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Schistosoma mansoni
cluster # 9463 cluster # 9463       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9463#0 length = 941 sequences # 9  

consensusID : consensus_9463#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 941
fasta sequence
                              [GATTTAACTGCGTCTTGCGGAATGTCATTACAATCTTTCAAGTACACTTGTTCAAGATATTCCCATGAAGGAGGAAGCCAATGTTAATTCTGGCAGTTCAATGTATGGTGTCGAAATTCTCCATCGAGCTGAAGTGCACGACATGTTAAAACGTCGGGGTATTTACGAGAAATTATTAGTACGTACAGATAGTGAAAATAATAAGTCCATATCACGACCACACTCCGGATTTTCGAAAACTTTGGGCATAAAATGGGTCACGCCGAAGACCTCGGATGCTAATTTTCTGCGCTTTGCTGTTGCTACATACCGAGTAACTTTAGCAGACGTTTGCCACAGAGCATCTACTTGCCTAGCTCAATTTGTTTTAGGAGGTCGGTCTGTTGCGTTGGCTCATCGTCTACAGTTTTCATTTCCAGCGTTACCTAATGATTCTAACTTCTTAACATCTTGCTCAACAGATGAAGCTCTTCTCCTCACCTGTCATGGATCCGTAATGTATATACATGTTTTAGCAACAATTTTCCCAATGACTCATCCTCAGAATATTCCCTTAACTTCTAATCCTAATGTGGCCTCGGGAGATTATCGTATACAAGCCTTCATTGACCAAATCTTACGCCCTTCTCGTCTGGCTCCAGCATCAGCTAGATTAAATTATTCAGTATTTCCCAAAGAACGAGCTCAACGACATATCGAACGTCAAACACGGTATTGGCCACTTATGGAATCTCAAACATTACTGGACAAAACTAAGCTAGCTGCTCCAATATTCGAAAATTTACCAAAAGAATACCTTGAACCTAACGAAATATCTGCCTGTGAAGAATCTATAGTGAACATTGTAAACTCTATTAAACAGCACGTTTGCCTGTCCGATTCTAGAAAGAACTCTTCCAAACGAGGATCATCATCTGGAACTTTACCTGTTGCACCTGTAC]

[+] EMBL CD184711             [GATTTAACTGCGTCTTGCGGAATGTCATTACAATCTTTCAAGTACACTTGTTCAAGATATTCCCATGAAGGAGGAAGCCAATGTTAATTCTGGCAGTTCAATGTATGGTGTCGAAATTCTCCATCGAGCTGAAGTGCACGACATGTTAAAACGTCGGGGTATTTACGAGAAATTATTAGTACGTACAGATAGTGAAAATAATAAGTCCATATCGCGACCACACTCCGGATTTTCGAAAACTTTGGGCATAAAATGGGTCACGCCGAAGACCTCGGATGCTAATTTTCTGCGCTTTGCTGTTGCTACATACCGAGTAACTTTAGCAGACGTTTGCCACAGAGCATCTACTTGCCTAGCTCAATTTGTTTTAGGAGGTCGGTCTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD069767             [                                                                                ATGTTAATTCTGGCAGTTCAATGTATGGTGTCGAAATTCTCCATCGAGCTGAAGTGCACGACATGTTAAAACGTCGGGGTATTTACGAGAAATTATTAGTACGTACAGATAGTGAAAATAATAAGTCCATATCACGACCACACTCCGGATTTTCGAAAACTTTGGGCATAAAATGGGTCACGCCGAAGACCTCGGATGCTAATTTTCTGCGCTTTGCTGTTGCTACATACCGAGTAACTTTAGCAGACGTTTGCCACAGAGCATCTACTTGCCTAGCTCAATTTGTTTTAGGAGGTCGGTCTGTTGCGTTGGCTCATCGTCTACAGTTTTCATTTCCAGCGTTACCTAATGATTCTAACTTCTTAACATCTTGCTCAACAGATGAAGCTCTTCTCCTCACCTGTCATGGATCCGTAATGTATATACATGTTTTAGCAACAATTTTCCCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD095779             [                                                                                    TAATTCTGGCAGTTCAATGTATGGTGTCGAAATTCTCCGTCGAGCTGAAGTGCACGACATGTTAAAACGTCGGGGTATTTACGAGAAATTATTAGTACGTACAGATAGTGAAAATAATAAGTCCATATCACGACCACACTCCGGATTTTCGAAAACTTTGGGCATAAAATGGGTCACGCCGAAGACCTCGGATGCTAATTTTCTGCGCTTTGCTGTTGCTACATACCGAGTAACTTTAGCAGACGTTTGCCACAGAGCATCTACTTGCCTAGCTCAATTTGTTTTAGGAGGTCGGTCTGTTGCGTTGGCTCATCGTCTACAGTTTTCATTTCCAGCGTTACCTAATGATTCTAACTTCTTAACATCTTGCTCAACAGATGAAGCTCTTCTCCTCACCTGTCATGGATCCGTAATGTATATACATGTTTTAGCAACAATTTTCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD121920             [                                                                                                                               ctTGAAGTGCACGACATGTTAAAACGTCGGGGTATTTACGAGAAATTATTAGTACGTACAGATAGTGAAAATAATAAGTCCATATCACGACCACACTCCGGATTTTCGAAAACTTTGGGCATAAAATGGGTCACGCCGAAGACCTCGGATGCTAATTTTCTGCGCTTTGCTGTTGCTACATACCGAGTAACTTTAGCAGACGTTTGCCACAGAGCATCTACTTGCCTAGCTCAATTTGTCTTAGGAGGTCGGTCTGTTGCGTTGGCTCATCGTCTACAGTTCTCATTTCCAGCGTTACCTAATGATTCTAACTTCTTAACATCTTGCTCAACAGATGAAGCTCTTCTCCTCACCTGTCATGGATCCGTAATGTATATACATGTTTTAGCAACAATTTTCCCAATGACTCATCCTCAGAATATTCCCTTAACTTCTAATCCTAATGTGGCCTCGGGAGATTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD122034             [                                                                                                                                      TGCACGACATGTTAAAACGTCGGGGTATTTACGAGAAATTATTAGTACGTACAGATAGTGAAAATAATAAGTCCATATCACGACCACACTCCGGATTTTCGAAAACTTTGGGCATAAAATGGGTCACGCCGAAGACCTCGGATGCTAATTTTCTGCGCTTTGCTGTTGCTACATACCGAGTAACTTTAGCAGACGTTTGCCACAGAGCATCTACTTGCCTAGCTCAATTTGTTTTAGGAGGTCGGTCTGTTGCGTTGGCTCATCGTCTACAGTTTTCATTTCCAGCGTTACCTAATGATTCTAACTTCTTAACATCTTGCTCAACAGATGAAGCTCTTCTCCTCACCTGTCATGGATCCGTAATGTATATACATGTTTTAGCAACAATTTTCCCAATGACTCATCCTCAGAATATTCCCTTAACTTCTAATCCTAATGTGGCCTCGGGAGATTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD121916             [                                                                                                                                                            GGGTATTTACGAGAAATTAGTAGTACGTACAGATAGTGAAAATAATAAGTCCATATCACGACCACACTCCGGATTTTCGAAAACTTTGGGCATAAAATGGGTCACGCCGAAGACCTCGGATGCTAATTTTCTGCGCTTTGCTGTTGCTACATACCGAGTAACTTTAGCAGACGTTTGCCACAGAGCATCTACTTGCCTAGCTCAATTTGTTTTAGGAGGTCGGTCTGTTGCGTTGGCTCATCGTCTACAGTTTTCATTTCCAGCGTTACCTAATGATTCTAACTTCTTAACATCTTGCTCAACAGATGAAGCTCTTCTCCTCACCTGTCATGGATCCGTAATGTATATACATGTTTTAGCAACAATTTTCCCAATGACTCATCCTCAGAATATTCCCTTAACTTCTAATCCTAATGTGGCCTCGGGAGATTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD190991             [                                                                                                                                                                                                                                                  TGGGCATAAAATGGGTCACGCCGAAGACCTCGGATGCTAATTTTCTGCGCTTTGCTGTTGCTACATACCGAGTAACTTTAGCAGACGTTTGCCACAGAGCATCTACTTGCCTAGCTCAATTTGTTTTAGGAGGTCGGTCTGTTGCGTTGGCTCATCGTCTACAGTTTTCATTTCCAGCGTTACCTAATGATTCTAACTTCTTAACATCTTGCTCAACAGATGAAGCTCTTCTCCTCACCTGTCATGGATCCGTAATGTATATACATGTTTTAGCAACAATTTTCCCAATGACTCATCCTCAGAATATTCCCTTAACTTCTAATCCTAATGTGGCCTCGGGAGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD131147             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CCTAGCTCAATTTGTTTTAGGAGGTCGGTCTGTTGCGTTGGCTCATCGTCTACAGTTTTCATTTCCAGCGTTACCTAATGATTCTAACTTCTTAACATCTTGCTCAACAGATGAAGCTCTTCTCCTCACCTGTCATGGATCCGTAATGTATATACATGTTTTAGCAACAATTTTCCCAATGACTCATCCTCAGAATATCCCCTTAGCTTCTAATCCTAATATGGCCTTGGGAGATTATCGTATACAAGCCTTCATTGACCAAATCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD127113             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TGGCTCATCGTCTACAGTTTTCATTTCCAGCGTTACCTAATGATTCTAACTTCTTAACATCTTGCTCAACAGATGAAGCTCTTCTCCTCACCTGTCATGGATCCGTAATGTATATACATGTTTTAGCAACAATTTTCCCAATGACTCATCCTCAGAATATTCCCTTAACTTCTAATCCTAATGTGGCCTCGGGAGATTATCGTATACAAGCCTTCATTGACCAAATCTTACGCCCTTCTCGTCTGGCTCCAGCATCAGCTAGATTAAATTATTCAGTATTTCCCAAAGAACGAGCTCAACGACATATCGAACGTCAAACACGGTATTGGCCACTTATGGAATCTCAAACATTACTGGACAAAACTAAGCTAGCTGCTCCAATATTCGAAAATTTACCAAAAGAATACCTTGAACCTAACGAAATATCTGCCTGTGAAGAATCTATAGTGAACATTGTAAACTCTATTAAACAGCACGTTTGCCTGTCCGATTCTAGAAAGAACTCTTCCAAACGAGGATCATCATCTGGAACTTTACCTGTTGCACCTGTAC]


>consensus_9463#0 GATTTAACTGCGTCTTGCGGAATGTCATTACAATCTTTCAAGTACACTTGTTCAAGATAT TCCCATGAAGGAGGAAGCCAATGTTAATTCTGGCAGTTCAATGTATGGTGTCGAAATTCT CCATCGAGCTGAAGTGCACGACATGTTAAAACGTCGGGGTATTTACGAGAAATTATTAGT ACGTACAGATAGTGAAAATAATAAGTCCATATCACGACCACACTCCGGATTTTCGAAAAC TTTGGGCATAAAATGGGTCACGCCGAAGACCTCGGATGCTAATTTTCTGCGCTTTGCTGT TGCTACATACCGAGTAACTTTAGCAGACGTTTGCCACAGAGCATCTACTTGCCTAGCTCA ATTTGTTTTAGGAGGTCGGTCTGTTGCGTTGGCTCATCGTCTACAGTTTTCATTTCCAGC GTTACCTAATGATTCTAACTTCTTAACATCTTGCTCAACAGATGAAGCTCTTCTCCTCAC CTGTCATGGATCCGTAATGTATATACATGTTTTAGCAACAATTTTCCCAATGACTCATCC TCAGAATATTCCCTTAACTTCTAATCCTAATGTGGCCTCGGGAGATTATCGTATACAAGC CTTCATTGACCAAATCTTACGCCCTTCTCGTCTGGCTCCAGCATCAGCTAGATTAAATTA TTCAGTATTTCCCAAAGAACGAGCTCAACGACATATCGAACGTCAAACACGGTATTGGCC ACTTATGGAATCTCAAACATTACTGGACAAAACTAAGCTAGCTGCTCCAATATTCGAAAA TTTACCAAAAGAATACCTTGAACCTAACGAAATATCTGCCTGTGAAGAATCTATAGTGAA CATTGTAAACTCTATTAAACAGCACGTTTGCCTGTCCGATTCTAGAAAGAACTCTTCCAA ACGAGGATCATCATCTGGAACTTTACCTGTTGCACCTGTAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)