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Schistosoma mansoni
cluster # 9490 cluster # 9490       Sequences # 10       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9490#0 length = 633 sequences # 10  

consensusID : consensus_9490#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 10
consensus length = 633
fasta sequence
                              [GGCTTCTTGGAAGTGGTAAAACTACTCAATTAACTCAATATTTACATGAAGATGGTTTTACAACCTATGGTATGGTTGGTTGTACTCAACCACGCCGTGTTGCTGCTATGTCTGTTGCTCGGCGAGTTGCTGAAGAAATGAATGTACGTTTAGGTGAAGAAGTTGGTTATGCTATAAGATTCGAAGATTGTACTTCTCCTTCCACTCTAATTAAGTATATGACTGATGGAATTCTATTACGTGAGTCACTACGTGAATCTGATCTTGATCCATACTCTGCAATTATCATGGATGAAGCACATGAAAGATCTTTAAATACTGATGTGTTATTTGGATTGTTGCGTGAAGTTGTTAGTAGGCGTAATGATTTACGTCTATTAATCACTTCTGCTACAATGGATGCAGAAAGATTTGCTCAGTTTTTC-GGTGATTGTCCTATTTTTCGAATACCTGGTCGAACATTTCCTGTTGATAAAGAATTTAGTAAAAC-AACAGTAATGGATTATGTAGATGCATCTGTGAAACAAGCAATTCAAGTTCATTTANGTTCACCAACAGATGGTGATATACTCATTTTTATGCCTGGTCAAGAGGATATTGAAGTGACATGTGAACTAATTGCTGAACGTTTGA]

[+] EMBL CD132859             [GGCTTCTTGGAAGTGGTAAAACTACTCAATTAACTCAATATTTACATGAAGATGGTTTTACAACCTATGGTATGGTTGGTTGTACTCAACCACGCCGTGTTGCTGCTATGTCTGTTGCTCGGCGAGTTGCTGAAGAAATGAATGTACGTTTAGGTGAAGAAGTTGGTTATGCTATAAGATTCGAAGATTGTACTTCTCCTTCCACTCTAATTAAGTATATGACTGATGGAATTCTATTACGTGAGTCACTACGTGAATCTGATCTTGATCCATACTCTGCAATTATCATGGATGAAGCACATGAAAGATCTTTAAATACTGATGTGTTATTTGGATTGTTGCGTGAAGTTGTTAGTAGGCGTAATGATTTACGTCTATTAATCACTTCTGCTACAATGGATGCAGAAAGATTTGCTCAGTTTTTC GGTGATTGTCCTATTTTTCGAATACCTGGTCGAACATTTCCTGTTGATAAAGAATTTAGTAAAAC AACAGTAATGGATTATGTAGATGCATCTGTGAAACAAGCAATTCAAGTTCATTTANGTTCACCAACAGATGGTGATATACTCATTTTTAT                                                     ]
[+] EMBL CD059218             [                                                                                                                                               GTACGTTTAGGTGAAGAAGTTGGTTATGCTATAAGATTCGAAGATTGTACTTCTCCTTCCACTCTAATTAAGTATATGACTGATGGAATTCTATTACGTGAGTCACTACGTGAATCTGATCTTGATCCATACTCTGCAATTATCATGGATGAAGCACATGAAAGATCTTTAAATACTGATGTGTTATTAGGATTGTTGCGTGAAGTTGTTAGTAGGCGTAATGATTTACGTCTATTAATCACTTCTGCTACAATGGATGCAGAAAGATTTGCTCAGTTTTTC GGTGATTGTCCTATTT                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD059186             [                                                                                                                                               GTACGTTTAGGTGAAGAAGTTGGTTATGCTATAAGATTCGAAGATTGTACTTCTCCTTCCACTCTAATTAAGTATATGACTGATGGAATTCTATTACGTGAGTCACTACGTGAATCTGATCTTGATCCATACTCTGCAATTATCATGGATGAAGCACATGAAAGATCTTCAAATACTGATGTGTTATTTGGATTGTTGCGTGAAGTTGTTAGTAGGCGTAATGATTTACGTCTATTAATCACTTCTGCTACAATGGATGCAGAAAGATTTGCTCAGTTTTTC GGTGATTGTCCTATTT                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD059216             [                                                                                                                                                TACGTTTAGGTGAAGAAGTTGGTTATGCTATAAGATTCGAAGATTGTACTTCTCCTTCCACTCTAATTAAGTATATGACTGATGGAATTCTATTACGTGAGTCACTACGTGAATCTGATCTTGATCCATACTCTGCAATTATCATGGATGAAGCACATGAAAGATCTTTAAATACTGATGTGTTATTTGGATTGTTGCGTGAAGTTGTTAGTAGGCGTAATGATTTACGTCTATTAATCACTTCTGCTACAATGGATGCAGAAAGATTTGCTCAGTTTTTC GGTGATTGTCCTAT                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD059168             [                                                                                                                                                TACGTTTAGGTGAAGAAGTTGGTTATGCTATAAGATTCGAAGATTGTACTTCTCCTTCCACTCTAATTAAGTATATGACTGATGGAATTCTATTACGTGAGTCACTACGTGAATCTGATCTTGATCCATACTCTGCAATTATCATGGATGAAGCACATGAAAGATCTTTAAATACTGATGTGTTATTTGGATTGTTGCGTGAAGTTGTTAGTAGGCGTAATGATTTACGTCTATTAATCACTTCTGCTACAATGGATGCAGAAAGATTTGCTCAGTTTTTC GGTGATTGTCCTATTT                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD059180             [                                                                                                                                                 ACGTTTAGGTGAAGAAGTTGGTTATGCTATAAGATTCGAAGATTGTACTTCTCCTTCCACTCTAATTAAGTATATGACTGATGGAATTCTATTACGTGAGTCACTACGTGAATCTGATCTTGATCCATACTCTGCAATTATCATGGATGAAGCACATGAAAGATCTTTAAATACTGATGTGTTATTTGGATTGTTGCGTGAAGTTGTTGGTAGGCGTAATGATTTACGTCTATTAATCACTTCTGCTACAATGGATGCAGAAAGATTTGCTCAGTTTTTCAGGTGATTGTCCTATTTTTCG                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD059265             [                                                                                                                                                 ACGTTTAGGTGAAGAAGTTGGTTATGCTATAAGATTCGAAGATTGTACTTCTCCTTCCACTCTAATTAAGTATATGACTGATGGAATTCTATTACGTGAGTCACTACGTGAATCTGATCTTGATCCATACTCTGCAATTATCATGGATGAAGCACATGAAAGATCTTTAAATACTGATGTGTTATTTGGATTGTTGCGTGAAGTTGTTAGTAGGCGTAATGATTTACGTCTATTAATCACTTCTGCTACAATGGATGCAGAAAGATTTGCTCAGTTTTTC GGTGATTGTCCTATTTTTCG                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD059226             [                                                                                                                                                 ACGTTTAGGTGAAGAAGTTGGTTATGCTATAAGATTCGAAGATTGTACTTCTCCTTCCACTCTAATTAAGTATATGACTGATGGAATTCTATTACGTGAGTCACTACGTGAATCTGATCTTGATCCATACTCTGCAATTATCATGGATGAAGCACATGAAAGATCTTTAAATACTGATGTGTTATTTGGATTGTTGCGTGAAGTTGTTAGTAGGCGTAATGATTTACGTCTATTAATCACTTCTACTACAATGGATGCAGAAAGATTTGCTCAGTTTTTC GGTGATTGTCCTATTT                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD059183             [                                                                                                                                                 ACGTTTAGGTGAAGAAGTTGGTTATGCTATAAGATTCGAAGATTGTACTTCTCCTTCCACTCTAATTAAGTATATGACTGATGGAATTCTATTACGTGAGTCACTACGTGAATCTGATCTTGATCCATACTCTGCAATTATCATGGATGAAGCACATGAAAGATCTTTAAATACTGATGTGTTATTTGGATTGTTGCGTGAAGTTGTTAGTAGGCGTAATGATTTACGTCTATTAATCACTTCTGCTACAATGGATGCAGAAAGATTTGCTCAGTTTTTC GGTGATTGTCCTATT                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD130602             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CTTTAAATACTGATGTGTTATNTGGATTGTGNCGTGAAGTTGTTAGTAGGCGTAATGATTTACGTCTATTAATCACTTCTGCTACAATGGATGCAGAAAGATTTGCTCAGTTTTTC GGTGATTGTCCTATTTTTCGAATACCTGGTCGAACATTTCCTGTTGATAAAGAATTTAGTANAACNAACAGTAATGGATTATGTAGATGCATCTGTGAAACAAGCAATTCAAGTTCATTTAGGTTCACCAACAGATGGTGATATACTCATTTTTATGCCTGGTCAAGAGGATATTGAAGTGACATGTGAACTAATTGCTGAACGTTTGA]


>consensus_9490#0 GGCTTCTTGGAAGTGGTAAAACTACTCAATTAACTCAATATTTACATGAAGATGGTTTTA CAACCTATGGTATGGTTGGTTGTACTCAACCACGCCGTGTTGCTGCTATGTCTGTTGCTC GGCGAGTTGCTGAAGAAATGAATGTACGTTTAGGTGAAGAAGTTGGTTATGCTATAAGAT TCGAAGATTGTACTTCTCCTTCCACTCTAATTAAGTATATGACTGATGGAATTCTATTAC GTGAGTCACTACGTGAATCTGATCTTGATCCATACTCTGCAATTATCATGGATGAAGCAC ATGAAAGATCTTTAAATACTGATGTGTTATTTGGATTGTTGCGTGAAGTTGTTAGTAGGC GTAATGATTTACGTCTATTAATCACTTCTGCTACAATGGATGCAGAAAGATTTGCTCAGT TTTTCGGTGATTGTCCTATTTTTCGAATACCTGGTCGAACATTTCCTGTTGATAAAGAAT TTAGTAAAACAACAGTAATGGATTATGTAGATGCATCTGTGAAACAAGCAATTCAAGTTC ATTTANGTTCACCAACAGATGGTGATATACTCATTTTTATGCCTGGTCAAGAGGATATTG AAGTGACATGTGAACTAATTGCTGAACGTTTGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)