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Schistosoma mansoni
cluster # 9523 cluster # 9523       Sequences # 10       consensus # 4


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9523#0 length = 969 sequences # 4  
consensus_9523#1 length = 585 sequences # 4  
consensus_9523#2 length = 487 sequences # 1  
consensus_9523#3 length = 295 sequences # 1  

consensusID : consensus_9523#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 969
fasta sequence
                              [AACGCTCTCACACTCACACTATTCGATTGTCCTAATTTCAAGAAATCAGCGATATGTTTGTTGCATGTTCTCATATTGGTCTGCAGTGGGTTGCGCTTTTACTGGCTTTGATCATGAGTTTCACAGTTCTAACAACATATCTCATTTCCATCTATAGAGGACATGTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTACAGGTGCCTATCCACCAGAAAGTTGTATATTTGGTGAGGGATTAAACATAGCTGCTTTTATCAGTTTGATATGCTCCTTTTGCTGGTATTTAATTGCCCTAGAGAGAACGAAATTTATGGGCACACACCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGCTTGTATTGTCTCTAATTGCTTCAATCGGTTTAACATTGGTTGGGAATTTTCAACAAGTTAACGTTGAATTAGTACATGATATTGGTGCTGGGATGGCTTTTTTCGGCACAACGCTTTATATCACTTTATGTGCTTTAGTTAGCAAACGATACCTTGGAANNNATTGGTGTATATGGGCTTTTAGACTTGTCTTAGGGATTATGGCAGCAATAACATCAAGTTTGTTTTCAGTCTGTCATACAATTTCCAGAATAAATTTCAACGGTACACAAGAAGAATCTTTGACTTATCGGCATCCTGGTCAAGGTGGATTTTCATTTTATCTATGCAGTACAAGTTTTGAGTGGGCTGCAGGATTTATCATCATAGTGTTTTTTACCACATGGGCTTACGAATTCAGATCATATGCTTTTCAGTTACCACAGGTTGTTAAAAAACACCCATTTGAATCCGATATCTATAGCCTCAAAAGCTGAAGACAGCTGCTGGTTACTTTAAAAGCTTTCTCCCTCAACTTCAAATAATCAAATAATTGAAACTTCTAACCCCTACGTTATCACTATATAAATCCATAATTACTTTAATATATTATTATTGATTATTCACCAATAAAACCACA]

[+] EMBL CD081050             [AACGCTCTCACACTCACACTATTCGATTGTCCTAATTTCAAGAAATCAGCGATATGTTTGTTGCATGTTCTCATATTGGTCTGCAGTGGGTTGCGCTTTTACTGGCTTTGATCATGAGTTTCACAGTTCTAACAACATATCTCATTTCCATCTATAGAGGACATGTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTACAGGTGCCTATCCACCAGAAAGTTGTATATTTGGTGAGGGATTAAACATAGCTGCTTTTATCAGTTTGATATGCTCCTTTTGCTGGTATTTAATTGCCCTAGAGAGAACGAAATTTATGGGCACACACCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGCTTGTATTGTCTCTAATTGCTTCAATCGGTTTAACATTGGTTGGGAATTTTCAACAAGTTAACGTTGAATTAGTACATGATATTGGTGCTGGGATGGCTTTTTTCGGCACAACGCTTTATATCACTTTATGTGCTTTAGTTAGCAAACGATACCTTGGAANNNATTGGTGTATATGGGCTTTTAGACTTGTCTTAGGGATTATGGCAGCAATAACATCAAGTTTGTTTTCAGTCTGTCATACAATTTCCAGAATAAATTTCAACGGTACACAAGAAGAATCTTTGACTTATCGGCATCCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD073173             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GGAATTTTCAACAAGTTAACGTTGAATTAGTACATGATATTGGTGCTGGGATGGC TTTTTCGGCACAACGCTTTATATCACTTTATGTGCTTTAGTTAGCAAACGATACCTTGGAACACATTGGTGTATATGGGCTTTTAGACTTGTCTTAGGGATTATGGCAGCAATAACATCAAGTTTGTTTTCAGTCTGTCATACAATTTCCAGAATAAATTTCAACGGTACACAAGAAGAATCTTTGACTTATCGGCATCCTGGTCAAGGTGGATTTTCATTTTATCTATGCAGTACAAGTTTTGAGTGGGCTGCAGGATTTATCATCATAGTGTTTTTTACCACATGGGCTTACGAATTCAGATCATATGCTTTTCAGTTACCACAGGTTGTTAAAAAACACCCATTTGAATCCGATATCTATAGCCTCAAAAGCTGAAGACAGCTGCTGGTTACTTTAAAAGCTTTCTCCCTCAACTTCAAATAATCAAATAATTGAAACTTCTAACCCCTACGTTATCACTATATAAATCCATAATTACTTTAATATATTATTATTGATTA                  ]
[-] EMBL CD077106             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GGTCAAGGTGGATTTTCATTTTATCTATGCAGTACAAGTTTTGAGTGGGCTGCAGGATTTATCATCATAGTGTTTTTTACCACATGGGCTTACGAATTCAGATCATATGCTTTTCAGTTACCACAGGTTGTTAAAAAACACCCATTTGAATCCGATATCTATAGCCTCAAAAGCTGAAGACAGCTGCTGGTTACTTTAAAAGCTTTCTCCCTCAACTTCAAATAATCAAATAATTGAAACTTCTAACCCCTACGTTATCACTATATAAATCCATAATTACTTTAATATATTATTATTGATTATTCACCAATAAAACCACA]
[-] EMBL BG932549             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CTTTTCAGTTACCACAGGTTGTTAAAAAACACCCATTTGAATCCGATATCTATAGCCTCAAAAGCTGAAGACAGCTGCTGGTTACTTTAAAAGCTTTCTC                                                                                                               ]


>consensus_9523#0 AACGCTCTCACACTCACACTATTCGATTGTCCTAATTTCAAGAAATCAGCGATATGTTTG TTGCATGTTCTCATATTGGTCTGCAGTGGGTTGCGCTTTTACTGGCTTTGATCATGAGTT TCACAGTTCTAACAACATATCTCATTTCCATCTATAGAGGACATGTANNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNCTACAGGTGCCTATCCACCAGAAAGTTGTATATTTGGTGAGGGATTAA ACATAGCTGCTTTTATCAGTTTGATATGCTCCTTTTGCTGGTATTTAATTGCCCTAGAGA GAACGAAATTTATGGGCACACACCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGCTTGTATTGTC TCTAATTGCTTCAATCGGTTTAACATTGGTTGGGAATTTTCAACAAGTTAACGTTGAATT AGTACATGATATTGGTGCTGGGATGGCTTTTTTCGGCACAACGCTTTATATCACTTTATG TGCTTTAGTTAGCAAACGATACCTTGGAANNNATTGGTGTATATGGGCTTTTAGACTTGT CTTAGGGATTATGGCAGCAATAACATCAAGTTTGTTTTCAGTCTGTCATACAATTTCCAG AATAAATTTCAACGGTACACAAGAAGAATCTTTGACTTATCGGCATCCTGGTCAAGGTGG ATTTTCATTTTATCTATGCAGTACAAGTTTTGAGTGGGCTGCAGGATTTATCATCATAGT GTTTTTTACCACATGGGCTTACGAATTCAGATCATATGCTTTTCAGTTACCACAGGTTGT TAAAAAACACCCATTTGAATCCGATATCTATAGCCTCAAAAGCTGAAGACAGCTGCTGGT TACTTTAAAAGCTTTCTCCCTCAACTTCAAATAATCAAATAATTGAAACTTCTAACCCCT ACGTTATCACTATATAAATCCATAATTACTTTAATATATTATTATTGATTATTCACCAAT AAAACCACA



consensusID : consensus_9523#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 585
fasta sequence
                              [AGAGGACATGTAAATGCAGAATTGCCATTTATCAGCTCTACAGGTGCCTATCCACCAGAAAGTTGTATATTTGGTGAGGGATTAAACATAGCTGCTTTTATCAGTTTGATATGCTCCTTTTGCTGGTATTTAATTGCCCTAGAGAGAACGAAATTTATGGGCACACACCAACCAAATTGTCTTCTTAAATTTATGCTTGTATTGTCTCTAATTGCTTCAATCGGTTTAACATTGGTTGGGAAT-TTTCAACAAGTTAACGTTGAATTAGTACATGATATTGGTGCTGGGATGGCTTTTTTCGGCACAACGCTTTATATCACTTTATGTGCTTTAGTTAGCAAACGATACCTTGGAACACATTGGTGTATATGGGCTTTTAGACTTGTCTTAGGGATTATGGCAGCAATAACATCAAGTTTGTTTTCAGTCTGTCATACAATTTCCAGAATAAATTTCAACGGTACACAAGAAGAATCTTTGACTTATCGGCATCCTGGTCAAGGTGGATTTTCATTTTATCTATGCAGTACAAGTTTTGAGTGGGCTGCAGGATTTATCATCATAGTGTTTTTTACCACATGGGCT]

[+] EMBL CD078710             [AGAGGACATGTAAATGCAGAATTGCCATTTATCAGCTCTACAGGTGCCTATCCACCAGAAAGTTGTATATTTGGTGAGGGATTAAACATAGCTGCTTTTATCAGTTTGATATGCTCCTTTTGCTGGTATTTAATTGCCCTAGAGAGAACGAAATTTATGGGCACACACCAACCAAATTGTCTTCTTAAATTTATGCTTGTATTGTCTCTAATTGCTTCAATCGGTTTAACATTGGTTGGGAAT TTTCAACAAGTTAACGTTGAATTAGTACATGATATTGGTGCTGGGATGGCTTTTTTCGGCACAACGCTTTATATCACTTTATGTGCTTTAGTTAGCAAACGATACCTTGGAACACATTGGTGTATATGGGCTTTTAGACTTGTCTTAGGGATTATGGCAGCAATAACATCAAGTTTGTTTTCAGTCTGTCATACAATTTCCAGAATAAATTTCAACGGTACACAAGAAGAATCTTTGACTTATCGGCATCCTGGTCAAGGTGGATTTTCATTTTATCTATGCAGTACAAGTTTTGAGTGGGCTGCAGGATTTATCATCATAGTGTTTTTTACCACATGGGCT]
[+] EMBL CD180790             [                                                                   TATTTGGTGAGGGATTAAACATAGCTGCTTTTATCAGTTTGATATGCTCCTTTTGCTGGTATTTAATTGCCCTAGAGAGAACGAAATTTATGGGCACACACCAACCAAATTGTCTTCTTAAATTTATGCTTGTATTGTCTCTAATTGCTTCAATCGGTTTAACATTGGTTGGGAATCTTTCAACAAGTTAACGTTGAATTAGTACATGATATTGGTGCTGGGATGGCTTTTTTCGGCACAACGCTTTATATCACTTTATGTGCTTTAGTTAGCAAACGATACCTTGGAACACATTGGTGTATATGGGCTTTTAGACTTGTCTTAGGGATTATGGCAGCAATAACATCAAGTTTGTTTTCAGTCTGTCATACAATTTCCAGAATAAATTTCAACGGTACACAAGAAGAATCTTTGACT                                                                                                      ]
[+] EMBL CD181098             [                                                                   TATTTGGTGAGGGATTAAACATAGCTGCTTTTATCAGTTTGATATGCTCCTTTTGCTGGTATTTAATTGCCCTAGAGAGAACGAAATTTATGGGCACACACCAACCAAATTGTCTTCTTAAATTTATGCTTGTATTGTCTCTAATTGCTTCAATCGGTTTAACATTGGTTGGGAAT TTTCAACAAGTTAACGTTGAATTAGTACATGATATTGGTGCTGGGATGGCTTTTTTCGGCACAACGCTTTATATCACTTTATGTGCTTTAGTTAGCAAACGATACCTTGGAACACATTGGTGTATATGGGCTTTTAGACTTGTCTTAGGGATTATGGCAGCAATAACATCAAGTTTGTTTTCAGTCTGTCATACAATTTCCAGAATAAATTTCAACGGTACACAAGAAGAATCTTTGACT                                                                                                      ]
[-] EMBL BG932428             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AGCAATAACATCAAGTTTGTTTTCAGTCTGTCATACAATTTCCAGAATAAATTTCAACGGTACACAAGAAGAATCTTTGACTTATCGGCATCCTGGTCAAGGTGGATTTTCATTTTATCTATGCAGTACAAGTTTTGAGTGGGCTGCAGGATTTATCATCATAGTGTTTTTTACCAC       ]


>consensus_9523#1 AGAGGACATGTAAATGCAGAATTGCCATTTATCAGCTCTACAGGTGCCTATCCACCAGAA AGTTGTATATTTGGTGAGGGATTAAACATAGCTGCTTTTATCAGTTTGATATGCTCCTTT TGCTGGTATTTAATTGCCCTAGAGAGAACGAAATTTATGGGCACACACCAACCAAATTGT CTTCTTAAATTTATGCTTGTATTGTCTCTAATTGCTTCAATCGGTTTAACATTGGTTGGG AATTTTCAACAAGTTAACGTTGAATTAGTACATGATATTGGTGCTGGGATGGCTTTTTTC GGCACAACGCTTTATATCACTTTATGTGCTTTAGTTAGCAAACGATACCTTGGAACACAT TGGTGTATATGGGCTTTTAGACTTGTCTTAGGGATTATGGCAGCAATAACATCAAGTTTG TTTTCAGTCTGTCATACAATTTCCAGAATAAATTTCAACGGTACACAAGAAGAATCTTTG ACTTATCGGCATCCTGGTCAAGGTGGATTTTCATTTTATCTATGCAGTACAAGTTTTGAG TGGGCTGCAGGATTTATCATCATAGTGTTTTTTACCACATGGGCT



consensusID : consensus_9523#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 487
fasta sequence
                              [CACGAGGCNCCTTTTGCTGGTATTTAATTGCCCTAAANAGAACGAAATTTATGGGGCACACACCAACCAAATTGTCTTCTTAAATTTATGCTTGTATTGTCTCTAATTGCTTCAATCGGTTTAACATNGGTTGGGAATTTTCAACAAGTTAACGTTGAATTAGTACATGAATATTGGTGCTGGGAATGGCTTTTTNCGGCACAACGCTTTATATCACTTTATGTGCTTTAGTTTAGCAAACGAATACCTTGGAAACACATTGGTGTTATATGGGGCTTTTANACTTGTCTTAGGGGATTATGGGCACCAAATAACATCAAGTTTGGTTTNCAGTTCTGGTCATACAAATTTCCCANAAATAAATTTCAACGGGTACNCAAAAAAANAATCCTTTGAACTTATCGGGCATCCTGGGTCAAGGTGGAATTTTCATTTTAACCTATGCCANTTACAAATTTTTGANTGGGCTGCAGGAATTTANCACNCA]

[+] EMBL AA559825             [CACGAGGCNCCTTTTGCTGGTATTTAATTGCCCTAAANAGAACGAAATTTATGGGGCACACACCAACCAAATTGTCTTCTTAAATTTATGCTTGTATTGTCTCTAATTGCTTCAATCGGTTTAACATNGGTTGGGAATTTTCAACAAGTTAACGTTGAATTAGTACATGAATATTGGTGCTGGGAATGGCTTTTTNCGGCACAACGCTTTATATCACTTTATGTGCTTTAGTTTAGCAAACGAATACCTTGGAAACACATTGGTGTTATATGGGGCTTTTANACTTGTCTTAGGGGATTATGGGCACCAAATAACATCAAGTTTGGTTTNCAGTTCTGGTCATACAAATTTCCCANAAATAAATTTCAACGGGTACNCAAAAAAANAATCCTTTGAACTTATCGGGCATCCTGGGTCAAGGTGGAATTTTCATTTTAACCTATGCCANTTACAAATTTTTGANTGGGCTGCAGGAATTTANCACNCA]


>consensus_9523#2 CACGAGGCNCCTTTTGCTGGTATTTAATTGCCCTAAANAGAACGAAATTTATGGGGCACA CACCAACCAAATTGTCTTCTTAAATTTATGCTTGTATTGTCTCTAATTGCTTCAATCGGT TTAACATNGGTTGGGAATTTTCAACAAGTTAACGTTGAATTAGTACATGAATATTGGTGC TGGGAATGGCTTTTTNCGGCACAACGCTTTATATCACTTTATGTGCTTTAGTTTAGCAAA CGAATACCTTGGAAACACATTGGTGTTATATGGGGCTTTTANACTTGTCTTAGGGGATTA TGGGCACCAAATAACATCAAGTTTGGTTTNCAGTTCTGGTCATACAAATTTCCCANAAAT AAATTTCAACGGGTACNCAAAAAAANAATCCTTTGAACTTATCGGGCATCCTGGGTCAAG GTGGAATTTTCATTTTAACCTATGCCANTTACAAATTTTTGANTGGGCTGCAGGAATTTA NCACNCA



consensusID : consensus_9523#3
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 295
fasta sequence
                              [ACATTTGATGCCTAAATGATTTTACTTTCAGGGATTTTCATTTTATCTATGCAGTACAAGTTTTGAGTGGGCTGCAGGATTTATCATCATAGTGTTTTTTACCACATGGGCTTACGAATTCAGATCATATGCTTTTCAGTTACCACAGGTAAATTTTGATGTTATTAGAATCCTATTCTTTACCACTGTTCTTTTAACATAATGCCAAAAATGCATGTTAAACGAACGCTGACTTATGGTTATTATTTTTAACACCTGAATCTAACAAATAGTCTTCAGGTTTCTAGAATATGGT]

[-] EMBL CD145524             [ACATTTGATGCCTAAATGATTTTACTTTCAGGGATTTTCATTTTATCTATGCAGTACAAGTTTTGAGTGGGCTGCAGGATTTATCATCATAGTGTTTTTTACCACATGGGCTTACGAATTCAGATCATATGCTTTTCAGTTACCACAGGTAAATTTTGATGTTATTAGAATCCTATTCTTTACCACTGTTCTTTTAACATAATGCCAAAAATGCATGTTAAACGAACGCTGACTTATGGTTATTATTTTTAACACCTGAATCTAACAAATAGTCTTCAGGTTTCTAGAATATGGT]


>consensus_9523#3 ACATTTGATGCCTAAATGATTTTACTTTCAGGGATTTTCATTTTATCTATGCAGTACAAG TTTTGAGTGGGCTGCAGGATTTATCATCATAGTGTTTTTTACCACATGGGCTTACGAATT CAGATCATATGCTTTTCAGTTACCACAGGTAAATTTTGATGTTATTAGAATCCTATTCTT TACCACTGTTCTTTTAACATAATGCCAAAAATGCATGTTAAACGAACGCTGACTTATGGT TATTATTTTTAACACCTGAATCTAACAAATAGTCTTCAGGTTTCTAGAATATGGT



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9523#1      ------------------------------------------------------------
consensus_9523#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9523#0      AACGCTCTCACACTCACACTATTCGATTGTCCTAATTTCAAGAAATCAGCGATATGTTTG 60
consensus_9523#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9523#1      ------------------------------------------------------------
consensus_9523#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9523#0      TTGCATGTTCTCATATTGGTCTGCAGTGGGTTGCGCTTTTACTGGCTTTGATCATGAGTT 120
consensus_9523#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9523#1      -----------------------------------AGAGGACATGTAAATGCAGAATTGC 25
consensus_9523#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9523#0      TCACAGTTCTAACAACATATCTCATTTCCATCTATAGAGGACATGTANNNNNNNNNNNNN 180
consensus_9523#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9523#1      CATTTATCAGCTCTACAGGTGCCTATCCACCAGAAAGTTGTATATTTGGTGAGGGATTAA 85
consensus_9523#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9523#0      NNNNNNNNNNNNCTACAGGTGCCTATCCACCAGAAAGTTGTATATTTGGTGAGGGATTAA 240
consensus_9523#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9523#1      ACATAGCTGCTTTTATCAGTTTGATATGCTCCTTTTGCTGGTATTTAATTGCCCTAGAGA 145
consensus_9523#2      ---------------------CACGAGGCNCCTTTTGCTGGTATTTAATTGCCCTAAANA 39
consensus_9523#0      ACATAGCTGCTTTTATCAGTTTGATATGCTCCTTTTGCTGGTATTTAATTGCCCTAGAGA 300
consensus_9523#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9523#1      GAACGAAATTTATGGG-CACACACCAACCAAATTGTCTTCTTAAATTTATGCTTGTATTG 204
consensus_9523#2      GAACGAAATTTATGGGGCACACACCAACCAAATTGTCTTCTTAAATTTATGCTTGTATTG 99
consensus_9523#0      GAACGAAATTTATGGG-CACACACCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-ATGCTTGTATTG 358
consensus_9523#3      -----------------------------------------------------------A 1
                                                                                  

consensus_9523#1      TCTCTAATTGCTTCAATCGGTTTAACATTGGTTGGGAATTTTCAACAAGTTAACGTTGAA 264
consensus_9523#2      TCTCTAATTGCTTCAATCGGTTTAACATNGGTTGGGAATTTTCAACAAGTTAACGTTGAA 159
consensus_9523#0      TCTCTAATTGCTTCAATCGGTTTAACATTGGTTGGGAATTTTCAACAAGTTAACGTTGAA 418
consensus_9523#3      CATTTGAT-GCCTAAAT-GATTTTACTTT---CAGGGATTTTCATTTTATCTATGCAGTA 56
                        * * ** ** * *** * *** ** *      ** *******     *  * *  * *

consensus_9523#1      TTAGTACATGA-TATTGGTGCTGGGA-TGGCTTTTTTCGGCACAACGCTTTATATCACTT 322
consensus_9523#2      TTAGTACATGAATATTGGTGCTGGGAATGGCTTTTTNCGGCACAACGCTTTATATCACTT 219
consensus_9523#0      TTAGTACATGA-TATTGGTGCTGGGA-TGGCTTTTTTCGGCACAACGCTTTATATCACTT 476
consensus_9523#3      CAAGTTT-TGA--GTGGGCTGCAGGA------TTTATCATCATAGTGTTTTTTACCAC-- 105
                        ***   ***   * **     ***      ***  *  ** *  * *** ** ***  

consensus_9523#1      TATGTGCTTTAGTT-AGCAAACGA-TACCTTGGAA-CAC-ATTGGTGT-ATATGGG-CTT 376
consensus_9523#2      TATGTGCTTTAGTTTAGCAAACGAATACCTTGGAAACAC-ATTGGTGTTATATGGGGCTT 278
consensus_9523#0      TATGTGCTTTAGTT-AGCAAACGA-TACCTTGGAA-NNN-ATTGGTGT-ATATGGG-CTT 530
consensus_9523#3      -ATGGGCTTACGAATTCAGATCATATGCTTTTCAGTTACCACAGGTAAATTTTGATGTTA 164
                       *** ****  *       * *   * * **  *      *  ***    * **    * 

consensus_9523#1      TTAGA--CTTGTCTTAGGG-ATTATGGCAGC--AATAACATCAAGTTTG-TTTTCAGTCT 430
consensus_9523#2      TTANA--CTTGTCTTAGGGGATTATGGGCACCAAATAACATCAAGTTTGGTTTNCAGTTC 336
consensus_9523#0      TTAGA--CTTGTCTTAGGG-ATTATGGCAGC--AATAACATCAAGTTTG-TTTTCAGTCT 584
consensus_9523#3      TTAGAATCCTATTCTTTACCACTGTTCTTTTAACATAATGCCAAAAATGCATGTTAAACG 224
                      *** *  * * *  *     * * *         ****   ***   **  *   *    

consensus_9523#1      --GTCATACAATTTCC---AGAATAAATTTCAACGG---TACACAAGAAGAATCTTT--G 480
consensus_9523#2      TGGTCATACAAATTTCCCANAAATAAATTTCAACGGGTACNCAAAAAAANAATCCTTTGA 396
consensus_9523#0      --GTCATACAATTTCC---AGAATAAATTTCAACGG---TACACAAGAAGAATCTTT--G 634
consensus_9523#3      ----AACGCTGACTTAT-GGTTATTATTTTTAACACCTGAATCTAACAAATAGTCTTCAG 279
                           *  *    *        ** * *** ***          ** **  *   **   

consensus_9523#1      ACTTATCGG-CATCCTGG-TCAAGGTGGA-TTTTCATTTTA-TCTATGC--AGTACAAGT 534
consensus_9523#2      ACTTATCGGGCATCCTGGGTCAAGGTGGAATTTTCATTTTAACCTATGCCANTTACAAAT 456
consensus_9523#0      ACTTATCGG-CATCCTGG-TCAAGGTGGA-TTTTCATTTTA-TCTATGC--AGTACAAGT 688
consensus_9523#3      GTTTCTAGAATATGGT-------------------------------------------- 295
                        ** * *   **  *                                            

consensus_9523#1      TTT-GAGTGGGCTGCAGGA-TTTATCATCATAGTGTTTTTTACCACATGGGCT------- 585
consensus_9523#2      TTTTGANTGGGCTGCAGGAATTTANCA-CNCA---------------------------- 487
consensus_9523#0      TTT-GAGTGGGCTGCAGGA-TTTATCATCATAGTGTTTTTTACCACATGGGCTTACGAAT 746
consensus_9523#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9523#1      ------------------------------------------------------------
consensus_9523#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9523#0      TCAGATCATATGCTTTTCAGTTACCACAGGTTGTTAAAAAACACCCATTTGAATCCGATA 806
consensus_9523#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9523#1      ------------------------------------------------------------
consensus_9523#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9523#0      TCTATAGCCTCAAAAGCTGAAGACAGCTGCTGGTTACTTTAAAAGCTTTCTCCCTCAACT 866
consensus_9523#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9523#1      ------------------------------------------------------------
consensus_9523#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9523#0      TCAAATAATCAAATAATTGAAACTTCTAACCCCTACGTTATCACTATATAAATCCATAAT 926
consensus_9523#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9523#1      -------------------------------------------
consensus_9523#2      -------------------------------------------
consensus_9523#0      TACTTTAATATATTATTATTGATTATTCACCAATAAAACCACA 969
consensus_9523#3      -------------------------------------------
                                                                 




Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)