These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9717#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 11 consensus length = 448 fasta sequence [TGTTATTTGTTGCATGATCTGTACTGCTGTTCTCTAACTGTTGATTCCACGTGTTACAAAGATTCTGGGAAAATTACTTAGACCGTAGTGTCGTGGTCCGGGCAGATATTAAATTTCTACCAAATAAATGAGCATCAAACCATGTCTACGTTAAGTGAGCAGATTGCTATACAAGAAGCTGTCCAAAACGAATTGCAACAAACTGTTTTCTCACAGCCTATATACGAACGTTTTGGTGGCAATATCTTTTTTCCTGTTTCTCGTACAAATGCTTTAATCCAATGTAAAGAAAAACTTTTAAAGCTGAGTAAAAATTCATCCGAATTAAAAACGGACAAGGACTAATGTATAATCATTATTCTTTATCAGTCTACTGAAAAGATGAATAACACAAGAGCATGTTACTTTTCTAAATATGAAAACGAAGCTTTATAATTAAATAAATCAT] [+] EMBL BF936649 [TGTTATTTGTTGCATGATCTGTACTGCTGTTCTCTAACTGTTGATTCCACGTGTTACAAAGATTCTGGGAAAATTACTTAGACCGTAGTGTCGTGGTCCGGGCAGATATTAAATTTCTACCAAATAAATGAGCATCAAACCATGTCTACGTTAAGTGAGCAGATTGCTATACAAGAAGCTGTCCAAAACGAATTGCAACAAACTGTTTTCTCACAGCCTATATACGAACGTTTTGGTGGCAATATCTTTTTTCCTGTTTCTCGTACAAATGCTTTAATCCAATGTAAAGAAAAACTTTTAAAGCTGAGTAAAAATTCATCCGAATTAAAAACGGACAAGGACTAATGTATAATCATTATTCTTTATCAGTCTACTGAAAAGATGAATAACACAAGAGCATGTTACTTTTCTAAATATGAAAACGAAGCTTTATAATTAAATAAATCAT] [-] EMBL CD140246 [ TGCATGATCTGTACTGCTGTTCTCTAACTGTTGATTCCACGTGTTACAAAGATCCTGGGAAAATTACTTAGACCGAAGTGTCGTGGTCCGGGCAGATATTAAATTTCTACCAAATAAATGAGCATCAAACCAGGTCTACGTTAAGTGAGCAGATTGCTAAACAAGAAGCTGTCCAAAACGAATTGCAACAAACTGTTTTCTCACAGCCTATATACGAACGTTTTGGTGGCAATATCTTTTTTCCTGTTTCTCGTACAAATGCTTTAATCCAATGTAAAGAAAAACTTTTAAAGCTGAGTAAAAATTCATCCGAATTAAAAACGGACAAGGACTAATGTATAATCATTATTCTTTATCAGTCTACTGAAAA ] [-] EMBL CD140270 [ CATGATCTGTACTGCTGTTCTCTAACTGTGGATCCCACGTGTGACAAAGATTCTGGGAAAATTACTTAGACCGTAGTGTCGTGGTCCGGGCAGATATTAAATTTCTACCAAATAAATGAGCATCAAACCATGTCTACGTTAAGTGAGCAGATTGCTATACAAGAAGCTGTCCAAAACGAATTGCAACAAACTGTTTTCTCACAGCCTATATACGAACGTTTTGGTGGCAATATCTTTTTTCCTGTTTCTCGTACAAATGCTTTAATCCAATGTAAAGAAAAACTTTTAAAGCTGAGTAAAAATTCATCCGAATTAAAAACGGACAAGGGCTAATGTATAATCATTATTCTactgaaaa ] [+] EMBL CD140252 [ ATGATCTGTACTGCTGTTCTCTAACTGTTGATTCCACGTGTTACAAAGATTCTGGGAAAATTACTTAGACCGTAGTGTCGTGGTCCGGGCAGATATTAAATTTCTACCAAATAAATGAGCATCAAACCATGTCTACGTTAAGTGAGCAGATTGCTATACAAGAAGCTGTCCAAAACGAATTGCAACAAACTGTTTTCTCACAGCCTATATACGAACGTTTTGGTGGCAATATCTTTTTTCCTGTTTCTCGTACAAATGCTTTAATCCAATGTAAAGAAAAACTTTTAAAGCTGAGTAAAAATTCATCCGAATTAAAAACGGACAAGGACTAATGTATAATCATTATTCTTCATCAGTCTACTGTAAcg ] [+] EMBL CD140312 [ ATGATCTGTACTGCTGTTCTCTAACTGTTGATTCCACGTGTTACAAAGATTCTGGGAAAATTACTTAGACCGTAGTGCCGTGGTCCGGGCAGATATTAAATTTCTACCAAATAAATGAGCATCAAACCATGTCTACGTTAAGTGAGCAGATTGCTATACAAGAAGCTGTCCAAAACGAATTGCAACAAACTGTTTTCTCACAGCCTATATACGAACGTTTTGGTGGCAATATCTTTTTTCCTGTTTCTCGTACAAATGCTTTAATCCAATGTAAAGAAAAACTTTTAAAGCTGAGTAAAAATTCATCCGAATTAAAAACGGACAAGGACTAATGTATAATCATTATTCTTTATCAGTCTACTGAAA ] [+] EMBL CD140153 [ ATGATCTGTACTGCTGTTCTCTAACTGTTGATTCCACGTGTTACAAAGATTCTGGGAAAATTACTTAGACCGTAGTGTCGTGGTCCGGGCAGATATTAAATTTCTACCAAATAAATGAGCATCAAACCATGTCTACGTTAAGTGAGCAGATTGCTATACAAGAAGCTGTCCAAAACGAATTGCAACAAACTGTTTTCTCACAGCCTATATACGAACGTTTTGGTGGCAATATCTTTTTTCCTGTTTCTCGTACAAATGCTTTAATCCAATGTAAAGAAAAACTTTTAAAGCTGAGTAAAAATTCATCCGAATTAAAAACGGACAAGGACTAATGTATAATCATTATTCTTTATCAGTCTACTGAAA ] [+] EMBL CD140305 [ ATGATCTGTACTGCTGTTCTCTAACTGTTGATTCCACGTGTTACAAAGATTCTGGGAAAATTACTTAGACCGTAGTGTCGTGGTCCGGGCAGATATTAAATTTCTACCAAATAAATGAGCATCAAACCATGTCTACGTTAAGTGAGCAGATTGCTATACAAGAAGCTGTCCAAAACGAATTGCAACAAACTGTTTTCTCACAGCCTATATACGAACGTTTTGGTGGCAATATCTTTTTTCCTGTTTCTCGTACAAATGCTTTAATCCAATGTAAAGAAAAACTTTTAAAGCTGAGTAAAAATTCATCCGAATTAAAAACGGACCAGGA ] [-] EMBL CD196329 [ TGATCTGTACTGCTGTCNTCTAACTGTTGATTCCACGTGTTACAAAGATTCTGGGAAAATTACTTAGACCGTAGTGTCGTGGTCCGGGCAGATATTAAATTTCTACCAAATAAATGAGCATCAAACCATGTCTACGTTAAGTGAGCAGATTGCTATACAAGAAGCTGTCCAAAACGAATTGCAACAAACTGTTTTCTCACAGCCTATATACGAACGTTTTGGTGGCAATATCTTTTTTCCTGTTTCTCGTACAAATGCCTTAATCCAATGTAAAGAAAAACTTTTAAAGCTGAGTAAAAATTCATCCGAATTAAAAACGGACAAGGACTAATGTATAATCATTATTCTactgaaaa ] [-] EMBL CD140118 [ TGATCTGTACTGCTGTTCTCTAACTGTTGATTCCACGTGTTACAAAGATTCTGGGAAAATTACTTAGACCGTAGTGTCGTGGTCCGGGCAGATATTAAATTTCTACCAAATAAATGAGCATCAAACCATGTCTACGTTAAGTGAGCAGATTGCTATACAAGAAGCTGTCCAAAACGAATTGCAACAAACTGTTTTCTCACAGCCTATATACGAACGTTTTGGTGGCAATATCTTTTTTCCTGTTTCTCGTACAAATGCTTTAATCCAATGTAAAGAAAAACTTTTAAAGCTGAGTAAAAATTCATCCGAATTAAAAACGGACAAGGACTAATGTATAATCATTATTCTactgaaaa ] [-] EMBL CD140324 [ TGATCTGTACTGCTGTTCTCTAACTGTTGATTCCACGTGTTACAAAGATTCTGGGAAAATTACTTAGACCGTAGTGTCGTGGTCCGGGCAGATATTAAATTTCTACCAAATAAATGAGCATCAAACCATGTCTACGTTAAGTGAGCAGATTGCTATACAAGAAGCTGTCCAAAACGAATTGCAACAAACTGTTTTCTCACAGCCTATATACGAACGTTTTGGTGGCAATATCTTTTTTCCTGTTTCTCGTACAAATGCTTTAATCCAATGTAAAGAAAAACTTTTAAAGCTGAGTAAAAATTCATCCGAATTAAAAACGGACAAGGACTAATGTATAATCATTATTCTTTATCAGTCTACTGAAAA ] [-] EMBL CD140170 [ GTTCTCTAACTGTTGATTCCACGTGTTACAAAGATTCTGGGAAAATTACTTAGACCGTAGTGTCGTGGTCCGGGCAGATATTAAATTTCTACCAAATAAATGAGCATCAAACCATGTCTACGTTAAGTGAGCAGATTGCTATACAAGAAGCTGTCCAAAACGAATTGCAACAAACTGTTTTCTCACAGCCTATATACGAACGTTTTGGTGGCAATATCTTTTTTCCTGTTTCTCGTACAAATGCTTTAATCCAATGTAAAGAAAAACTTTTAAAGCTGAGTAAAAATTCATCCGAATTAAAAACGGACAAGGACTAATGTATAATCATTATTCTTTATCAGTCTACTGAAAA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||