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Schistosoma mansoni
cluster # 9484 cluster # 9484       Sequences # 10       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9484#0 length = 457 sequences # 10  

consensusID : consensus_9484#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 10
consensus length = 457
fasta sequence
                              [GCGACTCCCTTCACGCATAGATTAATCACCACTGTGGATTAATAGTCATCGGCATGGGCGTTACCGTTGATACCTACAAGCCAGGGGATGGTAAACGAATTCCAAAGAAAGGTCAGAGAGTCGTTGTTCATTACACTGGTACCCTCATGGATGGGAAAAAGTTTGATAGTTCACGTGACAGAAATAAACCATTCGAGTTTGTAATTGGGACGGGGAAAGTAATTCGAGGTTGGGATGAAGGTGTTATTCAAATGAGTGTGGGAGAGCGTGCCTACCTTACTTGTACTCCAGACTACGCATATGGTTCCAAGGGGGTCGATAAAGTTATCCCTCCAAATGCTACTCTGAAATTTGATGTGGAGTTAATCGATATATTATGACTCATTCCAGTTTTTCTTACCATTCATTGCTTCCACTTAATAAATTTTGTTCACTAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]

[-] EMBL CD139517             [GCGACTCCCTTCACGCATAGATTAATCACCACTGTGGATTAATAGTCATCGGCATGGGCGTTACCGTTGATACCTACAAGCCAGGGGATGGTAAACGAATTCCAAAGAAAGGTCAGAGAGTCGTTGTTCATTACACTGGTACCCTCATGGATGGGAAAAAGTTTGATAGTTCACGTGACAGAAATAAACCATTCGAGTTTGTAATTGGGACGGGGAAAGTAATTCGAGGTTGGGATGAAGGTGTTATTCAAATGAGTGTGGGAGAGCGTGCCTACCTTACTTGTACTCCAGACTACGCATATGGTTCCAAGGGGGTCGATAAAGTTATCCCTCCAAATGCTACTCTGAAATTTGATGTGGAGTcgcc                                                                                          ]
[+] EMBL CD146164             [                       AATCACCACTGTGGATTAATAGTCATCGGCATGGGCGTTACCGTTGATACCTACAAGCCAGGGGATGGTAAACGAATTCCAAAGAAAGGTCAGAGAGTCGTTGTTCATTACACTGGTACCCTCATGGATGGGAAAAAGTTTGATAGTTCACGTGACAGAAATAAACCATTCGAGTTTGTAATTGGGACGGGGAAAGTAATTCGAGGTTGGGATGAAGGTGTTATTCc                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD191138             [                                       TAATAGTCATCGGCATGGGCGTTACCGTTGATACCTACAAGCCAGGGGATGGTAAACGAATTCCAAAGAAAGGTCAGAGAGTCGTTGTTCATTACACTGGTACCCTCATGGATGGGAAAAAGTTTGATAGTTCACGTGACAGAAATAAACCATTCGAGTTTGTAATTGGGACGGGG                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD158215             [                                        AATAGTCATCGGCATGGGCGTTACCGTTGATACCTACAAGCCAGGGGATGGTAAACGAATTCCAAAGAAAGGTCAGAGAGTCGTTGTTCATTACACTGGTACCCTCATGGATGGGAAAAAGTTTGATAGTTCACGTGACAGAAATAAACCATTCGAGTTTGTAATTGGGACGGGGAAAGTAATTCGAGGTTGGGATGAAGGTGTTATTCAAATGAGTGTGGGAGAGCGTGCCTACCTTACTTGTACTCCAGACTACGCATATGGTTCCAAGGGGGTCGATAAAGTTATCCCTCCAAATGCTACTCTGAAATTTGAT                                                                                                     ]
[+] EMBL AY118110             [                                              CATCGGCATGGGCGTTACCGTTGATACCTACAAGCCAGGGGATGGTAAACGAATTCCAAAGAAAGGTCAGAGAGTCGTTGTTCATTACACTGGTACTCTCATGGATGGGAAAAAGTTTGATAGTTCACGTGACAGAAATAAACCATTCGAGTTTGTAATTGGGACGGGGAAAGTAATTCGAGGTTGGGATGAAGGTGTTATTCAAATGAGTGTGGGAGAGCGTGCCTACCTTACTTGTACTCCAGACTACGCATATGGTTCCAAGGGGGTCGATAAAGTTATCCCTCCAAATGCTACTCTGAAATTTGATGTGGAGTTAATCGATATATTATGACTCATTCCAGTTTTTCTTACCATTCATTGCTTCCACTTAATAAATTTTGTTCACTAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]
[-] EMBL AI977270             [                                                 CGGCATGGGCGTTACCGTTGATACCTACAAGCCAGGGGATGGTAAACGAATTCCAAAGAAAGGTCAGAGAGTCGTTGTTCATTACACTGGTACCCTCATGGATGGGAAAAAGTTTGATAGTTCACGTGACAGAAATAAACCATTCGAGTTTGTAATTGGGACGGGGAAAGTAATTCGAGGTTGGGATGAAGGTGTTATTCAAATGAGTGTGGGAGAGCGTGCCTACCTTACTTGTACTCCAGACTACGCATATGGTTCCAAGGGGGTCGATAAAGTTATCCCTCCAAATGCTACTCTGAAATTTGATGTGGAGTTAATCGATATATTATGACTCATTCCAGTTTTTCTTACCATTCATTGCTTCCACTTAATAAATTTTG                            ]
[+] EMBL CD131652             [                                                             TACCGTTGATACCTACAAGCCAGGGGATGGTAAACGAATTCCAAAGAAAGGTCAGAGAGTCGTTGTTCATTACACTGGTACCCTCATGGATGGGAAAAAGTTTGATAGTTCACGTGACAGAAATAAACCATTCGAGTTTGTAATTGGGACGGGGAAAGTAATTCGAGGTTGGGATGAAGGTGTTATTCAAATGAGTGTGGGAGAGCGTGCCTACCTTACTTGTACTCCAGACTACGCATATGGTTCCAAGGGGGTCGATAAAGTTATCCCTCCAAATGCTACTCTGAAATTTGATGTGGAGTTAATCGATATATTATGACTCATTCCAGTTTTTCTTACCATTCATTGCTTCCACTTAATAAATTTTt                            ]
[+] EMBL SM612                [                                                                         CTACAAGCCAGGGGATGGTAAACGANTTCCAAAGAAAGGTCAGAGAGTCGTTGTTCATTACACTGGTACCCTCATGGATGGGAAAAAGTTTGATAGNNCACGTGACAGAAATAAACCATTCGAGTTTGTNATTGGGACGGGGAAAGTAATTCGNGGTTGGGATGAAGGTGTTATTCAAATGAGTGTGGGAGAGCGTGCCTACCTTACTTGTACTCCAGACTACGCATATGGTTCCAAGGGGGTCGATAAAGTTATCCCTCCAAATGCTACTCTGAAATTGGATGTGGAGTTAATCGATATNTTATGACTCATCCCAGgt                                                                 ]
[+] EMBL CD135267             [                                                                                     GGATGGTAAACGAATTCCAAAGAAAGGTCAGAGAGTCGTTGTTCATTACACTGGTACCCTCATGGATGGGAAAAAGTTTGATAGTTCACGTGACAGAAATAAACCATTCGAGTTTGTAATTGGGACGGGGAAAGTAATTCGAGGTTGGGATGAAGGTGTTATTCAAATGAGTGTGGGAGAGCGTGCCTACCTTACTTGTACTCCAGACTACGCATATGGTTCCAAGGNGGTCGATAAAGTTATCCCTCCAAATGCTACTCT                                                                                                               ]
[+] EMBL CD135285             [                                                                                     GGATGGTAAACGAATTCCAAAGAAAGGTCAGAGAGTCGTTGTTCATTACACTGGTACCCTCATGGATGGGAAAAAGTTTGATAGTTCACGTGACAGAAATAAACCATTCGAGTTTGTAATTGGGACGGGGAAAGTAATTCGAGGTTGGGATGAAGGTGTTATTCAAATGAGTGTGGGAGAGCGTGCCTACCTTACTTGTACTCCAGACTACGCATATGGTTCCAAGGCGGTCGATAAAGTTATCCCTCCAAATGCTACTCT                                                                                                               ]


>consensus_9484#0 GCGACTCCCTTCACGCATAGATTAATCACCACTGTGGATTAATAGTCATCGGCATGGGCG TTACCGTTGATACCTACAAGCCAGGGGATGGTAAACGAATTCCAAAGAAAGGTCAGAGAG TCGTTGTTCATTACACTGGTACCCTCATGGATGGGAAAAAGTTTGATAGTTCACGTGACA GAAATAAACCATTCGAGTTTGTAATTGGGACGGGGAAAGTAATTCGAGGTTGGGATGAAG GTGTTATTCAAATGAGTGTGGGAGAGCGTGCCTACCTTACTTGTACTCCAGACTACGCAT ATGGTTCCAAGGGGGTCGATAAAGTTATCCCTCCAAATGCTACTCTGAAATTTGATGTGG AGTTAATCGATATATTATGACTCATTCCAGTTTTTCTTACCATTCATTGCTTCCACTTAA TAAATTTTGTTCACTAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)