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Schistosoma mansoni
cluster # 9752 cluster # 9752       Sequences # 11       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9752#0 length = 800 sequences # 11  

consensusID : consensus_9752#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 11
consensus length = 800
fasta sequence
                              [AGTCTTTTGATACACCTGTATTTCCTGAAGAATCTTCGGAACTTTTTACAGCAGAAATATCAACCTCATGATTTTCACTTGGTAGCGTATGGTTGTCATTTTGAGATACTGAATTTTTACTGATAATAGGTTTTTTCCTTTGATGTTCAAAATTTAAAAGGCTTCTCTTATTTGCTGATGCTACAACAACATCATTCAGCAAAAAATCGATATGAAAAGGGTTATAATACACGACTGCCTTGTGTCCAGACTGTCCATCCAACACTAAACTATCCTCAGCAAATACAGACCTGACAGGGGCCTTTTGAACGCTTAGCAAAACGTCTCCTGTAGGTACGCGAAACCTTCTATACTCATCTGTCAATTCATTAATGAGTACATGGAAGATGGAGTGTTGATTATAGGTAATATCCAGTGACAGAGAATGGTTTAGATCTCCAGTGTAAATAACTGCAGTCATTCCATATGGGTTTATCTTGACAGAACTTGGTTCTAACCAGTGCGCAAGTTCCCCGGGTTTTATTTGTCGTTGTCGAGTACAGAACGAGCTTTGATCACATGTTTTAAAATTAGCACGATCTACCGACCACGAGATATTGAGTATCAAGAAAATAAGACCTAAACTCTCTAGCCTCAAAAACATGCTGAAAGAACTGTTTCAACAGGTTAACGAGTTTTGCTTGGTAAAAAAGTGAA-GGGATAATCTTGAGTGGGATTCCAGTCTGCCAGGTCAAACGGCGCAACAAAGAGTCTGAGATAAGCAAA-GCTCTTTTGAACGCGTCAGACGACCTACTATTTGC]

[-] EMBL CD062328             [AGTCTTTTGATACACCTGTATTTCCTGAAGAATCTTCGGAACTTTTTACAGCAGAAATATCAACCTCATGATTTTCACTTGGTAGCGTATGGTTGTCATTTTGAGATACTGAATTTTTACTGATAATAGGTTTTTTCCTTTGATGTTCAAAATTTAAAAGGCTTCTCTTATTTGCTGATGCTACAACAACATCATTCAGCAAAAAATCGATATGAAAAGGGTTATAATACACGACTGCCTTGTGTCCAGACTGTCCATCCAACACTAAACTATCCTCAGCAAATACAGACCTGACAGGGGCCTTTTGAACGCTTAGCAAAACGTCTCCTGTAGGTACGCGAAACCTTCTATACTCATCTGTCAATTCATTAATGAGTACATGGAAGATGGAGTGTTGATTATAGGTGATATCCAGTGACAGAGAATGGTTTAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL BF937038             [                                                              ACCTCATGATTTTCACTTGGTAGCGTATGGTTGTCATTTTGAGATACTGAATTTTTACTGATAATAGGTTTTTTCCTTTGATGTTCAAAATTTAAAAGGCTTCTCTTATTTGCTGATGCTACAACAACATCATTCAGCAAAAAATCGATATGAAAAGGGTTATAATACACGACTGCCTTGTGTCCAGACTGTCCATCCAACACTAAACTATCCTCAGCAAATACAGACCTGACAGGGGCCTTTTGAACGCTTAGCAAAACGTCTCCTGTAGGTACGCGAAACCTTCTATACTCATCTGTCAATTCATTAATGAGTACATGGAAGATGGAGTGTTGATTATAGGTAATATCCAGTGACAGAGAATGGTTTAGATCTCCAGTGTAAATAACTGCAGTCATTCCATATGGGTTTATCTTGACAGAACTTGGTTCTAACCAGTGCGCAAGTTCCCCGGGTTTTATTTGTCGTTGTCGAGTACAGAACGAGCTTTGATCACATctcgtgc                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD137642             [                                                                                             TGTCATTTTGAGATACTGAATTTTTACTGATAATAGGTTTTTTCCTTTGATGTTCAAAATTTAAAAGGCTTCTCTTATTTGCTGATGCTACAACAACATCATTCAGCAAAAAATCGATATGAAAAGGGTTATAATACACGACTGCCTTGTGTCCAGACTGTCCATCCAACACTAAACTATCCTCAGCAAATACAGACCTGACAGGGGCCTTTTGAACGCTTAGCAAAACGTCTCCTGTAGGTACGCGAAACCTTCTATACTCATCTGTCAATTCATTAATGAGTACATGGAAGATGGAGTGTTGATTATAGGTAATATCCAGTGACAGAGAATGGTTTAGATCTCCAGTGTAAATAACTGCAGTCATTCCATATGGGTTTATCTTGACAGAACTTGGTTCTAACCAGTGCGCAAGTTCCCCGGGTTTTATTTGTCGTTGTCGAGTACAGAACGAGCTTTGATCACATGTTTTAAAATTAGCACGATCTACCGACCACGAGATATTGAGTATCAAGAANATAAGACCTANACTCTCTAGCCTCANAAACATGCTGAAAGAACTGTNTCAACAGGTTAACGAGTTTTGCTTGGT AAAAAGTGAAGGGGAT ATCTTGAGTGG                                                                                        ]
[+] EMBL CD098009             [                                                                                                                                   TTTTTCCTTTGATGTTCAAAATTTAAAAGGCTTCTCTTATTTGCTGATGCTACAACAACATCATTCAGCAAAAAATCGATATGAAAAGGGTTATAATACACGACTGCCTTGTGTCCAGACTGTCCATCCAACACTAAACTATCCTCAGCAAATACAGACCTGACAGGGGCCTTTTGAACGCTTAGCAAAACGTCTCCTGTAGGTACGCGAAACCTTCTATACTCATCTGTCAATTCATTAATGAGTACATGGAAGATGGAGTGTTGATTATAGGTAATATCCAGTGACAGAGAATGGTTTAGATCTCCAGTGTAAATAACTGCAGTCATTCCATATGGGTTTATCTTGACAGAACTTGGTTCTAACCAGTGCGCAAGTTCCCCGGGTTTTATTTGTCGTCGTCGAGTACAGAACGAGCTTTGATCACATGTTTTAAAATTAGCACGATCTAACGACCACGAG                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD165085             [                                                                                                                                                                                                                                                   GTCCAGACTGTCCATCCAACACTAAACTATCCTCAGCAAATACAGACCTGACAGGGGCCTTTTGAACGCTTAGCAAAACGTCTCCTGTAGGTACGCGAAACCTTCTATACTCATCTGTCAATTCATTAATGAGTACATGGAAGATGGAGTGTTGATTATAGGTAATATCCAGTGACAGAGAATGGTTTAGATCTCCAGTGTAAATAACTGCAGTCATTCCATATGGGTTTATCTTGACAGAACTTGGTTCTAACCAGTGCGCAAGTTCCCCGGGTTTTATTTGTCGTTGTCGAGTACAGAACGAGCTTTGATCACAT                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD165147             [                                                                                                                                                                                                                                                    TCCAGACTGTCCATCCAACACTAAACTATCCTCAGCAAATACAGACCTGACAGGGGCCTTTTGAACGCTTAGCAAAACGTCTCCTGTAGGTACGCGAAACCTTCTATACTCATCTGTCAATTCATTAATGAGTACATGGAAGATGGAGTGTTGATTATAGGTAATATCCAGTGACAGAGAATGGTTTAGATCTCCAGTGTAAATAACTGCAGTCATTCCATATGGGTTTATCTTGACAGAACTTGGTTCTAACCAGTGCGCAAGTTCCCCGGGTTTTATTTGTCGTTGTCGAGTACAGAACGAGCTTTGATCACAT                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD120529             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GAACGCTTAGCAAAACGTCTCCTGTAGGTACGCGAAACCTTCTATACTCATCTGTCAATTCATTAATGAGTACATGGAAGATGGAGTGTTGATTATAGGTAATATCCAGTGACAGAGAATGGTTTAGATCTCCAGTGTAAATAACTGCAGTCATTCCATATGGGTTTATCTTGACAGAACTTGGTTCTAACCAGTGCGCAAGTTCCCCGGGTTTTATTTGTCGTTGTCGAGTACAGAACGAGCTTTGATCACATGTTTTAAAATTAGCACGATCTACCGACCACGAGATATTGAGTATCAAGAAAATAAGACCTAAACTCTCTAGCCTC AAAACATGCTGAAAGAACTGTTTCAACAGGTTAACGAGTTTTGCTTGGTAAAAAAGTGAA GGGATAATCTTGAGTGGGATTCCAGTCTGCCAGGc                                                                      ]
[-] EMBL CD098086             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     cgGTCAATTCATAAATGAGTACATGGAAGATGGAGTGTTGATAATAGGTAATATCCAGTGACAGAGAATGGTTTAGATCTCCAGTGTAAATAACTGCAGTCATTCCATATGGGTTTATCTTGACAGAACTTGGTTCTAACCAGTGCGCAAGTTCCCCGGGTTTTATTTGTCGTTGTCGAGTACAGAACGAGCTTTGATCACATGTTTTAAAATTAGCACGATCTACCGACCACGAGACATTGAGTATCAAGAAAATAAGACCTAAACTCTCTAGCCTCAAAAACATGCTGAAAGAACTGTTTCAACAGGTTAACGAGTTTTGCTTGGTAAAAAAGTGAA GGGATAATCTTGAGTGGGATTCCAGTCTGCCAGGTCAAACGGCGCAACAAAGAGTCTGAGATAAGCAAATGCTCTTTTGAACGCGTCAGACGA            ]
[+] EMBL CD179022             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GATTATAGGTAATATCCAGTGACAGAGAATGGTTTAGATCTCCAGTGTAAATAACTGCAGTCATTCCATATGGGTTTATCTAGACAGAACTTGGTTCTAACCAGTGCGCAAGTTCCCCGGGTTTTATTTGTCGTTGTCGAGTGCAGAACGAGCTTTGATCACATGTTTTAAAATTAGCACGATCTACCGACCACGAGATATTGAGTATCAAGAAAATAAGACCTAAACTCTCTAGCCTCAAAAACATGCTGAAAGAACTGTTTCAACAGGTTAACGAGTTTTGCTTGGTAAAAAAGTGAA GGGATAATCTTGAGTGGGATTCCAGTCTGCCAGGTCAAACGGCGCAACAAAGAGTCTGAGATAAGCAAATGCTCTTTTGAACGCGTCAGACG             ]
[-] EMBL CD127544             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GACAGAGAATGGTTTAGATCTCCAGTGTAAATAACTGCAGTCATTCCATATGGGTTTATCTTGACAGAACTTGGTTCTAACCAGTGCGCAAGTTCCCCGGGTTTTATTTGTCGTTGTCGAGTACAGAACGAGCTTTGATCACATGTTTTAAAATTAGCACGATCTACCGACCACGAGATATTGAGTATCAAGAAAATAAGACCTAAACTCTCTAGCCTCAAAAACATGCTGAAAGAACTGTTTCAACAGGTTAACGAGTTTTGCTTGGTAAAAAAGTGAA GGGATAATCTTGAGTGGGATTCCAGTCTGCCAGGTCAAACGGCGCAACAAAGAGTCTGAGATAAGCAAA GCTCTTTTGAACGCGTCAGACGACCTACTATTTGC]
[+] EMBL CD194965             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTATTTGTCGTTGTCGAGTACAGAACGAGCTTTGATCACATGTTTTAAAATTAGCACGACCTACCGACCACGAGATATTGAGTATCAAGAAAATAAGACCTAAACTCTCTAGCCTCAAAAACATGCTGAAAGAACTGTTTCAACAGGTTAACGAGTTTTGCTTGGTAAAAAAGTGAA GGGATAATCTTGA                                                                                            ]


>consensus_9752#0 AGTCTTTTGATACACCTGTATTTCCTGAAGAATCTTCGGAACTTTTTACAGCAGAAATAT CAACCTCATGATTTTCACTTGGTAGCGTATGGTTGTCATTTTGAGATACTGAATTTTTAC TGATAATAGGTTTTTTCCTTTGATGTTCAAAATTTAAAAGGCTTCTCTTATTTGCTGATG CTACAACAACATCATTCAGCAAAAAATCGATATGAAAAGGGTTATAATACACGACTGCCT TGTGTCCAGACTGTCCATCCAACACTAAACTATCCTCAGCAAATACAGACCTGACAGGGG CCTTTTGAACGCTTAGCAAAACGTCTCCTGTAGGTACGCGAAACCTTCTATACTCATCTG TCAATTCATTAATGAGTACATGGAAGATGGAGTGTTGATTATAGGTAATATCCAGTGACA GAGAATGGTTTAGATCTCCAGTGTAAATAACTGCAGTCATTCCATATGGGTTTATCTTGA CAGAACTTGGTTCTAACCAGTGCGCAAGTTCCCCGGGTTTTATTTGTCGTTGTCGAGTAC AGAACGAGCTTTGATCACATGTTTTAAAATTAGCACGATCTACCGACCACGAGATATTGA GTATCAAGAAAATAAGACCTAAACTCTCTAGCCTCAAAAACATGCTGAAAGAACTGTTTC AACAGGTTAACGAGTTTTGCTTGGTAAAAAAGTGAAGGGATAATCTTGAGTGGGATTCCA GTCTGCCAGGTCAAACGGCGCAACAAAGAGTCTGAGATAAGCAAAGCTCTTTTGAACGCG TCAGACGACCTACTATTTGC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)