These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9129#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 905 fasta sequence [CCGNNGCCGCCATGGCGGTCCGCGGGNAATTCGATTACTGCGAACCGGCTTCTTACTACTAGACGAACCGACGAATCATTTAGATTTGAATGCAGTTATATGGTTAGATAATTATCTTCAAAGATGGAAGAAAACTCTCCTGATTGTTTCACATGACCAGTCATTCTTAGATAATGTTTGTACAGATATC--ATCCATTTAGACCAACGTCAGTTATTTTATTATAGAGGCAATTATAATAACTTCAAAAGTATGTTTATCCAACGTAGAAAAGAACAATTGAAAGAATATGAAAAACAAGAAAAACGTCTTAAAGAATTAAAACAATCTGGAATGAGTAATAAACAAGCTCAAGCAAAAAATCAACGTGATGTATTAACAAGAAAACAGGCGAAAAATAAGCAAACTTCCAATGAAGCTAATGATAATGGAAAACCACAATTATTAT--CTAAACCAAAGGAGTATGTTGTTAAGTTCACGTTTCCAAATCCAACTCCTATTTCTCCTCCTATACTCGGTTTATACAGTGTAACTTTTGCTTATCCAAACCAAAAACCTTTGTTTAAAGAATTGAACTTTGGCATAGATATGACTTCTAGAATTTCAATTGTTGGTCCTAATGGTGTTGGAAAATCTACCTTTTTAAAACTACTTACGGGTGAAGTACAACCGACTGATGGAGAAACGTC-GCTAAATCATCGTGNTAAAATTGGGCAGTATGATCAACACTCAGCAGATCAATTAAATCTTAGTGAAACACCAACTGAATATTTACAACGCCTTTTCAATCTAACTTATCAAGATGCTCGAGCAACATTGGGTAAATTTGGTTTAGAAGCTCATGCCCATACTATTCCTAATGCTGACCTGTCAGGTGGACAACGTCCTCGTGTTGCTTTTGCTGATG] [+] EMBL CD130570 [CCGNNGCCGCCATGGCGGTCCGCGGGNAATTCGATTACTGCGAACCGGCTTCTTACTACTAGACGAACCGACGAATCATTTAGATTTGAATGCAGTTATATGGTTAGATAATTATCTTCAAAGATGGAAGAAAACTCTCCTGATTGTTTCACATGACCAGTCATTCTTAGATAATGTTTGTACAGATATCATATCCATTTAGACCAACGTCAGTTATTTTATTATAGAGGCAATTATAATAACTTCAAAAGTATGTTTATCCAACGTAGAAAAGAACAATTGAAAGAATATGAAAAACAAGAAAAACGTCTTAAAGAATTAAAACAATCTGGAATGAGTAATAAACAAGCTCAAGCAAAAAATCAACGTGATGTATTAACAAGAAAACAGGCGAAAAATAAGCAAACTTCCAATGAAGCTAATGATAATGGAAAACCACAATTATTATNACTAAACCAAAGGAGTATGTTGTTA ] [+] EMBL CD156885 [ GAATCATTTAGATTTGAATGCAGTTATATGGTTAGATAATTATCTTCAAAGATGGAAGAAAACTCTCCTGATTGTTTCGCACGACCAGTCATTCTTAGATAATGTTTGTACAGATATC ATCCATTTAGACCAACGTCAGTTATTTTATTATAGAGGCAATTATAATAACTTCAAAAGTATGTTTATCCAACGTAGAAAAGAACAATTGAGAGAATATGAAAAACAAGAAAAACGTCTTAAAGAATTAAAACAATCTGGAATGAGTAATAAACAAGCTCAAGCAAAAAATCAACGTGATGTATTAACAAGAAAACAGGCGAAAAATAAGCAAACTTCCAATGAAGCTAATGATAATGGAAAACCACAATTATTAT CTAAACCAAAGGAGTATGTTGTTAAGTTCACGTTTCCAAATCCAACTCCTATTTCTCCTCCTAAACTCGGTTTATACAGTGTAACTTTTGCTTATCCAAACCAAAAACCTTTGTTTAAAGAATTGAACTTTGGCATAGATATGACTTCTAGAATTTCAATTGTTGGTCCTAATGGTGTTGGAAAATCTACCTTTTTAAAACTACTTACGGGTGAAGTACAACCGACTGATGGAGAAACGTC GCTAAATCATCGTGNTAAAATTGGGCAG ] [+] EMBL CD118838 [ AGATTTGAATGCAGTTATATGGTTAGATAATTATCTTCAAAGATGGAAGAAAACTCTCCTGATTGTTTCACATGACCAGTCATTCTTAGATAATGTTTGTACAGATATC ATCCATTTAGACCAACGTCAGTTATTTTATTATAGAGGCAATTATAATAACTTCAAAAGTATGTTTATCCAACGTAGAAAAGAACAATTGAAAGAATATGAAAAACAAGAAAAACGTCTTAAAGAATTAAAACAATCTGGAATGAGTAATAAACAAGCTCAAGCAAAAAATCAACGTGATGTATTAACAAGAAAACAGGCGAAAAATAAGCAAACTTCCAATGAAGCTAATGATAATGGAAAACCACAATTATTAT CTAAACCAAAGGAGTATGTTGTTAAGTTCACGTTTCCAAATCCAACTCCTATTTCTCCTCCTATACTCGGTTTATACAGTGTAACTTTTGCTTATCCAAACCAAAAACCTTTGTTTAAAGAATTGAACTTTGGCATAGATATGACTTCTAG ] [+] EMBL CD156884 [ AGATTTGAATGCAGTTATATGGTTAGATAATTATCTTCAAAGATGGAAGAAAACTCTCCTGATTGTTTCACATGACCAGTCATTCTTAGATAATGTTTGTACAGATATC 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AACGTCGGTTAAATCATCGTGTTAAAATTGGCAAGTATGATCAACACTCAGCAGATCAATTAAATCTTAGTGAAACACCAACTGAATATTTACAACGCCTTTTCAATCTAACTTATCAAGATGCTCGAGCAACATTGGGTAAATTTGGTTTAGAAGCTCATGCCCATACTATTCCTAATGCTGACCTGTCAGGTGGACAACGTCCTCGTGTTGCTTTTGCTGATG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||