These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9463#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 941 fasta sequence [GATTTAACTGCGTCTTGCGGAATGTCATTACAATCTTTCAAGTACACTTGTTCAAGATATTCCCATGAAGGAGGAAGCCAATGTTAATTCTGGCAGTTCAATGTATGGTGTCGAAATTCTCCATCGAGCTGAAGTGCACGACATGTTAAAACGTCGGGGTATTTACGAGAAATTATTAGTACGTACAGATAGTGAAAATAATAAGTCCATATCACGACCACACTCCGGATTTTCGAAAACTTTGGGCATAAAATGGGTCACGCCGAAGACCTCGGATGCTAATTTTCTGCGCTTTGCTGTTGCTACATACCGAGTAACTTTAGCAGACGTTTGCCACAGAGCATCTACTTGCCTAGCTCAATTTGTTTTAGGAGGTCGGTCTGTTGCGTTGGCTCATCGTCTACAGTTTTCATTTCCAGCGTTACCTAATGATTCTAACTTCTTAACATCTTGCTCAACAGATGAAGCTCTTCTCCTCACCTGTCATGGATCCGTAATGTATATACATGTTTTAGCAACAATTTTCCCAATGACTCATCCTCAGAATATTCCCTTAACTTCTAATCCTAATGTGGCCTCGGGAGATTATCGTATACAAGCCTTCATTGACCAAATCTTACGCCCTTCTCGTCTGGCTCCAGCATCAGCTAGATTAAATTATTCAGTATTTCCCAAAGAACGAGCTCAACGACATATCGAACGTCAAACACGGTATTGGCCACTTATGGAATCTCAAACATTACTGGACAAAACTAAGCTAGCTGCTCCAATATTCGAAAATTTACCAAAAGAATACCTTGAACCTAACGAAATATCTGCCTGTGAAGAATCTATAGTGAACATTGTAAACTCTATTAAACAGCACGTTTGCCTGTCCGATTCTAGAAAGAACTCTTCCAAACGAGGATCATCATCTGGAACTTTACCTGTTGCACCTGTAC] [+] EMBL CD184711 [GATTTAACTGCGTCTTGCGGAATGTCATTACAATCTTTCAAGTACACTTGTTCAAGATATTCCCATGAAGGAGGAAGCCAATGTTAATTCTGGCAGTTCAATGTATGGTGTCGAAATTCTCCATCGAGCTGAAGTGCACGACATGTTAAAACGTCGGGGTATTTACGAGAAATTATTAGTACGTACAGATAGTGAAAATAATAAGTCCATATCGCGACCACACTCCGGATTTTCGAAAACTTTGGGCATAAAATGGGTCACGCCGAAGACCTCGGATGCTAATTTTCTGCGCTTTGCTGTTGCTACATACCGAGTAACTTTAGCAGACGTTTGCCACAGAGCATCTACTTGCCTAGCTCAATTTGTTTTAGGAGGTCGGTCTGT ] [+] EMBL CD069767 [ ATGTTAATTCTGGCAGTTCAATGTATGGTGTCGAAATTCTCCATCGAGCTGAAGTGCACGACATGTTAAAACGTCGGGGTATTTACGAGAAATTATTAGTACGTACAGATAGTGAAAATAATAAGTCCATATCACGACCACACTCCGGATTTTCGAAAACTTTGGGCATAAAATGGGTCACGCCGAAGACCTCGGATGCTAATTTTCTGCGCTTTGCTGTTGCTACATACCGAGTAACTTTAGCAGACGTTTGCCACAGAGCATCTACTTGCCTAGCTCAATTTGTTTTAGGAGGTCGGTCTGTTGCGTTGGCTCATCGTCTACAGTTTTCATTTCCAGCGTTACCTAATGATTCTAACTTCTTAACATCTTGCTCAACAGATGAAGCTCTTCTCCTCACCTGTCATGGATCCGTAATGTATATACATGTTTTAGCAACAATTTTCCCA ] [+] EMBL CD095779 [ TAATTCTGGCAGTTCAATGTATGGTGTCGAAATTCTCCGTCGAGCTGAAGTGCACGACATGTTAAAACGTCGGGGTATTTACGAGAAATTATTAGTACGTACAGATAGTGAAAATAATAAGTCCATATCACGACCACACTCCGGATTTTCGAAAACTTTGGGCATAAAATGGGTCACGCCGAAGACCTCGGATGCTAATTTTCTGCGCTTTGCTGTTGCTACATACCGAGTAACTTTAGCAGACGTTTGCCACAGAGCATCTACTTGCCTAGCTCAATTTGTTTTAGGAGGTCGGTCTGTTGCGTTGGCTCATCGTCTACAGTTTTCATTTCCAGCGTTACCTAATGATTCTAACTTCTTAACATCTTGCTCAACAGATGAAGCTCTTCTCCTCACCTGTCATGGATCCGTAATGTATATACATGTTTTAGCAACAATTTTCC ] [-] EMBL CD121920 [ ctTGAAGTGCACGACATGTTAAAACGTCGGGGTATTTACGAGAAATTATTAGTACGTACAGATAGTGAAAATAATAAGTCCATATCACGACCACACTCCGGATTTTCGAAAACTTTGGGCATAAAATGGGTCACGCCGAAGACCTCGGATGCTAATTTTCTGCGCTTTGCTGTTGCTACATACCGAGTAACTTTAGCAGACGTTTGCCACAGAGCATCTACTTGCCTAGCTCAATTTGTCTTAGGAGGTCGGTCTGTTGCGTTGGCTCATCGTCTACAGTTCTCATTTCCAGCGTTACCTAATGATTCTAACTTCTTAACATCTTGCTCAACAGATGAAGCTCTTCTCCTCACCTGTCATGGATCCGTAATGTATATACATGTTTTAGCAACAATTTTCCCAATGACTCATCCTCAGAATATTCCCTTAACTTCTAATCCTAATGTGGCCTCGGGAGATTA ] [-] EMBL CD122034 [ TGCACGACATGTTAAAACGTCGGGGTATTTACGAGAAATTATTAGTACGTACAGATAGTGAAAATAATAAGTCCATATCACGACCACACTCCGGATTTTCGAAAACTTTGGGCATAAAATGGGTCACGCCGAAGACCTCGGATGCTAATTTTCTGCGCTTTGCTGTTGCTACATACCGAGTAACTTTAGCAGACGTTTGCCACAGAGCATCTACTTGCCTAGCTCAATTTGTTTTAGGAGGTCGGTCTGTTGCGTTGGCTCATCGTCTACAGTTTTCATTTCCAGCGTTACCTAATGATTCTAACTTCTTAACATCTTGCTCAACAGATGAAGCTCTTCTCCTCACCTGTCATGGATCCGTAATGTATATACATGTTTTAGCAACAATTTTCCCAATGACTCATCCTCAGAATATTCCCTTAACTTCTAATCCTAATGTGGCCTCGGGAGATTA ] [-] EMBL CD121916 [ GGGTATTTACGAGAAATTAGTAGTACGTACAGATAGTGAAAATAATAAGTCCATATCACGACCACACTCCGGATTTTCGAAAACTTTGGGCATAAAATGGGTCACGCCGAAGACCTCGGATGCTAATTTTCTGCGCTTTGCTGTTGCTACATACCGAGTAACTTTAGCAGACGTTTGCCACAGAGCATCTACTTGCCTAGCTCAATTTGTTTTAGGAGGTCGGTCTGTTGCGTTGGCTCATCGTCTACAGTTTTCATTTCCAGCGTTACCTAATGATTCTAACTTCTTAACATCTTGCTCAACAGATGAAGCTCTTCTCCTCACCTGTCATGGATCCGTAATGTATATACATGTTTTAGCAACAATTTTCCCAATGACTCATCCTCAGAATATTCCCTTAACTTCTAATCCTAATGTGGCCTCGGGAGATTA ] [+] EMBL CD190991 [ TGGGCATAAAATGGGTCACGCCGAAGACCTCGGATGCTAATTTTCTGCGCTTTGCTGTTGCTACATACCGAGTAACTTTAGCAGACGTTTGCCACAGAGCATCTACTTGCCTAGCTCAATTTGTTTTAGGAGGTCGGTCTGTTGCGTTGGCTCATCGTCTACAGTTTTCATTTCCAGCGTTACCTAATGATTCTAACTTCTTAACATCTTGCTCAACAGATGAAGCTCTTCTCCTCACCTGTCATGGATCCGTAATGTATATACATGTTTTAGCAACAATTTTCCCAATGACTCATCCTCAGAATATTCCCTTAACTTCTAATCCTAATGTGGCCTCGGGAGAT ] [-] EMBL CD131147 [ CCTAGCTCAATTTGTTTTAGGAGGTCGGTCTGTTGCGTTGGCTCATCGTCTACAGTTTTCATTTCCAGCGTTACCTAATGATTCTAACTTCTTAACATCTTGCTCAACAGATGAAGCTCTTCTCCTCACCTGTCATGGATCCGTAATGTATATACATGTTTTAGCAACAATTTTCCCAATGACTCATCCTCAGAATATCCCCTTAGCTTCTAATCCTAATATGGCCTTGGGAGATTATCGTATACAAGCCTTCATTGACCAAATCT ] [+] EMBL CD127113 [ TGGCTCATCGTCTACAGTTTTCATTTCCAGCGTTACCTAATGATTCTAACTTCTTAACATCTTGCTCAACAGATGAAGCTCTTCTCCTCACCTGTCATGGATCCGTAATGTATATACATGTTTTAGCAACAATTTTCCCAATGACTCATCCTCAGAATATTCCCTTAACTTCTAATCCTAATGTGGCCTCGGGAGATTATCGTATACAAGCCTTCATTGACCAAATCTTACGCCCTTCTCGTCTGGCTCCAGCATCAGCTAGATTAAATTATTCAGTATTTCCCAAAGAACGAGCTCAACGACATATCGAACGTCAAACACGGTATTGGCCACTTATGGAATCTCAAACATTACTGGACAAAACTAAGCTAGCTGCTCCAATATTCGAAAATTTACCAAAAGAATACCTTGAACCTAACGAAATATCTGCCTGTGAAGAATCTATAGTGAACATTGTAAACTCTATTAAACAGCACGTTTGCCTGTCCGATTCTAGAAAGAACTCTTCCAAACGAGGATCATCATCTGGAACTTTACCTGTTGCACCTGTAC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||