These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9833#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 11 consensus length = 1004 fasta sequence [CAAGGTCGCCGAACAGAAAGCGGTAATTTTATACCGCTGCACCAATGTTATGTCCTTTTAACGGACTGTTATTGATCAGTTGTTATCTT-CACATTGAATACTTAATGTTGCGAGTCATTTACAGGTCATAGAAATTCATTATAACGCACTTGGTGATTTTCTGATGGAT-GACCAGAGTAAACCTCAGCTTCAAGACGGGGTCGCGGATCAGCAACAGTCAGATGCCTTCGAAATTGATGAGGTTGATGTACCTAACGCAGACGATGAAGAGATATACCTTGAACATTGCCGAATCAAATGTATCAGTAGACTGGACCGGTTCCCAAATGTTCGCCTATTATGTCTTCGAAATAACTTATTGAAGAAGTTGGAAAACTTCGAGCCTATCTCTCAAACCCTTGAAGATCTGGACGTTTATGATAACCAAATCACCAGGATTGAAAATCT-AGA-ATGTCTCATAAAGCTGACTAATCTTGATTTGAGCTTTAACCGGATAAAACGTATCGAAAATTTGGAAAATCTAAGTAATCTCCGGAAACTCTATTTCGTAAACAATCATATCTCAAAAATAGAGAACCTGAGCAATTTGAAAGACCTAGAAATGTTGGAACTTGGTTCAAACAAAATAAGAAAGTTAGAAAATTTGGATGAATTGGAAAAACTGACTCAACTTTATTGTGGTAAAAACAAAATACCAGCAATTGAAAACTTGGATAACTTGACTAATCTAACAATTCTTAGCATTCAGGGTAACAGACTCACCAAAATAAATGGATTAGCGAGTCTTGTTAATCTGGAGCAACTATATCTGAGCGAGAATGGGATAACAGAAATTGAAGGCCTTGAAACATTATCAAAGTTACAAATTTTAGACTTGGCATACAACTTCATATCGCAGATTCAAAACATGTCGAATTTGGTAAATCTAGAAGAATTTTGGGGTGCATGACATAAGATATCTGACTGGGAGCAGCTAGGAAAGTTAAGTGTATTAAAAAAGCTAC] [-] EMBL CD124119 [CAAGGTCGCCGAACAGAAAGCGGTAATTTTATACCGCTGCACCAATGTTATGTCCTTTTAACGGACTGTTATTGATCAGTTGTTATCTT CACATTGAATACTTAATGTTGCGAGTCATTTACAGGTCATAGAAATTCATTATAACGCACTTGGTGATTTTCTGATGGAT GACCAGAGTAAACCTCAGCTTCAAGACGGGGTCGCGGATCAGCAACAGTCAGATGCCTTCGAAATTGATGAGGTTGATGTACCTAACGCAGACGATGAAGAGATATACCTTGAACATTGCCGAATCAAATGTATCAGTAGACTGGACCGGTTCCCAAATGTTCGCCTATTATGTCTTCGAAATAACTTATTGAAGAAGTTGGAAAACTTCGAGCCTATCTCTCAAACCCTTGAAGATCTGGACGTTTATGATAACCAAATCACCAGGATTGAAA ] [-] EMBL CD124122 [CAAGGTCGCCGAACAGAAAGCGGTAATTTTATACCGCTGCACCAATGTTATGTCCTTTTAACGGACTGTTATTGATCAGTTGTTATCTT CACATTGAATACTTAATGTTGCGAGTCATTTACAGGTCATAGAAATTCATTATAACGCACTTGGTGATTTTCTGATGGAT GACCAGAGTAAACCTCAGCTTCAAGACGGGGTCGCGGATCAGCAACAGTCAGATGCCTTCGAAATTGATGAGGTTGATGTACCTAACGCAGACGATGAAGAGATATACCTTGAACATTGCCGAATCAAATGTATCAGTAGACTGGACCGGTTCCCAAATGTTCGCCTATTATGTCTTCGAAATAACTTATTGAAGAAGTTGGAAAACTTCGAGCCTATCTCTCAAACCCTTGAAGATCTGGACGTTTATGATAACCAAATCACCAGGATTGAAA ] [+] EMBL CD094497 [ AATTTTATACCGCTGCACCAATGTTATGTCCTTTTAACGGACTGTTATTGATCAGTTGTTATCTT CACATTGAATACTTAATGTTGCGAGTCATTTACAGGTCATAGAAATTCATTATAACGCACTTGGTGATTTTCTGATGGAT GACCAGAGTAAACCTCAGCTTCAAGACGGGGTCGCGGATCAGCAACAGTCAGATGCCTTCGAAATTGATGAGGTTGATGTACCTAACGCAGACGATGAAGAGATATACCTTGAACATTGCCGAATCAAATGTATCAGTAGGCTGGACCGGTTCCCAAATGTTCGCCTATTATGTCTTCGAAATAACTTATTGAAGAAGTTGGAAAACTTCGAGCCTATCTCTCAAACCCTTGAAGATCTGGACGTTTATGATAACCAAATCACCAGGATTGAAAATCT AGA ATGTCTCATAAAGCTGACTAATCTTGATTTGAGCTTTAACCGGATAAAACGTATCGAAAATTTGGAAAATCTAAGTAATCTCCGGAAACTCTATTTCGTAAACAATCATATCTCANAAATAGAGAACCTGAGCAATTTGAAAGACCTAGAAATGTTGGAACTTG ] [+] EMBL AI740260 [ ATGTTATGTCCTTTTAACGGACTGTTATTGATCAGTTGTTATCTT CACATTGAATACTTAATGTTGCGAGTCATTTACAGGTCATAGAAATTCATTATAACGCACTTGGTGATTTTCTGATGGAT GACCAGAGTAAACCTCAGCTTCAAGACGGGGTCGCGGATCAGCAACAGTCAGATGCCTTCGAAATTGATGAGGTTGATGTACCTAACGCAGACGATGAAGAGATATACCTTGAACATTGCCGAATCAAATGTATCAGTAGACTGGACCGGTTCCAAAATGTTCGCCTATTATGTCTTCGAAATAACTTATTGAAGAAGTTGGAAAACTTCGAGCCTATCTCTCAAACCCTTGAAGATCTGGACGTTTATGATAACCAAATCACCAGGATTGAAAATCT AGA ATGTCTCATAAAGCTGACTAATCTTGATTTGAGCTTTAACCGGATAAACCGTATCG AAATTTGG ] [+] EMBL AI764957 [ ATGTTATGTCCTTTTAACGGACTGTTATTGATCAGTTGTTATCTT CACATTGAATACTTAATGTTGCGAGTCATTTACAGGTCATAGAAATTCATTAGTACGCACTTGGTGA TTTCTGATGGAT GACCAGAGTAAACCTCAGCTTCAAGACGGGGTCGCGGATCAGCAACAGTCAGATGCCTTCGAAATTGATGAGGTTGATGTACCTAACGCAGACGATGAAGAGATATACCTTGAACATTGCCGAATC AATGTATCAGTAGACTGGAACGGTTCCCAATTGTTCGCCTATTATGTCTTCG AAT ACTTATTGAAGAAGTTGG AAACTTCGAGCCTATCTCTC AACCCTTGAAGATCTGGACGTTTATGATACCCAA CTCCGGGATTG GAATCTGAGAGATG TCAT AAGCTG CCATACTTGGATTGAGCTT ] [+] EMBL CD063557 [ ctGACTGTTATTGATCAGTTGTTATCTTACACATTGAATACTTAATGTTGCGAGTCATTTACAGGTCATAGAAATTCATTATAACGCACTTGGTGATTTACTGAATCATAGACCAGAGTAAACCTCAGCTTCAAGACGGGGTCGCGGATCAGCAACAGTCAGATGCCTTCGAAATTGATGAGGTTGATGTACCTAACGCAGACGATGAAGAGATATACCTTGAACATTGCCGAATCAAATGTATCAGTAGACTGGACCGGTTCCCAAATGTTCGCCTATTATGTCTTCGAAATAACTTATTGAAGAAGTAGGAAAACTTCGAGCCTATCTCTCAAACCCTTGAAGATCTGGACGTTTATGATAACCAAATCACCAAGATTG ] [+] EMBL CD116475 [ ATTTTCTGATGGAT GACCAGAGTAAACCTCAGCTTCAAGACGGGGTCGCGGATCAGCAACAGTCAGATGCCTTCGAAATTGATGAGGTTGATGTACCTAACGCAGACGATGAAGAGATATACCTTGAACATTGCCGAATCAAATGTATCAGTAGACTGGACCGGTTCCCAAATGTTCGCCTATTATGTCTTCGAAATAACTTATTGAAGAAGTTGGAAAACTTCGAGCCTATCTCTCAAACCCTTGAAGATCTGGACGTTTATGATAACCAAATCACCAAGATTGAAAATCT AGA ATGTCTCATAAAGCTGACTAATCTTGATTTGAGCTTTAACCGGATAAAACGTATCGAAAATTTGGAAAATCTAAGCAATCTCCGGAAACTCTATTTCGTAAACAATCATATCTCAAAAATAGAGAACCTGAGCAATTTGAAAGACCTAGAAATGTTGGAACTTGGTTCANACAAAATAAGAAAGTTAGAAAATTTGGATGAATTGGAAAAACTGACTCAACTNTATTGTGGTAAAAACAAAATACCAGCAATTGAAAACTTGGATAACTTGACTAATCTAACAATTCTTAGCATTCAGGGT ] [+] EMBL CD195677 [ TATTATGTCTTCGAAATAACTTATTGAAGAAGTTGGAAAACTTCGAGCCTATCTCTCAAACCCTTGAAGATCTGGACGTTTATGATAACCAAATCACCAAGATTGAAAATCT AGA ATGTCTCATAAAGCTGACTAATCTTGATTTGAGCTTTAACCGGATAAAACGTATCGAAAATTTGGAAAATCTAAGTAATCTCCGGAAACTCTATTTCGTAAACAATCATATCTCAAAAATAGAGAACCTGAGCAATTTGAAAGACCTAGAAATGTTGGAACTTTGGTC AACAAAATAAGAAAG TAGAAAAT ] [+] EMBL CD137348 [ ATTATGTCTTCGAAATAACTTATTGAAGAAGTTGGAAAACTTCGAGCCTATCTCTCAAACCCTTGAAGATCTGGACGTTTATGATAACCAAATCACCAAGATTGAAAATCT AGA 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Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||