Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 9325 cluster # 9325       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9325#0 length = 1308 sequences # 9  

consensusID : consensus_9325#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 1308
fasta sequence
                              [AATTGAATTTGCGAGGGTGAGGATTGAATACAAGTATGTCGATTGTAAAATAAAGTCTTACAAATTGTTTTCTTTATTTCTGTATATAAATCAATGATGAGAGTTTGGGTAGTCTCTTTTGACAAGTTTTATTTTACGTACTTTCCAGGAGAAATTTCATGTTACAATAATTCATCAGAGATCTATGCATCTTGTTGTTCACATGATAAAGTTTCATTGATGGGTGAAGATAATGCATTTAAGTTATGGTTAGTGTCAGGAGTAGTATTCATCAGATCTGATTGTGAGATTGGTGAGGTATGATATTGTTGATGGTGTGATTGCTGTTGGATTTCTGGTGTTCCACCATTTGAACTGATTGTATGATCATTTAGACCATTATTACCATTATTATTATTACTATCAGGATTCATATTTGTCCATAAAGGTGGCAAACTTTCATTTGTACTACTAGGATGAATTATATTATTATTGTAAGATGTAGGAGTATTAGAGCGTGAACTATGGTTTTTAACCGAAATTATTGATTTATTTAAATTCATGTGATCATTTTGATTTTGTGTCGATATTATTCCTGTTGACTGCACTGATGAAGTGACTTGACGTTGAGGTGAGGTTATTGCTGAAGAACAAGAGTATTGAGATGATTGTAAAGCAGATACTTGACTTC---GTTGTTGTTGTTGTTGAGGTGATGGCACCAAGTAGTTTGTTGAAAGCATTTGCGTAGAAGAAGGAGAACAATCTCTGGAATTTGAATATGCATTCGAATTGGATGGATTATAGGTTA-TTGAATTATCATGATAATTAAATTGTCCAGAAAATGG--ATGTGACTGATTATTTAAAGGTGAATCAGAATTCGATGACAAATTTGTAGTTGACGAATAAGATCCTCTCATATGAGATGAATCTGGAATTAAATGTGATTGTTGATGAATTTGATGTTGTGAGTTTTGTTTTTGAGTAACATCGTGTATTTGACCATCAGAAGAACAATGATCAATATTACCTGTTTGAATTCTATTTCCATTACTATTATTGCTATTATTGCAGTAAATCATGTTTTCGTTAATTGAACAAGATGGTATCATGTTGGAAATATCCGATCTATTAATAGATTGATTTGGATAATGATGATGAACAGCTTGTGGAATAGATACTGTTGAAGAACCATAATTTAATGGTGTTGTATTCGTGACATCACCATATGGAATAGCTTGTGGACAAACAGATGAAATATTTGGACATATAGGATATGAATTACCTGTATGTTGAGAAGGATTAGGAAGAGGTGTTAGTGCACCCTGATTG]

[+] EMBL CD161849             [AATTGAATTTGCGAGGGTGAGGATTGAATACAAGTATGTCGATTGTAAAATAAAGTCTTACAAATTGTTCTCTTTATTTCTGTATATAAATCAATGATGAGAGTTTGGGTAGTCTCTTTTGACAAGTTTTATTTTACGTACTTTCCAGGAGAAATTTCATGTTACAATAATTCATCAGAGATCTATGCATCTTGTTGTTCACATGATAAAGTTTCATTGATGGGTGAAGATAATGCATTTAAGTTATGGTTAGTGTCAGGAGTAGTATTCATCAGATCTGATTGTGAGATTGGTGAGGTATGATATTGTTGATGGTGTGATTGCTGTTGGATTTCTGGTGTTCCACCATTTGAACTGATTGTATGATCATTTAGACCATTATTACCATTATTATTATTACTATCAGGATTCATATTTGTCCATAAAGGTGGCAAACCTTCATTTGTACTACTAGGATGAATTATATTATTATTGTAAGATGTAGGAGTATTAGAGCGTGAACTATGGTTTTTAACCGAAATTATTGATTTATTTAAATTCATGTGATCATTNTGATTTTGTGTNGATATTATTCCTGTTGACTGCACTGATGAAGTGACTTGACGTTGAGGTGAGGGTATTGCTGAAGAAC AGA TATTGAGATGATTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD161798             [AATTGAATTTGCGAGGGTGAGGATTGAATACAAGTATGTCGATTGTAAAATAAAGTCTTACAAATTGTTTTCTTTATTTCTGTATATAAATCAATGATGAGAGTTTGGGTAGTCTCTTTTGACAAGTTTTATTTTACGTACTTTCCAGGAGAAATTTCATGTTACAATAATTCATCAGAGATCTATGCATCTTGTTGTTCACATGATAAAGTTTCATTGATGGGTGAAGATAATGCATTTAAGTTATGGTTAGTGTCAGGAGTAGTATTCATCAGATCTGATTGTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD161808             [AATTGAATTTGCGAGGGTGAGGATTGAATACAAGTATGTCGATTGTAAAATAAAGTCTTACAAATTGTTTTCTTTATTTCTGTATATAAATCAATGATGAGAGTTTGGGTAGTCTCTTTTGACAAGTTTTATTTTACGTACTTTCCAGGAGAAATTTCATGTTACAATAATTCATCAGAGATCTATGCATCTTGTTGTTCACATGATAAAGTTTCATTGACGGGTGAGGATTATGCATactggt                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD120850             [                                                                                                                                                                                                                                   AGATAATGCATTTAAGTTATGGTTAGTGTCAGGAGTAGTATTCATCAGATCTGATTGTGAGATTGGTGAGGTATGATATTGTTGATGGTGTGATTGCTGTTGGATTTCTGGTGTTCCACCATTTGAACTGATTGTATGATCATTTAGACCATTATTACCATTATTATTATTACTATCAGGATTCATATTTGTCCATAAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD096656             [                                                                                                                                                                                                                                                                         TATTCATCAGATCTGATTGTGAGATTGGTGAGGTATGATATTGTTGATGGTGTGATTGCTGTTGGATTTTTGGTGTTCCACCATTTGAACTGATTGTATGATCATTTAGACTATTATTACCATTATTATTATTACTATCAGGATTCATATTTGTCCATAAAGGTGGCAAACTTTCATTTGTACTACTAGGATGAATTATATTATTATTGTAAGATGTAGGAGTATTAGAGCGTGAACTATGGTTTTTAACCGAAATTATTGATTTATTTAAATTCATGTGATCATTTTGATTTTGTGTTGATATTATTCCTGTTGACTGCACTGATGAAGTGACTTGACGTTGAGGTGAGGTTATTGCTGAAGAACAAGAGTATTGAGATGATTGTAAAGCAGATACTTGACTTC   GTTGTTGTTGTTGTTGAGGTGATGGCACCAAGTAGTTTGTTGAAAGCATTTGCGTAGAAGAAGGAGAACAGTCTCTGGAATTTGAATATGCATTCGAATTGGATGGATTATAGGTTA TTGAATTATCATGATAATTAAATTGTCCAGAAAATGG  ATGTGACTGATTATTTAAAGGTGAATCAGAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD147225             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TGGATTTCTGGTGTTCCACCATTTGAACTGATTGTATGATCATTTAGACCATTATTACCATTATTATTATTACTGTCAGGATTCATATTTGTCCATAAAGGTGGCAAACTTTCATTTGTACTACTAGGATGAATTATATTATTATTGTAAGATGTAGGAGTATTAGAGCGTGAACTATGGTTTTTAACCGAAATTATTGATTTATTTAAATTCATGTGATCATTTTGATTTTGTGTCGATATTATTCCTGTTGATTGCACTGATGAAGTGACTTGACGTTGAGGTGAGGTTATTGCTGAAGAACAAGAGTATTGAGATGATTGTAAAGCAGATACTTGACTTCGTTGTTGTTGTTGTTGTTGAGGTGATGGCACCAAGTAGTTTGTTGAAAGCATTTGCGTAGAAGAAGGAGAACAATCTCTGGAATTTGAGTATGCATTCGAATTGGATGGATTATAGGTTA TTGAATTATCATGATAATTAAATTGTCCAGAAAATGG  ATGTGACTGATTATTTAAAGGTGAATCAGAATTCGATGACAAATTTGTAGTTGACGAATAAGATCCTCTCATATGAGATGAATCTGGAATTAAATGTGATTGTTGATGAATTTGATGTTGTGAGTTTTGTTTTTGAGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD147203             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TGGATTTCTGGTGTTCCACCATTTGAACTGATTGTATGATCATTTAGACCATTATTACCATTATTATTATTACTGTCAGGATTCATATTTGTCCATAAAGGTGGCAAACTTTCATTTGTACTACTAGGATGAATTATATTATTATTGTAAGATGTAGGAGTATTAGAGCGTGAACTATGGTTTTTAACCGAAATTATTGATTTATTTAAATTCATGTGATCATTTTGATTTTGCGTCGATATTATTCCTGTTGATTGCACTGATGAAGTGACTTGACGTTGAGGTGAGGTTATTGCTGAAGAACAAGAGTATTGAGATGATTGTAAAGCAGATACTTGACTTCGTTGTTGTTGTTGTTGTTGAGGTGATGGCACCAAGTAGTTTGTTGAAAGCATTTGCGTAGAAGAAGGAGAACAATCTCTGGAATTTGAGTATGCATTCGAATTGGATGGATTATAGGTTA TTGAATTATCATGATAATTAAATTGTCCAGAAAATGG  ATGTGACTGATTATTTAAAGGTGAATCAGAATTCGATGACAAATTTGTAGTTGACGAATAAGATCCTCTCATATGAGATGAATCTGGAATTAAATGTGATTGTTGATGAATNTGATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD096423             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AGGTGATGGCACCAAGTAGTTTGTTGAAAGCATTTGCGTAGAAGAAGGAGAACAATCTCTGGAATTTGAATATGCATTCGAATTGGATGGA TATAGGTTATTTGAATTATCATGATAATTAAATTGTCCAGAAAATGG  ATGTGACTGATTATTTAAAGGTGAATCAGAATTCGATGTCAAATTTGTAGTTGACGAATAAGATCCTCTCATATGAGATGAATCTGGAATTAAATGTGATTGTTGATGAATTTGATGTTGTGAGTTTTGTTTTTGAGTAACATCGTGTATTTGACCATCAGAAGAACAATGATCAATATTACCTGTTTGAATTCTATTTCCATTACTATTATTGCTATTATTGCAGTAAATCATGTTTTCGTTAATTGAACAAGATGGTATCATGTTGGAAATATCCGATCTATTAATAGATTGATTTGGATAATGATGATGAACAGCTTGTGGAATAGATACTGTTGAAGAACCATAATTTAATGGTGTTGTATTCGTGACATCACCATATGGAATAGCTTGTGGACAAACAGATGAAATATTTGGACATATAGGATATGAATTACCTGTATGTTGAGAAGGATTAGGAAGAGGTGTTAGTGCACCCTGATTG]
[-] EMBL CD147253             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AATGGNNATGTGACTGATTATTTAAAGGTGAATCAGAATTCGATGACAAATTTGTAGTTGACGAATAAGATCCTCTCATATGAGATGAATCTGGAATTAAATGTGATTGTTGATGAATTTGATGTTGTGAGTTTTGTTTTTGAGTAACATCGTGTATTTGACCATCAGAAGAACAATGATCAATATTACCTGTTTGAATTCTATTTCCATTACTATTATTGCTATTATTGCAGTAAATCATGTTTTCGTTAATTGAACAAGATGGTGTCATGTTGGAAATATCCGATCTATTAATAGATTGATTTGGATAATGATGGTGAACAGCTTGTGGAATAGATACTGTTGAAGAACCATAATTTAATGGTGCTGTATTTGTGACATCACCATATGGAATAGCTTGTGGACAAACAGATGAAATATTTGGACATATAGGATATGAATTACCTGTATGTTGAGAAGGATTAGGAAGAGGTGTTGGTGCACCCTGATTG]


>consensus_9325#0 AATTGAATTTGCGAGGGTGAGGATTGAATACAAGTATGTCGATTGTAAAATAAAGTCTTA CAAATTGTTTTCTTTATTTCTGTATATAAATCAATGATGAGAGTTTGGGTAGTCTCTTTT GACAAGTTTTATTTTACGTACTTTCCAGGAGAAATTTCATGTTACAATAATTCATCAGAG ATCTATGCATCTTGTTGTTCACATGATAAAGTTTCATTGATGGGTGAAGATAATGCATTT AAGTTATGGTTAGTGTCAGGAGTAGTATTCATCAGATCTGATTGTGAGATTGGTGAGGTA TGATATTGTTGATGGTGTGATTGCTGTTGGATTTCTGGTGTTCCACCATTTGAACTGATT GTATGATCATTTAGACCATTATTACCATTATTATTATTACTATCAGGATTCATATTTGTC CATAAAGGTGGCAAACTTTCATTTGTACTACTAGGATGAATTATATTATTATTGTAAGAT GTAGGAGTATTAGAGCGTGAACTATGGTTTTTAACCGAAATTATTGATTTATTTAAATTC ATGTGATCATTTTGATTTTGTGTCGATATTATTCCTGTTGACTGCACTGATGAAGTGACT TGACGTTGAGGTGAGGTTATTGCTGAAGAACAAGAGTATTGAGATGATTGTAAAGCAGAT ACTTGACTTCGTTGTTGTTGTTGTTGAGGTGATGGCACCAAGTAGTTTGTTGAAAGCATT TGCGTAGAAGAAGGAGAACAATCTCTGGAATTTGAATATGCATTCGAATTGGATGGATTA TAGGTTATTGAATTATCATGATAATTAAATTGTCCAGAAAATGGATGTGACTGATTATTT AAAGGTGAATCAGAATTCGATGACAAATTTGTAGTTGACGAATAAGATCCTCTCATATGA GATGAATCTGGAATTAAATGTGATTGTTGATGAATTTGATGTTGTGAGTTTTGTTTTTGA GTAACATCGTGTATTTGACCATCAGAAGAACAATGATCAATATTACCTGTTTGAATTCTA TTTCCATTACTATTATTGCTATTATTGCAGTAAATCATGTTTTCGTTAATTGAACAAGAT GGTATCATGTTGGAAATATCCGATCTATTAATAGATTGATTTGGATAATGATGATGAACA GCTTGTGGAATAGATACTGTTGAAGAACCATAATTTAATGGTGTTGTATTCGTGACATCA CCATATGGAATAGCTTGTGGACAAACAGATGAAATATTTGGACATATAGGATATGAATTA CCTGTATGTTGAGAAGGATTAGGAAGAGGTGTTAGTGCACCCTGATTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)