These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8919#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 781 fasta sequence [CATATCAAATAGAAACAGGTGATCTATTTGAATTAGTACAATATCCCGATCATCGATAATCATAATAATAAAGAACTTTTCAAAAGTACAATATGATATAAATATTTGTACGTGTGT-GTGTGTGTGTATGTGTAATTTTGTGAATT-CTCCCTTTTTTCTGTGTATAATACGACTGTTTGTATAAATAGTCATTGATTTGTTTATTTTGGTTATCATTGATTTTCTCCCCCCCCCCTCTCTCTCTCTCTTGTTAGTTTTCCTCTTTTCTCCCCAATTGTCATATTCATTCCCCATTCATAACATAGTAATAATAGTGTACATTCATCCGTTCATTCATTCATTCATTT-GATCTTATTAATTGTGAAATAGTGGCTTATTGATGAAGG-TATTCTACCTTCAATCACTACTATATCGTCATTTAGATTTATGTTCATTTTCATTCATTTCC-GTTGGAGCAGCTGAATACTAT-CATATTTTTTGAATCCCTTTACCTAAAAATAAGGTTATTGGTACTTAATGAGTCGTATTGTCTGTTTGTGTCTATTTATGGATACATATATGTGTATGTGTATGTGTAAATATGTACTACATTATAATTATTTTCTTATTACCCTCCCCCTTATTTATTCTAATGCCCATTTAGTTCGGCATTTATTATTCAATACAACATGTGATAGTCTCCAAGTTTGTTTGTTTTTCCTTTCGATTATTCGAGAAAGAACAAACTCTTCAATATATTTTGTTTAATTGTACTGTATTGTATTTATTAGTTAGTTTTGAC] [+] EMBL AI764945 [CATATCAAATAGATACAGGTGATCTATTTGAATTAGTACAATATCCCGATCATCGATAATCATAATAATAAAGAACTTTTCAAAAGTACAATATGATATAAATATTTGTACGTGTGTGGTGTGTGTGTATGTGTAATTTTGTGAATTCCTCCC TTTTTCTGGGGATAATACGACTGTTTGT TAAAAAATCATTGATTTGTTTATTTTGGTTATCATTGATTTTCTTCGCCCCCCCTCTCTCTCTCTCTGGTTAGTTTTCCTCTTTTCTCCCCAATTGTCATATTCATTCCCCATTCATAACATAGTAATAATAGTGTACATTCATCCGTTCATTCATTCA TCATTT GATCTTATTAATTGTG AATAGTGGGTTATTGATGAAGG TATTCTA CTTCAATCACTACTATATCGTCATTTAGATTTATGTTCATTTTCATTCATTTCCGGTGGGAGCAGTTGAATAATATACATATTTTTTGAATCCCTTTACCTAAAAATAAGGTTCATGGTACTTAAAGGGTCGTATTGTTCGTTTGT ] [+] EMBL AI740205 [CATATCAAATAGAAACAGGTGATCTATTTGAATTAGTACAATATCCCGATCATCGATAATCATAATAATAAAGAACTTTTCAAAAGTACAATATGATATAAATATTTGTACGTGTGT GTGTGTGTGTATGTGTAATTTTGTGAATT CTCCCTTTTTTCTGTGTATAATACGACTGTTTGTATAAATAGTCATTGATTTGTTTATTTTGGTTATCATTGATTTTCTCCCCCCCCCCTCTCTCTCTCTCTTGTTAGTTTTCCTCTTTTCTCCCCAATTGTCATATTCATTCCCCATTCATAACATAGTAATAATAGTGTACATTCATCCGTTCATTCATTCATTCATTT GATCTTATTAATTGTGAAATAGTGGCTTATTGATGAAGG TATTCTACCTTCAATCACTACTATATCGCCATTTAGATTTATGTTCATTTCCATTCATTTCC G TGGAGCAGCTGAATACTAT CATA TTTTGGA CCCCTTACATAAAAgggtat ] [+] EMBL AI740339 [CATATCAAATAGAAACAGGTGATCTATTTGAATTAGTACAATATCCCGATCATCGATAATCATAATAATAAAGAACTTTTCAAAAGTACAATATGATATAAATATTTGTACGTGTGT GTGTGTGTGTATGTGTAATTTTGTGAATT CTCCCTTTTTTCTGTGTATAATACGACTGTTTGTATAAATAGTCATTGATTTGTTTATTTTGGTTATCATTGATTTTCTCCCCCCCCCCTCTCTCTCTCTCTTGTTAGTTTTCCTCTTTTCTCCCCAATTGTCATATTCATTCCCCATTCATAACATAGTAATAATAGTGTACATTCATCCGTTCATTCATTCATTCATTTGGATCTTATTAATTGTGAAATAGTGGCTTATTGATGAAGGTTATTCTACCTTCAATCACTACTATATCGTCATTTAGATTTATGTTCAATTTCA ] [+] EMBL AI740206 [CATATCAAATAGAAACAGGTGATCTATTTGAATTAGTACAATATCCCGATCATCGATAATCATAATAATAAAGAACTTTTCAAAAGTACAATATGATATAAATATTTGTACGTGTGT GTGTGTGTGTATGTGTAATTTTGTGAATT CTCCCTTTTTTCTGTGTATAATACGACTGTTTGTATAAATAGTCATTGATTTGTTTATTTTGGTTATCATTGATTTTCTCCCCCCCCCCTCTCTCTCTCTCTTGTTAGTTTTCCTCTTTTCTCCCCAATTGTCATATTCATTCCCCATTCATAACATAGTAATAATAGTGTACATTCATCCGTTCATTCATTCATTCATTT GATCTTATTAATTGTGAAATAGTGGCTTTTTGATGGAGG TTTTCTACCTTCAATCACTACTATATCGTCA TTAGATTTATG TCAT ] [+] EMBL AI740280 [CATATCAAATAGAAACAGGTGATCTATTTGAATTAGTACAATATCCCGATCATCGATAATCATAATAATAAAGAACTTTTCAAAAGTACAATATGATATAAATATTTGTACGTGTGT GTGTGTGTGTATGTGTAATTTTGTGAATT CTCCCTTTTTTCTGTGTATAATACGACTGTTTGTATAAATAGTCATTGATTTGTTTATctgg ] [+] EMBL AI021756 [ ATATCAAATAGAAACAGGTGATCTATTTGAATTAGTACAATATCCCGATCATCGATAATCATAATAATAAAGAACTTTTCAAAAGTACAATATGATATAAATATTTGTACGTGTGT GTGTGTGTGTATGTGTAATTTTGTGAATT CTCCCTTTTTTCTGTGTATAATACGACTGTTTGTATAAATAGTCATTGATTTGTTTATTTGGGTTATCATTGATTTTCCCCCCCCCCCCTCTCTCTCTCTCTTGTTAG TTTCCCCTTTTC CCCCAATTGTCATATTCAT ] [-] EMBL CD197493 [ ACATTCATCCGTTCATTCATTCATTCATTT GATCTTATTAATTGTGAAATAGTGGCTTATTGATGAAGG TATTCTACCTTCAATCACTACTATATCGTCATTTAGATTTATGTTCATTTTCATTCATTTCC GTTGGAGCAGCTGAATACTAT CATATTTTTTGAATCCCTTTACCTATAAATAAGGTTATTGGTACTTAATGAGTCGTATTGTCTGTTTGTGTCTATTTATGGATACATATATGTGTATGTGTATGTGTAAATATGTACTACATTATAATTATTTTCTTATTACCCTCCCCCTTATTTATTCTAATGCCCATTTAGTTCGGCATTTATTATTCAATACAACATGTGATAGTCTCCAAGTTTGTTTGTTTTTCCTTTCGATTATTCGAGAAAGAACAAACTCTTCAATATATTTTGTTTAATTGTACTGTATTGTATTTATTAGTTAGTTTTGAC] [-] EMBL CD197303 [ T GATCTTATTAATTGTGAAATAGTGGCTTATTGATGAAGG TATTCTACCTTCAATCACTACTATATCGTCATTTAGATTTATGTTCATTTTCATTCATTTCC GTTGGAGCAGCTGAATACTAT CATATTTTTTGAATCCCTTTACCTATAAATAAGGTTATTGGTACTTAATGAGTCGTATTGTCTGTTTGTGTCTATTTATGGATACATATATGTGTATGTGTATGTGTAAATATGTACTACATTATAATTATTTTCTTATTACCCTCCCCCTTATTTATTCTAATGCCCATTTAGTTCGGCATTTATTATTCAATACAACATGTGATAGTCTCCAAGTTTGTTTGTTTTTCCTTTCGATTATTCGAGAAAGAACAAACTCTTCAATATATTTTGTTTAATTGTACTGTATTGTATTTATTAGTTAGTTTTGAC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||