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Schistosoma mansoni
cluster # 9833 cluster # 9833       Sequences # 11       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9833#0 length = 1004 sequences # 11  

consensusID : consensus_9833#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 11
consensus length = 1004
fasta sequence
                              [CAAGGTCGCCGAACAGAAAGCGGTAATTTTATACCGCTGCACCAATGTTATGTCCTTTTAACGGACTGTTATTGATCAGTTGTTATCTT-CACATTGAATACTTAATGTTGCGAGTCATTTACAGGTCATAGAAATTCATTATAACGCACTTGGTGATTTTCTGATGGAT-GACCAGAGTAAACCTCAGCTTCAAGACGGGGTCGCGGATCAGCAACAGTCAGATGCCTTCGAAATTGATGAGGTTGATGTACCTAACGCAGACGATGAAGAGATATACCTTGAACATTGCCGAATCAAATGTATCAGTAGACTGGACCGGTTCCCAAATGTTCGCCTATTATGTCTTCGAAATAACTTATTGAAGAAGTTGGAAAACTTCGAGCCTATCTCTCAAACCCTTGAAGATCTGGACGTTTATGATAACCAAATCACCAGGATTGAAAATCT-AGA-ATGTCTCATAAAGCTGACTAATCTTGATTTGAGCTTTAACCGGATAAAACGTATCGAAAATTTGGAAAATCTAAGTAATCTCCGGAAACTCTATTTCGTAAACAATCATATCTCAAAAATAGAGAACCTGAGCAATTTGAAAGACCTAGAAATGTTGGAACTTGGTTCAAACAAAATAAGAAAGTTAGAAAATTTGGATGAATTGGAAAAACTGACTCAACTTTATTGTGGTAAAAACAAAATACCAGCAATTGAAAACTTGGATAACTTGACTAATCTAACAATTCTTAGCATTCAGGGTAACAGACTCACCAAAATAAATGGATTAGCGAGTCTTGTTAATCTGGAGCAACTATATCTGAGCGAGAATGGGATAACAGAAATTGAAGGCCTTGAAACATTATCAAAGTTACAAATTTTAGACTTGGCATACAACTTCATATCGCAGATTCAAAACATGTCGAATTTGGTAAATCTAGAAGAATTTTGGGGTGCATGACATAAGATATCTGACTGGGAGCAGCTAGGAAAGTTAAGTGTATTAAAAAAGCTAC]

[-] EMBL CD124119             [CAAGGTCGCCGAACAGAAAGCGGTAATTTTATACCGCTGCACCAATGTTATGTCCTTTTAACGGACTGTTATTGATCAGTTGTTATCTT CACATTGAATACTTAATGTTGCGAGTCATTTACAGGTCATAGAAATTCATTATAACGCACTTGGTGATTTTCTGATGGAT GACCAGAGTAAACCTCAGCTTCAAGACGGGGTCGCGGATCAGCAACAGTCAGATGCCTTCGAAATTGATGAGGTTGATGTACCTAACGCAGACGATGAAGAGATATACCTTGAACATTGCCGAATCAAATGTATCAGTAGACTGGACCGGTTCCCAAATGTTCGCCTATTATGTCTTCGAAATAACTTATTGAAGAAGTTGGAAAACTTCGAGCCTATCTCTCAAACCCTTGAAGATCTGGACGTTTATGATAACCAAATCACCAGGATTGAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD124122             [CAAGGTCGCCGAACAGAAAGCGGTAATTTTATACCGCTGCACCAATGTTATGTCCTTTTAACGGACTGTTATTGATCAGTTGTTATCTT CACATTGAATACTTAATGTTGCGAGTCATTTACAGGTCATAGAAATTCATTATAACGCACTTGGTGATTTTCTGATGGAT GACCAGAGTAAACCTCAGCTTCAAGACGGGGTCGCGGATCAGCAACAGTCAGATGCCTTCGAAATTGATGAGGTTGATGTACCTAACGCAGACGATGAAGAGATATACCTTGAACATTGCCGAATCAAATGTATCAGTAGACTGGACCGGTTCCCAAATGTTCGCCTATTATGTCTTCGAAATAACTTATTGAAGAAGTTGGAAAACTTCGAGCCTATCTCTCAAACCCTTGAAGATCTGGACGTTTATGATAACCAAATCACCAGGATTGAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD094497             [                        AATTTTATACCGCTGCACCAATGTTATGTCCTTTTAACGGACTGTTATTGATCAGTTGTTATCTT CACATTGAATACTTAATGTTGCGAGTCATTTACAGGTCATAGAAATTCATTATAACGCACTTGGTGATTTTCTGATGGAT GACCAGAGTAAACCTCAGCTTCAAGACGGGGTCGCGGATCAGCAACAGTCAGATGCCTTCGAAATTGATGAGGTTGATGTACCTAACGCAGACGATGAAGAGATATACCTTGAACATTGCCGAATCAAATGTATCAGTAGGCTGGACCGGTTCCCAAATGTTCGCCTATTATGTCTTCGAAATAACTTATTGAAGAAGTTGGAAAACTTCGAGCCTATCTCTCAAACCCTTGAAGATCTGGACGTTTATGATAACCAAATCACCAGGATTGAAAATCT AGA ATGTCTCATAAAGCTGACTAATCTTGATTTGAGCTTTAACCGGATAAAACGTATCGAAAATTTGGAAAATCTAAGTAATCTCCGGAAACTCTATTTCGTAAACAATCATATCTCANAAATAGAGAACCTGAGCAATTTGAAAGACCTAGAAATGTTGGAACTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL AI740260             [                                            ATGTTATGTCCTTTTAACGGACTGTTATTGATCAGTTGTTATCTT CACATTGAATACTTAATGTTGCGAGTCATTTACAGGTCATAGAAATTCATTATAACGCACTTGGTGATTTTCTGATGGAT GACCAGAGTAAACCTCAGCTTCAAGACGGGGTCGCGGATCAGCAACAGTCAGATGCCTTCGAAATTGATGAGGTTGATGTACCTAACGCAGACGATGAAGAGATATACCTTGAACATTGCCGAATCAAATGTATCAGTAGACTGGACCGGTTCCAAAATGTTCGCCTATTATGTCTTCGAAATAACTTATTGAAGAAGTTGGAAAACTTCGAGCCTATCTCTCAAACCCTTGAAGATCTGGACGTTTATGATAACCAAATCACCAGGATTGAAAATCT AGA ATGTCTCATAAAGCTGACTAATCTTGATTTGAGCTTTAACCGGATAAACCGTATCG AAATTTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL AI764957             [                                            ATGTTATGTCCTTTTAACGGACTGTTATTGATCAGTTGTTATCTT CACATTGAATACTTAATGTTGCGAGTCATTTACAGGTCATAGAAATTCATTAGTACGCACTTGGTGA TTTCTGATGGAT GACCAGAGTAAACCTCAGCTTCAAGACGGGGTCGCGGATCAGCAACAGTCAGATGCCTTCGAAATTGATGAGGTTGATGTACCTAACGCAGACGATGAAGAGATATACCTTGAACATTGCCGAATC AATGTATCAGTAGACTGGAACGGTTCCCAATTGTTCGCCTATTATGTCTTCG AAT ACTTATTGAAGAAGTTGG AAACTTCGAGCCTATCTCTC AACCCTTGAAGATCTGGACGTTTATGATACCCAA  CTCCGGGATTG GAATCTGAGAGATG  TCAT AAGCTG CCATACTTGGATTGAGCTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD063557             [                                                             ctGACTGTTATTGATCAGTTGTTATCTTACACATTGAATACTTAATGTTGCGAGTCATTTACAGGTCATAGAAATTCATTATAACGCACTTGGTGATTTACTGAATCATAGACCAGAGTAAACCTCAGCTTCAAGACGGGGTCGCGGATCAGCAACAGTCAGATGCCTTCGAAATTGATGAGGTTGATGTACCTAACGCAGACGATGAAGAGATATACCTTGAACATTGCCGAATCAAATGTATCAGTAGACTGGACCGGTTCCCAAATGTTCGCCTATTATGTCTTCGAAATAACTTATTGAAGAAGTAGGAAAACTTCGAGCCTATCTCTCAAACCCTTGAAGATCTGGACGTTTATGATAACCAAATCACCAAGATTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD116475             [                                                                                                                                                            ATTTTCTGATGGAT GACCAGAGTAAACCTCAGCTTCAAGACGGGGTCGCGGATCAGCAACAGTCAGATGCCTTCGAAATTGATGAGGTTGATGTACCTAACGCAGACGATGAAGAGATATACCTTGAACATTGCCGAATCAAATGTATCAGTAGACTGGACCGGTTCCCAAATGTTCGCCTATTATGTCTTCGAAATAACTTATTGAAGAAGTTGGAAAACTTCGAGCCTATCTCTCAAACCCTTGAAGATCTGGACGTTTATGATAACCAAATCACCAAGATTGAAAATCT AGA ATGTCTCATAAAGCTGACTAATCTTGATTTGAGCTTTAACCGGATAAAACGTATCGAAAATTTGGAAAATCTAAGCAATCTCCGGAAACTCTATTTCGTAAACAATCATATCTCAAAAATAGAGAACCTGAGCAATTTGAAAGACCTAGAAATGTTGGAACTTGGTTCANACAAAATAAGAAAGTTAGAAAATTTGGATGAATTGGAAAAACTGACTCAACTNTATTGTGGTAAAAACAAAATACCAGCAATTGAAAACTTGGATAACTTGACTAATCTAACAATTCTTAGCATTCAGGGT                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD195677             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TATTATGTCTTCGAAATAACTTATTGAAGAAGTTGGAAAACTTCGAGCCTATCTCTCAAACCCTTGAAGATCTGGACGTTTATGATAACCAAATCACCAAGATTGAAAATCT AGA ATGTCTCATAAAGCTGACTAATCTTGATTTGAGCTTTAACCGGATAAAACGTATCGAAAATTTGGAAAATCTAAGTAATCTCCGGAAACTCTATTTCGTAAACAATCATATCTCAAAAATAGAGAACCTGAGCAATTTGAAAGACCTAGAAATGTTGGAACTTTGGTC AACAAAATAAGAAAG TAGAAAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD137348             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATTATGTCTTCGAAATAACTTATTGAAGAAGTTGGAAAACTTCGAGCCTATCTCTCAAACCCTTGAAGATCTGGACGTTTATGATAACCAAATCACCAAGATTGAAAATCT AGA ATGTCTCATAAAGCTGACTAATCTTGATTTGAGCTTTAACCGGATAAAACGTATCGAAAATTTGGAAAATCTAAGTAATCTCCGGAAACTCTATTTCGTAAACAATCATATCTCAAAAATAGAGAACCTGAGCAATTTGAAAGACCTAGAAATGTTGGAACTTGGTTCAAACAAAATAAGAAAGTTAGAAAATTTGGATGAATTGGAAAAACTGACTCAACTTTATTGTGGTAAAAACAAAATACCAGCAATTGAAAACTTTGATAACTTGACTAATCTAACAATTCTTAGCATTCAGGGTAACAGACTCACCAAAATAAATGGATTAGCGAGTCTTGTTAATCTGGAGCAACTATATCTGAGCGAGAATGGGATAACAGAAATTGAAGGCCTTGAAACATTATCAAAGTTACAAATTTTAGACTTGGCATACAACTTCATATCGCAGATTCAAAACATGTCGAATTTGGTAAATCTAGAAGAATTTTGGGGTGCATGACATAAGATATCTGACTGGGAGCAGCTAGGAAAGTTAAGTGTATTAAAAAAGCTAC]
[+] EMBL CD195875             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CTATCTCTCAAACCCTTGAAGATCTGGACGTTTATGATAACCAAATCACCAGGATTGAAAATCT AGA ATGTCTCATAAAGCTGACTAATCTTGATTTGAGCTTTAACCGGATAAAACGTATCGAAAATTTGGAAAATCTAAGTAATCTCCGGAAACTCTATTTCGTAAACAATCATATCTCAAAAATAGAGAACCTGAGCAATTTGAAAGACCTAGAAATGTTGGAACTTGGCTCAAACAAAATAAGAAAGTTAGAAAATTTGGATGAATTGGAAAAACTGACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD195888             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tnTGGAAAATCTAAGCAATCTCCGGAAACTCTATTTCGTAAACAATCATATCTCAAAAATAGAGAACCTGAGCAATNTGAAAGACCTAGAAATGTTGGAACTTGGTTCAAACAAAATAAGAAAGTTAGAAAATTTGGATGAATTGGAAAAACTGACTCAACTTTATTGTGGTAAAAACAAAATACCAGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]


>consensus_9833#0 CAAGGTCGCCGAACAGAAAGCGGTAATTTTATACCGCTGCACCAATGTTATGTCCTTTTA ACGGACTGTTATTGATCAGTTGTTATCTTCACATTGAATACTTAATGTTGCGAGTCATTT ACAGGTCATAGAAATTCATTATAACGCACTTGGTGATTTTCTGATGGATGACCAGAGTAA ACCTCAGCTTCAAGACGGGGTCGCGGATCAGCAACAGTCAGATGCCTTCGAAATTGATGA GGTTGATGTACCTAACGCAGACGATGAAGAGATATACCTTGAACATTGCCGAATCAAATG TATCAGTAGACTGGACCGGTTCCCAAATGTTCGCCTATTATGTCTTCGAAATAACTTATT GAAGAAGTTGGAAAACTTCGAGCCTATCTCTCAAACCCTTGAAGATCTGGACGTTTATGA TAACCAAATCACCAGGATTGAAAATCTAGAATGTCTCATAAAGCTGACTAATCTTGATTT GAGCTTTAACCGGATAAAACGTATCGAAAATTTGGAAAATCTAAGTAATCTCCGGAAACT CTATTTCGTAAACAATCATATCTCAAAAATAGAGAACCTGAGCAATTTGAAAGACCTAGA AATGTTGGAACTTGGTTCAAACAAAATAAGAAAGTTAGAAAATTTGGATGAATTGGAAAA ACTGACTCAACTTTATTGTGGTAAAAACAAAATACCAGCAATTGAAAACTTGGATAACTT GACTAATCTAACAATTCTTAGCATTCAGGGTAACAGACTCACCAAAATAAATGGATTAGC GAGTCTTGTTAATCTGGAGCAACTATATCTGAGCGAGAATGGGATAACAGAAATTGAAGG CCTTGAAACATTATCAAAGTTACAAATTTTAGACTTGGCATACAACTTCATATCGCAGAT TCAAAACATGTCGAATTTGGTAAATCTAGAAGAATTTTGGGGTGCATGACATAAGATATC TGACTGGGAGCAGCTAGGAAAGTTAAGTGTATTAAAAAAGCTAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)