These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9058#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 1089 fasta sequence [TAACGAGGAACATAAAAACCAATCATTTAATCCTTACTTAGGTGGTGCATTTTCTGGTGTAAATCAACTAAACACATGTTTAGATTTTAATGGTGAACTTCTGACAAATCCTTCGTTTATTAGTCATGTTTCTTTAGCTTGTAGTGAAGGCTACCTACCAACATTTATTCAGTCTAATGGGCCGCCCCCACAGGACATAACTAATTTTGGAGGTTGCTCAAACTATCCTGTAAATCAAGATTTTTATATGCATGGACCTTATAATAATCTCGGAGGCAACAGGACGGTGGAACATGCTTCGTCTGAACATACTACTAACGGACTAGTTACAAATTCTCCTTATGGTCCCGTACAGTATGGGCCACAAAAGTTTCAGCACACTCTTTACCCCAGAGGTGTATCACCAGCCCCAGGTGACCAACTGAATATACAGGTACCTAATTGTGCTGGTGTAAACAATTATCCAATGCACCCAGTTGATACTATGGTAAACACGTTGGTTGGGCCGCAATTTCTCGGACCGTCAGCGAATGGTCATGCACAAAATGGGGCTGGTTTTCAGAATTTACCTGTCAGCGGTTTATATCAATCTCTTATTCAACCTAAAGATCCTTCTATACATATCCAGGCTCAAGCTGTTCAACCTGTTTCAAACGACCAACAACAATCTGCAGCATTATTTGCACACACTCTTCAGATGTTTGCAGCTGCCGCTGCTAGGAATATGGGTTCTGGAACACACGATCTTCATGTAACTGGTGTCGGGTCAAGTAGCAGTGGATCCGTATTAAATTCTGTTGATTTTGAGTGTTTAAGGCCCCCAGGTGTAAGTGCAGAAGTCCCACCTACTGCACCCATACTACCAGATCATTTGCAGGCATATGCGGGTAATTCTTGTGTTCCTGTCAATGCCGTAGAAAGTCCGGGTCCCCGTCATCCCCATTCAACCTTGGATTTTAAGTCGATGTGCTCAACAGTTCCTGCTCCTTTTCCACCTATCTCATCATCCATTCATTCACAAAATATTTTTCCACAAACTGATGTAATTACTCAGGAGTTTCAGCGTGCTGGTTTAGGTTATACCGGATT] [+] EMBL CD178758 [TAACGAGGAACATAAAAACCAATCATTTAATCCTTACTTAGGTGGTGCATTTTCTGGTGTAAATCAACTAAACACATGTTTAGATTTTAATGGTGAACTTCTGACAAATCCTTCGTTTATTAGTCATGTTTCTTTAGCTTGTAGTGAAGGCTACCTACCAACATTTATTCAGTCTAATGGGCCGCCCCCACAGGACATAACTAATTTTGGAGGTTGCTCAAACTATCCTGTAAATCAAGATTTTTATATGCATGGACCTTATAATAATCTCGGAGGCAACAGGACGGTGGAACATGCTTCGTCTGAACATACTACTAACGGACTAGTTACAAATTCTCCTTATGGTCCCGTACAGTATGGGCCACAAAAGTTTCAGCACACTCTTTACCCCAGAGGTGTATCACCAGCCCCAGGTGACCAACTGAATATACAGGTACCTAATTGTGCTGGTGTAAACAATTATCCAATGCACCCAGTTGATACTATGGTAAACACGTTGGTTGGGCCGCAATTTCTCGGACCGTCAGCGAATGGTCATG ] [-] EMBL CD189048 [ TGACANATCCTTCGTNTATTAGTCATGTTTCTTTAGCTTGTAGTGAAGGCTACCTACCAACATTTATTCAGTCTAATGGGCCGCCCCCACAGGACATAACTAATTTTGGAGGTTGCTCAAACTATCCTGTAAATCAAGATTTTTATATGCATGGACCTTATAATAATCTCGGAGGCAACAGGACGGTGGAACATGCTTCGTCTGAACATACTACTAACGGACTAGTTACAAATTCTCCTTATGGTCCCGTACAGTATGGGCCACAAAAGTTTCAGCACACTCTTTACCCCAGAGGTGTATCACCAGCCCCAGGTGACCAACTGAATATACAGGTACCTAATTGTGCTGGTGTAAACAATTATCCAATGCACCCAGTTGATACTATGGTAAACACGTTGGTTGGGCCGCAATTTCTCGGACCGTCAGCGAATGGTCATGCACAAAATGGGGCTGGTTTTCAGAATTTACCTGTCAGCGGTTTATATCAATCTCTTATTCAACCTAAAGATCCTTC ] [+] EMBL CD191165 [ AACTAATTTTGGAGGTTGCTCAAACTATCCTGTAAATCAAGATTTTTATATGCATGGACCTTATAATAATCTCGGAGGCAACAGGACGGTGGAACATGCTTCGTCTGAACATACTACTAACGGACTAGTTACAAATTCTCCTTATGGCCCCGTACAGTATGGGCCACAAAAGTTTCAGCACACT ] [+] EMBL CD127205 [ CTTTACCCCAGAGGTGTATCACCAGCCCCAGGTGACCAACTGAATATACAGGTACCTAATTGTGCTGGTGTAAACAATTATCCAATGCACCCAGTTGATACTATGGTAAACACGTTGGTTGGGCCGCAATTTCTCGGACCGTCAGCGAATGGTCATGCACAAAATGGGGCTGGTTTTCAGAATTTGCCTGTCAGCGGTTTATATCAATCTCTTATTCAACCTAAAGATCCTTCTATACATATCCAGGCTCAAGCTGTTCAACCTGTTTCAAACGACCAACAACAATCTGCAGCATTATTTGCACACACTCTTCAGATGTTTGCAGCTGCCGCTGCTAGGAATATGGGTTCTGGAACACACGATCTTCATGTAACTGGTGTCGGGTCAAGTAGCAGTGGATCCGTATTAAATTCTGTTGATTTTGAGTGTTTAAGGCCCCCAGGTGTAAGTGCAGAAGTCCCACCTACTGCACCCATACTACCAGATCATTTGCAGGCATATGCGGGTAATTCTTGTGTTCCTGTCAATGCCGTAGAAAGTCCGGGTCCCCGTCATCCCCATTCAACCTTGGATTTTAAGTCGATGTGCTCAACAGTTCCTG ] [+] EMBL CD127356 [ CTTTACCCCAGAGGTGTATCACCAGCCCCAGGTGACCAACTGAATATACAGGTACCTAATTGTGCTGGTGTAAACAATTATCCAATGCACCCAGTTGATACTATGGTAAACACGTTGGTTGGGCCGCAATTTCTCGGACCGTCAGCGAATGGTCATGCACAAAATGGGGCTGGTTTTCAGAATTTACCTGTCAGCGGTTTATATCAATCTCTTATTCAACCTAAAGATCCTTCTATACATATCCAGGCTCAAGCTGTTCAACCTGTTTCAAACGACCAACAACAATCTGCAGCATTATTTGCACACACTCTTCAGATGTTTGCAGCTGCCGCTGCTAGGAATATGGGTTCTGGAACACACGATCTTCATGTAACTGGTGTCGGGTCAAGTAGCAGTGGATCCGTATTAAATTCTGTTGATTTTGAGTGTTTAAGGCCCCCAGGTGTAAGTGCAGAAGTCCCACCTACTGCACCCATACTACCAGATCATTTGCAGGCATATGCGGGTAATTCTTGTGTTCCTGTCAATGCCGTAGAAAGTCCGGGTCCCCGTCATTCCCATTCAACCTCGGATTTTAAGTCGATGTGCTCAACAGTTCCTG ] [+] EMBL CD127899 [ CTGAATATACAGGTACCTAATTGTGCTGGTGTAAACAATTATCCAATGCACCCAGTGGATACTATGGTAAACACGTTGGTTGGGCCGCAATTTCTCGGACCGTCAGCGAATGGTCATGCACAAAATGGGGCTGGGTTTCACAATTTACCTGTCACCGGGCTATATCAATCTCTTATTCAACCTAAAGATCCTTCTATACATATCCACGCTCAAGCTGTTCAACCTGGTTCAAACGACCAACAACAATCTGCAGCATTATTTGCACACACTCTTCACATGTCTGCAGCTGCCGTCGCTAGGAATATGGGTTCTGGAACACACGATCTTCATGTAACTGGTGTCGGGTCAAGTAGCAATGGATCCGAATTAAATTCTGTGGATTCTGAGTGTTTAATGCCCCCAGGTGTAAGTGCAGAAGTCCCACCTACTGCACCCATACTACCAGATCATTTGCAGGCATATGCGGGTAATTCTTGTGTTCCTGTCAATGCCGTAGAAAGTCCGGGTCCCCGTCATCCCCATTCAACCTTGGATTNTAAGTCGATGTGCTCAACAGTTCCTG ] [+] EMBL CD190160 [ CCAGGCTCAAGCTGTTCAACCTGTTTCAAACGACCAACAACAATCTGCAGCATTATTTGCACACACTCTTCAGATGTTTGCAGCTGCCGCTGCTAGGAATATGGGTTCTGGAACACACGATCTTCATGTAACTGGTGTCGGGTCAAGTAGCAGTGGATCCGTATTAAATTCTGTTGATTTTGAGTGTTTAAGGCCCCCAGGTGTAAGTGCAGAAGTCCCACCTACTGCACCCATACTACCAGATCATTTGCAGGCATATGCGGGTAATTCTTGTGTTCCTGTCAATGC ] [-] EMBL BG930971 [ GATCCGTATTAAATTCTGTTGATTTTGAGTGTTAAAGGCCCCCAGGTGTAAGTGCAGAAGTCCCACCTACTGCACCCATACTACCAGATCATTTGCAGGCATATGCGGGTAATTCTTGTGTTCCTGTCAATGCCGTAGAAAGTCCGGGTCCCCGTCATCCCCATTCAACCTTGGATTTTAAGTCGATGTGCTCAACAGTTCATGCTCCTTTTCCACCTATCTCATCATCCATTCATTCACAAAATATTTTTCCACAAACTGATGTAATTACTCAGGAGTTTCAGCGTGCTGGTTTAGGTTATACCGGATT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||