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Takifugu rubripes
cluster # 2156 cluster # 2156       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2156#0 length = 555 sequences # 4  

consensusID : consensus_2156#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 555
fasta sequence
                              [TTTAATTGTAAGATATTTAATCATTTGACTGTAATAAAAATGCGGGAATTCCACTAAAAATATTAATCTCATAATCTCAGTTGCATTGTTGGGCTGACATTTCACATTAAGTGTAAACTTCACCTGAAATTGTACAATCTGGTCACAAACATTGATAAACTGCTGGGTGGAACGTGACGCG-CCCCCTTGTGGCCCCGACTGATACCGACAATATCCTCCAAACTCTAATAGCAAAGGCTGCGTTTCTTACTAAGAATTGGTGCTTCTATCTACTTAATTCCTTTTATTTAACAGCTGCATGAGTACAAAAGACAAAAATGCTCTTTGGGCTTCAGCTTGTAAACATAAGAATCTCAGAGACCCTTGTCAGCCAGGCTGATTGTCCTTTAGTACCGCAACGGCTCCAGTGAGTAAAGACACCCCATTCTTCTTCATGATCCCCCTAGTCTTAGAGGAATAGTGTTAACTATTGTAGGTATGCACCAGCGATTAATAGCTTTTTCTCCTTCTGAAACTCCTAATCTGACATCTTTTCTTAAAAAAAAAACAAAAAAA]

[+] EMBL CA329218             [TTTAATTGGAAGATATTTAATCATTTGACTGTAATAAAAATGCGGGAATTCCACTAAAAATATTAATCTCATAATCTCAGTTGCATTGTTGGGCTGACATTTCACATTAAGTGTAAACTTCACCTGAAATTGTACAATCTGGTCACAAACATTGATAAACTGCTGGGTGGAACGTGACGCG CCCCCTTGTGGTCCCGACTGATACCGACAATATCCTCCAAACTCTAATAGCAAAGGCTGCGTTTCTTACTAAGAATTGGGGCTTCTATCTACTTAATTCCTTTTATTTAACAGCTGCATGAGTACAAAAGACAAAAATGCTCTTTGGGCTTCAGCTTGTAAACATAAGAATCTCAGAGACCCTTGTCAGCCAGGCTGATTGTCCTTTAGTACCGCAACGGCTCCAGTGAGTAAAGACACCCCATTCTTCTTCATGATCCCCCTAGTCTTAGAGGAATAGTGTTAACTATTGTAGGTATGCACCAGCGATTAATAGCTTTTTCTCCTTCTGAAACTCCTAATCTGACATCTTTTCTTAAAAAAAAAACAAAAAAA]
[+] EMBL CA331853             [   AATTGTAAGATATTTAATCATTTGACTGTAATAAAAATGCGGGAATTCCACTAAAAATATTAATCTCATAATCTCAGTTGCATTGTTGGGCTGACATTTCACATTAAGTGTAAACTTCACCTGAAATTGTACAATCTGGTCACAAACATTGATAAACTGCTGGGTGGAACGTGACGCG CCCCCTTGTGGCCCCGACTGATACCGACAATATCCTCCAAACTCTAATAGCAAAGGCTGCGTTTCTTACTAAGAATTGGTGCTTCTATCTACTTAATTCCTTTTATTTAACAGCTGCATGAGTACAAAAGACAAAAATGCTCTTTGGGCTTCAGCTTGTAAACATAAGAATCTCAGAGACCCTTGTCAGCCAGGCTGATTGTCCTTTAGTACCGCAACGGCTCCAGTGAGTAAAGACACCCCATTCTTCTTCATG                                                                                                                       ]
[+] EMBL CA332114             [        TAAGATATTTAATCATTTGACTGTAATAAAAATGCGGGAATTCCACTAAAAATATTAATCTCATAATCTCAGTTGCATTGTTGGGCTGACATTTCACATTAAGTGTAAACTTCACCTGAAATTGTACAATCTGGTCACAAACATTGATAAACTGCTGGGTGGAACGTGACGCG CCCCCTTGTGGCCCCGACTGATACCGACAATATCCTCCAAACTCTAATAGCAAAGGCTGCGTTTCTTACTAAGAATTGGTGCTTCTATCTACTTAATTCCTTTTATTTAACAGCTGCATGAGTACAAAAGACAAAAATGCTCTTTGGGCTTCAGCTTGTAAACATAAGAATCTCAGAGACCCTTGTCAGCCAGGCTGATTGTCCTTTAGTACCGCAACGGCTCCAGTGAGTAAAGACACCCCATTCTTCTTCATGATCCCCCTAGTCTTAGAGGAATAGTGTTAACTATTGTAGGTATGCACCAGCGATTAATAGCTTTTTCTCCTTCTGAAACTCCTAATCTGACATC                         ]
[-] EMBL FR0056976            [                                                                                                                                                                          cACGTGCCGCGCCCCCCTTGTGCCCCGAACTGATACCGCCAATATCCCCCAAACTCTAATAGCAAAGGCTGCGTCTCTTACTAAGAATTGGTGCTTCTATCTACTTAATTCCTCTTATTTAACAGGTGCATGAGTACAAAAGACAAAAATGCTCTTTGGGCTTCAGCTTGTAAACATAAGAATCTCAGAGAC                                                                                                                                                                                                  ]


>consensus_2156#0 TTTAATTGTAAGATATTTAATCATTTGACTGTAATAAAAATGCGGGAATTCCACTAAAAA TATTAATCTCATAATCTCAGTTGCATTGTTGGGCTGACATTTCACATTAAGTGTAAACTT CACCTGAAATTGTACAATCTGGTCACAAACATTGATAAACTGCTGGGTGGAACGTGACGC GCCCCCTTGTGGCCCCGACTGATACCGACAATATCCTCCAAACTCTAATAGCAAAGGCTG CGTTTCTTACTAAGAATTGGTGCTTCTATCTACTTAATTCCTTTTATTTAACAGCTGCAT GAGTACAAAAGACAAAAATGCTCTTTGGGCTTCAGCTTGTAAACATAAGAATCTCAGAGA CCCTTGTCAGCCAGGCTGATTGTCCTTTAGTACCGCAACGGCTCCAGTGAGTAAAGACAC CCCATTCTTCTTCATGATCCCCCTAGTCTTAGAGGAATAGTGTTAACTATTGTAGGTATG CACCAGCGATTAATAGCTTTTTCTCCTTCTGAAACTCCTAATCTGACATCTTTTCTTAAA AAAAAAACAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Sat Aug 9 00:50:02 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)