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Schistosoma mansoni
cluster # 9532 cluster # 9532       Sequences # 10       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9532#0 length = 1397 sequences # 10  

consensusID : consensus_9532#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 10
consensus length = 1397
fasta sequence
                              [TCTACGCCAACTTGGTGAACCTGTCTGTTTATTTGGTGAAGATGGAGCAGACCGAAGAGAAAGACTACGGATGATTCTTGCAGTGAGCGGTGGTCCAGCTCAAAGACCACCTTTAACAGATACAGTAAAATCATCGACTGGGACTGGTACATCTATTAATCGACTTGGTGAAAATATTTCTACTGATACTGTCGGAGATGATACTACAGTGTGGTACCATCAAGGTCCGAATACTCTTGCAGAGGCTCGCCTATGGATTAGTGAATTTTCCTTAACTCGAGCTAAAGTACGGCTGGATAGAGCTAGGAATTATTTCAATAATGTTCCAGCACCTCAACGCAAAGCTAAACTCCAAGAATATCATAAGGTTTTGCGAAACACAAATTTGCTATGCAGTCAAGTTGGAGATATTCGACCATTAAGTATGTGTCGCTTTTCACCTGATGGTAAACAATTAGCTACA-TCATCTTGGAGTGG-TCTGTGTCGTTTATGGTCTATACCTGATTGTAATTTAGTTATGAATTTAC-GTGGGCATACTGCACCAACTT-GTGCTATTGTTTGGCATCCTCAAGCTGGTCTCCAGTCGGAACAACAATTGGCACTTGCCAGTTCAGCTCAAGACGGAAGTGTTAAACTATGGAGTTTAGATAATGAAGAACCTTTGGCCGATATTGAAGGTCACGCACCTCACAGAGTATCTCGCTTAGCCTTCCATCCTTCTGGACGTTTCCTGGCAACTACGTGCTTCGATCACTCATGGCGCTTATGGGATTTAGAGGCTTGTGAAG-AAATTTTACACCAAGAAGGTCATTCCAAGCCAGTTTATGATGTTGTTTTTCACCCTGATGGTTCCTTAGCTCTAACCACCGGTTTGGATGGATATGCTCGTGTTTGGGACTTACGAACAGGTCGTTGTATTATGTTTCTAGAAGGCCACCTTGAAGAGTTGCTGGGCGCAGATGTAGCTGATAATGGTTATCACGCAGCCACTTCTAGTGCAGATAACACCGTTCGTATTTGGGATTTACGACAACA-ACAAGCAATTTATGTAATACCAGCTCACACTAGTGTTGTAAGCAGCGTACGATTTGAATCACGCAACTGTAGCTATATTGTTACCAGTTCGTTTGATAAAACAACCAAAA-TTGGGGCCATCCTATCTGGACACCTATCAAAACGCTCGAAGGACATAACAGTAAAGTTGTTTATGCAGACATTT-CACCAGACAATAAATACATTGCAACCTGTTCCCACGACCTGACTTATAAACTGTGGAGTAAAGAAGCAAACTAATCCTCTCCGTTACAACAAATGTTAATAACAATATTCCTATAATACGTTGTAAAATAATCTTATATATACATTCGTGTTTCTAATTTTCCNAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL CD081977             [TCTACGCCAACTTGGTGAACCTGTCTGTTTATTTGGTGAAGATGGAGCAGACCGAAGAGAAAGACTACGGATGATTCTTGCAGTGAGCGGTGGTCCAGCTCAAAGACCACCTTTAACAGATACAGTAAAATCATCGACTGGGACTGGTACATCTATTAATCGACTTGGTGAAAATATTTCTACTGATACTGTCGGAGATGATACTACAGTGTGGTACCATCAAGGTCCGAATACTCTTGCAGAGGCTCGCCTATGGATTAGTGAATTTTCCTTAACTCGAGCTAAAGTACGGCTGGATAGAGCTAGGAATTATTTCAATAATGTTCCAGCACCTCAACGCAAAGCTAAACTCCAAGAATATCATAAGGTTTTGCGAAACACAAATTTGCTATGCAGTCAAGTTGGAGATATTCGACCATTAAGTATGTGTCGCTTTTCACCTGATGGTAAACAATTAGCTACA TCATCTTGGAGTGG TCTGTGTCGTTTATGGTCTATACCTGATTGTAATTTAGTTATGAATTTAC GTGGGCATACTGCACCAACTT GTGCTATTGTTTGGCATCCTCAAGCTGGTCTCCAGTCGGAACAACAATTGGCACTTGCCAGTTCAGCTCAAGACGGAAGTGTTAAACTATGGAGTTTAGATAATGAAGAACCTTTGGCCGATATTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD177716             [                                                                                                                                                           TTAATCGACTTGGTGAAAATATTTCTACTGATACTGTCGGAGATGATACTACAGTGTGGTACCATCAAGGTCCGAATACTCTTGCAGAGGCTCGCCTATGGATTAGTGAATTTTCCTTAACTCGAGCTAAAGTACGGCTGGATAGAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL BE431235             [                                                                                                                                                                                                                                           CTTGCAGAGGCTCGCCTATGGATTAGTGAATTTTCCTTAACTCGAGCTAAAGTACGGCTGGATAGAGCTAGGAATTATTTCAATAATGTTCCAGCACCTCAACGCAAAGCTAAACTCCAAGAATATCATAAGGTTTTGCGAAACACAAATTTGCTATGCAGTCAAGTTGGAGATATTCGACCATTAAGTATGTGTCGCTTTTCACCTGATGGTAAACAATTAGCTACACTCATCTTGGAGTGGTTCTGTGTCGTTTATGGTCTATACCGGATTGAAATTTAGTTATGAATTTACTGTGGGCATACTGCACCAACTTGGTGCTATTGTTTGGCACCCCCAAGCTGGTCCCCAGTCGGAACAACAATTGGCACTTG CAGTTCAGCTCAAGACGGAAGTGTAAAACTATGGAGTTTAGATAATG AGAA CTTTGGCCGTAATTG AGGTC CGCACCCCACAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD169868             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTTGCGAAACACAAATNTGCTATGCAGTTAAGTTGGAGATATTCGACCATTAAGTATGTGTCGCCTTTCACCTGATGGTAAACAATTAGCTACA TCATCTTGGAGTGG TCTGTGTCGTTTATGGTCTATACCTGATTGTAATTTAGTTATGAATTTAC GTGGGCATACTGCACCAACTT GAGCTATTGTTTGGCATCCTCAAGCTGGTCTCCTGTCGGAACAACAATTGGCACTTGCCAGTTCAGCTCAAGACGGAAGTGTTAAACTATGGAGTTTAGATAATGAAGAACCTTTGGCCGATATTGAAGGTCACGCACCTCACAGAGTATCTCGCTTAGCCTTCCATCCTTCTGGACGTTTCCTGGCAACTACGTGCTTCGATCACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD141169             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AACTATGGAGTTTAGATAATGAAGAACCTTTGGCCGATATTGAAGGTCACGCACCTCACAGAGTATCTCGCTTAGCCTTCCATCCTTCTGGACGTTTCCTGGCAACTACGTGCTTCGATCACTCATGGCGCTTATGGGATTTAGAGGCTTGTGAAG AAATTTTACACCAAGAAGGTCATTCCAAGACAGTTTATGATGTTGTTTTTCACCCTGATGGTTCCTTAGCTCTAACCACCGGTTTGGATGGATATGCTCGTGTTTGGGACTTACGAACAGGTCGTTGTATTATGTTTCTANGAGGCCACCTTGAAGAGTTGCTGGGCGCAGATGTAGCTGATAATGGTTATCACGCAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD171503             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ACTCATGGCGCTTATGGGATTTAGAGGCTTGTGAAGAAAATTTTACACCAAGAAGGTCATTCCATGCCAGTTTATGATGTTGTTTTTCACCCTGATGGTTCCTTAGCTCTAACCACCGGTTTGGATGGATATGCTCGTGTTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD183532             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GGCTTGTGAAG AAATTTTACACCAAGAAGGTCATTCCAAGCCAGTTTATGATGTTGTTTTTCACCCTGATGGTTCCTTAGCTCTAACCACCGGTTTGGATGGATATGCTCGTGTTTGGGACTTACGAACAGGTCGTTGTATTATGTTTCTAGAAGGCCACCTTGAAGAGTTGCTGGGCGCAGATGTAGCTGATAATGGTTATCACGCAGCCACTTCTAGTGCAGATAACACCGTTCGTATTTGGGATTTACGACAACA ACAAGCAATTTATGTAATACCAGCTCACACTAGTGTTGTAAGCAGCGTACGATTTGAATCACGCAACTGTAGCTATATTGTTACCAGTTCGTTTGATAAAACAACCAAAA TTGGGGCTATCCTATCTGGACACCTATCAAAACGCTCGAAGGACATAACAGTAAAGTTGTTTATGC                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD130627             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TGCTCGTGTTTGGGACTTACGAACAGGTCGTTGTATTATGTTTCTAGAAGGCCACCTTGAAGAGTTGCTGGGCGCAGATGTAGCTGATAATGGTTATCACGCAGCCACTTCTAGTGCAGATAACACCGTTCGTATTTGGGATTTACGACAACA ACAAGCAATTTATGTAATACCAGCTCACACTAGTGTTGTAAGCAGCGTACGATTTGAATCACGCAACTGTAGCTATATTGTTACCAGTTCGTTTGATAAAACAACCAAAATTTGGGGCCATCCTATCTGGACACCTATCAAAACGCTCGAAGGACATAACAGTAAAGTTGTTTATGCAGACATTTNCACCAGACAATAAATACATTGCAACCTGTTCCCACGACCTGACTTATAAA                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD141552             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ACGAC ACANNCAAGCAATTTATGTAATACCAGCTCACACTAGTGTTGTAAGCAGCGTACGATTTGAATCACGCAACTGTAGCTATATTGTTACCAGTTCGTCTGATAAAACAACCAAAATTTGGGGCCATCCTATCTGGACACCTATCAAAACGCTCGAAGGACATAACAGTAAAGTTGTTTATGCAGACATTT CACCAGACAATAAATACATTGCAACCTGTTCCCACGACCTGACTTATAAACTGTGGAGTAAAGAAG                                                                                                                ]
[-] EMBL AI395487             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TAGTGTTGTAAGCAGCGTACGATTTGAATCACGCAACTGTAGCTATATTGTTACCCGTTCGTTTGATAAAACAACCAAAATTTGGGGCCATCCTATCTGGACACCTATCAAAACGCTCGAAGGACATAACAGTAAAGTTGTTTATGCAGACATTT CACCAGACAATAAATACATTGCAACCTGTTCCCACGACCTGACTTATAAACTGTGGAGTAAAGAAGCAAACTAATCCTCTCCGTTACAACAAATGTTAATAACAATATTCCTATAATACGTTGTAAAATAATCTTATATATACATTCGTGTTTCTAATTTTCCNAAAAAAAAAAAAAA]


>consensus_9532#0 TCTACGCCAACTTGGTGAACCTGTCTGTTTATTTGGTGAAGATGGAGCAGACCGAAGAGA AAGACTACGGATGATTCTTGCAGTGAGCGGTGGTCCAGCTCAAAGACCACCTTTAACAGA TACAGTAAAATCATCGACTGGGACTGGTACATCTATTAATCGACTTGGTGAAAATATTTC TACTGATACTGTCGGAGATGATACTACAGTGTGGTACCATCAAGGTCCGAATACTCTTGC AGAGGCTCGCCTATGGATTAGTGAATTTTCCTTAACTCGAGCTAAAGTACGGCTGGATAG AGCTAGGAATTATTTCAATAATGTTCCAGCACCTCAACGCAAAGCTAAACTCCAAGAATA TCATAAGGTTTTGCGAAACACAAATTTGCTATGCAGTCAAGTTGGAGATATTCGACCATT AAGTATGTGTCGCTTTTCACCTGATGGTAAACAATTAGCTACATCATCTTGGAGTGGTCT GTGTCGTTTATGGTCTATACCTGATTGTAATTTAGTTATGAATTTACGTGGGCATACTGC ACCAACTTGTGCTATTGTTTGGCATCCTCAAGCTGGTCTCCAGTCGGAACAACAATTGGC ACTTGCCAGTTCAGCTCAAGACGGAAGTGTTAAACTATGGAGTTTAGATAATGAAGAACC TTTGGCCGATATTGAAGGTCACGCACCTCACAGAGTATCTCGCTTAGCCTTCCATCCTTC TGGACGTTTCCTGGCAACTACGTGCTTCGATCACTCATGGCGCTTATGGGATTTAGAGGC TTGTGAAGAAATTTTACACCAAGAAGGTCATTCCAAGCCAGTTTATGATGTTGTTTTTCA CCCTGATGGTTCCTTAGCTCTAACCACCGGTTTGGATGGATATGCTCGTGTTTGGGACTT ACGAACAGGTCGTTGTATTATGTTTCTAGAAGGCCACCTTGAAGAGTTGCTGGGCGCAGA TGTAGCTGATAATGGTTATCACGCAGCCACTTCTAGTGCAGATAACACCGTTCGTATTTG GGATTTACGACAACAACAAGCAATTTATGTAATACCAGCTCACACTAGTGTTGTAAGCAG CGTACGATTTGAATCACGCAACTGTAGCTATATTGTTACCAGTTCGTTTGATAAAACAAC CAAAATTGGGGCCATCCTATCTGGACACCTATCAAAACGCTCGAAGGACATAACAGTAAA GTTGTTTATGCAGACATTTCACCAGACAATAAATACATTGCAACCTGTTCCCACGACCTG ACTTATAAACTGTGGAGTAAAGAAGCAAACTAATCCTCTCCGTTACAACAAATGTTAATA ACAATATTCCTATAATACGTTGTAAAATAATCTTATATATACATTCGTGTTTCTAATTTT CCNAAAAAAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)