATTTGTGGTTATCTTTTTCCATTCGGCATCTAAACAATTCGATACACTTGCTAGCGTTAACTTCCTCATGTGTAATTTCATTTCTCCGTTGCGGTGAGTCATATTGCGTTAATGTTGTTTGTGTTTATTTCATTTGATAGTTGAGCTTCATTTTCTCCTTGTTTAGATTTCTTGAAACTCGAGTAAAAGTGTAAATCATCAAAAAACCTAAACACATATTGTAACTCTTGACAGTT                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD074201             [                                                                                                                                                                                                                     GTTTTAATGTTGTGAGGCGAATTACAAAAAACTAGTCCTCAAGTCTAGTCTGTGCAATATCAGGATTCATTTCAGCTGTTCTAAATACTAAAGTCAGGAATAATATACAACTACTGGTTTCTTGAATGAAATTTCCTAAAAGTGTATATCGTTTTAGGTCACTTAATTTCTAGTTCCATCAGATTTACACTTATTCTTTATAAGCTGTCATTATTTGTGGTTATCTTTTTCCATTCGGCATCTAAACAATTCGATACACTTGCTAGCGTTAACTTCCTCATGTGTAATTTCATTTCTCCGTTGCGGTGAGTCATATTGCGTTAATGTTGTTTGTGTTTATTTCATTTGATAGTTGAGCTTCATTTTCTCCTTGTTTAGATTTCTTGAAACTCGAGTAAAAGTGTAAATCATCAAAAAACCTAACAACATATTGTAACTCTTGACAGTTGATCCTTTTATTTTTACGACTTGTGAGTTCAGATGTTTTTGCTTAAAAACATGCTGACCACCTGTTAAACAGGATTCATAGAAAGATTTTGGTAAACTTCTGGTTTATATTTTTTATATGGAATACAATGAATTTATCATCAACCTATAAATATATTTCTACATTAGCTAAAAAAAAGGTTAAAAAAA]




>consensus_89#0
GGGGCTAGCGTATAGCACGTCGTGTATCAGTATTAGATTTGGGACACCACCTTTCATAAC
AGGTAATACCACTAAGTGTTTGTTAACATAACCTCATATATGATCAAATGGGATTCACTT
GATGCATCAGAGAACTTCAATAGATAGTGATTTATCTTATCGGATTCTGCATAATAGATC
ATGGATTTTCCTATGTTTCTTGCAGTGTATGTAGTTTTAATGTTGTGAGGCGAATTACAA
AAAACTAGTCCTCAAGTCTAGTCTGTGCAATATCAGGATTCATTTCAGCTGTTCTAAATA
CTAAAGTCAGGAATAATATACAACTACTGGTTTCTTGAATGAAATTTCCTAAAAGTGTAT
ATCGTTTTAGGTCACTTAATTTCTAGTTCCATCAGATTTACACTTATTCTTTATAAGCTG
TCATTATTTGTGGTTATCTTTTTCCATTCGGCATCTAAACAATTCGATACACTTGCTAGC
GTTAACTTCCTCATGTGTAATTTCATTTCTCCGTTGCGGTGAGTCATATTGCGTTAATGT
TGTTTGTGTTTATTTCATTTGATAGTTGAGCTTCATTTTCTCCTTGTTTAGATTTCTTGA
AACTCGAGTAAAAGTGTAAATCATCAAAAAACCTAAACACATATTGTAACTCTTGACAGT
TGATCCTTTTATTTTTACGACTTGTGAGTTCAGATGTTTTTGCTTAAAAACATGCTGACC
ACCTGTTAAACAGGATTCATAGAAAGATTTTGGTAAACTTCTGGTTTATATTTTTTATAT
GGAATACAATGAATTTATCATCAACCTATAAATATATTTCTACATTAGCTAAAAAAAAGG
TTAAAAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case