These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9484#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 10 consensus length = 457 fasta sequence [GCGACTCCCTTCACGCATAGATTAATCACCACTGTGGATTAATAGTCATCGGCATGGGCGTTACCGTTGATACCTACAAGCCAGGGGATGGTAAACGAATTCCAAAGAAAGGTCAGAGAGTCGTTGTTCATTACACTGGTACCCTCATGGATGGGAAAAAGTTTGATAGTTCACGTGACAGAAATAAACCATTCGAGTTTGTAATTGGGACGGGGAAAGTAATTCGAGGTTGGGATGAAGGTGTTATTCAAATGAGTGTGGGAGAGCGTGCCTACCTTACTTGTACTCCAGACTACGCATATGGTTCCAAGGGGGTCGATAAAGTTATCCCTCCAAATGCTACTCTGAAATTTGATGTGGAGTTAATCGATATATTATGACTCATTCCAGTTTTTCTTACCATTCATTGCTTCCACTTAATAAATTTTGTTCACTAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAA] [-] EMBL CD139517 [GCGACTCCCTTCACGCATAGATTAATCACCACTGTGGATTAATAGTCATCGGCATGGGCGTTACCGTTGATACCTACAAGCCAGGGGATGGTAAACGAATTCCAAAGAAAGGTCAGAGAGTCGTTGTTCATTACACTGGTACCCTCATGGATGGGAAAAAGTTTGATAGTTCACGTGACAGAAATAAACCATTCGAGTTTGTAATTGGGACGGGGAAAGTAATTCGAGGTTGGGATGAAGGTGTTATTCAAATGAGTGTGGGAGAGCGTGCCTACCTTACTTGTACTCCAGACTACGCATATGGTTCCAAGGGGGTCGATAAAGTTATCCCTCCAAATGCTACTCTGAAATTTGATGTGGAGTcgcc ] [+] EMBL CD146164 [ AATCACCACTGTGGATTAATAGTCATCGGCATGGGCGTTACCGTTGATACCTACAAGCCAGGGGATGGTAAACGAATTCCAAAGAAAGGTCAGAGAGTCGTTGTTCATTACACTGGTACCCTCATGGATGGGAAAAAGTTTGATAGTTCACGTGACAGAAATAAACCATTCGAGTTTGTAATTGGGACGGGGAAAGTAATTCGAGGTTGGGATGAAGGTGTTATTCc ] [+] EMBL CD191138 [ TAATAGTCATCGGCATGGGCGTTACCGTTGATACCTACAAGCCAGGGGATGGTAAACGAATTCCAAAGAAAGGTCAGAGAGTCGTTGTTCATTACACTGGTACCCTCATGGATGGGAAAAAGTTTGATAGTTCACGTGACAGAAATAAACCATTCGAGTTTGTAATTGGGACGGGG ] [+] EMBL CD158215 [ AATAGTCATCGGCATGGGCGTTACCGTTGATACCTACAAGCCAGGGGATGGTAAACGAATTCCAAAGAAAGGTCAGAGAGTCGTTGTTCATTACACTGGTACCCTCATGGATGGGAAAAAGTTTGATAGTTCACGTGACAGAAATAAACCATTCGAGTTTGTAATTGGGACGGGGAAAGTAATTCGAGGTTGGGATGAAGGTGTTATTCAAATGAGTGTGGGAGAGCGTGCCTACCTTACTTGTACTCCAGACTACGCATATGGTTCCAAGGGGGTCGATAAAGTTATCCCTCCAAATGCTACTCTGAAATTTGAT ] [+] EMBL AY118110 [ CATCGGCATGGGCGTTACCGTTGATACCTACAAGCCAGGGGATGGTAAACGAATTCCAAAGAAAGGTCAGAGAGTCGTTGTTCATTACACTGGTACTCTCATGGATGGGAAAAAGTTTGATAGTTCACGTGACAGAAATAAACCATTCGAGTTTGTAATTGGGACGGGGAAAGTAATTCGAGGTTGGGATGAAGGTGTTATTCAAATGAGTGTGGGAGAGCGTGCCTACCTTACTTGTACTCCAGACTACGCATATGGTTCCAAGGGGGTCGATAAAGTTATCCCTCCAAATGCTACTCTGAAATTTGATGTGGAGTTAATCGATATATTATGACTCATTCCAGTTTTTCTTACCATTCATTGCTTCCACTTAATAAATTTTGTTCACTAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAA] [-] EMBL AI977270 [ CGGCATGGGCGTTACCGTTGATACCTACAAGCCAGGGGATGGTAAACGAATTCCAAAGAAAGGTCAGAGAGTCGTTGTTCATTACACTGGTACCCTCATGGATGGGAAAAAGTTTGATAGTTCACGTGACAGAAATAAACCATTCGAGTTTGTAATTGGGACGGGGAAAGTAATTCGAGGTTGGGATGAAGGTGTTATTCAAATGAGTGTGGGAGAGCGTGCCTACCTTACTTGTACTCCAGACTACGCATATGGTTCCAAGGGGGTCGATAAAGTTATCCCTCCAAATGCTACTCTGAAATTTGATGTGGAGTTAATCGATATATTATGACTCATTCCAGTTTTTCTTACCATTCATTGCTTCCACTTAATAAATTTTG ] [+] EMBL CD131652 [ TACCGTTGATACCTACAAGCCAGGGGATGGTAAACGAATTCCAAAGAAAGGTCAGAGAGTCGTTGTTCATTACACTGGTACCCTCATGGATGGGAAAAAGTTTGATAGTTCACGTGACAGAAATAAACCATTCGAGTTTGTAATTGGGACGGGGAAAGTAATTCGAGGTTGGGATGAAGGTGTTATTCAAATGAGTGTGGGAGAGCGTGCCTACCTTACTTGTACTCCAGACTACGCATATGGTTCCAAGGGGGTCGATAAAGTTATCCCTCCAAATGCTACTCTGAAATTTGATGTGGAGTTAATCGATATATTATGACTCATTCCAGTTTTTCTTACCATTCATTGCTTCCACTTAATAAATTTTt ] [+] EMBL SM612 [ CTACAAGCCAGGGGATGGTAAACGANTTCCAAAGAAAGGTCAGAGAGTCGTTGTTCATTACACTGGTACCCTCATGGATGGGAAAAAGTTTGATAGNNCACGTGACAGAAATAAACCATTCGAGTTTGTNATTGGGACGGGGAAAGTAATTCGNGGTTGGGATGAAGGTGTTATTCAAATGAGTGTGGGAGAGCGTGCCTACCTTACTTGTACTCCAGACTACGCATATGGTTCCAAGGGGGTCGATAAAGTTATCCCTCCAAATGCTACTCTGAAATTGGATGTGGAGTTAATCGATATNTTATGACTCATCCCAGgt ] [+] EMBL CD135267 [ GGATGGTAAACGAATTCCAAAGAAAGGTCAGAGAGTCGTTGTTCATTACACTGGTACCCTCATGGATGGGAAAAAGTTTGATAGTTCACGTGACAGAAATAAACCATTCGAGTTTGTAATTGGGACGGGGAAAGTAATTCGAGGTTGGGATGAAGGTGTTATTCAAATGAGTGTGGGAGAGCGTGCCTACCTTACTTGTACTCCAGACTACGCATATGGTTCCAAGGNGGTCGATAAAGTTATCCCTCCAAATGCTACTCT ] [+] EMBL CD135285 [ GGATGGTAAACGAATTCCAAAGAAAGGTCAGAGAGTCGTTGTTCATTACACTGGTACCCTCATGGATGGGAAAAAGTTTGATAGTTCACGTGACAGAAATAAACCATTCGAGTTTGTAATTGGGACGGGGAAAGTAATTCGAGGTTGGGATGAAGGTGTTATTCAAATGAGTGTGGGAGAGCGTGCCTACCTTACTTGTACTCCAGACTACGCATATGGTTCCAAGGCGGTCGATAAAGTTATCCCTCCAAATGCTACTCT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||