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Schistosoma mansoni
cluster # 9968 cluster # 9968       Sequences # 12       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9968#0 length = 1274 sequences # 12  

consensusID : consensus_9968#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 12
consensus length = 1274
fasta sequence
                              [TAGATGGAGTATTTATGCATAAACGTGAACAGAAATTCAAATTTCTTTGCGAACGTAATGATAAGGTATTTTTCTCGAATACACGGTCTGGGCCACCCCAAGTATCTATGATGACCCTTAGTGGTATACACTGGTAATAAATTAATTTGACTTTCCCTGTCTACAGTTATTCTTGATGGTTTTTAA-ACTGAGAGAGTATCACCAACATCCGTACAATACAGAGAAATCAGCATCTTAATATCATTTAAGTTAACTTATTCAAAATTACTACGATACTTTAATTTAATGTCTGACAATGCATTTCTATTTGAATGTGTTGTTGTAATGGTAAATGACAGTGATTTCGAGTAAGAAGAAATGATAACTTTCCAACCAATTTTTATCGTTTTAGTCTACAGCATCGTACAAATAAACGAACAAAAACATTTTCTCTCCTAATCTTATGCATAATTTACAATCTTCTTCCAACCGACCTTTATTTGCGCATTTTGTTTGAATTGTGTACATTATCGTTACTAATATTAACCCACATGAATGAATGAAATGTTCTACATATTTATTATTACTTGCCAGTAAATCAAACATACTCATAGACACTAAACAAACGATGTATCCCAATCTGTGCTGTGTATGTGATGAAAGCTTATGTTCTTTGTTAATCGTTCTTTTCTTGTTCAGTACTGTTATATGTATACAAAGAATTTTAGGAAAATTTGATTTGTAGTTGTGAAATGTTTTAGAAATTTTTACTTCTAATTGTAACAATAACCTCAATTCCTTCCCTCCTATATTATATTGAACTCTTTTGATATATCCATCTTTCTAGGTGCATATATGACCATATGTGCTTAACTTTATCAGTTTTGGTTAGTGCTATTCATTTCCTGTTCATATTATCTAGAGGTTATTAGAATTTGACATATGCGCTATTATTATCAACCAATCATTCGTTCATCCACTGCTCTCAGATAATAATATGGATAATCTTGCTTATCGAATATTCATTTCTACTTTAAGTTCTTCACATTTTTCACTATTATTTTCAATCCATGAGGGATGATGATAGGTTTGTTACATACAAATAAATACCTAGCATGTTTTGCTCCTTTCAAAGTTTCGTAAATCGAAACTCTTGATAACAGTTTTCACTTCTTTTTTTTTTTTAAAAAGTTGTTCATGCTTATTATCTTATCCGTCTCGTTTGTATTATTGTTAACACTCAGTATTTAAATGAGTTGTATGAACAAATTTTATGTATGCAAGGTAGTGTAAGA]

[+] EMBL CD149328             [TAGATGGAGTATTTATGCATAAACGTGAACGGAAATTCAAATTTCTTTGCGAACGTAATGATAAGGTATTTTTCTCGAATACACGGTCTGGGCCACCCCAAGTATCTATGATGACCCTTAGTGGTATACACTGGTAATAAATTAATTTGACTTTCCCTGTCTACAGTTATTCTTGATGGTTTTTAA ACTGAGAGAGTATCACCAACATCCGTACAATACAGAGAAATCAGCATCTTAATATCATTTAAGTTAACTTATCCAAAATTACTACGATACTTTAATTTAATGTCTGACAATGCATTTCTATTTGAATGTGTTGTTGTAATGGTAAATGACAGTGATTTCGAGTAAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD149232             [TAGATGGAGTATTTATGCATAAACGTGAACAGAAATTCAAATTTCTTTGCGAACGTAATGATAAGGTATTTTTCTCGAATACACGGTCTGGGCCACCCCAAGTATCTATGATGACCCTTAGTGGTATACACTGGTAATAAATTAATTTGACTTTCCCTGTCTACAGTTATTCTTGATGGTTTTTAA ACTGAGAGAGTATCACCAACATCCGTACAATACAGAGAAATCAGCATCTTAATATCATTTAAGTTAACTTATTCAAAATTACTACGATACTTTAATTTAATGTCTGACAATGCATTTCTATTTGAATGTGTTGTTGTAATGGTAAATGACAGTGATTTCGAGTAAGAAGAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD149310             [TAGATGGAGTATTTATGCATAAACGTGAACAGAAATTCAAATTTCTTTGCGAACGTAATGATAAGGTATTTTTCTCGAATACACGGTCTGGGCCACCCCAAGTATCTATGATGACCCTTAGTGGTGTACACTGGTAATAAATTAATTTGACTTTCCCTGTCTACAGTTATTCTTGATGGTTTTTAA ACTGAGAGAGTATCACCAACATCCGTACAATACAGAGAAATCAGCATCTTAATATCATTTAAGTTAACTTATTCAAAATTACTACGATACTTTAATTTAATGTCTGACAATGCATTTCTATTTGAATGTGTTGTTGTAATGGTAAATGAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD200706             [                                                                                                   gAGTATCTATGATGACCCTTATTGGCTTACACTGACAATAAATTAATTAGACTTTCCCTGTCTACAGTTATTCTTGATGGTTTTTAACACTGAGAGAGTATCACCAACATCCGTACAATACAGAGAAATCAGCATCTTAATATCATTTAAGTTAACTTATTCAAAATTACTACGATACTTTAATTTAATGTCTGACAATGCATTTCTATTTGAATGTGTTGTTGTAATGGTAAATGACAGTGATTTCGAGTAAGAAGAAATGATAACTTTCCAACCAATTTTTATCGTTTTAGTCTACAGCATCGTACAAATAAACGAACAAAAACATTTTCTCTCCTAATCTTATGCATAATTTACAATCTTCTTCCAACCGACCTTTATTTGCGCATTTTGTTTGAATTGTGTACATTATCGGTACTAATATTAACCCACATGAATGAATGAAATGTTCTACATATTTATTATTACTTGCCAGTAAATCAAACCTACTTCTAGACCCTAAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD071586             [                                                                                                     GTATCTATGATGACCCTTAGTGGTATACACTGGTAATAAATTAATTTGACTTTCCCTGTCTACAGTTATTCTTGATGGTTTTTAA ACTGAGAGAGTATCACCAACATCCGTACAATACAGAGAAATCAGCATCTTAATATCATTTAAGTTAACTTATTCAAAATTACTACGATACCTTAATTTAATGTCTGACAATGCATTTCTATTTGAATGTGTTGTTGTAATGGTAAATGACAGTGATTTCGAGTAAGAAGAAATGATAACTTTCCAACCAATTCTTATCGTTTTAGTCTACAGCATCGTACAAATAAACGAACAAAAACATTTTCTCTCCTAATCTTATGCATAATTTACAATCTTCTTCCAACCGACCTTTATTTGCGCATTTTGTTTGAATTGTGTACATTATCGTTACTAATATTAACCCACATGAATGAATGAAATGTTCTACATATTTATTATTACTTGCCAGTAAATCAAACATACTCATAGACACTAAACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD071596             [                                                                                                     GTATCTATGATGACCCTTAGTGGTATACACTGGTAATAAATTAATTTGACTTTCCCTGTCTACAGTTATTCTTGATGGTTTTTAA ACTGAGAGAGTATCACCAACATCCGTACAATACAGAGAAATCAGCATCTTAATATTATTTAAGTTAACTTATTCAAAATTACTACGATACTTTAATTTAATGTCTGACAATGCATTTCTATTTGAATGTGTTGTTGTAATGGTAAATGACGGTGATTTTGAGTAAGAAGAAATGATAACTTTCCAACCAATTTTTATCGTTTTAGTCTACAGCATCGTACAAATAAACGAACAAAAACATTT    TCCTAATCTTATGCATAATTTACAATCTTCTTCCAACCGACCTTTATTTGCGCATTTTGTTTGAATTGTGTACATTATCGTTACTAATATTAACCCACATGAATGAATGAAATGTTCTACATATTTATTATTACTCGCCAGTAAATCGAACATACTCATAGACACTAAACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD071532             [                                                                                                     GTATCTATGATGACCCTTAGTGGTATACACTGGTAATAAATTAATTTGACTTTCCCTGTCTACAGTTATTCTTGATGGTTTTTAA ACTGAGAGAGTATCACCAACATCCGTACAATACAGAGAAATCAGCATCTTAATATCATTTAAGTTAACTTATTCAAAATTACTACGATACTTTAATTTAATGTCTGACAATGCATTTCTATTTGAATGTGTTGTTGTAATGGTAAATGACGGTGATTTCGAGTAAGAAGAAATGATAACTTTCCAACCAATTTTTATCGTTTTAGTCTACAGCATCGTACAAATAAACGAACAAAAACATTTTCTCTCCTAATCTTATGCATAATTTACAATCTTCTTCCAACCGACCTTTATTTGCGCATTTTGTTTGAATTGTGTACATTATCGTTACTAATACTAACCCACATGAATGAATGAAATGTTCTACATATTTATTATTACTTGCCAGTAAATCAAACATACTCATAGACACTAAACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD112429             [                                                                                                     GTATCTATGATGACCCTTAGTGGTATACACTGGTAATAAATTAATTTGACTTTCCCTGTCTACAGTTATTCTTGATGGTTTATAA ACTGAGAGAGTATCACCAACATCCGTACAATACAGAGAAATCAGCATCTTAATATTATTTAAGTCAACTTATTCAAAATTACTACGATACTTTAATTTAATGTCTGACAATGCATTTCTATTcg                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD065345             [                                                                                                                                                                                                                                                                                    CTTTAATGTAATGTCTGACAATGCATTTCTATTTGTATGTGTTGTTGTAATGGTAAATGACAGTGATTTTGAGTAAGAAGAAATGATAACTTTCCAACCAATTTTTATCGTTTTAGTCTACAGCATCGTCCATATATACGAcatgtaca                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL AI977723             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tcaaaaTAATATTAACCCACATGAATGAATGAAATGTTCTACATATTTATTATTACTCGCCAGTAAATCAAACATACTCATAGACACTAAACAAACGATGTATCCCAATCTGTGCTGTGTATGTGATGAAAGCTTATGTTCTTTGTTAATCGTTCTTTTCTTGTTCAGTACTGTTATATGTATACAAAGAATTTTAGGAAAATTTGATTTGTAGTTGTGAAATGTTTTAGAAATTTTTACTTCTAATTGTAACAATAACCTCAATTCCTTCCCTCCTATATTATATTGAACTCTTTTGATATATCCATCTTTCTAGGTGCATATATGACCATATGTGCTTAACTTTATCAGTTTTGGTTAGTGCTATTCATTTCCTGTTCATATTATCTAGAGGCTATTAGAATTTGACATATGCGCTATTATTATCAACCAATCATTCGTTCATCCACTGCTCTCAGATAATAATATGGATAATCTTGCTTATCGAATATTCATTTCTACTTTAAGTTCTTCACATTTTTCACTATTATTTTCAATCCATGAGGGATGATGATAGGTTTGTTACATACAAATAAATACCT                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD149557             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GTTCTTTGTTAATCGTTCTTTTCTTGTTCAGTACTGTTATATATATACAAAGAATTTTAGGAAAATTTGATTTGTAGTTGTGAAATGTTTTAGAAATTTTTACTTCTAATTGTAACAATAACCTCAATTCCTTCCCTCCTATATTATATTGAACTCTTTTGATATATCCATCTTTCTAGGTGCATATATGACCATATGTCCTTAACTTTATCAGTTTTGGTTAGTGCTATTCATTTCCTGTTCATATTATCTAGAGGTTATTAGAATTTGACATATGCGCTATTATTATCAACCAATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD140939             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ACTTTATCAGTTTTGGTTAGTGCTAATCATTTCCTGTTCAAATTATCTAGAGGTTATTAGGATTTGACATATGCGCTATTATTATCAACCAATCAATCGTTCATCCACTGCTCTCAGATAATAATATGGATAATCTTGCTTATCGAATAGTCAATTCTACTTTAAGTTTTTCACAATTTTCACTAATATTTTCAATCCATGAGGGATGATGATAGGTTTGTTACATACAAATAAATACCTAGCATGTTTTGCTCCTTTCAAAGTTTCGTAAATCGAAACTCTTGATAACAGTTTTCACTTCTTTTTTTTTTTTAAAAAGTTGTTCATGCTTATTATCTTATCCGTCTCGTTTGTATTATTGTTAACACTCAGTATTTAAATGAGTTGTATGAACAAATTTTATGTATGCAAGGTAGTGTAAGA]


>consensus_9968#0 TAGATGGAGTATTTATGCATAAACGTGAACAGAAATTCAAATTTCTTTGCGAACGTAATG ATAAGGTATTTTTCTCGAATACACGGTCTGGGCCACCCCAAGTATCTATGATGACCCTTA GTGGTATACACTGGTAATAAATTAATTTGACTTTCCCTGTCTACAGTTATTCTTGATGGT TTTTAAACTGAGAGAGTATCACCAACATCCGTACAATACAGAGAAATCAGCATCTTAATA TCATTTAAGTTAACTTATTCAAAATTACTACGATACTTTAATTTAATGTCTGACAATGCA TTTCTATTTGAATGTGTTGTTGTAATGGTAAATGACAGTGATTTCGAGTAAGAAGAAATG ATAACTTTCCAACCAATTTTTATCGTTTTAGTCTACAGCATCGTACAAATAAACGAACAA AAACATTTTCTCTCCTAATCTTATGCATAATTTACAATCTTCTTCCAACCGACCTTTATT TGCGCATTTTGTTTGAATTGTGTACATTATCGTTACTAATATTAACCCACATGAATGAAT GAAATGTTCTACATATTTATTATTACTTGCCAGTAAATCAAACATACTCATAGACACTAA ACAAACGATGTATCCCAATCTGTGCTGTGTATGTGATGAAAGCTTATGTTCTTTGTTAAT CGTTCTTTTCTTGTTCAGTACTGTTATATGTATACAAAGAATTTTAGGAAAATTTGATTT GTAGTTGTGAAATGTTTTAGAAATTTTTACTTCTAATTGTAACAATAACCTCAATTCCTT CCCTCCTATATTATATTGAACTCTTTTGATATATCCATCTTTCTAGGTGCATATATGACC ATATGTGCTTAACTTTATCAGTTTTGGTTAGTGCTATTCATTTCCTGTTCATATTATCTA GAGGTTATTAGAATTTGACATATGCGCTATTATTATCAACCAATCATTCGTTCATCCACT GCTCTCAGATAATAATATGGATAATCTTGCTTATCGAATATTCATTTCTACTTTAAGTTC TTCACATTTTTCACTATTATTTTCAATCCATGAGGGATGATGATAGGTTTGTTACATACA AATAAATACCTAGCATGTTTTGCTCCTTTCAAAGTTTCGTAAATCGAAACTCTTGATAAC AGTTTTCACTTCTTTTTTTTTTTTAAAAAGTTGTTCATGCTTATTATCTTATCCGTCTCG TTTGTATTATTGTTAACACTCAGTATTTAAATGAGTTGTATGAACAAATTTTATGTATGC AAGGTAGTGTAAGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)