Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 9675 cluster # 9675       Sequences # 10       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9675#0 length = 717 sequences # 10  

consensusID : consensus_9675#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 10
consensus length = 717
fasta sequence
                              [AAAAACCTGTTTTGTTTTCAGTTAACTTTCGTTTATTGACCATTGGAACATTGAACGATTGAATGGATCATGTGTTGTCAAAGACGTCGTTTTCTTATTTGTTTTTCTTTAAAATTTTAAGTATAATTCTTTTGATCTTCCAT-AAAAAAATCACATCACAATAAAGAGTGGAGAACAACTTTGTTCATTATATTCAACTAGACATTGCGATTGTAGAATTCTTCTCGACATTTGATCATCGTGCTATGATTATACAATTTTGTGATGATTCA-TCATGAGATTTTTGTCATTAGAATGAATTGTTTAACCTTATAAAAGTGTATTTCATACAATCAAGTAAAATATATTTACATTTGTTTACCCATTTGTTCGAATGCAATTTATTATATGCATCTCTATCATATATATATCTGTGTGTTTATGGAAACTATTGTCATTATTCTGTTAAATTTAAACTCCACAACCGATCATGCAATAACTAGATCACCCTTGGGTTCTCCTTTCTTTTTGGTATTTCATAAATTGTCTTATTCCTATCGACATTGAAATAAAATAACAGGTGTATAATTTATTTTTAAAAACTCCAATGTATAAAACTTTTACATCATCACCGTTCTCTTTTAGTCGTTTCTTTTCTCCTACGTACTCGTGCTTCTCTTGCCTGGCTTTTTTTCTTTTCCGTTTCGCTGATGCCATTAGTAAAGTTTGCATATCTTT]

[+] EMBL CD169581             [AAAAACCTGTTTTGTTTTCAGTTAACTTTCGTTTATTGACCATTGGAACATTGAACGATTGAATGGATCATGTGTTGTCAAAGACGTCGTTTTCTTATTTGTTTTTCTTTAAAATTTTAAGTATAATTCTTTTGATCTTCCATAAAAAAAATCACATCACAATAAAGAGTGGAGAACAACTTTGTTCATTATATTCAACTAGACATTGCGATTGTAGAATTCTTCTCGACATTTGATCATCGTGCTATGATTATACAATTTTGTGATGATTCA TCATGAGATTTTTGTCATTAGAATGAATTGTTTAACCTTATAAAAGTGTATTTCATACAATCAAGTAAAATATATTTACATTTGTTTACCCATTTGTTCGAATGCAATTTATTATATGCATCTCTATCATATATATATCTGTGTGTTTATGGAAACTATTGTCATTATTCTGTTAAATTTAAACTCCACAACCGATCATGCAATAACTAGATCACCCTTGGGTTCTCCTTTCTTTTTGGTATTTCATAAATTGTCTTATTCCTATCGACATTGAAATAAAATAACAGGTGTATAATTTATTTTTAAAAACTCCAATGTATAAAACTTTTACATCATCACCGTTCTCTTTTAGTCGTTTCTTTTCTCCTACGTACTCGTGCTTCTCTTGCC                                                       ]
[+] EMBL CD169806             [AAAAACCTGTTTTGTTTTCAGTTAACTTTCGTTTATTGACCATTGGAACATTGAACGATTGAATGGATCATGTGTTGTCAAAGACGTCGTTTTCTTATTTGTTTTTCTTTAAAATTTTAAGTATAATTCTTTTGATCTTCCAT AAAAAAATCACATCACAATAAAGAGTGGAGAACAACTTTGTTCATTATATTCAACTAGACATTGCGATTGTAGAATTCTTCTCGACATTTGATCATCGTGCTATGATTATACAATTTTGTGATGATTCA TCATGAGATTTTTGTCATTAGAATGAATTGTTTAACCTTATAAAAGTGTATTTCATACAATCAAGTAAAATATATTTACATTTGTTTACCCATTTGTTCGAATGCAATTTATTATATGCATCTCTATCATATATATATCTGTGTGTTTATGGAAACTATTGTCATTATTCTGTTAAATTTAAACTCCACAACCGATCATGCAATAACTAGATCACCCTTGGGTTCTCCTTTCTTTTTGGTATTTCATAAATTGTCTTATTCCTATCGACATTGAAATAAAATAACAGGTGTATAATTTATTTTTAAAAA                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD129958             [AAAAACCTGTTTTGTTTTC     ACTTTCGTTTATTGACCATTGGAACATTGAACGATTGAATGGATCATGTGTTGTCAAAGACGTCGTTTTCTTATTTGTTTTTCTTTAAAATTTTAAGTATAATTCTTTTGATCTTCCAT AAAGAAATCACATCACAATAAAGAGTGGAGAACAACTTTGTTCATTATATTCAACTAGACATTGCGATTGTAGAATTCTTCTCGACATTTGATCATCGTGCTATGATTATACAATTTTGTGATGATTCA TCATGAGATTTTTGTCATTAGAATGAATTGTTTAACCTTATAAAAGTGTAATTCATACAATCAAGTAAAATATATTTACATTTGTTTACCCATTTGTTCGAATGCAATTTATTATATGCACCTCTATCATATATATATCTGTGTGTTTATGGAAACTATTGTCATTATTCTGTTAAATTTAAACTCCACAACCGATCATGCAATAACTAGATCACCCTTGGGTTCTCCTTTCTTTTTGGTATT                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD169630             [ AAAACCTGTTTTGTTTTCAGTTAACTTTCGTTTATTGACCATTGGAACATTGAACGATTGAATGGATCATGTGTTGTCAAAGACGTCGTTTTCTTATTTGTTTTTCTTTAAAATTTTAAGTATAATTCTTTTGATCTTCCAT AAAAAAATCACATCACAATAAAGAGTGGAGAACAACTTTGTTCATTATATTCAACTAGACATTGCGATTGTAGAATTCTTCTCGACATTTGATCATCGTGCTATGATTATACAATTTTGTGATGATTCA TCATGAGATTTTTGTCATTAGAATGAATTGTTTAACCTTATAAAAGTGTATTTCATACAATCAAGTAAAATATATTTACATTTGTTTACCCATTTGTTCGAATGCAATTTATTATATGCATCTCTATCATATATATATCTGTGTGTTTATGGAAACTATTGTCATTATTCTGTTAAATTTAAACTCCACAACCGATCATGCAATAACTAGATCACCCTTGGGTTCTCCTTTCTTTTTGGTATTTCATAAATTGTCTTATTCCTATCGACATTGAAATAAAATAACAGGTGTATAATTTATTTTTAAAAACTCCAACGTATAAAACTTTTACATCATCACCGTTCTCTTTTAGTCGTTTCTTTTCTCCTACGTACTCGTGCTTCTCTTGCCT                                                      ]
[-] EMBL CD129943             [ anAACCTGTTNTGTTNTCAGTTAACTTTCGTNTATTGACCATTGGAACATTGAACGATTGAATGGATCATGTG TGTCAAAGACGTCGTTTTCTTATNTGTTTTTCTTTAAAATTTTAAGTATAATTCTTTTGATCTTCCAT AAAAAAATCACATCACAATAAAGAGTGGAGAACAACTTTGTTCATTATATTCAACTAGACATTGCGATTGTAGAATTCTTCTCGACATTTGATCATCGTGCTATGATTATACAATTTTGTGATGATTCA TCATGAGATTTTTGTCATTAGAATGAATTGTTTAACCTTATAAAAGTGTATTTCATACAATCAAGTAAAATATATTTACATTTGTTTACCCATTTGTTCGAATGCAATTTATTATATGCATCTCTATCATATATATATCTGTGTGTTTATGGAAACTATTGTCATTATTCTGTTAAATTTAAACTCCACAACCGATCATGCAATAACTAGATCACCCTTGGGTTCTCCTTTCTTTTTGGTATTTCATAAATTGTCTTATTCCTATCGACATTGAAATAAAATAACAGGTGTATAATTTATTTTTAAAAACTCCAATGTATAAAACTTTTACATCATCACCGTTCTCTT                                                                                                 ]
[-] EMBL CD169232             [                                                                                       CGTTTTCTTATTTGTTTTTCTTTAAAATTTANAGTATAATTCTTTTGATCTTCCATAAAAAAAATCACATCACAATAAAGAGTGGAGAACAACTTTGTTCATTATATTCAACTAGACATTGCGATTGTAGAATTCTTCTCGACATTTGATCATCGTGCTATGATTATACAATTTTGTGATGATTCA TCATGAGATTTTTGTCATTAGAATGAATTGTTTAACCTTATAAAAGTGTATTTCATACAATCAAGTAAAATATATTTACATTTGTTTACCCATTTGTTCGAATGCAATTTATTATATGCATCTCTATCATATATATATCTGTGTGTTTATGGAAACTATTGTCATTATTCTGTTAAATTTAAACTCCACAACCGATCATGCAATAACTAGATCACCCTTGGGTTCTCCTTTCTTTTTGGTATTTCATAAATTGTCTTATTCCTATCGACATTGAAATAAAATAACAGGTGTATAATTTATTTTTAAAAACTCCAATGTATAAAACTTTTACATCATCACCGTTCTCTTTTAGTCGTTTCTTTTCTCCTACGTACTCGTGCTTCTCTTGCCT                                                      ]
[-] EMBL CD168976             [                                                                                              TTATTTGTTTTTCTTTAAAATTTAAAGTATAATTCTTTTGATCTTCCAT AAAAAAATCACATCACAATAAAGAGTGGAGAACAACTTTGTTCATTATATTCAACTAGACATTGCGATTGTAGAATTCTTCTCGACATTTGATCATCGTGCTATGATTATACAATTTTGTGATGATTCA TCATGAGATTTTTGTCATTAGAATGAATTGTTTAACCTTATAAAAGTGTATTTCATACAATCAAGTAAAATATATTTACATTTGTTTACCCATTTGTTCGAATGCAATTTATTATATGCATCTCTATCATATATATATCTGTGTGTTTATGGAAACTATTGTCATTATTCTGTTAAATTTAAACTCCACAACCGATCATGCAATAACTAGATCACCCTTGGGTTCTCCTTTCTTTTTGGTATTTCATAAATTGTCTTATTCCTATCGACATTGAAATAAAATAACAGGTGTATAATTTATTTTTAAAAACTCCAATGTATAAAACTTTTACATCATCACCGTTCTCTTTTAGTCGTTTCTTTTCTCCTACGTACTCGTGCTTCTCTTGCCT                                                      ]
[+] EMBL CD068654             [                                                                                                                                                                                                    AACTAGACATTGCGATTGTAGAATTCTTCTCGACATTTGATCATCGTGCTATGATTATACAATTTTGTGATGATTCACTCATGAGATTTTCGTCATTAGAATGAATTGTTTAACCTTATAAAAGTGTATTTCATACAATCAAGTAAAATATATTTACATTTGTTTACCCATTTGTTCGAATGCAATCTATTATATGCATCTCTATCATATATATATCTGTGTGTCTATGGAAACTATTGTCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD143531             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AACCGATCATGCAATAACTAGATCACCCTTGGGTTCTCCTTTCTTTTTGGTATTTCATAAATTGTCTTATTCCTATCGGCATTGAAATAAAATAACAGGTGTATAATTTATTTTTAAAAACTCCAATGTATAAAACTTTTACATCATCACCGTTCTCTTTTAGTCGTTTCTTTTCCCCTACGTACTCGTGCTTCTCTTGCCTGGCTTTTTTTCTTTTCCGTTTCGCTGATGCCATTAGTAAAGTTTGCATATCTTT]
[-] EMBL CD142518             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tgTCTGTCTGGTATTTCATAAATTGTCTTATTCCTATCGACATTGAAATGAAATAACAGGTGTATAATTTATTTTTAAAAACTCCAATGTATAAAACTTCTACATCATCACCGTTCTCTGTTAGTCGTTTCTTTTCTCCTACGTAC                                                                       ]


>consensus_9675#0 AAAAACCTGTTTTGTTTTCAGTTAACTTTCGTTTATTGACCATTGGAACATTGAACGATT GAATGGATCATGTGTTGTCAAAGACGTCGTTTTCTTATTTGTTTTTCTTTAAAATTTTAA GTATAATTCTTTTGATCTTCCATAAAAAAATCACATCACAATAAAGAGTGGAGAACAACT TTGTTCATTATATTCAACTAGACATTGCGATTGTAGAATTCTTCTCGACATTTGATCATC GTGCTATGATTATACAATTTTGTGATGATTCATCATGAGATTTTTGTCATTAGAATGAAT TGTTTAACCTTATAAAAGTGTATTTCATACAATCAAGTAAAATATATTTACATTTGTTTA CCCATTTGTTCGAATGCAATTTATTATATGCATCTCTATCATATATATATCTGTGTGTTT ATGGAAACTATTGTCATTATTCTGTTAAATTTAAACTCCACAACCGATCATGCAATAACT AGATCACCCTTGGGTTCTCCTTTCTTTTTGGTATTTCATAAATTGTCTTATTCCTATCGA CATTGAAATAAAATAACAGGTGTATAATTTATTTTTAAAAACTCCAATGTATAAAACTTT TACATCATCACCGTTCTCTTTTAGTCGTTTCTTTTCTCCTACGTACTCGTGCTTCTCTTG CCTGGCTTTTTTTCTTTTCCGTTTCGCTGATGCCATTAGTAAAGTTTGCATATCTTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)