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Schistosoma mansoni
cluster # 9761 cluster # 9761       Sequences # 11       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9761#0 length = 1479 sequences # 11  

consensusID : consensus_9761#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 11
consensus length = 1479
fasta sequence
                              [GAACAGTTGGCTTCATTGGAGGAAGATGGTGATCGTGTCGCTACAAGACCTGAGAAAGTCGCTTATCAATTAGCATTACATCGTGAATTACAACGAGCATTAAGCACACGTACTGTGGCTTATGATGGAGTGCGTCGTTACGCTAGACAACTACGTGACAGAGCACCAGTATGTGATCATGATGAATTAGATGATATGGTCAGTGAATTAAAGCATTTATGGCAAGCAGTGTGTACAAAAGCCTTAGCCAGACAACGCATTTTAGAACGAGCTCT-TTTGGCATCT-GGTCTTTATAAAGAAGCATTGGAAGCTTTACTTGA-TTGGTTAAGTAAGATTGAACCACAGTTAGCTGAACAACAAACTGGAAACTATGGTGATGTGGATATTGTCGAGCAATTATTAGAATCTCATCATCGTTTCAAAGCTGAGCTGGAACAACGCTCCACATCTGTGAAATTAATACATCAAGCTGCCAGTGATTTAATGAATAAGGCTTCATCTACTACTGACTCTGGAGCTGGTTCATCAACTAGCAATCAAGCTGATGTGTTTGCTATGCAAGCTCAATTAAATCATTTATCTAAAATATGGGATCGTGTACAGAATTTAACTCAACGTCGTAGTGAACGAATGGATCAAGCATTAAAAATGGCGCAGCAATTTCAGGATACAT-GTCGAAGTTTAAT-GGATTATTTTGCTGGAGCAGAACGTGTCATTCATCGTTTGGCTGCTTTACCTACCTTCGATGATGATGGTGAACTGGAAATTGAAACTGCTGGCACTAACAATCCACCAACTAATTTAACAGATGCAATTACAGCTCATCGACAAACACATTCTAATTTAATGAATCAAGCTGATCGAGTTGAAGCTGCTTTACAATTAGGCAATAAACTTTTATCTCAAGCTCATCCAGCAGCTGTGAAACGTTTACGTCAATGGGTTAATACTATTCGTACACGATGGGAGGAGTTAACTTCATGGTCGGAACAACGTGGAGAACGTTTGCAACAAGCTTTAGAAGAACAAAGTAAACGTAAACTTCAACGTGAAGAACTCATGCAATGGATCCATGTAAAAACTAGTGAATTAAAAAGTATTCCAACATTAATACCGATATCATCATTGTCATCTTCCTCAACTAATCTGCAATCAGCTAAGAGTAAACTAGACTCAAATGATTCAAAATCAATAGACTCCAAAGACTTATTTTCCATAACTCAAGAGCGTATTGCTATGTCACCTGTAACTTCTTTAGTTCGTCAACCTAACGTTGTTGTCAGTAGTAATGGTAATATAAATAGTAGAGATTNCAAACAACCTGAAACCCTTACTGATTTTGCAACATTTTTAAATGAAATAAACGATTCAAAAATCATTGGACAGTTACTCAATCTACATAGTCATTTAGAAGAAGAAGTGAAACAAAAACAACCTATTTATGGAAATATTATAAAACATGCTAAACGACGTACACCA]

[+] EMBL CD116253             [GAACAGTTGGCTTCATTGGAGGAAGATGGTGATCGTGTCGCTACAAGACCTGAGAAAGTCGCTTATCAATTAGCATTACATCGTGAATTACAACGAGCATTAAGCACACGTACTGTGGCTTATGATGGAGTGCGTCGTTACGCTAGACAACTACGTGACAGAGCACCAGTATGTGATCATGATGAATTAGATGATATGGTCAGTGAATTAAAGCATTTATGGCAAGCAGTGTGTACAAAAGCCTTAGCCAGACAACGCATTTTAGAACGAGCTCT TTTGGCATCT GGTCTTTATAAAGAAGCATTGGAAGCTTTACTTGA TTGGTTAAGTAAGATTGAACCACAGTTAGCTGAACAACAAACTGGAAACTATGGTGATGTGGATATTGTCGAGCAATTATTAGAATCTCATCATCGTTTCAAAGCTGAGCTGGAACAACGCTCCACATCTGTGAAATTAATACATCAAGCTGCCAGTGATTTAATGAATAAGGCTTCATCTACTACTGACTCTGGAGCTGGTTCATCAACTAGCAATCAAGCTGATGTGTTTGCTATGCAAGCTCAATTAAATCATTTATCTAAAATATGGGATCGTGTACAGAATTTAACTCAACGTCGTAGTGAACGATTGGATCAAGCATTAAAAATGGCGCAGCAATTTCAAGATACATGGTCGAAGTTTATTGGGATTTATTTGCTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD153949             [                                                   GAGAAAGTCGCTTATCAATTAGCATTACATCGTGAATTACAACGAGCATTAAGCACACGTACTGTGGCTTATGATGGAGTGCGTCGTTACGCTAGACAACTACGTGACAGAGCACCTGTATGTGATCATGATGAATTAGATGATATGGTCAGTGAATTAAAGCATTTATGGCAAGCAGTGTGTACAAAAGCCTTAGCCAGACAACGCATTTTAGAACAAGCTCT TTTGGCATCT GGTCTTTATAAAGAAGCATTGGAAGCTTTACTTGA TTGGTTAAGTAAGATTGAACCACAGTTAGCTGAACAACAAACTGGAAACTATGGTGATGTGGATATTGTCGAGCAATTATTAGAATCTCATCATCGTTTCAAAGCTGAGCTGGAACAACGCTCCACATCTGTGAAATTAATACATCAAGCTGCCAGTGATTTAATGAATAAGGCTTCATCTACTACTGACTCTGGAGCTGGTTCATCAACTAGCAATCAAGCTGATGTGTTTGCTATGCAAGCTCAATTAAATCATTTATCTAAAATATGGGATCGTGTACAGAATTTAACTCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD187128             [                                                                       AGCATTACATCGTGAATTACAACGAGCATTAAGCACACGTACTGTGGCTTATGATGGAGTGCGTCGTCACGCTAGACAACTACGTGACAGAGCACCAGTATGTGATCATGATGAATTAGATGATATGGTCAGTGAATTAAAGCATTTATGGCAAGCAGTGTGTACAAAAGCCTTAGCCAGACAACGCATTTTAGAACGAGCTCT TTTGGCATCT GGTCTTTATAAAGAAGCATTGGAAGCTTTACTTGA TTGGTTAAGTAAGATTGAACCACAGTTAGCTGAACAACAAACTGGAAACTATGGTGATGTGGATATTGTCGAGCAATTATTAGAATCTCATCATCGTTTCAAAGCTGAGCTGGAACAACGCTCCACATCTGTGAAATTAATACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD163965             [                                                                                                                                                                                                                                                                       AGNACAAGCTC  TTTGGCATCTGGGTCTTTATAAAGAAGCATTGGAAGCTTTACTTGA TTGGTTAAGTTAGATTGAACCACAGTTAGCTGAACAACAAACTGGAAACTATGGTGATGTGGATATTGTCGAGCAATANTTAGAATCTCATCATCGTTTCAAAGCTGAGCTGGAACAACGCTCCACATCTGTGAAATTAATACATCAAGCTGCCAGTGATTTAATGAATAAGGCTTCATCTACTACTGACTCTGGAGCTGGTTCATCAACTAGCAATCAAGCTGATGTGTTTGCTATGCAAGCTCAATTAAATCATTTATCTAAAATATGGGATCGTGTACAGAATTTAACTCAACGTCGTAGTGAACGAATGGATCAAGCATTAAAAATGGCGCAGCAATTTCAGGATACAT GTCGAAGTTTAAT GGATTATTTTGCTGGAGCAGAACGTGTCATTCATCGTTTGGCTGCTTTACCTACCTTCGATGATGATGGTGAACTGGAAATTGAAACTGCTGGCACTAACAATCCACCAACTAATTTAACAGATGCAATTACAGCTCATCGACAAACACATTCTAATTTAATGACTCAAGCTGATCGAGTTGAAGCTGCTTTACAATTAGGCAATAAACTTTTATCTCAAGCTCATCCAGCAGCTGTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD164076             [                                                                                                                                                                                                                                                                          gacAGCTTTCTTTGGCATCT GGTCTTTATAAAGAAGCATTGNAAGCTTTAC TGANTTGGTTAAGTAAGATTGAACCACAGTTAGCTGAACAACAAACTGGAAACTATGGTGATGTGGATATTGTCGAGCAATTATTAGAATCTCATCATCGTTTCAAAGCTGAGCTGGAACAACGCTCCACATCTGTGAAATTAATACATCAAGCTGCCAGTGATTTAATGAATAAGGCTTCATCTACTACTGACTCTGGAGCTGGTTCATCAACTAGCAATCAAGCTGATGTGTTTGCTATGCAAGCTCAATTAAATCATTTATCTAAAATATGGGATCGTGTACAGAATTTAACTCAACGTCGTAGTGAACGAATGGATCAAGCATTAAAAATGGCGCAGCAATTTCAGGATACAT GTCGAAGTTTAAT GGATTATTTTGCTGGAGCAGAACGTGTCATTCATCGTTTGGCTGCTTTACCTACCTTCGATGATGATGGTGAACTGGAAATTGAAACTGCTGGCACTAACAATCCACCAACTAATTTAACAGATGCAATTACAGCTCATCGACAAACACATTCTAATTTAATGAATCAAGCTGATCGAGTTGAAGCTGCTTTACAATTAGGCAATAAACTTTTATCTCAAGCTCATCCAGCAGCTGTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD086839             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GTAGTGAACGAATGGATCAAGCATTAAAAATGGCGCAGCAATTTCAGGATACAT GTCGAAGTTTAAT GGATTATTTTGCTGGAGCAGAACGTGTCATTCATCGTTTGGCTGCTTTACCTACCTTCGATGATGATGGTGAACTGGAAATTGAAACTGCTGGCACTAACAATCCACCAACTAATTTAACAGATGCAATTACAGCTCATCGACAAACACATTCTAATTTAATGAATCAAGCTGATCGAGTTGAAGCTGCTTTACAATTAGGCAATAAACTTTTACCTCAAGCTCATCCAGCAGCTGTGAAACGTTTACGTCAATGGGTTAATACTATTCGTACACGATGGGAGGAGTTAACTTCATGGTCGGAACAACGTGGAGAACGTTTGCAACAAGCTTTTGAAGAACAAAGTAAACGTAAACTTCAACGTGAAGAACTCATGCAATGGATCCATGTAAAAACTAGTGAATTAAAAAGTATTCCAACATTAATACCGATATCATCATTGTCATCTTCCTCAACTAATCTGCAATCAGCTAAGAGTAAACTAGACTCAAATGATTCAAAATCAATAGACTCCAAAGACTTATTTTCCATAACTCAAGAGCGTATTGCTATGCCACCTGTAACTTCTTTAGTTCGTCAACCTA                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD086873             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CGATGATGATGGTGAACTGGAAATTGAAACTGCTGGCACTAACAATCCACCAACTAATTTAACAGATGCAATTACAGCTCATCGACAAACACATTCTAATTTAATGAATCAAGCTGATCGAGTTGAAGCTGCTTTACAATTAGGCAATAAACTTTTATCTCAAGCTCATCCAGCAGCTGTGAAACGTTTACGTCAATGGGTTAATACTATTCGTACACGATGGGAGGAGTTAACTTCATGGTCGGAACAACGTGGAGAACGTTTGCAACAAGCTTTAGAAGAACAAAGTAAACGTAAACTTCAACGTGAAGAACTCATGCAATGGATCCATGTAAAAACTAGTGAATTAAAAAGTATTCCAACATTAATACCGATATCATCATTGTCATCTTCCTCAACTAATCTGCAATCAGCTAAGAGTAAACTAGACTCAAATGATTCAAAATCAATAGACTCCAAAGACTTATTTTCCATAACTCAAGAGCGTATTGCTATGTCACCTGTAACTTCTTTAGTTCGTCAACCTAA                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD202272             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGGAAATTGAAACTGCTGGCACTAACAATCCACCAACTAATTTAACAGATGCAATTACAGCTCATCGACAAACACATTCTAATTTAATGAATCAAGCTGATCGAGTTGAAGCTGCTTTACAATTAGGCAATAAACTTTTATCTCAAGCTCATCCAGCAGCTGTGAAACGTTTACGTCAATGGGTTAATACTATTCGTACACGATGGGAGGAGTTAACTTCATGGTCGGAACAACGTGGAGAACGTTTGCAACAAGCTTTAGAAGAACAAAGTAAACGTAAACTTCAACGTGAAGAACTCATGCAATGGATCCATGTAAAAACTAGTGAATTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD115150             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GTTTGCAACAAGCTTTAGAAGAACAAAGTAAACGTAAACTTCAACGTGAAGAACTCATGCAATGGATCCATGTAAAAACTAGTGAATTAAAAAGTATTCCAACATTAATACCGATATCATCATTGTCATCTTCCTCAAnt                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD182079             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          taccTGGATCCATGTAAAAACTAGTGAATTAAAAAGTATTCCAACATTAATACCGATATCATCATTGTCATCTTCCTCAACTAATCTGCAATCAGCTAAGAGTAAACTAGACTCAAATGATTCAAAATCAATAGACTCCAAAGACTTATTTTCCATAACTCAAGAGCGTATTGCTATGTCACCTGTAACTTCTTTAGTTCGTCAACCTAACGTTGTTGTCAGTAGTAATGGTAATATAAATAGTAGAGATTNCAAACAACCTGAAACCCTTACTGATTTTGCAACATTTTTAAATGAAATAAACGATTCAAAAATCATTGGACAGT                                                                                            ]
[-] EMBL CD149382             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACCGATATCATCATTGTCATCTTCCTCAACTAATCTGCAATCAGCTAAGAGTAAACTAGACTCAAATGATTCAAAATCAATAGACTCCAAAGACTTATTTTCCATAACTCAAGAGCGTAATGCTATGTCACCTGTAACTTCTTTAGTTCGTCGACCTAACGTTGTTGTCAGTAGTAATGGTAATATAAATAGTAAAGATTCAAAACCACTTGAAACCCTTACTGATTTTGCAACATTTTTAAATGAAATAAACGATTCAAAAATCATTGGACAGTTACTCAATCTACATAGTCATTTAGAAGAAGAAGTGAAACAAAAACAACCTATTTATGGAAATATTATAAAACATGCTAAACGACGTACACCA]


>consensus_9761#0 GAACAGTTGGCTTCATTGGAGGAAGATGGTGATCGTGTCGCTACAAGACCTGAGAAAGTC GCTTATCAATTAGCATTACATCGTGAATTACAACGAGCATTAAGCACACGTACTGTGGCT TATGATGGAGTGCGTCGTTACGCTAGACAACTACGTGACAGAGCACCAGTATGTGATCAT GATGAATTAGATGATATGGTCAGTGAATTAAAGCATTTATGGCAAGCAGTGTGTACAAAA GCCTTAGCCAGACAACGCATTTTAGAACGAGCTCTTTTGGCATCTGGTCTTTATAAAGAA GCATTGGAAGCTTTACTTGATTGGTTAAGTAAGATTGAACCACAGTTAGCTGAACAACAA ACTGGAAACTATGGTGATGTGGATATTGTCGAGCAATTATTAGAATCTCATCATCGTTTC AAAGCTGAGCTGGAACAACGCTCCACATCTGTGAAATTAATACATCAAGCTGCCAGTGAT TTAATGAATAAGGCTTCATCTACTACTGACTCTGGAGCTGGTTCATCAACTAGCAATCAA GCTGATGTGTTTGCTATGCAAGCTCAATTAAATCATTTATCTAAAATATGGGATCGTGTA CAGAATTTAACTCAACGTCGTAGTGAACGAATGGATCAAGCATTAAAAATGGCGCAGCAA TTTCAGGATACATGTCGAAGTTTAATGGATTATTTTGCTGGAGCAGAACGTGTCATTCAT CGTTTGGCTGCTTTACCTACCTTCGATGATGATGGTGAACTGGAAATTGAAACTGCTGGC ACTAACAATCCACCAACTAATTTAACAGATGCAATTACAGCTCATCGACAAACACATTCT AATTTAATGAATCAAGCTGATCGAGTTGAAGCTGCTTTACAATTAGGCAATAAACTTTTA TCTCAAGCTCATCCAGCAGCTGTGAAACGTTTACGTCAATGGGTTAATACTATTCGTACA CGATGGGAGGAGTTAACTTCATGGTCGGAACAACGTGGAGAACGTTTGCAACAAGCTTTA GAAGAACAAAGTAAACGTAAACTTCAACGTGAAGAACTCATGCAATGGATCCATGTAAAA ACTAGTGAATTAAAAAGTATTCCAACATTAATACCGATATCATCATTGTCATCTTCCTCA ACTAATCTGCAATCAGCTAAGAGTAAACTAGACTCAAATGATTCAAAATCAATAGACTCC AAAGACTTATTTTCCATAACTCAAGAGCGTATTGCTATGTCACCTGTAACTTCTTTAGTT CGTCAACCTAACGTTGTTGTCAGTAGTAATGGTAATATAAATAGTAGAGATTNCAAACAA CCTGAAACCCTTACTGATTTTGCAACATTTTTAAATGAAATAAACGATTCAAAAATCATT GGACAGTTACTCAATCTACATAGTCATTTAGAAGAAGAAGTGAAACAAAAACAACCTATT TATGGAAATATTATAAAACATGCTAAACGACGTACACCA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)