These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9094#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 577 fasta sequence [GGGCTGATTTGTATTTCTCAAAACTATTCAGGTTGCTTGACAACACGGTGGTGATGGGGAACAAAATCAGTTAATGTGGCAGCCGCAGAAGTGAAAACTAAAATAGGCATTGCAAAACTACATATTTGCCAGGAATTGAAAGAGAGCTTCAATAGGAAAATTGAGTAAATCTAATGTCAAGCAAACCAAAACATATGGTTAGTTCTCAAATAAAAACCTCACAGAACGCCAACCTTACACTTAGGTGAAGACAACAATTTGTCGTCACAATAAATGTAACATGAAGTATTTCCACACACACTCATATAAAAGCATATTAAAAGATCTTACACCTTACACTTTTATTTGGTAATTCTGTTTTACAAGGTGTTGTAATAGTTGGTGACTATACCTGTCAAGTGTTGTTCAGTATTATGAAACTTTAGATTCTACCAATTCTACTACTTGCACCACTCTATTTTTAGTAATCTGTTAGTAAACGTCGACATCTATTCCTATTATAAACCATATTTAAGGTTATTTTATTACCTGGTCATAATAATTAAACTAAAAGTCATCGGCACTTCAATATAAGCTT] [+] EMBL CD087996 [GGGCTGATTTGTATTTCTCAAAACTATTCAGGTTGCTTGACAACACGGTGGTGATGGGGAACAAAATCAGTTAATGTGGCAGCCGCAGAAGTGAAAACTAAAATAGGCATTGCAAAACTACATATTTGCCAGGAATTGAAAGAGAGCTTCAATAGGAAAATTGAGTAAATCTAATGTCAAGCAAACTAAAACATATGGTTAGTTCTCAAATAAAAACCTCACAGAACGCCAACCTTACACTTAGGTGAAGACAACAATTTGTCGTCACAATAAATGTAACATGAAGTATTTCCACACACACTCATATAAAAGCATATTAAAAGATCTTACACCTTACACTTTTATTTGGTAATTCTGTTTTACAAGGTGTTGTAATAGTTGGTGACTATACCTGTCAAGTGTTGTTCAGTATTATGAAACTTTAGATTCTACCAATTCTACTACTTGCACCACTCTATTTTTAGTAATCTGTTAGTAAACGTCGACATCTAT ] [+] EMBL CD088006 [GGGCTGATTTGTATTTCTCAAAACTATTCAGGTTGCTTGACAACACGGTGGTGATGGGGAACAAAATCAGTTAATGTGGCAGCCGCAGAAGTGAAAACTAAAATAGGCATTGCAAAACTACATATTTGCCAGGAATTGAAAGAGAGCTTCAATAGGAAAATTGAGTAAATCTAATGTCAAGCAAACCAAAACATATGGTTAGTTCTCAAATAAAAACCTCACAGAACGCCAACCTTACACTTAGGTGAAGACAACAATTTGTCGTCACAATAAATGTAACATGAAGTATTTCCACACACACTCATATAAAAGCATATTAAAAGATCTTACACCTTACACTTTTATTTGGTAATTCTGTTTTACAAGGTGTTGTAATAGTTGGTGACTATACCTGTCAAGTGTTGTTCAGTATTATGAAACTTTAGATTCTACCAATTCTACTACTTGCACCACTTTATTTTTAGTAATCTGTTAGTAAACGTCGACATCTAT ] [+] EMBL CD088038 [GGGCTGATTTGTATTTCTCAAAACTATTCAGGTTGCTTGACAACACGGTGGTGATGGGGAACAAAATCAGTTAATGTGGCAGCCGCAGAAGTGAAAACTAAAATAGGCATTGCAAAACTACATATTTGCCAGGAATTGAAAGAGAGCTTCAATAGGAAAATTGAGTAAATCTAATGTCAAGCAAACCAAAACATATGGTTAGTTCTCAAATAAAAACCTCACAGAACGCCAACCTTACACTTAGGTGAAGACAACAATTTGTCGTCACAATAAATGTAACATGAAGTATTTCCACACACACTCATATAAAAGCATATTAAAAGATCTTACACCTTACACTTTTATTTGGTAATTCTGTTTTACAAGGTGTTGTAATAGTTGGTGACTATACCTGTCAAGTGTTGTTCAGTATTATGAAACTTTAGATTCTACCAATTCTACTACTTGCACCACTCTATTTTTA ] [+] EMBL CD088048 [GGGCTGATTTGTATTTCTCAAAACTATTCAGGTTGCTTGACAACACGGTGGTGATGGGGAACAAAATCAGTTAATGTGGCAGCCGCAGAAGTGAAAACTAAAATAGGCATTGCAAAACTACATATTTGCCAGGAATTGAAAGAGAGCTTCAATAGGAAAATTGAGTAAATCTAATGTCAAGCAAACCAAAACATATGGTTAGTTCTCAAATAAAAACCTCACAGAACGCCAACCTTACACTTAGGTGAAGACAACAATTTGTCGTCACAATAAATGTAACATGAAGTATCTCCACACACACTCATATAAAAGCATATTAAAAGATCTTACACCTTACACTTTTATTTGGTAATTCTGTTTTACAAGGTGTTGTAATAGTTGGTGACTATACCTGTCAAGTGTTGTTCAGTATTATGAAACTTTAGATTCTACCAAT ] [+] EMBL CD088063 [GGGCTGATTTGTATTTCTCAAAACTATTCAGGTTGCTTGACAACACGGTGGTGATGGGGAACAAAATCAGTTAATGTGGCAGCCGCAGAAGTGAAAACTAAAATAGGCGTTGCAAAACTACATATTTGCCAGGAATTGAAAGAGAGCTTCAATAGGAAAATTGAGTAAATCTAATGTCAAGCAAACCAAAACATATGGTTAGTTCTCAAATAAAAACCTCACAGAACGCCAACCTTACACTTAGGTGAAGACAACAATTTGTCGTCACAATAAATGTAACATGAAGTATTTCCACACACACTCATATAAAAGCATATTAAAAGATCTTACACCTTACACTTTTATTTGGTAATTCTGTTTTACAAGGTGTTGTAATAGTTGGTGACTATACCTGTCAAGTGTTGTTCAGTATTATGAAACTTTAGATTCTAC ] [+] EMBL CD088004 [GGGCTGATTTGTATTTCTCAAAACTATTCAGGTTGCTTGACAACACGGTGGTGATGGGGAACAAAATCAGTTAATGTGGCAGCCGCAGAAGTGAAAACTAAAATAGGCATTGCAAAACTACATATTTGCCAGGAATTGAAAGAGAGCTTCAATAGGAAAATAGAGTAAATCTAATGTCAAGCAAACCAAAACATATGGTTAGTTCTCAAATAAAAACCTCACAGAACGCCAACCTTACACTTAGGTGAAGACAACAATTTGTCGTCACAATAAATGTAACATGAAGTATTTCCACACACACTCATATAAAAGCATATTAAAAGATCTTACACCTTACACTTTTATTTGGTAACTCTGTTTTACAAGGTGTTGTCATAGTTGGTGACTATACCTGTCAAGTGTTGTTCAGTAT ] [-] EMBL CD088008 [ ttTTTGCCAGGAATTGAAAGAGAGCTTCAATAGGAAAATTGAGTAAATCTAATGGCAAGCAAACCAAAACATATGGTTAGTTCTCAAATAAAAACCTCACAGAACGCCAACCTTACACTTAGGTGAAGACAACAATTTGTCGTCACAATAAATGTAACATGAAGTATTTCCACACACACTCATATAAAAGCATATTAAAAGATCTTACACCTTACACTTTTATTTGGTAATTCTGTTTTACAAGGTGTTGTAATAGTTGGTGACTATACCTGTCAAGTGTTGTTCAGTATTATGAAACTTTAGATTCTACCAATTCTACTACTTGCACCACTCTATTTTTAGTAATCTGTTAGTAAACGTCGACATCTATTCCTATTATAAACCATATTTAAGGTTATTTTATTACCTGGTCATAATAATTAAACTAAAAGTCATCGGCACTTCAATATAAGCTT] [-] EMBL CD088054 [ GCTTCAATAGGAAAATTGAGTAAATCTAATGTCAAGCAAACCAAAACATATGGTTAGTTCTCAAATAAAAACCTCACAGAACACCAACCTTACACTTAGGTGAAGACAACAATTTGTCGTCACAATAGATGTAACATGAAGTATTTCCACACACACTCATATAAAAGCATATTAAAAGATCTTACACCTTACACTTTTATTTGGTAATTCTGTCTTACAAGGTGTTGTAATAGTTGGTGACTATACCTGTCAAGTGTTGTTCAGTATTATGAAACTTTAGATTCTACCAATTCTACTACTTGCACCACTCTATTTTTAGTAATCTGTTAGTAAACGTCGACATCTATTCCTATTATAAATCATATTTAAGGTTATTTTATTACCTGGTCATAATAATTAAACTAAAAGTTATCGGCACTTCAATATAAGCTT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||