These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Takifugu rubripes see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_1799#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 1077 fasta sequence [TGTGCATGTGGGGGATCGGTCACCCCGGAGTCTAATCAGGAAGCTAGTTAGAGAGCTCTTCACAGCATGCGTAAAATGGTCGCAGGACGATAAAAACGTGTAGTGGTGTATAAAAAGCTAAACACACGCCTTTAAAGCGTGCCGACTGTTGTTTGTTCAGAACAACTATTAGGTTGTGAAGTGACGTATCTCTATCAGCTAGACTAGTTAACAAAACTAAAGTGGAGAGACAGGAGTATGTTTGCAACAGTTAAGATTCCTTTTCTCACTCTCCTTTAGAGCTCTCTGCTGCTTGCCTGACCACAAACGTTCTGGTCTGATGGAATCCTCCGGCAGTCGACAGCAGCAACGGTGTGTTTGCTGGAGTCCCTCGAGTGCAGTATCTCTCTCTGCTTGACAGTGCTTAAGAAATCAACACATATCGGTCTAGTATAAAGTAGAAGGCAATTAAAACCATCACAAAGTTGATAGTAAAACATAAATCAAAACGGATATATCTCTCTATGCTTATTGTACAAACACAGAAAAATAATATAGAAATAAAAGAAACTTAAAAAAAAAAAACAACAACTCCAGTGTTGACTTAGTGTATGTTTGTTTACAACAGGAAGTTAGTAGATATATGGCTGCAAAATTAAGTCCATGTAACTCAGTTTAGTGTAAAAAGAATCTTCCCTCAGTAGTAAGGTCTGGGTGTAGCGAGACGTGAGTCTGGGATCTGTCCGTGAGAGAAGCCTTGGTAGCCAGAAATCCAGCTTTGAAACTGTCAGGGAGTTGTAAATGTTGTTCTGTCGCTTAAATTGGTCAATAAACCCACAGTTCCTTCAAAGCACCCGATGTGCAAAACCCCGACACACACATGAATATCCAGGCAAGGTCCACACGGAGAGGAACGACCAGCCATAGTCCTTCAACCTTCCAGCTCAGTCCCCTTAATAAAATTATAAGGTGAAATACGCCTGCCTGATGAGCAAGCTGCTGCTTTTTCTGGTCTTCTCTCTCCAAGAAAGTGTTGGCATCAGACCTCCACACACACTCATACACACACACACACACACACACACACACACACGCGCA] [-] EMBL FR0062831 [TGTGCATGTGGGGGATCGGTCACCCCGGAGTCTAATCAGGAAGCTAGTTAGAGAGCTCTTCACAGCATGCGTAAAATGGTCGCAGGACGATAAAAACGTGTAGTGGTGTATAAAAAGCTAAACACACGCCTTTAAAGCGTGCCGACTGTTGTTTGTTCAGAACAACTATTAGGTTGTGAAGTGACGTATCTCTATCAGCTAGACTAGTTAACAAAACTAAAGTGGAGAGACAGGAGTATGTTTGCAACAGTTAAGATTCCTTTTCTCACTCTCCTTTAGAGCTCTCTGCTGCTTGCCTGACCACAAACGTTCTGGTCTGATGGAATCCTCCGGCAGT ] [-] EMBL BU806500 [ GTGCCGACTGTTGTTTGTTCAGAACAACTATTAGGTTGTGAAGTGACGTATCTCTATCAGCTAGACTAGTTAACAAAACTAAAGTGGAGAGACAGGAGTATGTTTGCAACAGTTAAGATTCCTTTTCTCACTCTCCTTTAGAGCTCTCTCCTGCTTGCCTGACCACAAACGTTCTGGTCTGATGGAATCCTCCGGCAGTCGACAGCAGCAACGGTGTGTTTGCTGGAGTCCCTCGAGTGCAGTATCTCTCTCTGCTTGACAGTGCTTAAGAAATCAACACATATCGGTCTAGTATAAAGTAGAAGGCAATTAAAACCATCACAAAGTTGATAGTAAAACATAAATCAAAACGGATATATCTCTCTATGCTTATTGTACAAACACAGAAAAATAATATAGAAATAAAAGAAACTTAAAAAAAAAAAACAACAACTCCAGTGTTGACTTAGTGTATGTTTGTTTACAACAGGAAGTTAGTAGATATATGGCTGCAAAATTAAGTCCATGTAACTCAGTTTAGTGTAAAAAGAATCTTCCCTCAGTAGTAAGGTCTGGGTGTAGCGAGACGTGAGTCTGGGATCTGTCCGTGAGAGAAGCCTTGGTAG ] [+] EMBL CA329451 [ TAGTGTATGTTTGTTTACAACAGGAAGTTAGTAGATATATGGCTGCAAAATTAAGTCCATGTAACTCAGTTTAGTGTAAAAAGAATCTTCCCTCAGTAGTAAGGTCTGGGTGTAGCGAGACGTGAGTCTGGGATCTGTCCGTGAGAGAAGCCTTGGTAGCCAGAAATCCAGCTTTGAAACTGTCAGGGAGTTGTAAATGTTGTTCTGTCGCTTAAATTGGTCAATAAACCCACAGTTCCTTCAAAGCACCCGATGTGCAAAACCCCGACACACACATGAATATCCAGGCAAGGTCCACACGGAGAGGAACGACCAGCCATAGTCCTTCAACCTTCCAGCTCAGTCCCCTTAATAAAATTATAAGGTGAAATACGCCTGCCTGATGAGCAAGCTGCTGCTTTTTCTGGTCTTCTCTCTCCAAGAAAGTGTTGGCATCAGACCTCCACACACACTCATACACACACACACACACACACACACACACACACGCGCA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Data build on Sat Aug 9 00:50:02 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) |