These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9375#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 524 fasta sequence [GCGCGACATCTATCTGGAATTCTCTTTCAATACTTTAAATAGTTTAAGTAAAGAAAAACATTTTGTAATCATTTATGCTTGTGATTGTTA-TTTTTTTTTCGAATGGCTGATCTCGTACATACTATTAGTATCACGACTATCAACACCTAGTACTAGAATGTTTCTATGAAAATTGATAATCTCTTCATATTTTATATGATGTTTTTTTTGTGGTTTCGATAGGTCCAATCAAATGTTCCGTCTTTATTGCCAATCTATTACCTTATAATTGATTTTTCCCTACGTTTTATTAAAAAAAAAATCGATCACTATATTCCATGCTCACATTTATATCTTGATTGTCTT-GGGGGGGGGAAAGAACAAACAAAATATTGGCATTCCATTATTGTTGATAAGTTGGAGCGTTATGGAAGCGTTTAATGTATGAGCATAGTAGAGAAACACTATTGACATTGTTATCTATTCTCTTTACATTCTATTATGAATCATATTGTTTCTTCTCTTTCATGTCAGTTATTATTTTA] [+] EMBL CD185500 [GCGCGACATCTATCTGGAATTCTCTTTCAATACTTTAAATAGTTTAAGTAAAGAAAAACATTTTGTAATCATTTATGCTTGTGATTGTTA TTTTTTTTTCGAATGGCTGATCTCGTACATACTATTAGTATCACGACTATCAACACCTAGTACTAGAATGTTTCTATGAAAATTGATAATCTCTTCATATTTTATATGATGTTTTTTTTGTGGTTTCGATAGGTCCAATCAAATGTTCCGTCTTTATTGCCAATCTATTACCTTATAATTGATTTTTCCCT ] [+] EMBL CD131582 [GCGCGACATCTATCTGGAATTCTCTTTCAATACTTTAAATAGTTTAAGTAAAGAAAAACATTTTGTAATCATTTATGCTTGAAATTGTTA TTTTTTTTTCGTATGGCTGATCTCCTACATATTATGAGTACCACAACTATCACCACCTAGTACTAAAATGTTTCTATAAAAATTGATAATCTCTTCATATTTTATATGATGTTTTTTTTGTGGTTTCGATAGGTCCAATCAAATGTTCCGTCTTTATTGCCAATCTATTACCTTATAATTGATTTTTCCCT ] [+] EMBL CD131658 [ CGCGACATCTATCTGGAATTCTCTTTCAATACATTAAATAGTTTAAGTAAAGAAAAACATTTTGTAATCATTTATGCTTGTGATTGTTA TTTTTTTTCGAATGGCTGATCTCGTACATACTATTAGTATCACGACTATCAACACCTAGTACTAGAATGTTTCTATGAAAATTGATAATCTCTTCATATTTTATATGATGTTTTTTTTGTGGTTTCGATAGGTCCAATCAAATGTTCCGTCTTTATTGCCAATCTATTACCTTATAATTGATTTTTCGCTACGT ] [+] EMBL CD192715 [ ATCTGGAATTCTCTTTCAATACTTTAAATAGTTTAAGTAAAGAAAAACATTTTGTAATCATTTATGCTTGTGATTGTTATTTTTTTTTTCGAATGGCTGATCTCGTACATACTATTAGTATCACGACTATCAACACCTAGTACTAGAATGTTTCTATGAAAATTGATAATCTCTTCATATTTTATATGATGTTTTTTTTGTGGTTTCGATAGGTCCAATCAAATGTTCCGTCTTTATTGCCAATCTATTACCTTATAATTGATTTTTCCCTACGTTTTATTAAAAAAAAAATCGATCACTATATTCCATGCTCACATTTATATCTTGATTGTCTT GGGGGGGGGAAAGAACAAACAAAATATTGGCATTCCATTATTGTTGATAAGTTGGAGCGTTATGGAAGCGTTTAATGTATGAGCATAGTAGAGAAACACTATTGACATTGNTATCTATTCTCTTTACATTCTATTATGAATCATATTGTTTCTTCTCTTTCATGTCAGTTA ] [+] EMBL CD192374 [ TTCTCTTTCAATACTTTAAATAGTTTAAGTAAAGAAAAACATTTTGTAATCATTTATGCTTGTGATTGTTA TTTTTTTTTCGAATGGCTGATCTCGTACATACTATTAGTATCACGACTATCAACACCTAGTACTAGAATGTTTCTATGAAAATTGATAATCTCTTCATATTTTATATGATGTTTTTTTTGTGGTTTCGATAGGTCCAATCAAATGTTCCGTCTTTATTGCCAATCTATTACCTTATAATTGATTTTTCCCTACGTTTTATT AAAAAAAAATCGATCACTATATTCCATGCTCACATTTATATCTTGATTGTCTT GGGGGGGGGAAAGAACAAACAAAATATTGGCATTCCATTATTGTTGATAAGTTGGAGCGTTATGGAAGCGTTTAATGTATGAGCATAGTAGAGAAACACTATTGACATTGTTATCTATTCTCTTTACATTCTATTATGAATCATATTGTTTCTTCTCTTTCATGTCAGTTA ] [+] EMBL CD134818 [ TTCTCTTTCAATACTTTAAATAGTTTAAGTAAAGAAAAACATTTTGTAATCATTTATGCTTGTGATTGTTA TTTTTTTTTCGAATGGCTGATCTCGTACATACTATTAGTATCACGACTATCAACACCTAGTACTAGAATGTTTCTATGAAAATTGATAATCTCTTCATATTTTATATGATGTTTTTTTTGTGGTTTCGATAGGTCCAATCAAATGTTCCGTCTTTATTGCCAATCTATTACCTTATAATTGATTTTTCCCTACGTTTTATTAAAAAAAAAATCGATCACTATATTCCATGCTCACATTTATATCTTGATTGTCTTGGGGGGGGGGAAAGAACAAACAAAATATTGGCATTCCATTATTGTTGATAAGTTGGAGCGTTATGGAAGCGTTTAATGTATGAGCATAGTAGAGAAACACTATTGACATTGTTATCTATTCTCTTTACATTCTATTATGAATCATATTGTTTCTTCTCTTTCATGTCAGTTA ] [+] EMBL CD192468 [ TTCTCTTTCAATACTTTAAATAGTTTAAGTAAAGAAAAACATTTTGTAATCATTTATGCTTGTGATTGTTA TTTTTTTTTCGAATGGCTGATCTCGTACATACTATTAGTATCACGACTATCAACACCTAGTACTAGAATGTTTCTATGAAAATTGATAATCTCTTCATATTTTATATGATGTTTTTTTTGTGGTTTCGATAGGTCCAATCAAATGTTCCGTCTTTATCGCCAATCTATTACCTTATAATTGATTTTTCCCTACGTTTTATTAAAAAAAAAATCGATCACTATATTCCATGCTCACATTTATATCTTGATTGTCTT GGGGGGGGGAAAGAACAAACAAAATATTGGCATTCCATTATTGTTGATAAGTTGGAGCGTTATGGAAGCGTTTAATGTATGAGCATAGTAGAGAAACACTATTGACATTGNTATCTATTCTCTNTACATTCTATTATGAATCATATTGTTTCTTCTCTTTCATGTCAGTTA ] [-] EMBL CD192298 [ TCTTTTTCAATACTTTAAATAGTTTAAGTAAAGAAAAACATTTTGTAATCATTTATGCTTGTGATTGTTATTTTTTTTTTCGAATGGCTGATCTCGTACATACTATTAGTATCACGACTATCAACACCTAGTACTAGAATGTTTCTATGAAAATTGATAATCTCTTCATATTTTATATGATGTTTTTTTTGTGGTTTCGATAGGTCCAATCAAATGTTCCGTCTTTATTGCCAATCTATTACCTTATAATTGATTTTTCCCTACGTTTTATTAAAAAAAAAATCGATCACTATATTCCATGCTCACATTTATATCTTGATTGTCTT GGGGGGGGGAAAGAACAAACAAAATATTGGCATTCCATTATTGTTGATAAGTTGGAGCGTTATGGAAGCGTTTAATGTATGAGCATAGTAGAGAAACACTATTGACATTGTTATCTATTCTCTTTACATTCTATTATGAATCATATTGTTTCTTCTCTTTCATGTCAGTTATTATTTTA] [+] EMBL CD156006 [ CTTTCAATACTTTAAATAGTTTAAGTAAAGAAAAACATTTTGTAATCATTTATGCTTGTGATTGTTA TTTTTTTTTCGAATGGCTGATCTCGTACATACTATTAGTATCACGACTATCAACACCTAGTACTAGAATGTTTCTATGAAAATTGATAATCTCTTCATATTTTATATGATGTTTTTTTTGTGGTTTCGATAGGTCCAATCAAATGTTCCGTCTTTATTGCCAATCTATTACCTTATAATTGATTTTTCCCTACGTTTTATTAAAAAAAAAATCGATCACTATATTCCATGCTCACATTTATATCTTGATTGTCTT GGGGGGGGGAAAGAACAAACAAAATATTGGCATTCCATTATTGTTGATAAGGTGGAGCGTTATGGAAGCGTTTAATG ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||