These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9968#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 12 consensus length = 1274 fasta sequence [TAGATGGAGTATTTATGCATAAACGTGAACAGAAATTCAAATTTCTTTGCGAACGTAATGATAAGGTATTTTTCTCGAATACACGGTCTGGGCCACCCCAAGTATCTATGATGACCCTTAGTGGTATACACTGGTAATAAATTAATTTGACTTTCCCTGTCTACAGTTATTCTTGATGGTTTTTAA-ACTGAGAGAGTATCACCAACATCCGTACAATACAGAGAAATCAGCATCTTAATATCATTTAAGTTAACTTATTCAAAATTACTACGATACTTTAATTTAATGTCTGACAATGCATTTCTATTTGAATGTGTTGTTGTAATGGTAAATGACAGTGATTTCGAGTAAGAAGAAATGATAACTTTCCAACCAATTTTTATCGTTTTAGTCTACAGCATCGTACAAATAAACGAACAAAAACATTTTCTCTCCTAATCTTATGCATAATTTACAATCTTCTTCCAACCGACCTTTATTTGCGCATTTTGTTTGAATTGTGTACATTATCGTTACTAATATTAACCCACATGAATGAATGAAATGTTCTACATATTTATTATTACTTGCCAGTAAATCAAACATACTCATAGACACTAAACAAACGATGTATCCCAATCTGTGCTGTGTATGTGATGAAAGCTTATGTTCTTTGTTAATCGTTCTTTTCTTGTTCAGTACTGTTATATGTATACAAAGAATTTTAGGAAAATTTGATTTGTAGTTGTGAAATGTTTTAGAAATTTTTACTTCTAATTGTAACAATAACCTCAATTCCTTCCCTCCTATATTATATTGAACTCTTTTGATATATCCATCTTTCTAGGTGCATATATGACCATATGTGCTTAACTTTATCAGTTTTGGTTAGTGCTATTCATTTCCTGTTCATATTATCTAGAGGTTATTAGAATTTGACATATGCGCTATTATTATCAACCAATCATTCGTTCATCCACTGCTCTCAGATAATAATATGGATAATCTTGCTTATCGAATATTCATTTCTACTTTAAGTTCTTCACATTTTTCACTATTATTTTCAATCCATGAGGGATGATGATAGGTTTGTTACATACAAATAAATACCTAGCATGTTTTGCTCCTTTCAAAGTTTCGTAAATCGAAACTCTTGATAACAGTTTTCACTTCTTTTTTTTTTTTAAAAAGTTGTTCATGCTTATTATCTTATCCGTCTCGTTTGTATTATTGTTAACACTCAGTATTTAAATGAGTTGTATGAACAAATTTTATGTATGCAAGGTAGTGTAAGA] [+] EMBL CD149328 [TAGATGGAGTATTTATGCATAAACGTGAACGGAAATTCAAATTTCTTTGCGAACGTAATGATAAGGTATTTTTCTCGAATACACGGTCTGGGCCACCCCAAGTATCTATGATGACCCTTAGTGGTATACACTGGTAATAAATTAATTTGACTTTCCCTGTCTACAGTTATTCTTGATGGTTTTTAA ACTGAGAGAGTATCACCAACATCCGTACAATACAGAGAAATCAGCATCTTAATATCATTTAAGTTAACTTATCCAAAATTACTACGATACTTTAATTTAATGTCTGACAATGCATTTCTATTTGAATGTGTTGTTGTAATGGTAAATGACAGTGATTTCGAGTAAGA ] [+] EMBL CD149232 [TAGATGGAGTATTTATGCATAAACGTGAACAGAAATTCAAATTTCTTTGCGAACGTAATGATAAGGTATTTTTCTCGAATACACGGTCTGGGCCACCCCAAGTATCTATGATGACCCTTAGTGGTATACACTGGTAATAAATTAATTTGACTTTCCCTGTCTACAGTTATTCTTGATGGTTTTTAA ACTGAGAGAGTATCACCAACATCCGTACAATACAGAGAAATCAGCATCTTAATATCATTTAAGTTAACTTATTCAAAATTACTACGATACTTTAATTTAATGTCTGACAATGCATTTCTATTTGAATGTGTTGTTGTAATGGTAAATGACAGTGATTTCGAGTAAGAAGAAA ] [+] EMBL CD149310 [TAGATGGAGTATTTATGCATAAACGTGAACAGAAATTCAAATTTCTTTGCGAACGTAATGATAAGGTATTTTTCTCGAATACACGGTCTGGGCCACCCCAAGTATCTATGATGACCCTTAGTGGTGTACACTGGTAATAAATTAATTTGACTTTCCCTGTCTACAGTTATTCTTGATGGTTTTTAA ACTGAGAGAGTATCACCAACATCCGTACAATACAGAGAAATCAGCATCTTAATATCATTTAAGTTAACTTATTCAAAATTACTACGATACTTTAATTTAATGTCTGACAATGCATTTCTATTTGAATGTGTTGTTGTAATGGTAAATGAC ] [+] EMBL CD200706 [ gAGTATCTATGATGACCCTTATTGGCTTACACTGACAATAAATTAATTAGACTTTCCCTGTCTACAGTTATTCTTGATGGTTTTTAACACTGAGAGAGTATCACCAACATCCGTACAATACAGAGAAATCAGCATCTTAATATCATTTAAGTTAACTTATTCAAAATTACTACGATACTTTAATTTAATGTCTGACAATGCATTTCTATTTGAATGTGTTGTTGTAATGGTAAATGACAGTGATTTCGAGTAAGAAGAAATGATAACTTTCCAACCAATTTTTATCGTTTTAGTCTACAGCATCGTACAAATAAACGAACAAAAACATTTTCTCTCCTAATCTTATGCATAATTTACAATCTTCTTCCAACCGACCTTTATTTGCGCATTTTGTTTGAATTGTGTACATTATCGGTACTAATATTAACCCACATGAATGAATGAAATGTTCTACATATTTATTATTACTTGCCAGTAAATCAAACCTACTTCTAGACCCTAAAC ] [+] EMBL CD071586 [ GTATCTATGATGACCCTTAGTGGTATACACTGGTAATAAATTAATTTGACTTTCCCTGTCTACAGTTATTCTTGATGGTTTTTAA ACTGAGAGAGTATCACCAACATCCGTACAATACAGAGAAATCAGCATCTTAATATCATTTAAGTTAACTTATTCAAAATTACTACGATACCTTAATTTAATGTCTGACAATGCATTTCTATTTGAATGTGTTGTTGTAATGGTAAATGACAGTGATTTCGAGTAAGAAGAAATGATAACTTTCCAACCAATTCTTATCGTTTTAGTCTACAGCATCGTACAAATAAACGAACAAAAACATTTTCTCTCCTAATCTTATGCATAATTTACAATCTTCTTCCAACCGACCTTTATTTGCGCATTTTGTTTGAATTGTGTACATTATCGTTACTAATATTAACCCACATGAATGAATGAAATGTTCTACATATTTATTATTACTTGCCAGTAAATCAAACATACTCATAGACACTAAACA ] [+] EMBL CD071596 [ GTATCTATGATGACCCTTAGTGGTATACACTGGTAATAAATTAATTTGACTTTCCCTGTCTACAGTTATTCTTGATGGTTTTTAA ACTGAGAGAGTATCACCAACATCCGTACAATACAGAGAAATCAGCATCTTAATATTATTTAAGTTAACTTATTCAAAATTACTACGATACTTTAATTTAATGTCTGACAATGCATTTCTATTTGAATGTGTTGTTGTAATGGTAAATGACGGTGATTTTGAGTAAGAAGAAATGATAACTTTCCAACCAATTTTTATCGTTTTAGTCTACAGCATCGTACAAATAAACGAACAAAAACATTT TCCTAATCTTATGCATAATTTACAATCTTCTTCCAACCGACCTTTATTTGCGCATTTTGTTTGAATTGTGTACATTATCGTTACTAATATTAACCCACATGAATGAATGAAATGTTCTACATATTTATTATTACTCGCCAGTAAATCGAACATACTCATAGACACTAAACA ] [+] EMBL CD071532 [ GTATCTATGATGACCCTTAGTGGTATACACTGGTAATAAATTAATTTGACTTTCCCTGTCTACAGTTATTCTTGATGGTTTTTAA ACTGAGAGAGTATCACCAACATCCGTACAATACAGAGAAATCAGCATCTTAATATCATTTAAGTTAACTTATTCAAAATTACTACGATACTTTAATTTAATGTCTGACAATGCATTTCTATTTGAATGTGTTGTTGTAATGGTAAATGACGGTGATTTCGAGTAAGAAGAAATGATAACTTTCCAACCAATTTTTATCGTTTTAGTCTACAGCATCGTACAAATAAACGAACAAAAACATTTTCTCTCCTAATCTTATGCATAATTTACAATCTTCTTCCAACCGACCTTTATTTGCGCATTTTGTTTGAATTGTGTACATTATCGTTACTAATACTAACCCACATGAATGAATGAAATGTTCTACATATTTATTATTACTTGCCAGTAAATCAAACATACTCATAGACACTAAACA ] [+] EMBL CD112429 [ GTATCTATGATGACCCTTAGTGGTATACACTGGTAATAAATTAATTTGACTTTCCCTGTCTACAGTTATTCTTGATGGTTTATAA ACTGAGAGAGTATCACCAACATCCGTACAATACAGAGAAATCAGCATCTTAATATTATTTAAGTCAACTTATTCAAAATTACTACGATACTTTAATTTAATGTCTGACAATGCATTTCTATTcg ] [-] EMBL CD065345 [ CTTTAATGTAATGTCTGACAATGCATTTCTATTTGTATGTGTTGTTGTAATGGTAAATGACAGTGATTTTGAGTAAGAAGAAATGATAACTTTCCAACCAATTTTTATCGTTTTAGTCTACAGCATCGTCCATATATACGAcatgtaca ] [+] EMBL AI977723 [ tcaaaaTAATATTAACCCACATGAATGAATGAAATGTTCTACATATTTATTATTACTCGCCAGTAAATCAAACATACTCATAGACACTAAACAAACGATGTATCCCAATCTGTGCTGTGTATGTGATGAAAGCTTATGTTCTTTGTTAATCGTTCTTTTCTTGTTCAGTACTGTTATATGTATACAAAGAATTTTAGGAAAATTTGATTTGTAGTTGTGAAATGTTTTAGAAATTTTTACTTCTAATTGTAACAATAACCTCAATTCCTTCCCTCCTATATTATATTGAACTCTTTTGATATATCCATCTTTCTAGGTGCATATATGACCATATGTGCTTAACTTTATCAGTTTTGGTTAGTGCTATTCATTTCCTGTTCATATTATCTAGAGGCTATTAGAATTTGACATATGCGCTATTATTATCAACCAATCATTCGTTCATCCACTGCTCTCAGATAATAATATGGATAATCTTGCTTATCGAATATTCATTTCTACTTTAAGTTCTTCACATTTTTCACTATTATTTTCAATCCATGAGGGATGATGATAGGTTTGTTACATACAAATAAATACCT ] [-] EMBL CD149557 [ GTTCTTTGTTAATCGTTCTTTTCTTGTTCAGTACTGTTATATATATACAAAGAATTTTAGGAAAATTTGATTTGTAGTTGTGAAATGTTTTAGAAATTTTTACTTCTAATTGTAACAATAACCTCAATTCCTTCCCTCCTATATTATATTGAACTCTTTTGATATATCCATCTTTCTAGGTGCATATATGACCATATGTCCTTAACTTTATCAGTTTTGGTTAGTGCTATTCATTTCCTGTTCATATTATCTAGAGGTTATTAGAATTTGACATATGCGCTATTATTATCAACCAATC ] [-] EMBL CD140939 [ ACTTTATCAGTTTTGGTTAGTGCTAATCATTTCCTGTTCAAATTATCTAGAGGTTATTAGGATTTGACATATGCGCTATTATTATCAACCAATCAATCGTTCATCCACTGCTCTCAGATAATAATATGGATAATCTTGCTTATCGAATAGTCAATTCTACTTTAAGTTTTTCACAATTTTCACTAATATTTTCAATCCATGAGGGATGATGATAGGTTTGTTACATACAAATAAATACCTAGCATGTTTTGCTCCTTTCAAAGTTTCGTAAATCGAAACTCTTGATAACAGTTTTCACTTCTTTTTTTTTTTTAAAAAGTTGTTCATGCTTATTATCTTATCCGTCTCGTTTGTATTATTGTTAACACTCAGTATTTAAATGAGTTGTATGAACAAATTTTATGTATGCAAGGTAGTGTAAGA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||