These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9293#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 1402 fasta sequence [ACAAAAGGTCGCTCAGCGTGTCGTGTTGTTTCCAAAACAGAGTAACCCAGGAAGCCAACTTATTTGGCGTGGTGGTTGTTTGCAAAGCATTTTGAGTGATGTGCCAAGTCAAAATACTCAGTCCAGTGTTGGGCAGCTAGGTAACAGCTTTGGAGAAACCTTACAAAGAAAGATAGTTAACATAAACCCTTTTGAGGACAAACCCTTATCTTTGTCATTGCCATCGGTTTGGAATCAAAATCAGCAGGATCCTACTAGAGATGGAATCTGTTCCTTAAGTTCGAAAAACAAAAACTTAAAGAGACCTAGGAATGAGTTCAATCCTAATAATCCTGAAGGTAACAGTGATTCATCTGAGGAAAAATCATCTACAAAAGTCTCAGTAACCAAACCTCGCATTCGGGCACAAACGAAACGTTCAGGGCGGCGAAATGCTCCAAAACCTGTACAACAACCTCTCCTCCTAACCTTGCGACCTTTTCATCCACCTGGAAACTTGTTACTTCCTGCACTTGATCTAATGTCTAAGTTTGATGGCTTAGTTTCATTTGAAAATGAAAAGTTAGTAACAAATAACACTTCGAGTGGTTTATCAACTATCAACGAAGAAAATGTTGACGAGACATCAACAACAGTTAGTGCTTGTGTATCAACTACCGGTCGGATGAAAAGTAGCGCAGGAATAAATGATATCGACTTTGAGGAATTTAAGCATTATAGACGTCTCAACGGGTATTCACTTTTCGTACATGTCAATAAGAAAAAATATGAATCATTTCCAGGCTCGACACCCGTTGATGATACAAATGATTCCAATGATAACATACAAACTGGCCTTGGTACCTCCAGTTCAGGAAAAGAAAACCAGAAGTCCAATCGTAGATGGCAGGCTTTATGGTTAACTGTGCCAGAAAAAGTTAAACGTGAATGGAAAAACAAGGCAAAACGTCTTTTAAAACAAATTGAACAGCATGGAAAACGGGAAGTTATATCTGAAGATAGAAAATTAAGAGAACGTGATCGTTTGGAAGTTCAACTCAGTCGCACACAAACAACATTTTATAGTTTGCTTGATCTGGCCGCTCATTTCCAGCTTTTGTGTGATCGATTCGCAACATTTTCTAAAAGTGTTAATGATTATGAGGGACCAGTTGACCCTGTAGGTGTAGAGTCGTTACTACTCGATGGTTTATTAACATGTTTAATCCCATTGATTGCACTAACAAATGAATTGGAGCCATTCACAGAAGTTCCTGATCGTAAAACTATGTGTGACGCTTTAACCAATTTAACTTTTATCGCTCCATTTTAAAATATGGAAATTTAATACATTCATATAAAGTTTTGTAAATATATCCATGTTATCCCATTTTAAATGTAGAATAATTGTGTAAATAAACTT] [+] EMBL CD081119 [ACAAAAGGTCGCTCAGCGTGTCGTGTTGTTTCCAAAACAGAGTAACCCAGGAAGCCAACTTATTTGGCGTGGTGGTTGTTTGCAAAGCATTTTGAGTGATGTGCCAAGTCAAAATACTCAGTCCAGTGTTGGGCAGCTAGGTAACAGCTTTGGAGAAACCTTACAAAGAAAGATAGTTAACATAAACCCTTTTGAGGACAAACCCTTATCTTTGTCATTGCCATCGGTTTGGAATCAAAATCAGCAGGATCCTACTAGAGATGGAATCTGTTCCTTAAGTTCGAAAAACAAAAACTTAAAGAGACCTAGGAATGAGTTCAATCCTAATAATCCTGAAGGTAACAGTGATTCATCTGAGGAAAAATCATCTACAAAAGTCTCAGTAACCAAACCTCGCATTCGGGCACAAACGAAACGTTCAGGGCGGCGAAATGCTCCAAAACCTGTACAACAACCTCTCCTCCTAACCTTGCGACCTTTTCATCCACCTGGAAACTTGTTACTTCCTGCACTTGATCTAATGTCTAAGTTTGATGGCTTAGTTTCATTTGAAAATGAAAAGTTAGTAACAAATAACACTTCGAGTGGTTTATCAACTATCAACGAAGAAAATGTTGACGAGACATCAACAACAGTTAGTGCTTGTGTATCAACTACCGGTCGGATGAAAAGTAGCGCAGGAAT AATGATATCGACTTTGAGGAA ] [-] EMBL CD149357 [ ttTTGGTAATGGCCATCGGTTTGGAATCAAAATCAGCAGGATCCTACTAGAGATGGAATCTGTTCCTTAAGTTCGAAAAACAAAAACTTAAAGAGACGTAGGAATGAGTTCAATCCTAATAATCCTGAAGGTAACAGTGATTCATCTGAGGAAAGATCAT ] [-] EMBL CD149209 [ CGAAAACCAAAAATTTAAAGAGACCTAGGAATGAGTTCAATCCTAATAATCCTGAAGGTAACAGTGATTCATCTGAGGAAAAATCAT ] [-] EMBL CD113853 [ AGTTAGTAACAAATAACACTTCGAGTGCTTTATCAACTATCAACGAAGAAAATGTTGACGAGACATCAACAACAGTTAGTGCTTGTGTATCAGCTACCGGTCGGATGAAAAGTAGCGCAGGAATAAATGATATCGACTTAGAGGAATTTAAGCATTATAGACGTCTCAACGGGTATTCACTTTTCGTACATGTCAATAAGAAAAAATATGAATCATTTCCAGGCTCGACACCCGTTGATGATACAAATGATTCCAATGATAACATACAAACTGGCCTTGGTACCTCCAGTTCAGGAAAAGAAAACCAGAAGTCCAATCGTAGATGGCAGGCTTTATGGTTAACTGTGCCAGAAAAAGTTAAACGTGAATGGAAAAACAAGGCAAAACGTCTTTTAAAACAAATTGAACAGCATGGAAAACGGGAAGTTATATCTGAAGATAGAAAATTAAGAGAACGTGATCGTTTGGAAGTTCTAATCAATGGCACACATAC ] [+] EMBL CD164315 [ AATGTTGACGAGACATCAACAACAGTTAGTGCTTGTGTATCAACTACCGGTCGGATGAAAAGTAGCGCAGGAATAAATGATATCGACTTTGAGGAATTTAAGCATTATAGACGTCTCAATGGGTATTCACTTTTCGTACATGTCAATAAGAAAAAATATGAATCATTTCCAGGCTCGACACCCGTTGATGATACAAATGATTCCAATGATAACATACAAACTGGCCTTGGTACCTCCAGTTCAGGAAAAGAGAACCAGAAGTCCAATCGT ] [+] EMBL CD164219 [ GACATCAACAACAGTTAGTGCTTGTGTATCAACTACCGGTCGGATGAAAATTTGCGCAGGAGTAAATGATATGGACTTTGAGGAATTga ] [-] EMBL CD113733 [ AGTAGCGCAGGAATAAATGATATCGACTTTGAGGAATTTAAGCATTATAGACGTTTCAACGGGTATTCACTTTTCGTACATGTC ] [-] EMBL CD074941 [ CTCAATGGGTATTCACTTTTCGTACATGTCAATAAGAAAAAATATGAATCATTTCCAGGCTCGACACCCGTTGATGATACAAATGATTCCAATGATAACATACAAACTGGCCTTGGTACCTCCAGTTCAGGAAAAGAAAACCAGAAGTCCAATCGTAGATGGCAGGCTTTATGGTTAACTGTGCCAGAAAAAGTTAAACGTGAATGGAAAAACAAGGCAAAACGTCTTTTAAAACAAATTGAACAGCATGGAAAACGGGAAGTTATATCTGAAGATAGAAAATTAAGAGAACGTGATCGTTTGGAAGTTCAACTCAGTCGCACACAAACAACATTTTATAGTTTGCTTGATCTGGCCGCTCATTTCCAGCTTTTGTGTGATCGATTCGCAACATTTTCTAAAAGTGTTAATGATTATGAGGGACCAGTTGACCCTGTAGGTGTAGAGTCGTTACTACTCGATGGTTTATTAACATGTTTAATCCCATTGATTGCACTAACAAATGAATTGGAGCCATTCACAGAAGTTCCTGATCGTAAAACTATGTGTGACGCTTTAACCAATTTAACTTTTATCGCTCCATTTTAAAATATGGAAATTTAATACATTCATATAAAGTTTTGTAAATATATCCATGTTATCCCATTTTAAATGTAGAATAATTGTGTAAATAAACTT] [+] EMBL CD158518 [ CCAATCGTAGATGGCAGGCTTTATGGTTAACTGTGCCAGAAAAAGTTAAACGTGAATGGAAAAACAAGGCAAAACGTCTTTTAAAACAAATTGAACAGCATGGAAAACGGGAAGTTATATCTGAAGATAGAAAATTAAGAGAACGTGATCGTTTGGAAGTTCAACTCAGTCGCACACAAACAACATTTTATAGTT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||