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Schistosoma mansoni
cluster # 9058 cluster # 9058       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9058#0 length = 1089 sequences # 8  

consensusID : consensus_9058#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 1089
fasta sequence
                              [TAACGAGGAACATAAAAACCAATCATTTAATCCTTACTTAGGTGGTGCATTTTCTGGTGTAAATCAACTAAACACATGTTTAGATTTTAATGGTGAACTTCTGACAAATCCTTCGTTTATTAGTCATGTTTCTTTAGCTTGTAGTGAAGGCTACCTACCAACATTTATTCAGTCTAATGGGCCGCCCCCACAGGACATAACTAATTTTGGAGGTTGCTCAAACTATCCTGTAAATCAAGATTTTTATATGCATGGACCTTATAATAATCTCGGAGGCAACAGGACGGTGGAACATGCTTCGTCTGAACATACTACTAACGGACTAGTTACAAATTCTCCTTATGGTCCCGTACAGTATGGGCCACAAAAGTTTCAGCACACTCTTTACCCCAGAGGTGTATCACCAGCCCCAGGTGACCAACTGAATATACAGGTACCTAATTGTGCTGGTGTAAACAATTATCCAATGCACCCAGTTGATACTATGGTAAACACGTTGGTTGGGCCGCAATTTCTCGGACCGTCAGCGAATGGTCATGCACAAAATGGGGCTGGTTTTCAGAATTTACCTGTCAGCGGTTTATATCAATCTCTTATTCAACCTAAAGATCCTTCTATACATATCCAGGCTCAAGCTGTTCAACCTGTTTCAAACGACCAACAACAATCTGCAGCATTATTTGCACACACTCTTCAGATGTTTGCAGCTGCCGCTGCTAGGAATATGGGTTCTGGAACACACGATCTTCATGTAACTGGTGTCGGGTCAAGTAGCAGTGGATCCGTATTAAATTCTGTTGATTTTGAGTGTTTAAGGCCCCCAGGTGTAAGTGCAGAAGTCCCACCTACTGCACCCATACTACCAGATCATTTGCAGGCATATGCGGGTAATTCTTGTGTTCCTGTCAATGCCGTAGAAAGTCCGGGTCCCCGTCATCCCCATTCAACCTTGGATTTTAAGTCGATGTGCTCAACAGTTCCTGCTCCTTTTCCACCTATCTCATCATCCATTCATTCACAAAATATTTTTCCACAAACTGATGTAATTACTCAGGAGTTTCAGCGTGCTGGTTTAGGTTATACCGGATT]

[+] EMBL CD178758             [TAACGAGGAACATAAAAACCAATCATTTAATCCTTACTTAGGTGGTGCATTTTCTGGTGTAAATCAACTAAACACATGTTTAGATTTTAATGGTGAACTTCTGACAAATCCTTCGTTTATTAGTCATGTTTCTTTAGCTTGTAGTGAAGGCTACCTACCAACATTTATTCAGTCTAATGGGCCGCCCCCACAGGACATAACTAATTTTGGAGGTTGCTCAAACTATCCTGTAAATCAAGATTTTTATATGCATGGACCTTATAATAATCTCGGAGGCAACAGGACGGTGGAACATGCTTCGTCTGAACATACTACTAACGGACTAGTTACAAATTCTCCTTATGGTCCCGTACAGTATGGGCCACAAAAGTTTCAGCACACTCTTTACCCCAGAGGTGTATCACCAGCCCCAGGTGACCAACTGAATATACAGGTACCTAATTGTGCTGGTGTAAACAATTATCCAATGCACCCAGTTGATACTATGGTAAACACGTTGGTTGGGCCGCAATTTCTCGGACCGTCAGCGAATGGTCATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD189048             [                                                                                                     TGACANATCCTTCGTNTATTAGTCATGTTTCTTTAGCTTGTAGTGAAGGCTACCTACCAACATTTATTCAGTCTAATGGGCCGCCCCCACAGGACATAACTAATTTTGGAGGTTGCTCAAACTATCCTGTAAATCAAGATTTTTATATGCATGGACCTTATAATAATCTCGGAGGCAACAGGACGGTGGAACATGCTTCGTCTGAACATACTACTAACGGACTAGTTACAAATTCTCCTTATGGTCCCGTACAGTATGGGCCACAAAAGTTTCAGCACACTCTTTACCCCAGAGGTGTATCACCAGCCCCAGGTGACCAACTGAATATACAGGTACCTAATTGTGCTGGTGTAAACAATTATCCAATGCACCCAGTTGATACTATGGTAAACACGTTGGTTGGGCCGCAATTTCTCGGACCGTCAGCGAATGGTCATGCACAAAATGGGGCTGGTTTTCAGAATTTACCTGTCAGCGGTTTATATCAATCTCTTATTCAACCTAAAGATCCTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD191165             [                                                                                                                                                                                                      AACTAATTTTGGAGGTTGCTCAAACTATCCTGTAAATCAAGATTTTTATATGCATGGACCTTATAATAATCTCGGAGGCAACAGGACGGTGGAACATGCTTCGTCTGAACATACTACTAACGGACTAGTTACAAATTCTCCTTATGGCCCCGTACAGTATGGGCCACAAAAGTTTCAGCACACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD127205             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CTTTACCCCAGAGGTGTATCACCAGCCCCAGGTGACCAACTGAATATACAGGTACCTAATTGTGCTGGTGTAAACAATTATCCAATGCACCCAGTTGATACTATGGTAAACACGTTGGTTGGGCCGCAATTTCTCGGACCGTCAGCGAATGGTCATGCACAAAATGGGGCTGGTTTTCAGAATTTGCCTGTCAGCGGTTTATATCAATCTCTTATTCAACCTAAAGATCCTTCTATACATATCCAGGCTCAAGCTGTTCAACCTGTTTCAAACGACCAACAACAATCTGCAGCATTATTTGCACACACTCTTCAGATGTTTGCAGCTGCCGCTGCTAGGAATATGGGTTCTGGAACACACGATCTTCATGTAACTGGTGTCGGGTCAAGTAGCAGTGGATCCGTATTAAATTCTGTTGATTTTGAGTGTTTAAGGCCCCCAGGTGTAAGTGCAGAAGTCCCACCTACTGCACCCATACTACCAGATCATTTGCAGGCATATGCGGGTAATTCTTGTGTTCCTGTCAATGCCGTAGAAAGTCCGGGTCCCCGTCATCCCCATTCAACCTTGGATTTTAAGTCGATGTGCTCAACAGTTCCTG                                                                                                          ]
[+] EMBL CD127356             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CTTTACCCCAGAGGTGTATCACCAGCCCCAGGTGACCAACTGAATATACAGGTACCTAATTGTGCTGGTGTAAACAATTATCCAATGCACCCAGTTGATACTATGGTAAACACGTTGGTTGGGCCGCAATTTCTCGGACCGTCAGCGAATGGTCATGCACAAAATGGGGCTGGTTTTCAGAATTTACCTGTCAGCGGTTTATATCAATCTCTTATTCAACCTAAAGATCCTTCTATACATATCCAGGCTCAAGCTGTTCAACCTGTTTCAAACGACCAACAACAATCTGCAGCATTATTTGCACACACTCTTCAGATGTTTGCAGCTGCCGCTGCTAGGAATATGGGTTCTGGAACACACGATCTTCATGTAACTGGTGTCGGGTCAAGTAGCAGTGGATCCGTATTAAATTCTGTTGATTTTGAGTGTTTAAGGCCCCCAGGTGTAAGTGCAGAAGTCCCACCTACTGCACCCATACTACCAGATCATTTGCAGGCATATGCGGGTAATTCTTGTGTTCCTGTCAATGCCGTAGAAAGTCCGGGTCCCCGTCATTCCCATTCAACCTCGGATTTTAAGTCGATGTGCTCAACAGTTCCTG                                                                                                          ]
[+] EMBL CD127899             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CTGAATATACAGGTACCTAATTGTGCTGGTGTAAACAATTATCCAATGCACCCAGTGGATACTATGGTAAACACGTTGGTTGGGCCGCAATTTCTCGGACCGTCAGCGAATGGTCATGCACAAAATGGGGCTGGGTTTCACAATTTACCTGTCACCGGGCTATATCAATCTCTTATTCAACCTAAAGATCCTTCTATACATATCCACGCTCAAGCTGTTCAACCTGGTTCAAACGACCAACAACAATCTGCAGCATTATTTGCACACACTCTTCACATGTCTGCAGCTGCCGTCGCTAGGAATATGGGTTCTGGAACACACGATCTTCATGTAACTGGTGTCGGGTCAAGTAGCAATGGATCCGAATTAAATTCTGTGGATTCTGAGTGTTTAATGCCCCCAGGTGTAAGTGCAGAAGTCCCACCTACTGCACCCATACTACCAGATCATTTGCAGGCATATGCGGGTAATTCTTGTGTTCCTGTCAATGCCGTAGAAAGTCCGGGTCCCCGTCATCCCCATTCAACCTTGGATTNTAAGTCGATGTGCTCAACAGTTCCTG                                                                                                          ]
[+] EMBL CD190160             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CCAGGCTCAAGCTGTTCAACCTGTTTCAAACGACCAACAACAATCTGCAGCATTATTTGCACACACTCTTCAGATGTTTGCAGCTGCCGCTGCTAGGAATATGGGTTCTGGAACACACGATCTTCATGTAACTGGTGTCGGGTCAAGTAGCAGTGGATCCGTATTAAATTCTGTTGATTTTGAGTGTTTAAGGCCCCCAGGTGTAAGTGCAGAAGTCCCACCTACTGCACCCATACTACCAGATCATTTGCAGGCATATGCGGGTAATTCTTGTGTTCCTGTCAATGC                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL BG930971             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GATCCGTATTAAATTCTGTTGATTTTGAGTGTTAAAGGCCCCCAGGTGTAAGTGCAGAAGTCCCACCTACTGCACCCATACTACCAGATCATTTGCAGGCATATGCGGGTAATTCTTGTGTTCCTGTCAATGCCGTAGAAAGTCCGGGTCCCCGTCATCCCCATTCAACCTTGGATTTTAAGTCGATGTGCTCAACAGTTCATGCTCCTTTTCCACCTATCTCATCATCCATTCATTCACAAAATATTTTTCCACAAACTGATGTAATTACTCAGGAGTTTCAGCGTGCTGGTTTAGGTTATACCGGATT]


>consensus_9058#0 TAACGAGGAACATAAAAACCAATCATTTAATCCTTACTTAGGTGGTGCATTTTCTGGTGT AAATCAACTAAACACATGTTTAGATTTTAATGGTGAACTTCTGACAAATCCTTCGTTTAT TAGTCATGTTTCTTTAGCTTGTAGTGAAGGCTACCTACCAACATTTATTCAGTCTAATGG GCCGCCCCCACAGGACATAACTAATTTTGGAGGTTGCTCAAACTATCCTGTAAATCAAGA TTTTTATATGCATGGACCTTATAATAATCTCGGAGGCAACAGGACGGTGGAACATGCTTC GTCTGAACATACTACTAACGGACTAGTTACAAATTCTCCTTATGGTCCCGTACAGTATGG GCCACAAAAGTTTCAGCACACTCTTTACCCCAGAGGTGTATCACCAGCCCCAGGTGACCA ACTGAATATACAGGTACCTAATTGTGCTGGTGTAAACAATTATCCAATGCACCCAGTTGA TACTATGGTAAACACGTTGGTTGGGCCGCAATTTCTCGGACCGTCAGCGAATGGTCATGC ACAAAATGGGGCTGGTTTTCAGAATTTACCTGTCAGCGGTTTATATCAATCTCTTATTCA ACCTAAAGATCCTTCTATACATATCCAGGCTCAAGCTGTTCAACCTGTTTCAAACGACCA ACAACAATCTGCAGCATTATTTGCACACACTCTTCAGATGTTTGCAGCTGCCGCTGCTAG GAATATGGGTTCTGGAACACACGATCTTCATGTAACTGGTGTCGGGTCAAGTAGCAGTGG ATCCGTATTAAATTCTGTTGATTTTGAGTGTTTAAGGCCCCCAGGTGTAAGTGCAGAAGT CCCACCTACTGCACCCATACTACCAGATCATTTGCAGGCATATGCGGGTAATTCTTGTGT TCCTGTCAATGCCGTAGAAAGTCCGGGTCCCCGTCATCCCCATTCAACCTTGGATTTTAA GTCGATGTGCTCAACAGTTCCTGCTCCTTTTCCACCTATCTCATCATCCATTCATTCACA AAATATTTTTCCACAAACTGATGTAATTACTCAGGAGTTTCAGCGTGCTGGTTTAGGTTA TACCGGATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)