Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 9882 cluster # 9882       Sequences # 12       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9882#0 length = 1396 sequences # 12  

consensusID : consensus_9882#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 12
consensus length = 1396
fasta sequence
                              [TAAATGAATATTCGATGTACGACTAGAATTGGTGTTATTGATAGTATTAACTGGTGCAACTGGTAAATAAATCTGTCGTACAAAAAATCCTCCGCTGCCTCTTTCAGCTAATTCCAAAGCCTTTTTAATTTCTTCTTCATTTAAAGGTGTCATATTTAACATTGAATCAATTTGGTCTTGTTGATTGCTTGAATTAATTGTACAGCAAGTAGATTCACGTAACCGATAATGATTATCATTCACACAATGTTCACCATCTTCATCTTGTTGTTCAGGCAAAGTGCACATATCTCTTAAAAAGCTTGGTGTTTCAATGCATGGCATAACGCCACCAAATAATGTCGGTAGTTCTAGTGACGGAGGTGGATTAGGTGGGAACATATCATGTTCATCTTGTTGAGTTCGATGAGATGGACATAATGAAGTGACTGGTAGTGGAGAATGCTTAAAACATTTATCTGATATAGTATTATTGTTAGCAGATAATGGTGCGTTGAAATACGGTAAACGACCAAATTCTATCGTACAATACAGTAGATTAGCTAATAGCTGGCCAACTTGAGTTGGGTTCAACCAATCCACCGGTTCACGATCTATACTTAATAAGCGATCACCTGGCATTATCATTCCTAATCGATCTGCTGGACTATCATGTTGTATACTATCCACGATTAGTCGAATGTGTGAGTCCCGTAATTCTTGTGAATTCGCTTGACGAATACGCAAACCAAATGCAGCTGAAGCTATTTCATCATTATTACTATCATCATCACCACTAATCTTCTGGTCGTTCTTTACGGTAATATAGTAGTCAGTTGATGATTTTAAATCGCGTAATTTATTTTCCTCAG-TTTTTTGACAGACAGAGTCAACAAGAGCATCAGTATCATTGGAATAAGGTTTTTCCACCTGAGAACGATCATTACAAAAGCCGAATTGACGACGTTCAAGTACAACAACATAGACATTTAATCGATTTCGAGGATAGGCTATGAGATAAAATGCAGATATATGGAAAAACTCATATTTTCTGTTATGGGATCATCGTATACAGGATGCAAATACAAGGGTATTATGATGAGATTTTAAAAACGAGTGATAAACGCATTCACACATGCTGGCTCATATCTACCGTAACACAAACGTTTAAACATCAATGCAGAAATTCCAAACAAATACACACTAGCAAAACTATTTAATAATACATGTATACGCCTACGTGAATCAGTATATAGTTTAGAAATTACATTAAAGTACAAGTGATTAAAATAACAAAAGAAAAAGGGTTCCAGTGCAACCATATAGTAACACTTGCACATTATTGCATCACATATCAGTTGAAACTCTTATATAAGTTGTAACTATACTTGTGCTTACATAAGAGATCAGAANAGTT]

[+] EMBL CD183973             [TAAATGAATATTCGATGTACGACTAGAATTGGTGTTATTGATAGTATTAACTGGTGCAACTGGTAAATAAATCTGTCGTACAAAAAATCCTCCGCTGCCTCTTTCAGCTAATTCCAAAGCCTTTTTAATTTCTTCTTCATTTAAAGGTGTCATATTTAACATTGAATCAATTTGGTCTTGTTGATTGCTTGAATTAATTGTACAGCAAGTAGATTCACGTAACCGATAATGATTATCATTCACACAATGTTCACCATCTTCATCTTGTTGTTCAGGCAAAGTGCACATATCTCTTAAAAAGCTTGGTGTTTCAATGCATGGCATAACGCCACCAAATAATGTCGGTAGTTCTAGTGACGGAGGTGGATTANGTGGGAACATATCATGTTCATCTTGTTGAGTTCGATGAGATGGACATAATGAAGTGACTGGTAGTGGAGAATGCTTAAAACATTTATCTGATATAGTATTATTGTTAGCAGATAATGGTGCGTTGAAATACNGTAAACGACCAAATTCTATCGTACAATACAGTAGATTAGCTAATAGCTGGCCAACTTGAGTTGGGTTCAcc                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD184049             [TAAATGAATATTCGATGTACGACTAGAATTGGTGTTATTGATAGTATTAACTGGTGCAACTGGTAAATAAATCTGTCGTACAAAAAATCCTCCGCTGCCTCTTTCAGCTAATTCCAAAGCCTTTTTAATTTCTTCTTCATTTAAAGGTGTCATATTTAACATTGAATCAATTTGGTCTTGTTGATTGCTTGAATTAATTGTACAGCAAGTAGATTCACGTAACCGATAATGATTATCATTCACACAATGTTCACCATCTTCATCTTGTTGTTCAGGCAAAGTGCACATATCTCTTAAAAAGCTTGGTGTTTCAATGCATGGCATAACGCCACCAAATAATGTCGGTAGTTCTAGTGACGGAGGTGGATTANGTGGGAACATATCATGTTCATCTTGTTGAGTTCGATGAGATGGACATAATGAAGTGACTGGTAGTGGAGAATGCTTAAAACATTTATCTGATATAGTATTATTGTTAGCAGATAATGGTGCGTTGAAATACGGTAAACGACCAAATTCTATCGTACAATACAGTAGATTAGCTAATAGCTGGCCAACTTGAGTTGGGTTCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD061330             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AAAGCTTGGTG TTCAATGCATGGCATAACGCCACCAAATAATGTCGGTAGTTCTAGTGACGGAGGTGGATTAGGTGGGAACATATCATGTTCATCTTGTTGAGTTCGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD121109             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GCATGGCATAACGCCACCAAATAATGTCGGCAGTTCTAGTGACGGAGGTGGATTAGGTGGGAACATATCATGTTCATCTTGTTGAGTTCGATGAGATGGACATAATGAAGTGACTGGTAGTGGAGAATGCTTAAAACATTTATCTGATATAGTATTATTGTTAGCAGATAATGGTGCGTTGAAATACGGTAAACGACCAAATTCTATCGTACAATACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD121110             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GCATGGCATAGCGCCACCAAATAATGTCGGTAGTTCTAGTGACGGAGGTGGATTAGGTGGGAACATATCATGTTCATCTTGTTGAGTTCGATGAGATGGACATAATGAAGTGACTGGTAGTGGAGAATGCTTAAAACATTTATCTGATATAGTATTATTGTTAGCAGATAATGGTGCGTTGAAATACGGTAAACGACCAAATTCTATCGTACAATACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD068922             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGCTTAAAACATTTATCTGATATAGTATTATTGTTAGCAGATAATGGTGCGTTGAAATACGGTAAACGACCAAATTCTATCGTACAATACAGTAGATTAGCTAATAGCTGGCCAACTTGAGTTGGGTTCAACCAATCCACCGGTTCACGATCTATACTTAATAAGCGATCACCTGGCATTATCATTCCTAATCGATCTGCTGGACTATCATGTTGTATACTATCCACGATTAGTCGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD090097             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AAATTCTATCGTACAATACAGTAGATTAGCTAATAGCTGGCCAACTTGAGTTGGGTTCAACCAATCCACCGGTTCACGATCTATACTTAATAAGCGATCACCTGGCATTATCATTCCTAATCGATCTGCTGGACTATCATGTTGTATACTATCCACGATTAGTCGAATGTGTGAGTCCCGTAATTCTTGTGAATTCGCTTGACGAATACGCAAACCAAATGCAGCTGAAGCTATTTCATCATTATTACTATCATCATCACCACTAATCTTCTGGTCGTTCTTTACGGTAATATAGTAGTCAGTTGATGATTTTAAATCGCGTAATTTATTTTCCTCAG TTTTTTGACAGACAGAGTCAACAAGAGCATCAGTATCATTGGAATAAGGTTTTTCCACCTGAGAACGATCATTACAAAAGCCGAATTGACGACGTTCAAGTACAACAACATAGACATTTAATCGATTTCGAGGATAGGCTATGAGATAAAATGCAGATATATGGAAAAACTCATATTTTCTGTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD193913             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TGCAGCTGAAGCTATTTCATCATTATTACTATCATCATCACCACTAATCTTCTGGTCGTTCTTTACGGTAATATAGTAGCCAGTTGATGATTTTAAATCGCGTAATTTATTTTCCTCAG TTTTTTGACAGACAGAGTCAACAAGAGCATCAGTATCATTGGAATAAGGTTTTTCCACCTGAGAACGATCATTACAAAAGCCGAATTGACGACGTTCAAGTACAACAACATAGACATTTAATCGATTTCGAGGATAGGCTATGAGATAAAATGCAGATATATGGAACAACTCATATTTTCTGGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD136536             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TGCAGCTGAAGCTATTTCATCATTATTACTATCATCATCACCACTAATCTTCTGGTCGTTCTTTACGGTAATATAGTAGTCAGTTGATGATTTTAAATCGCGTAATTTATTTTCCTCAGTTTTTTTGACAGACAGAGTCAACAAGAGCATCAGTATCATTGGAATAAGGTTTTTCCACCTGAGAACGATCATTACAAAAGCCGAATTGACGACGTTCAAGTACAACAACATAGACATTTAATCGATTTCGAGGATAGGCTATGAGATAAAATGCAGATATATGGAAAAACTCATATTTTCTGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD193937             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TGCAGCTGAAGCTATTTCATCATTATTACTATCATCATCACCACTAATCTTCTGGACGTTCTTTACGGTAATATAGTAGTCAGTTGATGATTTTAAATCGCGTAATTTATTTTCCTCAG TTTTTTGACAGACAGAGTCAACAAGAGCATCAGTATCATTGGAATAAGGTTTTTCCACCTGAGAACGATCATTACAAAAGCCGAATTGACGACGTTCAAGTACAACAACATAGACNTTTAATCGATTTCGAGGATAGGCTATGAGATAAAATGCAGATATATGGAACAACTCATATTTTCTGat                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD134575             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AATATAGTAGTCAGTTGATGATTTTAAATCGCGTAATTTATTTTCCTCAG TTTTTTGACAGACAGAGTCAACAAGAGCATCAGTATCATTGGAATAAGGTTTTTCCACCTGAGAACGATCATTACAAAAGCCGAATTGACGACGTTCAAGTACAACAACATAGACATTTAATCGATTTCGAGGATAGGCTATGAGATAAAATGCAGATATATGGAAAAACTCATATTTTCTGTTATGGGATCATCGTATACAGGATGCAAATACAAGGGTATTATGATGAGATTTTAAAAACGAGTGATAAACGCATTCACACATGCTGGCTCATATCTACCGTAACACAAACGTTTAAACATCAATGCAGAAATTCCAAACAAATACACACTAGCAAAACTATTTAATAATACATGTATACGCCTACGTGAATCAGTATATAGTTTAGAAATTACATTAAAGTACAAGTGATTAAAATAACAAAAGAAAAAGGGTTCCAGTGCAACCATATAGTAACACTTGCACATTATTGCATCACATATCAGTTGAAACT                                                   ]
[+] EMBL CD179745             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ACATGCTGGTTCATATTTACCGTAACACAAACGTTTAAACATCAATGCAGAAATTCCAAACAAATACACACTAGCAAAACTATTTAATAATACATGTATACGCCTACGTGAATCAGTATATAGTTTAGAAATTACATTAAAGTACAAGTGATTAAAATAACAAAAGAAAAAGGGTTCCAGTGCAACCATATAGTAACACTTGTACATTATTGCATCACATATCAGTTGAAACTCTTATATAAGTTGTAACTATACTTGTGCTTACATAAGAGATCAGAANAGTT]


>consensus_9882#0 TAAATGAATATTCGATGTACGACTAGAATTGGTGTTATTGATAGTATTAACTGGTGCAAC TGGTAAATAAATCTGTCGTACAAAAAATCCTCCGCTGCCTCTTTCAGCTAATTCCAAAGC CTTTTTAATTTCTTCTTCATTTAAAGGTGTCATATTTAACATTGAATCAATTTGGTCTTG TTGATTGCTTGAATTAATTGTACAGCAAGTAGATTCACGTAACCGATAATGATTATCATT CACACAATGTTCACCATCTTCATCTTGTTGTTCAGGCAAAGTGCACATATCTCTTAAAAA GCTTGGTGTTTCAATGCATGGCATAACGCCACCAAATAATGTCGGTAGTTCTAGTGACGG AGGTGGATTAGGTGGGAACATATCATGTTCATCTTGTTGAGTTCGATGAGATGGACATAA TGAAGTGACTGGTAGTGGAGAATGCTTAAAACATTTATCTGATATAGTATTATTGTTAGC AGATAATGGTGCGTTGAAATACGGTAAACGACCAAATTCTATCGTACAATACAGTAGATT AGCTAATAGCTGGCCAACTTGAGTTGGGTTCAACCAATCCACCGGTTCACGATCTATACT TAATAAGCGATCACCTGGCATTATCATTCCTAATCGATCTGCTGGACTATCATGTTGTAT ACTATCCACGATTAGTCGAATGTGTGAGTCCCGTAATTCTTGTGAATTCGCTTGACGAAT ACGCAAACCAAATGCAGCTGAAGCTATTTCATCATTATTACTATCATCATCACCACTAAT CTTCTGGTCGTTCTTTACGGTAATATAGTAGTCAGTTGATGATTTTAAATCGCGTAATTT ATTTTCCTCAGTTTTTTGACAGACAGAGTCAACAAGAGCATCAGTATCATTGGAATAAGG TTTTTCCACCTGAGAACGATCATTACAAAAGCCGAATTGACGACGTTCAAGTACAACAAC ATAGACATTTAATCGATTTCGAGGATAGGCTATGAGATAAAATGCAGATATATGGAAAAA CTCATATTTTCTGTTATGGGATCATCGTATACAGGATGCAAATACAAGGGTATTATGATG AGATTTTAAAAACGAGTGATAAACGCATTCACACATGCTGGCTCATATCTACCGTAACAC AAACGTTTAAACATCAATGCAGAAATTCCAAACAAATACACACTAGCAAAACTATTTAAT AATACATGTATACGCCTACGTGAATCAGTATATAGTTTAGAAATTACATTAAAGTACAAG TGATTAAAATAACAAAAGAAAAAGGGTTCCAGTGCAACCATATAGTAACACTTGCACATT ATTGCATCACATATCAGTTGAAACTCTTATATAAGTTGTAACTATACTTGTGCTTACATA AGAGATCAGAANAGTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)