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Schistosoma mansoni
cluster # 9129 cluster # 9129       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9129#0 length = 905 sequences # 8  

consensusID : consensus_9129#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 905
fasta sequence
                              [CCGNNGCCGCCATGGCGGTCCGCGGGNAATTCGATTACTGCGAACCGGCTTCTTACTACTAGACGAACCGACGAATCATTTAGATTTGAATGCAGTTATATGGTTAGATAATTATCTTCAAAGATGGAAGAAAACTCTCCTGATTGTTTCACATGACCAGTCATTCTTAGATAATGTTTGTACAGATATC--ATCCATTTAGACCAACGTCAGTTATTTTATTATAGAGGCAATTATAATAACTTCAAAAGTATGTTTATCCAACGTAGAAAAGAACAATTGAAAGAATATGAAAAACAAGAAAAACGTCTTAAAGAATTAAAACAATCTGGAATGAGTAATAAACAAGCTCAAGCAAAAAATCAACGTGATGTATTAACAAGAAAACAGGCGAAAAATAAGCAAACTTCCAATGAAGCTAATGATAATGGAAAACCACAATTATTAT--CTAAACCAAAGGAGTATGTTGTTAAGTTCACGTTTCCAAATCCAACTCCTATTTCTCCTCCTATACTCGGTTTATACAGTGTAACTTTTGCTTATCCAAACCAAAAACCTTTGTTTAAAGAATTGAACTTTGGCATAGATATGACTTCTAGAATTTCAATTGTTGGTCCTAATGGTGTTGGAAAATCTACCTTTTTAAAACTACTTACGGGTGAAGTACAACCGACTGATGGAGAAACGTC-GCTAAATCATCGTGNTAAAATTGGGCAGTATGATCAACACTCAGCAGATCAATTAAATCTTAGTGAAACACCAACTGAATATTTACAACGCCTTTTCAATCTAACTTATCAAGATGCTCGAGCAACATTGGGTAAATTTGGTTTAGAAGCTCATGCCCATACTATTCCTAATGCTGACCTGTCAGGTGGACAACGTCCTCGTGTTGCTTTTGCTGATG]

[+] EMBL CD130570             [CCGNNGCCGCCATGGCGGTCCGCGGGNAATTCGATTACTGCGAACCGGCTTCTTACTACTAGACGAACCGACGAATCATTTAGATTTGAATGCAGTTATATGGTTAGATAATTATCTTCAAAGATGGAAGAAAACTCTCCTGATTGTTTCACATGACCAGTCATTCTTAGATAATGTTTGTACAGATATCATATCCATTTAGACCAACGTCAGTTATTTTATTATAGAGGCAATTATAATAACTTCAAAAGTATGTTTATCCAACGTAGAAAAGAACAATTGAAAGAATATGAAAAACAAGAAAAACGTCTTAAAGAATTAAAACAATCTGGAATGAGTAATAAACAAGCTCAAGCAAAAAATCAACGTGATGTATTAACAAGAAAACAGGCGAAAAATAAGCAAACTTCCAATGAAGCTAATGATAATGGAAAACCACAATTATTATNACTAAACCAAAGGAGTATGTTGTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD156885             [                                                                        GAATCATTTAGATTTGAATGCAGTTATATGGTTAGATAATTATCTTCAAAGATGGAAGAAAACTCTCCTGATTGTTTCGCACGACCAGTCATTCTTAGATAATGTTTGTACAGATATC  ATCCATTTAGACCAACGTCAGTTATTTTATTATAGAGGCAATTATAATAACTTCAAAAGTATGTTTATCCAACGTAGAAAAGAACAATTGAGAGAATATGAAAAACAAGAAAAACGTCTTAAAGAATTAAAACAATCTGGAATGAGTAATAAACAAGCTCAAGCAAAAAATCAACGTGATGTATTAACAAGAAAACAGGCGAAAAATAAGCAAACTTCCAATGAAGCTAATGATAATGGAAAACCACAATTATTAT  CTAAACCAAAGGAGTATGTTGTTAAGTTCACGTTTCCAAATCCAACTCCTATTTCTCCTCCTAAACTCGGTTTATACAGTGTAACTTTTGCTTATCCAAACCAAAAACCTTTGTTTAAAGAATTGAACTTTGGCATAGATATGACTTCTAGAATTTCAATTGTTGGTCCTAATGGTGTTGGAAAATCTACCTTTTTAAAACTACTTACGGGTGAAGTACAACCGACTGATGGAGAAACGTC GCTAAATCATCGTGNTAAAATTGGGCAG                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD118838             [                                                                                 AGATTTGAATGCAGTTATATGGTTAGATAATTATCTTCAAAGATGGAAGAAAACTCTCCTGATTGTTTCACATGACCAGTCATTCTTAGATAATGTTTGTACAGATATC  ATCCATTTAGACCAACGTCAGTTATTTTATTATAGAGGCAATTATAATAACTTCAAAAGTATGTTTATCCAACGTAGAAAAGAACAATTGAAAGAATATGAAAAACAAGAAAAACGTCTTAAAGAATTAAAACAATCTGGAATGAGTAATAAACAAGCTCAAGCAAAAAATCAACGTGATGTATTAACAAGAAAACAGGCGAAAAATAAGCAAACTTCCAATGAAGCTAATGATAATGGAAAACCACAATTATTAT  CTAAACCAAAGGAGTATGTTGTTAAGTTCACGTTTCCAAATCCAACTCCTATTTCTCCTCCTATACTCGGTTTATACAGTGTAACTTTTGCTTATCCAAACCAAAAACCTTTGTTTAAAGAATTGAACTTTGGCATAGATATGACTTCTAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD156884             [                                                                                 AGATTTGAATGCAGTTATATGGTTAGATAATTATCTTCAAAGATGGAAGAAAACTCTCCTGATTGTTTCACATGACCAGTCATTCTTAGATAATGTTTGTACAGATATC  ATCCATTTAGACCAACGTCAGTTATTTTATTATAGAGGCAATTATAATAACTTCAAAAGTATGTTTATCCAACGTAGAAAAGAACAATTGAAAGAATATGAAAAACAAGAAAAACGTCTTAAAGAATTAAAACAATCTGGAATGAGTAATAAACAAGCTCAAGCAAAAAATCAACGTGATGTATTAACAAGAAAACAGGCGAAAAATAAGCAAACTTCCAATGAAGCTAATGATAATGGAAAACCACAATTATTAT  CTAAACCAAAGGAGTATGTTGTTAAGTTCACGTTTCCAAATCCAACTCCTATTTCTCCTCCTATACTCGGTTTATACAGTGTAACTTTTGCTTATCCAAACCAAAAACCTTTGTTTAAAGAATTGAACTTTGGCATAGATATGACTTCTAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD157030             [                                                                                  GATTTGAATGCAGTTATATGGTTAGATAATTATCTTCAAAGATGGAAGAAAACTCTCCTGATTGTTTCACATGACCAGTCATTCTTAGATAATGTTTGTACAGATATC  ATCCATTTAGACCAACGTCAGTTATTTTATTATAGAGGCAATTATAATAACTTCAAAAGTATGTTTATCCAACGTAGAAAAGAACAATTGAAAGAATATGAAAAACAAGAAAAACGTCTTAAAGAATTAAAACAATCTGGAATGAGTAATAAACAAGTTCAAGCAAAAAATCAACGTGATGTATTAACAAGAAAACAGGCGAAAAATAAGCAAACTTCCAATGAAGCTAATGATAATGGAAAACCACAATTATTAT  CTAAACCAAAGGAGTATGTTGTTAAGTTCACGTTTCCAAATCCAACTCCTATTTCTCCTCCTATACTCGGTTTATACAGTGTAACTTTTGCTTATCCAAACCAAAAACCTTTGTTTAAAGAATTGAACTTTGGCATAGAGATAACTTCTAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD156867             [                                                                                    TTTGAATGCAGTAATATGG TAAATAAATATCTTCAAAGATGGAAGAAAACTCTCCTGATTGTTTCACATGACCAGTCATTCTTAGATAATGTTTGTACAGATATC  ATCCATTTAGACCAACGTCAGTTATTTTATTATAGAGGCAATTATAATAACTTCAAAAGTATGTTTATCCAACGTAGAAAAGAACAATTGAAAGAATATGAAAAACAAGAAAAACGTCTTAAAGAATTAAAACAATCTGGAATGAGTAATAAACAAGCTCAAGCAAAAAATCAACGTGATGTATTAACAAGAAAACAGGCGAAAAATAAGCAAACTTCCAATGAAGCTAATGATAATGGAAAACCACAATTATTAT  CTAAACCAAAGGAGTATGTTGTTAAGTTCACGTTTCCAAATCCAACTCCTATTTCTCCTCCTATACTCGGTTTATACAGTGTAACTTTTGCTTATCCAAACCAAAAACCTTTGTTTAAAGAATTGAACTTTGGCATAGATATGACTTCTAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL AI975005             [                                                                                                                                                                                                                                                           TATGTTTATCCAACGTAGAAAAGAACAATTGAAAGAATATGAAAAACAAGAAAAACGTCTTAAAGAATTAAAACAATCTGGAATGAGTAATAAACAAGCTCAAGCAAAAAATCAACGTGATGTATTAACAAGAAAACAGGCGAAAAATAAGCAAACTTCCAATGAAGCTAATGATAATGGAAAACCACAATTATTAT  CTTAACCAAAGGAGTATGTTGTTAAGTTCACGTTTCCAAATCCAACTCCTATTTCTCCTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD064197             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             accattcAACTTTTGCTTATCCAAACCAAAAACCTTTGTTTAAAGAATTGAACTTTGGCATAGATATGACTTCTAGAATTTCAATTGTTGGTCCTAATGGTGTTGGAAAATCAACCTTTTTAAAACTACTTACGGGTGAAGTACAACCGACTGATGGAG AACGTCGGTTAAATCATCGTGTTAAAATTGGCAAGTATGATCAACACTCAGCAGATCAATTAAATCTTAGTGAAACACCAACTGAATATTTACAACGCCTTTTCAATCTAACTTATCAAGATGCTCGAGCAACATTGGGTAAATTTGGTTTAGAAGCTCATGCCCATACTATTCCTAATGCTGACCTGTCAGGTGGACAACGTCCTCGTGTTGCTTTTGCTGATG]


>consensus_9129#0 CCGNNGCCGCCATGGCGGTCCGCGGGNAATTCGATTACTGCGAACCGGCTTCTTACTACT AGACGAACCGACGAATCATTTAGATTTGAATGCAGTTATATGGTTAGATAATTATCTTCA AAGATGGAAGAAAACTCTCCTGATTGTTTCACATGACCAGTCATTCTTAGATAATGTTTG TACAGATATCATCCATTTAGACCAACGTCAGTTATTTTATTATAGAGGCAATTATAATAA CTTCAAAAGTATGTTTATCCAACGTAGAAAAGAACAATTGAAAGAATATGAAAAACAAGA AAAACGTCTTAAAGAATTAAAACAATCTGGAATGAGTAATAAACAAGCTCAAGCAAAAAA TCAACGTGATGTATTAACAAGAAAACAGGCGAAAAATAAGCAAACTTCCAATGAAGCTAA TGATAATGGAAAACCACAATTATTATCTAAACCAAAGGAGTATGTTGTTAAGTTCACGTT TCCAAATCCAACTCCTATTTCTCCTCCTATACTCGGTTTATACAGTGTAACTTTTGCTTA TCCAAACCAAAAACCTTTGTTTAAAGAATTGAACTTTGGCATAGATATGACTTCTAGAAT TTCAATTGTTGGTCCTAATGGTGTTGGAAAATCTACCTTTTTAAAACTACTTACGGGTGA AGTACAACCGACTGATGGAGAAACGTCGCTAAATCATCGTGNTAAAATTGGGCAGTATGA TCAACACTCAGCAGATCAATTAAATCTTAGTGAAACACCAACTGAATATTTACAACGCCT TTTCAATCTAACTTATCAAGATGCTCGAGCAACATTGGGTAAATTTGGTTTAGAAGCTCA TGCCCATACTATTCCTAATGCTGACCTGTCAGGTGGACAACGTCCTCGTGTTGCTTTTGC TGATG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)