These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9945#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 12 consensus length = 285 fasta sequence [CCTACCGTCCTCCCTCACCCTTGTGTCCATAAAAAATTAAACGTATAAATTCTGGTTATTAATATATCACATACAGTAATAATAATAATAAACTCTCAAATAACAGTCTGTTACATG--A-GGCA-TGCCAGTTTACGGGAAAGATCAGATTGTTACAGAAGTTACAATTTTCACTGTAGTAGATTACTCAGCTTGGTTAATACTTTATAAGATATGAATTTAGATGGTATTAGTATGAAACGTATTGTCAATAACACAATTGACGCACTTTATGCAGGTTGTGTTGCG] [+] EMBL CD071046 [CCTACCGTCCTCCCTCACCCTTGTGTCCATAAAAAATTAAACGTATAAATTCTGGTTATTAATATATCACATACAGTAATAATAATAATAAACTCTCAAATAACAGTCTGTTACATG A GGCA TGCCAGTTTACGGGAAAGATCAGATTGTTACAGAAGTTACAATTTTTACTGTAGTAGATTACTCAGCTTGGTTAATACTTTATAAGATATGAATTTAGATGGTATTAGTATGAAACGTATTGTCAATAACACAATTGACGCACTTTATGCAGGTTGTGTTGCG] [+] EMBL CD071025 [ CCTTGTGTCCATAAAAAACTAAACGTATAAATTCTGGTTATTAATATATCACATACAGTAATAATAATAATAAACTCTCAAATAACA T TGTTNNAAGNNAGGGCATTGCCAGTTTACGGGAAAGATCAGATTGTTACAGAAGTTACAATTTTCACTGTAGTAGATTACTCAGCTTGGTTAATACTTTATAAGATATGAATTTAGATGGTATTAATATGAAACGTATTGTC ATTACACAATTGACGCACTTTATGCAGGTTGTGTTGCG] [+] EMBL CD071047 [ CCTTGTGTCCATAAAAAATTAAACGTATAAATTCTGGTTATTAATATATCACATACAGTAATAATAATAATAAACTCTCAAATAACAGTCTGTTACATG A GGCA TGCCAGTTTACGGGAAAGATCAGATTGTTACAGAAGTTACAATTTTCACTGTAGTAGATTACTCAGCTTGGTTAATACTTTATAAGATATGAATTTAGATGGTATTAGTATGAAACGTATTGTCAATAACACAATTGACGCACTTTATGCAGGTTGTGTTGCG] [+] EMBL CD071061 [ CCTTGTGTCCATAAAAAATTAAACGTATAAATTCTGGTTATTAATATATCACATACAGTAATAATAATAATAAACTCTCAAATAACAGTCTGTTACATG A GGCA TGCCAGTTTACGGGAAAGATCAGATTGTTACAGAAGTTACAATTTTCACTGTAGTAGATTACTCAGCTTGGTTAATACTTTATAAGATATGAATTTAGATGGTATTAGTATGAAACGTATTGTCAATAACACAATTGACGCACTTTATGCAGGTTGTGTTGCG] [+] EMBL CD071107 [ CCTTGTGTCCATAAAAAATTAAACGTATAAATTCTGGTTATTAATATATCACATACAGTAATAATAATAATAAACTCTCAAATAACAGTCTGTTACATG A GGCA TGCCAGTTTACGGGAAAGATCAGATTGTTACAGAAGTTACAATTTTCACTGTAGTAGATTACTCAGCTTGGTTAATACTTTATAAGATATGAATTTAGATGGTATTAGTATGAAACGTATTGTCAATAACACAATTGACGCACTTTATGCAGGTTGTGTTGCG] [+] EMBL CD071130 [ CCTTGTGTCCATAAAAAATTAAACGTATAAATTCTGGTTATTAATATATCACATACAGTAATAATAATAATAAACTCTCAAATAACAGTCTGTTACATG A GGCA TGCCAGTTTACGGGAAAGATCAGATTGTTACAGAAGTTACAATTTTCACTGTAGTAGATTACTCAGCTTGGTTAATACTTTATAAGATATGAATTTAGATGGTATTAGTATGAAACGTATTGTCAATAACACAATTGACGCACTTTATGCAGGTTGTGTTGCG] [+] EMBL CD071135 [ CCTTGTGTCCACAAAAAATTAAACGTATAAATTCTGGTTATTAATATATCACATACAGTAATAATAATAATAAACTCTCAAATAACAGTCTGTTACATG A GGCA TGCCAGTTTACGGGAAAGATCAGATTGTTACAGAAGTTACAATTTTCACTGTAGTAGATTACTCAGCTTGGTTAATACTTTATAAGATATGAATTTAGATGGTATTAGTATGAAACGTATTGTCAATAACACAATTGACGCACTTTATGCAGGTTGTGTTGCG] [+] EMBL CD071153 [ CCTTGTGTCCATAAAAAATTAAACGTATAAATTCTGGTTATTAATATATCACATACAGTAATAATAATAATAAACTCTCAAATAACAGTCTGTTACATG A GGCA TGCCAGTTTACGGGAAAGATCAGATTGTTACAGAAGTTACAATTTTCACTGTAGTAGATTACTCAGCTTGGTTAATACTTTATAAGATATGAATTTAGATGGTATTAGTATGAAACGTATTGTCAATAACACAATTGACGCACTTTATGCAGGTTGTGTTGCG] [+] EMBL CD071165 [ CCTTGTGCCCATAAAAAATTAAACGTATAAATTCTGGTTATTAATATATCACATACAGTAATAATAATAATAAACTCTCAAATAACAGTCTGTTACATG A GGCA TGCCAGTTTACGGGAAAGATCAGATTGTTACAGAAGTTACAATTTTCACTGTAGTAGATTACTCAGCTTGGTTAATACTTTATAAGATATGAATTTAGATGGTATTAGTATGAAACGTATTGTCAATAACACAATTGACGCACTTTATGCAGGTTGTGTTGCG] [+] EMBL CD071201 [ CCTTGTGTCCATAAAAAATTAAACGTATAAATTCTGGTTATTAATATATCACATACAGTAATAATAATAATAAACTCTCAAATAACAGTCTGTTACATG A GGCA TGCCAGTTTACGGGAAAGATCAGATTGTTACAGAAGTTACAATTTTCACTGTAGTAGATTACTCAGCTTGGTTAATACTTTATAAGATATGAATTTAGATGGTATTAGTATGAAACGTATTGTCAATAACACAATTGACGCACTTTATGCAGGTTGTGTTGCG] [+] EMBL CD071070 [ CCTTGTGTCCATAAAAAATTAAACGTATAAATTCTGGTTATTAATATATCACATACAGTAATAATAATAATAAACTCTCAAATAACAGTCTGTTACATG A GGCA TGCCAGTTTACGGGAAAGATCAGATTGTTACAGAAGTTACAATTTTCACTGTAGTAGATTACTCAGCTTGGTTAATACTTTATAGGATATGAATTTAGATGGTATTAGTATGAAACGTATTGTCAATAACACAATTGACGCACTTTATGCAGGTTGTGTTGCG] [+] EMBL CD071209 [ CCTTGTGTCCATAAAAAATTAAACGTATAAATTCTGGTTATTAATATATCACATACAG TAATAATAATAAACTCTCAAATAACAGTCTGTTACATG A GGCA TGCCAGTTTACGGGAAAGATCAGATTGTTACAGAAGTTACAATTTTCACTGTAGTAGATTACTCAGCTTGGTTAATACTTTATAAGATATGAATTTAGATGGTATTAGTATGAAACGTATTGTCAATAACACAATTGACGCACTTTATGCAGGTTGTGTTGCG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||