These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9192#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 1217 fasta sequence [ATATGATAGGTATCGGTACGGGTTTTCCGATTTAATGGTCCCCACACTCTACTCGATATCTCACTAGTGTAGTGACTTATTCAAAGGAGTCGGTTAAAGAGATAGGACCATCAAGTTTTCAACACTTCCTATCTCAGAGTATTGCCAGTTGGGATCCAGAACATAGAGCGAACGAAGTTCCGGCTAGTAGTGACTGTCTTCTCCGAATAACTAAAGACTTACGTTCCATTTGCAACGATCCAGCCCCTGGAATATGTGTCGTACCTGACAATGAGGATATGACAGAAATATACGCATTGATCACAGGTCCCTTCGATACACCATATGAAGGTGGTTTTTTCTTGTCTCTTATACGATGTCCACCCGAATATCCACTGATGCCGCCGAAGGTGAAATTAATGACTACTGGGAATGGTACTGTCAGATTTAATCCAAATTTCTATTCCAACGGGAAGGTTTGTCTAAGTGTTCTCGGTACTTGGCAAGGTCCCGAATGGACACCGGCACAAAGCCTATCCTCAGTTTTAATATCAATTCAATCTCTGATGAACGATAAACCGTATTTTAATGAGCCTGGATTCACCACTGAACGTAGCCCGGGTGATGCTCAACAATACAATGCAATAATTACACATGAAACTATTCGATGTGCAGTTTGTGATGTATTAGAGCGTCGTACAACATTTCCTTCAGATTTATACGCGGTAGTAGAATCTAGTTTTGAGGATTATTACGAATATTATATTAGCGTTTGTGAACGAAATATGCATTTGTCAGGTCAACCTATGGTTGATCCTTTCGAAGATGGACGAGGAATTTTCGATTATGCCAGTCTATTAAAGCGTTTAAAGGCTTTAAACAGTCAATTAAAACAAAGGCATTCTGGAACAGACGACGCCAATGTGAGGGGCATGTCCAGAGAAGACAAATGACTATCTATACAGTCATAACAATGAATTCTGGACTACAAATGACTACTAATCCGGAAGAACATGTGGGATGTTTTGTTGTATATCACCAAGTTTATCTTAAGTCTAGTTAACTTTATTCCTATCACTTTTTCTTTCCAAGTGTCTCCCTTTTGATAAAGTAAACATTTATCTTGATCTATCCACTTTAATTTGATTGTTTTCCATTCTCCTTTACGATTTTATTTTCTCATTTTGTTATTACTGTTATTGCTTATGAAGTGCGAAATGATGTTGAACATGTGTAAA] [+] EMBL CD150207 [ATATGATAGGTATCGGTACGGGTTTTCCGATTTAATGGTCCCCACACTCTACTCGATATCTCACTAGTGTAGTGACTTATTCAAAGGAGTCGGTTAAAGAGATAGGACCATCAAGTTTTCAACACTTCCTATCTCAGAGTATTGCCAGTTGGGATCCAGAACATAGAGCGAACGAAGTTCCGGCTAGTAGTGACTGTCTTCTCCGAATAACTAAAGACTTACGTTCCATTTGCAACGATCCAGCCCCTGGAATATGTGTCGTACCTGACAATGAGGATATGACAGAAATATACGCATTGATCACAGGTCCCTTCGATACACCATATGAAGGTGGTTTTTTCTTGTCTCTTATACGATGTCCACCCGAATATCCACTGATGCCGCCGAAGGTGAAATTAATGACTACTGGGAATGGTTCTGTCAGATTTAATCCAAATTTCTATTCCAACGGGAAGGTTTGTCTAAGTGTTCTCGGTACTTGGCAAGGTCCCGAATGGACACCGGCACAAAGCCTATCCTCAGTTTTAATATCAATTCAATCTCTGATGAACGATAAACCGTATTTTAATGAGCCTGGA ] [+] EMBL CD094833 [ GATAGGTATCGGTACGGGTTTTCCGATTTAATGGTCCCCACACTCTACTCGATATCTCACTAGTGTAGTGACTTATTCAATGGAGTCGGTTAAAGAGATAGGACCATCAAGTTTTCAACACTTCCTATCTCAGAGTATTGCCAGTTGGGATCCAGAACATAGAGCGAACGAAGTTCCGGCTAGTAGTGACTGTCTTCTCCGAATAACTAAAGACTTACGTTCCATTTGCAA ] [-] EMBL CD135788 [ TCCACTGATGCCGCCGAAGGTGAAATTAATGACTACTGGGAATGGTACTGTCAGATTTAATCCAAATTTCTATTCCAACGGGAAGGTTTGTCTAAGTGTTCTCGGTACTTGGCAAGGTCCCGAATGGACACCGGCACAAAGCCTATCCTCAGTTTTAATATCAATTCAATCTCTGATGAACGATAAACCGTATTTTAATGAGCCTGGATTCTCCACTGACCGTAGCCCGGGTGATGCTCAACAATACAATGCAATAATTACACATGAAACTATTCGATGTGCAGTTTGTGATGTATTAGAGCGTCGTACAACATTTCCTTCAGATTTATACGCGGTAGTAGAATCTAGTTTTGAGGATTATTACGAATATTATATTAGCGTTTGTGAACGAAATATGCATTTGTCAGGTCAACCTATGGTTGA ] [+] EMBL CD118280 [ CACTGATGCCGCCGAAGGTGAAATTAATGACTACTGGGAATGGTACTGTCAGATTTAATCCAAATTTCTATTCCAACGGGAAGGTTTGTCTAAGTGTTCTCGGTACTTGGCAAGGTCCCGAATGGACACCGGCACAAAGCCTATCCTCAGTTTTAATATCAATTCAATCTCTGATGAACGATAAACCGTATTTTAATGAGCCTGGATTCACCACTGAACGTAGCCCGGGTGATGCTCAACAATACAATGCAATAATTA ] [+] EMBL CD078697 [ CTTGCCAAGGTCCCGAATGGACACCGGCACAAAGCCTATCCTCAGTTTTAATATCAATTCAATCTCTGATGAACGATAAACCGTATTTTAATGAGCCTGGATTCACCACTGAACGTAGCCCGGGTGATGCTCAACAATACAATGCAATAATTACACATGAAACTATTCGATGTGCAGTTTGTGATGTATTAGAGCGTCGTACAACATTTCCTTCAGATTTATACGCGGTAGTAGAATCTAGTTTTGAGGATTATTACGAATATTATATTAGCGTTTGTGAACGAAATATGCATTTGTCAGGTCAACCTATGGTTGATCCTTTCGAAGATGGACGAGGAATTTTCGATTATGCCAGTCTATTAACGCGTTTAAAGGCTTTAAACAGTCAATTAAAACAAAGGCATTCTGGAACAGACGACGCCAATGTGAGGGGCATGTCCAGAGAAGACAAATGACTATCTATACAGTCATAACAATGAATTCTGGACTACAAATGACTACTAATCCGGAAGAACATGTGGGATGTTNTGTTGTATATCACCAAGTTTATCTTAAGTCTAGTTAACTTTATTn ] [-] EMBL CD198534 [ CACTGAACGTAGCCCGGGTGATGCTCAACAATACAATGCAATAATTACACATGAAACTATTCGATGTGCAGTTTGTGATGTATTAGAGCGTCGTACAACATTTCCTTCAGATTTATACGCGGTAGTAGAATCTAGTTTTGAGGATTATTACGAATATTATATTAGCGTTTGTGAACGAAATATGCATTTGTCAGGTCAACCTATGGTTGATCCTTTCGAAGATGGACGAGGAATTTTCGATTATGCCAGTCTATTAAAGCGTTTAAAGGCTTTAAACAGTCAATTAAAACAAAGGCATTCTGGAACAGACGACGCCAATGTGAGGGGCATGTCCAGAGAAGACAAATGACTATCTATACAGTCATAACAATGAATTCTGGACTACAAATGACTACTAATCCGGAAGAACATGTGGGATGTTTTGTTGTATATCACCAAGTTTATCTTAAGTCTAGTTAACTTTATTCCTA ] [-] EMBL CD198432 [ ATTATTACGAATATTATATNAGCGTTTGTGAACGAAATATGCATTTGTCAGGTCAACCTATGGTTGATCCTTTCGAAGATGGACGAGGAATTTTCGATTATGCCAGTCTATTAAAGCGTTTAAAGGCTTTAAACAGTCAATTAAAACAAAGGCATTCTGGAACAGACGACGCCAATGTGAGGGGCATGTCCAGAGAAGACAAATGACTATCTATACAGTCATAACAATGAATTCTGGACTACAAATGACTACTAATCCGGAAGAACATGTGGGATGTTTTGTTGTATATCACCAAGTTTATCTTAAGTCTAGTTAACTTTATTCCTA ] [+] EMBL CD136737 [ CTGGAACAGACGACGCCAATGTGAGGGGCATGTCCAGAGAAGACAAATGACTATCTATACAGTCATAACAATGAATTCTGGACTACAAATGACTACTAATCCGGAAGAACATGTGGGATGTTTTGTTGTATATCACCAAGTTTATCTTAAGTCTAGTTAACTTTATTCCTATCACTTTTTCTTTCCAAGTGTCTCCCTTTTGATAAAGTAAACATTTATCTTGATCTATCCACTTTAATTTGATTGTTTTCCATTCTCCTTTACGATTTTATTTTCTCATTTTGTTATTACTGTTATTGCTTATGAAGTGCGAAATGATGTTGAACATGTGTAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||