These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9490#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 10 consensus length = 633 fasta sequence [GGCTTCTTGGAAGTGGTAAAACTACTCAATTAACTCAATATTTACATGAAGATGGTTTTACAACCTATGGTATGGTTGGTTGTACTCAACCACGCCGTGTTGCTGCTATGTCTGTTGCTCGGCGAGTTGCTGAAGAAATGAATGTACGTTTAGGTGAAGAAGTTGGTTATGCTATAAGATTCGAAGATTGTACTTCTCCTTCCACTCTAATTAAGTATATGACTGATGGAATTCTATTACGTGAGTCACTACGTGAATCTGATCTTGATCCATACTCTGCAATTATCATGGATGAAGCACATGAAAGATCTTTAAATACTGATGTGTTATTTGGATTGTTGCGTGAAGTTGTTAGTAGGCGTAATGATTTACGTCTATTAATCACTTCTGCTACAATGGATGCAGAAAGATTTGCTCAGTTTTTC-GGTGATTGTCCTATTTTTCGAATACCTGGTCGAACATTTCCTGTTGATAAAGAATTTAGTAAAAC-AACAGTAATGGATTATGTAGATGCATCTGTGAAACAAGCAATTCAAGTTCATTTANGTTCACCAACAGATGGTGATATACTCATTTTTATGCCTGGTCAAGAGGATATTGAAGTGACATGTGAACTAATTGCTGAACGTTTGA] [+] EMBL CD132859 [GGCTTCTTGGAAGTGGTAAAACTACTCAATTAACTCAATATTTACATGAAGATGGTTTTACAACCTATGGTATGGTTGGTTGTACTCAACCACGCCGTGTTGCTGCTATGTCTGTTGCTCGGCGAGTTGCTGAAGAAATGAATGTACGTTTAGGTGAAGAAGTTGGTTATGCTATAAGATTCGAAGATTGTACTTCTCCTTCCACTCTAATTAAGTATATGACTGATGGAATTCTATTACGTGAGTCACTACGTGAATCTGATCTTGATCCATACTCTGCAATTATCATGGATGAAGCACATGAAAGATCTTTAAATACTGATGTGTTATTTGGATTGTTGCGTGAAGTTGTTAGTAGGCGTAATGATTTACGTCTATTAATCACTTCTGCTACAATGGATGCAGAAAGATTTGCTCAGTTTTTC GGTGATTGTCCTATTTTTCGAATACCTGGTCGAACATTTCCTGTTGATAAAGAATTTAGTAAAAC AACAGTAATGGATTATGTAGATGCATCTGTGAAACAAGCAATTCAAGTTCATTTANGTTCACCAACAGATGGTGATATACTCATTTTTAT ] [+] EMBL CD059218 [ GTACGTTTAGGTGAAGAAGTTGGTTATGCTATAAGATTCGAAGATTGTACTTCTCCTTCCACTCTAATTAAGTATATGACTGATGGAATTCTATTACGTGAGTCACTACGTGAATCTGATCTTGATCCATACTCTGCAATTATCATGGATGAAGCACATGAAAGATCTTTAAATACTGATGTGTTATTAGGATTGTTGCGTGAAGTTGTTAGTAGGCGTAATGATTTACGTCTATTAATCACTTCTGCTACAATGGATGCAGAAAGATTTGCTCAGTTTTTC GGTGATTGTCCTATTT ] [+] EMBL CD059186 [ GTACGTTTAGGTGAAGAAGTTGGTTATGCTATAAGATTCGAAGATTGTACTTCTCCTTCCACTCTAATTAAGTATATGACTGATGGAATTCTATTACGTGAGTCACTACGTGAATCTGATCTTGATCCATACTCTGCAATTATCATGGATGAAGCACATGAAAGATCTTCAAATACTGATGTGTTATTTGGATTGTTGCGTGAAGTTGTTAGTAGGCGTAATGATTTACGTCTATTAATCACTTCTGCTACAATGGATGCAGAAAGATTTGCTCAGTTTTTC GGTGATTGTCCTATTT ] [+] EMBL CD059216 [ TACGTTTAGGTGAAGAAGTTGGTTATGCTATAAGATTCGAAGATTGTACTTCTCCTTCCACTCTAATTAAGTATATGACTGATGGAATTCTATTACGTGAGTCACTACGTGAATCTGATCTTGATCCATACTCTGCAATTATCATGGATGAAGCACATGAAAGATCTTTAAATACTGATGTGTTATTTGGATTGTTGCGTGAAGTTGTTAGTAGGCGTAATGATTTACGTCTATTAATCACTTCTGCTACAATGGATGCAGAAAGATTTGCTCAGTTTTTC GGTGATTGTCCTAT ] [+] EMBL CD059168 [ TACGTTTAGGTGAAGAAGTTGGTTATGCTATAAGATTCGAAGATTGTACTTCTCCTTCCACTCTAATTAAGTATATGACTGATGGAATTCTATTACGTGAGTCACTACGTGAATCTGATCTTGATCCATACTCTGCAATTATCATGGATGAAGCACATGAAAGATCTTTAAATACTGATGTGTTATTTGGATTGTTGCGTGAAGTTGTTAGTAGGCGTAATGATTTACGTCTATTAATCACTTCTGCTACAATGGATGCAGAAAGATTTGCTCAGTTTTTC GGTGATTGTCCTATTT ] [-] EMBL CD059180 [ ACGTTTAGGTGAAGAAGTTGGTTATGCTATAAGATTCGAAGATTGTACTTCTCCTTCCACTCTAATTAAGTATATGACTGATGGAATTCTATTACGTGAGTCACTACGTGAATCTGATCTTGATCCATACTCTGCAATTATCATGGATGAAGCACATGAAAGATCTTTAAATACTGATGTGTTATTTGGATTGTTGCGTGAAGTTGTTGGTAGGCGTAATGATTTACGTCTATTAATCACTTCTGCTACAATGGATGCAGAAAGATTTGCTCAGTTTTTCAGGTGATTGTCCTATTTTTCG ] [-] EMBL CD059265 [ ACGTTTAGGTGAAGAAGTTGGTTATGCTATAAGATTCGAAGATTGTACTTCTCCTTCCACTCTAATTAAGTATATGACTGATGGAATTCTATTACGTGAGTCACTACGTGAATCTGATCTTGATCCATACTCTGCAATTATCATGGATGAAGCACATGAAAGATCTTTAAATACTGATGTGTTATTTGGATTGTTGCGTGAAGTTGTTAGTAGGCGTAATGATTTACGTCTATTAATCACTTCTGCTACAATGGATGCAGAAAGATTTGCTCAGTTTTTC GGTGATTGTCCTATTTTTCG ] [+] EMBL CD059226 [ ACGTTTAGGTGAAGAAGTTGGTTATGCTATAAGATTCGAAGATTGTACTTCTCCTTCCACTCTAATTAAGTATATGACTGATGGAATTCTATTACGTGAGTCACTACGTGAATCTGATCTTGATCCATACTCTGCAATTATCATGGATGAAGCACATGAAAGATCTTTAAATACTGATGTGTTATTTGGATTGTTGCGTGAAGTTGTTAGTAGGCGTAATGATTTACGTCTATTAATCACTTCTACTACAATGGATGCAGAAAGATTTGCTCAGTTTTTC GGTGATTGTCCTATTT ] [-] EMBL CD059183 [ ACGTTTAGGTGAAGAAGTTGGTTATGCTATAAGATTCGAAGATTGTACTTCTCCTTCCACTCTAATTAAGTATATGACTGATGGAATTCTATTACGTGAGTCACTACGTGAATCTGATCTTGATCCATACTCTGCAATTATCATGGATGAAGCACATGAAAGATCTTTAAATACTGATGTGTTATTTGGATTGTTGCGTGAAGTTGTTAGTAGGCGTAATGATTTACGTCTATTAATCACTTCTGCTACAATGGATGCAGAAAGATTTGCTCAGTTTTTC GGTGATTGTCCTATT ] [-] EMBL CD130602 [ CTTTAAATACTGATGTGTTATNTGGATTGTGNCGTGAAGTTGTTAGTAGGCGTAATGATTTACGTCTATTAATCACTTCTGCTACAATGGATGCAGAAAGATTTGCTCAGTTTTTC GGTGATTGTCCTATTTTTCGAATACCTGGTCGAACATTTCCTGTTGATAAAGAATTTAGTANAACNAACAGTAATGGATTATGTAGATGCATCTGTGAAACAAGCAATTCAAGTTCATTTAGGTTCACCAACAGATGGTGATATACTCATTTTTATGCCTGGTCAAGAGGATATTGAAGTGACATGTGAACTAATTGCTGAACGTTTGA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||