These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9532#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 10 consensus length = 1397 fasta sequence [TCTACGCCAACTTGGTGAACCTGTCTGTTTATTTGGTGAAGATGGAGCAGACCGAAGAGAAAGACTACGGATGATTCTTGCAGTGAGCGGTGGTCCAGCTCAAAGACCACCTTTAACAGATACAGTAAAATCATCGACTGGGACTGGTACATCTATTAATCGACTTGGTGAAAATATTTCTACTGATACTGTCGGAGATGATACTACAGTGTGGTACCATCAAGGTCCGAATACTCTTGCAGAGGCTCGCCTATGGATTAGTGAATTTTCCTTAACTCGAGCTAAAGTACGGCTGGATAGAGCTAGGAATTATTTCAATAATGTTCCAGCACCTCAACGCAAAGCTAAACTCCAAGAATATCATAAGGTTTTGCGAAACACAAATTTGCTATGCAGTCAAGTTGGAGATATTCGACCATTAAGTATGTGTCGCTTTTCACCTGATGGTAAACAATTAGCTACA-TCATCTTGGAGTGG-TCTGTGTCGTTTATGGTCTATACCTGATTGTAATTTAGTTATGAATTTAC-GTGGGCATACTGCACCAACTT-GTGCTATTGTTTGGCATCCTCAAGCTGGTCTCCAGTCGGAACAACAATTGGCACTTGCCAGTTCAGCTCAAGACGGAAGTGTTAAACTATGGAGTTTAGATAATGAAGAACCTTTGGCCGATATTGAAGGTCACGCACCTCACAGAGTATCTCGCTTAGCCTTCCATCCTTCTGGACGTTTCCTGGCAACTACGTGCTTCGATCACTCATGGCGCTTATGGGATTTAGAGGCTTGTGAAG-AAATTTTACACCAAGAAGGTCATTCCAAGCCAGTTTATGATGTTGTTTTTCACCCTGATGGTTCCTTAGCTCTAACCACCGGTTTGGATGGATATGCTCGTGTTTGGGACTTACGAACAGGTCGTTGTATTATGTTTCTAGAAGGCCACCTTGAAGAGTTGCTGGGCGCAGATGTAGCTGATAATGGTTATCACGCAGCCACTTCTAGTGCAGATAACACCGTTCGTATTTGGGATTTACGACAACA-ACAAGCAATTTATGTAATACCAGCTCACACTAGTGTTGTAAGCAGCGTACGATTTGAATCACGCAACTGTAGCTATATTGTTACCAGTTCGTTTGATAAAACAACCAAAA-TTGGGGCCATCCTATCTGGACACCTATCAAAACGCTCGAAGGACATAACAGTAAAGTTGTTTATGCAGACATTT-CACCAGACAATAAATACATTGCAACCTGTTCCCACGACCTGACTTATAAACTGTGGAGTAAAGAAGCAAACTAATCCTCTCCGTTACAACAAATGTTAATAACAATATTCCTATAATACGTTGTAAAATAATCTTATATATACATTCGTGTTTCTAATTTTCCNAAAAAAAAAAAAAA] 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AACTATGGAGTTTAGATAATGAAGAACCTTTGGCCGATATTGAAGGTCACGCACCTCACAGAGTATCTCGCTTAGCCTTCCATCCTTCTGGACGTTTCCTGGCAACTACGTGCTTCGATCACTCATGGCGCTTATGGGATTTAGAGGCTTGTGAAG AAATTTTACACCAAGAAGGTCATTCCAAGACAGTTTATGATGTTGTTTTTCACCCTGATGGTTCCTTAGCTCTAACCACCGGTTTGGATGGATATGCTCGTGTTTGGGACTTACGAACAGGTCGTTGTATTATGTTTCTANGAGGCCACCTTGAAGAGTTGCTGGGCGCAGATGTAGCTGATAATGGTTATCACGCAGC ] [+] EMBL CD171503 [ ACTCATGGCGCTTATGGGATTTAGAGGCTTGTGAAGAAAATTTTACACCAAGAAGGTCATTCCATGCCAGTTTATGATGTTGTTTTTCACCCTGATGGTTCCTTAGCTCTAACCACCGGTTTGGATGGATATGCTCGTGTTTG ] [+] EMBL CD183532 [ GGCTTGTGAAG AAATTTTACACCAAGAAGGTCATTCCAAGCCAGTTTATGATGTTGTTTTTCACCCTGATGGTTCCTTAGCTCTAACCACCGGTTTGGATGGATATGCTCGTGTTTGGGACTTACGAACAGGTCGTTGTATTATGTTTCTAGAAGGCCACCTTGAAGAGTTGCTGGGCGCAGATGTAGCTGATAATGGTTATCACGCAGCCACTTCTAGTGCAGATAACACCGTTCGTATTTGGGATTTACGACAACA ACAAGCAATTTATGTAATACCAGCTCACACTAGTGTTGTAAGCAGCGTACGATTTGAATCACGCAACTGTAGCTATATTGTTACCAGTTCGTTTGATAAAACAACCAAAA TTGGGGCTATCCTATCTGGACACCTATCAAAACGCTCGAAGGACATAACAGTAAAGTTGTTTATGC ] [+] EMBL 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CACCAGACAATAAATACATTGCAACCTGTTCCCACGACCTGACTTATAAACTGTGGAGTAAAGAAGCAAACTAATCCTCTCCGTTACAACAAATGTTAATAACAATATTCCTATAATACGTTGTAAAATAATCTTATATATACATTCGTGTTTCTAATTTTCCNAAAAAAAAAAAAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||