These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9398#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 1288 fasta sequence [TGCAATTGACATGTTGGGGGTGGCGGTGGTAAAGAAAACTGCTGTTGTTGTGATTGTTGTATCGACTGTTGTTGTTGTGGATGAAATTGATTAGAAGCAGGTGTTTGGTTAGCCACTAACTGTTGTTGTTGTTGAGGTTGGTTCTGAAATTGAAAGTTAGACGGTTGTTGAAATGATTGAGCTATTTGTGGTTGTGGTTGAATTAAATTCGTTTGAGATTGTTGAGTCGGGGGAAAATATTGCGATTGTGCACGTGGTTGATGGTGCTGTTGTTGTACTGTTGGTTTGTTGTATGCTTGACCACTTGGATTTAATTGATTTATTTGTTGAGTATTAGTATTAGAAAAATTTGACTGAGCAACATGATTCGCTTCAGAGCCGTAATTTGGTGCCATAGATTGTGTCATTAGCATTGGAGATTGACTGGCTGTCATCACTGCCATAGAGACAGATTCCCCAAAAACCGGATTCGTTTGGTAATTGTAAGCTTCATTTTGTTGTTGACTTTGTGACTGTTGTTGAATAAGTTCATTTGACACTAACGGCATTGTATTTTGACCAGTGCGTGCAACAGTAGTAACATTTGTACCACAATTATTCAGTGAAACTGTCCCATTAACATTTGTTAGCATAACCTGATTATTTTGTGCATTTGACAGATAATTTGTGTTTGTATATCCAGCATTATTATGATTATGACGAAGTGTGTTGCCGCCTAAAGTATTTCCGGAATAATTAAAAGCCACTACACGTCCACCTGGTACAACTACATCAGGTAAAT-CCA-TTACATCAGCATTACTCAACATCAGATGATGCCCCCCACCACCACCATTCAATAAAGTACCAGTTGCTGACGGGGAGTTAAATTGTTTTGAACGTAACATACTTGAACTACCACGAAAACCATTTGGATCATCACATATTTCTTTGCCACCAATGTAATACCATAGATTTGTTGAAAATAATTTACTATCCGTATGAGTTAGAATGCATAGCATGATGACGGCGACGACAAGCCCAAATCAGAATAACCAAAAACAACACTGGTATTAATAAACCTAAGATCAAAGCACCAACAAATGTCAATCCAAAGTATTGTGCCCAACTCCATTGACTTGGCAATGGTGCAGATGCTTTCTCCAAAGCACTACATGGTTCAGTATAAGAAGTAATATTATCAACACAGATTCTAGCATCCGGATAGCCAGCAGGAATCGTACCTTCTAATATCAGCTTGTAATCTTTTGAAGAGAAACCCAATGATGATTTAGATAGAATATCCACATAT] [+] EMBL CD144927 [TGCAATTGACATGTTGGGGGTGGCGGTGGTAAAGAAAACTGCTGTTGTTGTGATTGTTGTATCGACTGTTGTTGTTGTGGATGAAATTGATTAGAAGCAGGTGTTTGGTTAGCCACTAACTGTTGTTGTTGTTGAGGTTGGTTCTGAAATTGAAAGTTAGACGGTTGTTGAAATGATTGAGCTATTTGTGGTTGTGGTTGAATTAAATTCGTTTGAGATTGTTGAGTCGGGGGAAAATATTGCGATTGTGCACGTGGTTGATGGTGCTGTTGTTGTACTGTTGGTTTGTTGTATGCTTGACCACTTGGATTTAATTGATTTATTTGTTGAGTATTAGTATTAGAAAAATTTGACTGAGCAACATGATTCGCTTCAGAGCCGTAATTTGGTGCCATAGATTGTGTCATTAGCATTGGAGATTGACTGGCTGTCATCACTGCCATAGAGACAGATTCCCCAAAAAACGGATTCGTT ] [+] EMBL CD132302 [ TGGATGAAATTGATTAGAAGCAGGTGTTTGGTTAGCCACTAACTGTTGTTGTTGTTGAGGTTGGTTCTGAAATTGAAAGTTAGACGGTTGTTGAAATGATTGAGCTATTTGTGGTTGTGGTTGAATTAAATTCGTTTGAGATTGTTGAGTCGGGGGAAAATATTGCGATTGTGCACGTGGTTGATGGTGCTGTTGTTGTACCGTTGGTTTGTTGTATGCTTGACCACTTGGATTTAATTGATTTATTTGTTGAGTATTAGTATTAGAAAAATTTGACTGAGCAACATGATTCGCTTCAGAGCCGTAATTTGGTGCCATAGATAGTGTCATTAGCATT ] [-] EMBL CD183820 [ TTGTTGTTGAGGTTGGTTCTGAAATTGAAAGTTAGACGGTTGTTGAAATGATTGAGCTATTTGTGGTTGTGGTTGAATTAAATTCGTTTGAGATTGTTGAGTCGGGGGAAAATATTGCGATTGTGCACGTGGTTGATGGTGCTGTTG ] [-] EMBL CD112573 [ TGGAGATTGACTGGCCGTCATCACTGCTATAGAGACAGATTCCCCAAAAACCGGATTCGTTTGGTAATTGTAAGCTTCATTTTGTTGTTGACTTTGTGACTGTTGTTGAATAAGTTCATTTGACACTAACGGCATTGTATTTTGACCAGTGCGTGCAACAGTAGTAACATTTGTACCACAATTATTCAGTGAAACTGTCCCATTAACATTTGTTAGCATAACCTGATTATTTTGTGCATTTGACAGATAATTTGTGTTTGTATATCCAGCATTATTATGATTATGACGAAGTGTGTTGCCGCCTAAAGTATTTCCGGAATAATTAAAAGCCA ] [-] EMBL CD197666 [ ATTGACTGGCTGTCATCACTGCCATAGAGACAGATTCCCCAAAAACNGGATTCGTTTGGTAATTGTAAGCTTCATTTTGTTGTTGACTTTGTGACTGTTGTTGAATAAGTTCTTTTGACACTAACGGCATTGTATTTTGACCAGTGCGTGCAACAGTAGTAACATTTGTACCACAATTATTCAGTGAAACTGTCCCATTAACATTTGTTAGCATAACCTGATTATTTTGTGCATTTGACAGATAATTTGTGTTTGTATATCCAGCATTATTATGATTATGACGAAGTGTGTTGCCGCCTAAAGTATTTCCGGAATAATTAAAAGCCACTACACGTCCACCTGGTACAACTACATCAGGTAAAT CCA TTACATCAGCATTACT ] [-] EMBL CD187105 [ AGATTCCCCAAAAACCGGATTCGTTTGGTAATTGTAAGCTTCATTTTGTTGTTGACTTTGTGACTGTTGTTGAATAAGTTCATTTGACACTAACGGCATTGTATTTTGACCAGTGCGTGCAACAGTAGTAACATTTGTACCACAATTATTCAGTGAAACTGTCCCATTAACATTTGTTAGCATAACCTGATTATTTTGTGCATTTGACAGATAATTTGTGTTTGTATATCCAGCATTATTATGATTATGACGAAGTGTGTTGCCGCATAAAGTATTTCCGGAATAATTAAAAGCCACTACACGTCCACCTGGTACAACTACATCAGGTAAAT CCA TTACATCAGCATT ] [-] EMBL CD128328 [ TTTTGTTGTTGACTTTGTGACTGTTGTTGAATAAGTTCATTTGACACTAACGGCATTGTATTTTGACCAGTGCGTGCAACAGTAGTAACATTTGTACCACAATTATTCAGTGAAACTGTCCCATTAACATTTGTTAGCATAACCTGATTATTTTGTGCATTTGACAGATAATTTGTGTTTGTATATCCAGCATTATTATGATTATGACGAAGTGTGTTGCCGCCTAAAGTATTTCCGGAATAATTAAAAGCCACTACACGTCCACCTGGTACAACTACATCAGGTAAAT CCACTTACATCAGCATTACTCAACATCAGATGATGCCCCCCACCACCA ] [+] EMBL CD112588 [ tgtaaaGACTGTGGTTGAATAAGTTCATTTGACACTAACGGCATTGTATTTTGACCAGTGCGTGCAACAGTAGTAACATTTGTACCACAATTATTCAGTGAAACTGTCCCATTAACATTTGTTAGCATAACCTGATTATTTTGTGCATTTGACAGATAATCTGTGTTTGTATATCCAGCATTATTATGATTATGACGAAGTGTGTTGCCGCCTAAAGTATTTCCGGAATAATTAAAAGCC ] [+] EMBL CD183484 [ ATCAGGTAAATGCCA TTACATCAGCATTACTCAACATCAGATGATGCCCACCACCACCACCATTCAATAAAGTACCAGTTGCTGACGGGGAGTTAAATTGTTTTGAACGTAACATACTTGAACTACCACGAAAACCATTTGGATCATCACATATTTCTTTGCCACCAATGTAATACCATAGATTTGTTGAAAATAATTTACTATCCGTATGAGTTAGAATGCATAGCATGATGACGGCGACGACAAGCCCAAATCAGAATAACCAAAAACAACACTGGTATTAATAAACCTAAGATCAAAGCACCAACAAATGTCAATCCAAAGTATTGTGCCCAACTCCATTGACTTGGCAATGGTGCAGATGCTTTCTCCAAAGCACTACATGGTTCAGTATAAGAAGTAATATTATCAACACAGATTCTAGCATCCGGATAGCCAGCAGGAATCGTACCTTCTAATATCAGCTTGTAATCTTTTGAAGAGAAACCCAATGATGATTTAGATAGAATATCCACATAT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||