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Schistosoma mansoni
cluster # 9187 cluster # 9187       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9187#0 length = 1062 sequences # 8  

consensusID : consensus_9187#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 1062
fasta sequence
                              [AACGCAGGTTTTTGTGACTGTGATTCGTAGTTAAGTGAATGAGTAGCATTTAGCATTGAAGATGATGATGGAGAAGGTGCGCTAACCGTTGAACCAACAGATTTTACATGCGTATTCAACGTCAAATCAGTAGTCGATGAAGTTAAACGAGTTTCATTCGTTGAACAAATTGAATTCACACAACAAACAGGTGTTTTCTGTAGATCAGAATTTGTTCGCATAGTTGAACTGGATGTAGAATTCGATCCAGTCAGTAACCATGATAAAGCTGATGATGATGACGGTGCTCTTGTCAAATATGATCGAAATAGTTGTTTGGATTTTTGTTCAGCAGATGATTTACATGGTACAAACAGTATTGGGTTTTTTTGAATCAAGAGCAACCGGATGGTGAGATTTATTGTCAAGCACAGGTAATACTAACTTATTTGAATGATCAGGTAAAGTGAGATATATTGGTACATCATGATTGTTGTCATGATCAGGTGACTTAAGATTAGGATCAATACGTGTACATTCTGTAACATTGAATAATGGACAAGAAGGATTAGGAAATGTTTCCATAGCATCCATTTCTGCTTCACTCGGGACATGTTCATTTGCATTGATAATAGCTATCGCATAACCTTGTTCATGTGCTTTTTTGACTAAAGATATTTGACTGCCAGACTGTAGACCATGTTGAGGATGTAATAGAAGACGTGGAGCCCAAACACCAGCCTGAGCAATTCCACCACCTTGTAATAAAATAATGATGGGACCTTTATGGGTAAAAAAATTTTTAGAATGTAAAACTCTCATACAGTGAGTAGGATGTCCAGGAATCGGAATTTGACTTGATTCCATATTTAAAGCAAATAAACGTTGACGAATTAAGCGTGTACAAATTGCACGAATAATTTCTTGTCTTTTAAGTGATGGGCCTGTTGAAGTTACCTTTACACAGAATGTGTCTCCTGTTTGAATATGACGAAGAATACCTTCCGAATCANAATCGAAACAAAAATCTGAAATTTGGTGATAAATGGGTCGAACTAGTTCAATTCGACTAGGTAAGCTTGT]

[+] EMBL CD117542             [AACGCAGGTTTTTGTGACTGTGATTCGTAGTTAAGTGAATGAGTAGCATTTAGCATTGAAGATGATGATGGAGAAGGTGCGCTAACCGTTGAACCAACAGATTTTACATGCGTATTCAACGTCAAATCAGTAGTCGATGAAGTTAAACGAGTTTCATTCGTTGAACAAATTGAATTCACACAACAAACTGGTGTTTTCTGTAGATCAGAATTTGTTCGCATAGTTGAACTGGATGTAGAATTCGATCCAGTCAGTAACCATGATAAAGCTGATGATGATGACGGTGCTCTCGTCAAATATGATCGAAATAGTTGTTTGGATTTTTGTTCAGCAGATGATTTACATGGTACAAACAGTATTGGGTTTTTTTGAATCAAGAGCAACCGGATGGTGAGATTTATTGTCAAGCACAGGTAATACTAACTTATTTGAATGATCAGGTAAAGTGAGATATATTGGTACATCATGATTGTTGTCATGATCAGGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD116634             [AACGCAGGTTTTTGTGACTGTGATTCGTAGTTAAGTGAATGAGTAGCATTTAGCATTGAAGATGATGATGGAGAAGGTGCGCTAACCGTTGAACCAACAGATTTTACATGCGTATTCAACGTCAAATCAGTAGTCGATGAAGTTAAACGAGTTTCATTCGTTGAACAAATTGAATTCACACAACAAACAGGTGTTTTCTGTAGATCAGAATTTGTTCGCATAGTTGAACTGGATGTAGAATTCGATCCAGTCAGTAACCATGATAAAGCTGATGATGATGACGGTGCTCTTGTCAAATATGATCGAAATAGTTGTTTGGATTTTTGTTCAGCAGATGATTTACATGGTACAAACAGTATTGGGTTTTTTTGAATCAAGAGCAACCGGATGGTGAGATTTATTGTCAAGCACAGGTAATACTAACTTATTTGAATGATCAGGTAAAGTGAGATATATTGGTACATCATGATTGTTGTCATGATCAGGTGACTTAAGATTAGGATCAATACGTGTACATTCTGTAACATTGAATAATGGACAAGAAGGATTAGGAAATGTTTCCATAGCATCCATTTCTGCTTCACTCGGGACATGTTCATTTGCATTGATAATAGCTATCGCATAACCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD117384             [AACGCAGGTTTTTGTGACTGTGATTCGTAGTTAAGTGAATGAGTAGCATTTAGCATTGAAGATGATGATGGAGAAGGTGCGCTAACCGTTGAACCAACAGATTTTACATGCGTATTCAACGTCAAATCAGTAGTCGATGAAGTTAAACGAGTTTCATTCGTTGAACAAATTGAATTCACACAACAAACTGGTGTTTTCTGTAGATCAGAATTTGTTCGCATAGTTGAACTGGATGTAGAATTCGATCCAGTCAGTAACCATGATAAAGCTGATGATGATGACGGTGCTCTCGTCAAATATGATCGAAATAGTTGTTTGGATTTTTGTTCAGCAGATGATTTACATGGTACAAACAGTATTGGGTTTTTTTGAATCAAGAGCAACCGGATGGTGAGATTTATTGTCAAGCACAGGTAATACTAACTTATTTGAATGATCAGGTAAAGTGAGATATATTGGTACATCATGATTGTTGTCATGATCAGGTGACTTAAGATTAGGATCAATACGTGTACATTCTGGTACATTGAATAATGGACAAGAAGGATTAGGAAATGTTTCCATAGCATCCATTTCTGCTTCACTCGGGACATGTTCATTTGCATTGATAATAGCTATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD116743             [AACGCAGGTTTTTGTGACTGTGATTCGTAGTTAAGTGAATGAGTAGCATTTAGCATTGAAGATGATGATGGAGAAGGTGCGCTAACCGTTGAACCAACAGATTTTACATGCGTATTCAACGTCAAATCAGTAGTCGATGAAGTTAAACGAGTTTCATTCGTTGAACAAATTGAATTCACACAACAAACAGGTGTTTTCTGTAGATCAGAATTTGTTCGCATAGTTGAACTGGATGTAGAATTCGATCCAGTCAGTAACCATGATAAAGCTGATGATGATGACGGTGCTCTTGTCAAATATGATCGAAATAGTTGTTTGGATTTTTGTTCAGCAGATGATTTACATGGTACAAACAGTATTGGGTTTTTTTGAATCAAGAGCAACCGGATGGTGAGATTTATTGTCAAGCACAGGTAATACTAACTTATTTGAATGATCAGGTAAAGTGAGATATATTGGTACATCATGATTGTTGTCATGATCAGGTGACTTAAGATTAGGATCAATACGTGTACATTCTGTAACATTGAATAATGGACAAGAAGGATTAGGAAATGTTTCCATAGCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD117677             [ ACGCAGGTTTTTGTGACTGTGATTCGTAGTTAAGTGAATGAGTAGCATTTAGCATTGAAGATGATGATGGAGAAGGTGCGCTAACCGTTGAACCAACAGATTTTACATGCGTATTCAACGTCAAATCAGTAGTCGATGAAGTTAAACGAGTTTCATTCGTTGAACAAATTGAATTCACACAACAAACAGGTGTTTTCTGTAGATCAGAATTTGTTCGCATAGTTGAACTGGATGTAGAATTCGATCCAGTCAGTAACCATGATAAAGCTGATGATGATGACGGTGCTCTTGTCAAATATGATCGAAATAGTTGTTTGGATTTTTGct                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD117614             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTATTTGAATGATCAGGTAAAGTGAGATATATTGGTACATCATGATTGTTGTCATGATCAGGTGACTTAAGA TAGGATCAATACGTGTACATTCTGTAACATTGAATAATGGACAAGAAGGATTAGGAAATGTTTCCATAGCATCCATTTCTGCTTCACTCGGGACATGTTCATTTGCATTGATAATAGCTATCGCATAACCTTGTTCATGTGCTTTTTTGACTAAAGATATTTGACTGCCAGACTGTAGACCATGTTGAGGATGTAATAGAAGACGTGGAGCCCAAACACCAGCCTGAGCAATTCCACCACCTTGTAATAAAATAATGATGGGACCTTTATGGGTAAAAAAATTTTTAGAATGTAAAACTCTCATACAGTGAGTAGGATGTCCAGGAATCGGAATTTGACTTGATTCCATATTTAAAGCAAATAAACGTTGACGAATTAAGCGTGTACAAATTGCACGAATAATTTCTTGTCTTTTAAGTGATGGGCCTGTTGAAGTTACCTTTACACAGAATGTGTCTCCTGTTTGAATATGACGAAGAATACCTTCCGAATCANAATCGAAACAAAAATCTGAAATTTGGTGATAAATGGGTCGAACTAGTTCAATTCGACTAGGTAAGCTTGT]
[+] EMBL CD117517             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTATTTGAATGATCAGGTAAAGTGAGATATATTGGTACATCATGATTGTTGTCATGATCAGGTGACTTAAGA TAGGATCAATACGTGTACATTCTGTAACATTGAATAATGGACAAGAAGGATTAGGAAATGTTTCCATAGCATCCATTTCTGCTTCACTCGGGACATGTTCATTTGCATTGATAATAGCTATCGCATAACCTTGTTCATGTGCTTTTTTGACTAAAGATATTTGACTGCCAGACTGTAGACCATGTTGAGGATGTAATAGAAGACGTGGAGCCCAAACACCAGCCTGAGCAATTCCACCACCTTGTAATAAAATAATGATGGGACCTTTATGGGTAAAAAAATTTTTAGAATGTAAAACTCTCATACAGTGAGTAGGATGTCCAGGAATCGGAATTTGACTTGATTCCATATTTAAAGCAAATAAACGTTGACGAATTAAGCGTGTACAAATTGCACGAATAATTTCTTGTCTTTTAAGTGATGGGCCTGTTGA                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD117689             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TATATTGGTACATCATGATTGTTGTCATGATCAGGTGACTTAAGATTAGGATCAATACGTGTACATTCTGTAACATTGAATAATGGACAAGAAGGATTAGGAAATGTTTCCATAGCATCCATTTCTGCTTCACTCGGGACATGTTCATTTGCATTGATAATAGCTATCGCATAACCTTGTTCATGTGCTTTTTTGACTAAAGATATTTGACTGCCAGACTGTAGACCATGTTGAGGATGTAATAGAAGACGTGGAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]


>consensus_9187#0 AACGCAGGTTTTTGTGACTGTGATTCGTAGTTAAGTGAATGAGTAGCATTTAGCATTGAA GATGATGATGGAGAAGGTGCGCTAACCGTTGAACCAACAGATTTTACATGCGTATTCAAC GTCAAATCAGTAGTCGATGAAGTTAAACGAGTTTCATTCGTTGAACAAATTGAATTCACA CAACAAACAGGTGTTTTCTGTAGATCAGAATTTGTTCGCATAGTTGAACTGGATGTAGAA TTCGATCCAGTCAGTAACCATGATAAAGCTGATGATGATGACGGTGCTCTTGTCAAATAT GATCGAAATAGTTGTTTGGATTTTTGTTCAGCAGATGATTTACATGGTACAAACAGTATT GGGTTTTTTTGAATCAAGAGCAACCGGATGGTGAGATTTATTGTCAAGCACAGGTAATAC TAACTTATTTGAATGATCAGGTAAAGTGAGATATATTGGTACATCATGATTGTTGTCATG ATCAGGTGACTTAAGATTAGGATCAATACGTGTACATTCTGTAACATTGAATAATGGACA AGAAGGATTAGGAAATGTTTCCATAGCATCCATTTCTGCTTCACTCGGGACATGTTCATT TGCATTGATAATAGCTATCGCATAACCTTGTTCATGTGCTTTTTTGACTAAAGATATTTG ACTGCCAGACTGTAGACCATGTTGAGGATGTAATAGAAGACGTGGAGCCCAAACACCAGC CTGAGCAATTCCACCACCTTGTAATAAAATAATGATGGGACCTTTATGGGTAAAAAAATT TTTAGAATGTAAAACTCTCATACAGTGAGTAGGATGTCCAGGAATCGGAATTTGACTTGA TTCCATATTTAAAGCAAATAAACGTTGACGAATTAAGCGTGTACAAATTGCACGAATAAT TTCTTGTCTTTTAAGTGATGGGCCTGTTGAAGTTACCTTTACACAGAATGTGTCTCCTGT TTGAATATGACGAAGAATACCTTCCGAATCANAATCGAAACAAAAATCTGAAATTTGGTG ATAAATGGGTCGAACTAGTTCAATTCGACTAGGTAAGCTTGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)