These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9431#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 791 fasta sequence [CAAATATTTTGCTACCCCAAGGCCACG-TTTTTGCTTTTGGTAA-TGTTCAATCAGAAAAAAGCGCATAAAGAAGGAACTAAGAGTGAAAAACTCATTCACGAAGAAAATGTACGGACACTAAAGTTCTACCGTTATTTATTTCTGTCATGTTATGTAGTTTATTTCGTTATCACTTTAACATTTT-TCTGGCCAACCTTTACAAAACGTTACATAACGTTGTCACTAGGCTGCTTCGGTGCTTGTTTAGCCGCTTATAAATTTATGTCCTACATGGCTTCACCATCTTATGCTGTCAACGAACGAGGGACTCGTCAACTGGTGGATGCTGGCCTAGATTTAAATATAGGGTCTGGTGGACTTGGAGAACAAGCCAAAGATGCAATAATCATGTGCAGTTTAGTCACTATGTTAAGCTTAATTCACCAATATTTCTGGTTCCTCCTATTAATTATTCCCATCCGGTTATTCTACGTGCTTTGGGTAAATATTTTGGCACCGTGGATTTTTGATCCAAATCAAGAAACTCAGGTAAATGAAAAGAAACAAAAGAAAATGGAACGAAAAATGAGACGAGTTGGTCATCTGATGCATGGTACAGACAGAGGTGTTGGCCGAGCGAATTAGATAACGAATTGTTTTTATGGGAGAGGTTATCCTTCTGAGTATTGTACTTTATTCTATGAATATTTCCATCCCCTCTCTCGCGTTATTCCTACACGATATTCTTTATTTGTCCTTTTAAGTACATATTGATATCTGTACAGTAATTTATGTTATGTACAGTTTCTGAT] [+] EMBL CD142245 [CAAATATTTTGCTACCCCAAGGCCACG GTTTTGCTTTTGGTAA TGTTCAATCAGAAAAAAGCGCATAAAGAAGGAACTAAGAGTGAAAAACTCATTCACGAAGAAAATGTACGGACACTAAAGTTCTACCGTTATTTATTTCTGTCATGTTATGTAGTTTATTTCGTTATCACTTTAACATTTT TCTGGCCAACCTTTACAAAACGTTACATAACGTTGTCACTAGGCTGCTTCGGTGCTTGTTTAGCCGCTTATAAATTTATGTCCTACATGGCTTCACCATCTTATGCTGTCAACGAACGAGGGACTCGTCAACTGGTGGATGCTGGCCTAGATTTAAAT ] [+] EMBL CD180764 [ ATATTTTGCTACCCCAAGGCCACG TTTTTGCTTTTGGTAA TGTTCAATCAGAAAAAAGCGCATAAAGAAGGAACTAAGAGTGAAAAACTCATTCACGAAGAAAATGTACGGACACTAAAGTTCTACCGTTATTTATTTCTGTCATGTTATGTAGTTTATTTCGTTATCACTTTAACATTTT TCTGGCCAACCTTTACAAAACGTTACATAACGTTGTCACTAGGCTGCTTCGGTGCTTGTTTAGCCGCTTATAAATTTATGTCCTACATGGCTTCACCATCTTATGCTGTCAACGAACGAGGGACTCGTCAACTGGTGGATGCTGGCCTAGATTTA ] [+] EMBL CD200621 [ ATATTTTGCTA CCCAAGGCCACG TTTTTGCTTTTGGTAA TGTTCAATCAGAGAAAAGCGCATAAAGAAGGAACTAAGAGTGAACAACTCATTCACGAATAATATGTACGGACACTAAAGTGCTACCGATATTTATTCGTGACATGTTATGGACTTGATTTCGATATCACTTTAACACTTT TCTGGCCAACCTTTACAAAACGTTACATAACGTTGACACTACGCTGCTTCTGTGCTTGTTTAGCCGCTTATAAATCTATGTTCTACATGGCTTCACCATCTTATGC ] [+] EMBL CD084179 [ ggcacgagGGCCACGCTTTTTGCTTTTGGTAACTGTTCAATCAGAAAAAAGCGCATAAAGAAGGAACTAAGAGTGAAAAACTCATTCACGAAGAAAATGTACGGACACTAAAGTTCTACCGTTATTTATTTCTGTCATGTTATGTAGTTTATTTCGTTATCACTTTAACATTTT TCTGGCCAACCTTTACAAAACGTTACATAACGTTGTCACTAGGCTGCTTCGGTGCTTGTTTAGCCGCTTATAAATTTATGTCCTACATGGCTTCACCATCTTATGCTGTCAACGAACGAGGGACTCGTCAACTGGTGGATGCTGGCCTAGATTTAAATATAGGGTCTGGTGGACTTGGAGAACAAGCCAAAGATGCAATAATCATGTGCAGTTTAGTCACTATGTTAAGCTTAATTCACCAATATTTCTGGTTCCTCCTATTAATTATTCCCATCCGGTTATTCTACGTGCTTTGGGTAAATATTTTGGCACCGTGGATTTTTGATCCAAATCAAGAAACTCAGGTAAATGAAAAGAAACAAAAGAAAATGGAAC ] [-] EMBL CD097284 [ TTTGGTAA TGTTCAATCAGAAAAAAGCGCATAAAGAAGGAACTAAGAGTGAAAAACTCATTCACGAAGAAAATGTACGGACACTAAAGTTCTACCGTTATTTATTTCTGTCATGTTATGTAGTTTATTTCGTTATCACTTTAACATTTT TCTGGTCAACCTTTACAAAACGTTACATAACGTTGTCACTAGGCTGCTTCGGTGCTTGTTTAGCCGCTTATAAATTTATGTCCTACATGGCTCCACCATCTCATGCTGTCAACGAACGAGGGACTCGTCAACTGGTGGATGCTGGCCTAGATTTAAATATAGGGTCTGGTGGACTTGGAGAACAAGCCAAAGATGCAATAATCATGTGCAGTTCAGTCACTATGTTAAGCTTAATTCACCAATATTTCTGGTTCCTCCTATTAATTATTCCCATCCGGTTATTCTACGTGCTTTGGGTAAATATTTTGGCACCGTGGATTTTTGATCCAAATCAAGAAACTCAGGTAAATGAAAAGAAACAAAAGAAAATGGAACGAAAAAT ] [+] EMBL AI974967 [ AA TGTTCAATCAGAAAAAAGCGCATAAAGAAGGAACTAAGAGTGAAAAACTCATTCACGAAGAAAATGTACGGACACTAAAGTTCTACCGTTATTTATTTCTGACATGTTATGTAGTTTATTTCGTTATCACTTTAACATTTT TCTGGCCAACCTTTACAAAACGTTACATAACGTTGTCACTAGGCTGCTTCGGTGCTTGTTTAGCCGCTTATAAATTTATGTCCTACATGGCTTCACCATCTTATGCTGTCAACGAACGAGGGACTCGTCAACTGGTGGATGCTGGCCTAGATTTAAATATAGGGTCTGGTGGACTTGGAGAACAAGCCAAAGATGCAATAATCATGTGCAGTTTAGTCACTATGTTAAGCTTAATTCACCAATATTTCTGGTTCCTGCTATTAATTATTCCCATCCGGTTATTCTACGTGCTTTGGGTAAATATTTTGGCACCGTGGATTTTTGATCCAAATCAAGAAACTCAGGTAAATGAAAAGAAACAAAga ] [+] EMBL CD077862 [ taggGAGAAAAGCGCATAAAGAAGGAACTAAGAGTGAAAAACTCATTCACGAAGAAAATGTACGGACACTAAAGTTCTACCGTTATTTATTTCTGTCATGTTATGTAGTTTATTTCGTTATCACTCTAACATTTTGTCTGGCCAACCTTTACAAAACGTTACATAACGTTGTCACTAGGCT ] [+] EMBL AI975317 [ AACGTTACATAACGTTGTCACTAGGCTGCTTCGGTGCTTGTTTAGCCGCTTATAAATTTATGTCCTACATGGCTTCACCATCTTATGCTGTCAACGAACGAGGGACTCGTCAACTGGTGGATGCTGGCCTAGATTTAAATATAGGGTCTGGTGGACTTGGAGAACAAGCCAAAGATGCAATAATCATGTGCAGTTTAGTCACTATGTTAAGCTTAATTCACCAATATTTCTGGTTCCTCCTATTAATTATTCCCATCCGGTTATTCTACGTGCTTTGGGTAAATATTTTGGCACCGTGGATTTTTGATCCAAATCAAGAAACTCAGGTAAATGAAAAGAAACAAAAGAAAATGGAACGAAAAATGAGACGAGTTGGTCATCTGATGCATGGTACAGACAGAGGTGTTGGCCGAGCGAATTAGATAACGAATTGTTTTTATGGGAGAGGTTATCCTTCTGAGTATTGTACTTTATTCTATGAATATTTCCATCCCCTCTCTCGCGTTATTCCTACACGATATTCTTTATTTGTCCTTTTAAGTACATATTGATATCTGTACAGTAATTTATGTTATGTACAGTTTCTGAT] [-] EMBL CD097285 [ GTTTAGCCGCTAATAAATTTATGTCCTACATGGATCCACCATCTCATGCTGTCAACGAACGAGGGACTCGTCAATTGGTGGATGCTGGCCTAGATTTAAATATAGGGTCTGGTGGACTTGGAGAACAAGCCAAAGATGCAATAATCATGTGCAGTTCAGTCACTATGTTAAGCTTAATTCACCAATATTTCTGGTTCCTCCTATTAATTATTCCCATCCGGTTATTCTACGTGCTTTGGGTAAATATTTTGGCACCGTGGATTTTTGATCCAAATCAAGAAACTCAGGT AATGAAAAGAAACAAAAGAAAATGGAACGAAAAATGAGACGAGTgcgcc ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||