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Schistosoma mansoni
cluster # 8919 cluster # 8919       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8919#0 length = 781 sequences # 8  

consensusID : consensus_8919#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 781
fasta sequence
                              [CATATCAAATAGAAACAGGTGATCTATTTGAATTAGTACAATATCCCGATCATCGATAATCATAATAATAAAGAACTTTTCAAAAGTACAATATGATATAAATATTTGTACGTGTGT-GTGTGTGTGTATGTGTAATTTTGTGAATT-CTCCCTTTTTTCTGTGTATAATACGACTGTTTGTATAAATAGTCATTGATTTGTTTATTTTGGTTATCATTGATTTTCTCCCCCCCCCCTCTCTCTCTCTCTTGTTAGTTTTCCTCTTTTCTCCCCAATTGTCATATTCATTCCCCATTCATAACATAGTAATAATAGTGTACATTCATCCGTTCATTCATTCATTCATTT-GATCTTATTAATTGTGAAATAGTGGCTTATTGATGAAGG-TATTCTACCTTCAATCACTACTATATCGTCATTTAGATTTATGTTCATTTTCATTCATTTCC-GTTGGAGCAGCTGAATACTAT-CATATTTTTTGAATCCCTTTACCTAAAAATAAGGTTATTGGTACTTAATGAGTCGTATTGTCTGTTTGTGTCTATTTATGGATACATATATGTGTATGTGTATGTGTAAATATGTACTACATTATAATTATTTTCTTATTACCCTCCCCCTTATTTATTCTAATGCCCATTTAGTTCGGCATTTATTATTCAATACAACATGTGATAGTCTCCAAGTTTGTTTGTTTTTCCTTTCGATTATTCGAGAAAGAACAAACTCTTCAATATATTTTGTTTAATTGTACTGTATTGTATTTATTAGTTAGTTTTGAC]

[+] EMBL AI764945             [CATATCAAATAGATACAGGTGATCTATTTGAATTAGTACAATATCCCGATCATCGATAATCATAATAATAAAGAACTTTTCAAAAGTACAATATGATATAAATATTTGTACGTGTGTGGTGTGTGTGTATGTGTAATTTTGTGAATTCCTCCC TTTTTCTGGGGATAATACGACTGTTTGT TAAAAAATCATTGATTTGTTTATTTTGGTTATCATTGATTTTCTTCGCCCCCCCTCTCTCTCTCTCTGGTTAGTTTTCCTCTTTTCTCCCCAATTGTCATATTCATTCCCCATTCATAACATAGTAATAATAGTGTACATTCATCCGTTCATTCATTCA TCATTT GATCTTATTAATTGTG AATAGTGGGTTATTGATGAAGG TATTCTA CTTCAATCACTACTATATCGTCATTTAGATTTATGTTCATTTTCATTCATTTCCGGTGGGAGCAGTTGAATAATATACATATTTTTTGAATCCCTTTACCTAAAAATAAGGTTCATGGTACTTAAAGGGTCGTATTGTTCGTTTGT                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL AI740205             [CATATCAAATAGAAACAGGTGATCTATTTGAATTAGTACAATATCCCGATCATCGATAATCATAATAATAAAGAACTTTTCAAAAGTACAATATGATATAAATATTTGTACGTGTGT GTGTGTGTGTATGTGTAATTTTGTGAATT CTCCCTTTTTTCTGTGTATAATACGACTGTTTGTATAAATAGTCATTGATTTGTTTATTTTGGTTATCATTGATTTTCTCCCCCCCCCCTCTCTCTCTCTCTTGTTAGTTTTCCTCTTTTCTCCCCAATTGTCATATTCATTCCCCATTCATAACATAGTAATAATAGTGTACATTCATCCGTTCATTCATTCATTCATTT GATCTTATTAATTGTGAAATAGTGGCTTATTGATGAAGG TATTCTACCTTCAATCACTACTATATCGCCATTTAGATTTATGTTCATTTCCATTCATTTCC G TGGAGCAGCTGAATACTAT CATA  TTTTGGA CCCCTTACATAAAAgggtat                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL AI740339             [CATATCAAATAGAAACAGGTGATCTATTTGAATTAGTACAATATCCCGATCATCGATAATCATAATAATAAAGAACTTTTCAAAAGTACAATATGATATAAATATTTGTACGTGTGT GTGTGTGTGTATGTGTAATTTTGTGAATT CTCCCTTTTTTCTGTGTATAATACGACTGTTTGTATAAATAGTCATTGATTTGTTTATTTTGGTTATCATTGATTTTCTCCCCCCCCCCTCTCTCTCTCTCTTGTTAGTTTTCCTCTTTTCTCCCCAATTGTCATATTCATTCCCCATTCATAACATAGTAATAATAGTGTACATTCATCCGTTCATTCATTCATTCATTTGGATCTTATTAATTGTGAAATAGTGGCTTATTGATGAAGGTTATTCTACCTTCAATCACTACTATATCGTCATTTAGATTTATGTTCAATTTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL AI740206             [CATATCAAATAGAAACAGGTGATCTATTTGAATTAGTACAATATCCCGATCATCGATAATCATAATAATAAAGAACTTTTCAAAAGTACAATATGATATAAATATTTGTACGTGTGT GTGTGTGTGTATGTGTAATTTTGTGAATT CTCCCTTTTTTCTGTGTATAATACGACTGTTTGTATAAATAGTCATTGATTTGTTTATTTTGGTTATCATTGATTTTCTCCCCCCCCCCTCTCTCTCTCTCTTGTTAGTTTTCCTCTTTTCTCCCCAATTGTCATATTCATTCCCCATTCATAACATAGTAATAATAGTGTACATTCATCCGTTCATTCATTCATTCATTT GATCTTATTAATTGTGAAATAGTGGCTTTTTGATGGAGG TTTTCTACCTTCAATCACTACTATATCGTCA TTAGATTTATG TCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL AI740280             [CATATCAAATAGAAACAGGTGATCTATTTGAATTAGTACAATATCCCGATCATCGATAATCATAATAATAAAGAACTTTTCAAAAGTACAATATGATATAAATATTTGTACGTGTGT GTGTGTGTGTATGTGTAATTTTGTGAATT CTCCCTTTTTTCTGTGTATAATACGACTGTTTGTATAAATAGTCATTGATTTGTTTATctgg                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL AI021756             [ ATATCAAATAGAAACAGGTGATCTATTTGAATTAGTACAATATCCCGATCATCGATAATCATAATAATAAAGAACTTTTCAAAAGTACAATATGATATAAATATTTGTACGTGTGT GTGTGTGTGTATGTGTAATTTTGTGAATT CTCCCTTTTTTCTGTGTATAATACGACTGTTTGTATAAATAGTCATTGATTTGTTTATTTGGGTTATCATTGATTTTCCCCCCCCCCCCTCTCTCTCTCTCTTGTTAG TTTCCCCTTTTC CCCCAATTGTCATATTCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD197493             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ACATTCATCCGTTCATTCATTCATTCATTT GATCTTATTAATTGTGAAATAGTGGCTTATTGATGAAGG TATTCTACCTTCAATCACTACTATATCGTCATTTAGATTTATGTTCATTTTCATTCATTTCC GTTGGAGCAGCTGAATACTAT CATATTTTTTGAATCCCTTTACCTATAAATAAGGTTATTGGTACTTAATGAGTCGTATTGTCTGTTTGTGTCTATTTATGGATACATATATGTGTATGTGTATGTGTAAATATGTACTACATTATAATTATTTTCTTATTACCCTCCCCCTTATTTATTCTAATGCCCATTTAGTTCGGCATTTATTATTCAATACAACATGTGATAGTCTCCAAGTTTGTTTGTTTTTCCTTTCGATTATTCGAGAAAGAACAAACTCTTCAATATATTTTGTTTAATTGTACTGTATTGTATTTATTAGTTAGTTTTGAC]
[-] EMBL CD197303             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            T GATCTTATTAATTGTGAAATAGTGGCTTATTGATGAAGG TATTCTACCTTCAATCACTACTATATCGTCATTTAGATTTATGTTCATTTTCATTCATTTCC GTTGGAGCAGCTGAATACTAT CATATTTTTTGAATCCCTTTACCTATAAATAAGGTTATTGGTACTTAATGAGTCGTATTGTCTGTTTGTGTCTATTTATGGATACATATATGTGTATGTGTATGTGTAAATATGTACTACATTATAATTATTTTCTTATTACCCTCCCCCTTATTTATTCTAATGCCCATTTAGTTCGGCATTTATTATTCAATACAACATGTGATAGTCTCCAAGTTTGTTTGTTTTTCCTTTCGATTATTCGAGAAAGAACAAACTCTTCAATATATTTTGTTTAATTGTACTGTATTGTATTTATTAGTTAGTTTTGAC]


>consensus_8919#0 CATATCAAATAGAAACAGGTGATCTATTTGAATTAGTACAATATCCCGATCATCGATAAT CATAATAATAAAGAACTTTTCAAAAGTACAATATGATATAAATATTTGTACGTGTGTGTG TGTGTGTATGTGTAATTTTGTGAATTCTCCCTTTTTTCTGTGTATAATACGACTGTTTGT ATAAATAGTCATTGATTTGTTTATTTTGGTTATCATTGATTTTCTCCCCCCCCCCTCTCT CTCTCTCTTGTTAGTTTTCCTCTTTTCTCCCCAATTGTCATATTCATTCCCCATTCATAA CATAGTAATAATAGTGTACATTCATCCGTTCATTCATTCATTCATTTGATCTTATTAATT GTGAAATAGTGGCTTATTGATGAAGGTATTCTACCTTCAATCACTACTATATCGTCATTT AGATTTATGTTCATTTTCATTCATTTCCGTTGGAGCAGCTGAATACTATCATATTTTTTG AATCCCTTTACCTAAAAATAAGGTTATTGGTACTTAATGAGTCGTATTGTCTGTTTGTGT CTATTTATGGATACATATATGTGTATGTGTATGTGTAAATATGTACTACATTATAATTAT TTTCTTATTACCCTCCCCCTTATTTATTCTAATGCCCATTTAGTTCGGCATTTATTATTC AATACAACATGTGATAGTCTCCAAGTTTGTTTGTTTTTCCTTTCGATTATTCGAGAAAGA ACAAACTCTTCAATATATTTTGTTTAATTGTACTGTATTGTATTTATTAGTTAGTTTTGA C



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)