These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Takifugu rubripes see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_2400#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 916 fasta sequence [GGCGAAAGCCTCCACTGACCCAGATTTACCAACGCACAAGTTCTTCAACCAACCCCAACAGACGTAGATGCTCGGCAGACTTCAATTTTCTTACTGATAGTGGAGATCTTTTGCACATAGCTGAGGCAGCTTAGGAGACTACCTGGACCCTGCAGAGACAAGCACACAGCAGCTCCTGTCCCCAAAGAAAAACCAAGGCCGGGCAGCACCGAACCAGCTCTGAGAAGGATTCTCATCTTCTTCCATGTAGCAGTTCTGTGTACAGGAGCTCACCTGTTAGCATTTGAAGCTTTTCTCTCGCCGTTTGAAAAGGGAGCCACTTGAAGCTAATGTTACAGAGGGGGAGGGTTGTGGTTTGTTTTATTTCGTCTCTAAACTGTGCC-TTTTTTTTCCCCTTCGGGTCACGTCGTCTGGTTTTGTCTGTGTCGACTCCTGAGTTCTGGGTGTGAGAAGCCACCTCACAACGACGTAGCGCTTACTTTATGCACACGTGTCTTAAAGGCTTGAGACACAGAAAACTCAAATGTTTCATATCTTCGTTTGCACATTACAACCAGAATGCTGATCAGAGAGGGAGCGAGAGCTGCTGCTGCTAGCTGAGGAAGCTGTCGTGTTCGTAGTTCTGCTTGACAACTGTGTCCTGCTCATACAGTCTTCCGATCGCCTCGCCATTCACGTAACGGCG--GC-CTGCAGCCGATTGTTGAAACTGAACATTCCATTTTAATATTGCCGTGTTGCAGTTTGAAGATATTTAAATTTTGTTTGTATATTTCGAGTCATGTTCTAGTTTTAATGTATATTAAAGAGGACAAAAAGAGTATGCTTAAATATGTATATGTAACTATTCATGTTAAATGTACTGTAAATTGTAATTTGAAGATTTATGTGACCATGTTTGGTTTGCAATAAAAGGTGA] [+] EMBL CA845127 [GGCGAAAGCCTCCACTGACCCAGATTTACCAACGCACAAGTTCTTCAACCAACCCCAACAGACGTAGATGCTCGGCAGACTTCAATTTTCTTACTGATAGTGGAGATCTTTTGCACATAGCTGAGGCAGCTTAGGAGACTACCTGGACCCTGCAGAGACAAGCACACAGCAGCTCCTGTCCCCAAAGAAAAACCAAGGCCGGGCAGCACCGAACCAGCTCTGAGAAGGATTCTCATCTTCTTCCATGTAGCAGTTCTGTGTACAGGAGCTCACCTGTTAGCATTTGAAGCTTTTCTCTCGCCGTTTGAAAAGGGAGCCACTTGAAGCTAATGTTACAGAGGGGGAGGGTTGTGGTTTGTTTTATTTCGTCTCTAAACTGTGCC TTTTTTTTCCCCTTCGGGTCACGTCGTCTGGTTTTGTCTGTGTCGACTCCTGAGTTCTGGGTGTGAGAAGCCACCTCACAACGACGTAGCGCTTACTTTATGCACACGTGTCTTAAAGGCTTGAGACACAGAAAACTCAAATGTTT ] [-] EMBL CA331762 [ TGTGGTTTGTTTTATTTCGTCTCTAAACTGTGCCTTTTTTTTTCCCCTTCGGGTCACGTCGTCTGGTTTTGTCTGTGTCGACTCCTGAGTTCTGGGTGTGAGAAGCCACCTCACAACGACGTAGCGCTTACTTTATGCACACGTGTCTTAAAGGCTTGAGACACAGAAAACTCAAATGTTTCATATCTTCGTTTGCACATTACAACCAGAATGCTGATCAGAGAGGGAGCGAGAGCTGCTGCTGCTAGCTGAGGAAGCTGTCGTGTTCGTAGTTCTGCTTGACAACTGTGTCCTGCTCATACAGTCTTCCGATCGCCTCGCCATTCACGTAACGGCG GC CTGCAGCCGATTGTTGAAACTGAACATTCCATTTTAATATTGCCGTGTTGCAGTTTGAAGATATCTAAATTTTGTTTGTATATTTCGAGTCATGTTCTAGTTTTAATGTATATTAAAGAGGACAAAAAGAGTATGCTAAAATATGTATATGTAACTATTCATGTTAAATGTACTGTAAATTGTAATTTGAAGATTTATGTGACCATGTTTGGTTTGCAATAAAAGGTG ] [-] EMBL CA329194 [ TGTGGTTTGTTTTATTTCGTCTCTAAACTGTGCC TTTTTTTTCCCCTTCGGGTCACGTCGTCTGGTTTTGTCTGTGTCGACTCCTGAGTTCTGGGTGTGAGAAGCCACCTCACAACGACGTAGCGCTTACTTTATGCACACGTGTCTTAAAGGCTTGAGACACAGAAAACTCAAATGTTTCATATCTTCGTTTGCACATTACAACCAGAATGCTGATCAGAGAGGGAGCGAGAGCTGCTGCTGCTAGCTGAGGAAGCTGTCGTGTTCGTAGTTCTGCTTGACAACTGTGTCCTGCTCATACAGTCTTCCGATCGCCTCGCCATTCACGTAACGGCG GC CTGCAGCCGATTGTTGAAACTGAACATTCCATTTTAATATTGCCGTGTTGCAGTTTGAAGATATTTAAATTTTGTTTGTATATTTCGAGTCATGTTCTAGTTTTAATGTATATTAAAGAGGACAAAAAGAGTATGCTTAAATATGTATATGTAACTATTCATGTTAAATGTACTGTAAATTGTAATTTGAAGATTTATGTG ] [-] EMBL CA332438 [ ACTCCTGAGTTCTGGGTGTGAGAAGCCACCTCACAACGACGTAGCGCTTACTTTATGCACACGTGTCTTAAAGGCTTGAGACACAGAAAACTCAAATGTTTCATATCTTCGTTTGCACATTACAACCAGAATGCTGATCAGAGAGGGAGCGAGAGCTGCTGCTGCTAGCTGAGGAAGCTGTCGTGTTCGTAGTTCTGCTTGACAACTGTGTCCTGCTCATACAGTCTTCCGATCGCCTCGCCATTCACGTAACGGCG GC CTGCAGCCGATTGTTGAAACTGAACATTCCATTTTAATATTGCCGTGTTGCAGTTTGAAGATATTTAAATTTTGTTTGTATATTTCGAGTCATGTTCTAGTTTTAATGTATATTAAAGAGGACAAAAAGAGTATGCTTAAATATGTATATGTAACTATTCATGTTAAATGTACTGTAAATTGTAATTTGAAGATTTATGTGACCATGTTTGGTTTGCAATAAAAGGTGA] [-] EMBL CA332462 [ CTTTATGCACACGTGTCTTAAAGGCTTGAGACACAGAAAACTCAAATGTTTCATATCTTCGTTTGCACATTACAACCAGAATGCTGATCAGAGAGGGAGCGAGAGCTGCTGCTGCTAGCTGAGGAAGCTGTCGTGTTCGTAGTTCTGCTTGACAACTGTGTCCTGCTCATACAGTCTTCCGATCGCCTCGCCATTCACGTAACGGCG ACAATACAGCCGATTGTTGAAACTGAACATTCCATTTTAATATTGCCGTGTTGCAGTTTGAAGATATTTAAATTTTGTTTGTATATTTCGAGTCATGTTCTAGTTTTAATGTATATTAAAGAGGACAAAAAGAGTATGCTTAAATATGTATATGTAACTATTCATGTTAAATGTACTGTAAATTGTAATTTGAAGATTTATGTGACCATGTTTGGTTTGCAATAA ] [-] EMBL CA332227 [ GCTGATCAGAGAGGGAGCGAGAGCTGCTGCTGCTAGCTGAGGAAGCTGTCGTGTTCGTAGTTCTGCTTGACAACTGTGTCCTGCTCATACAGTCTTCCGATCGCCTCGCCATTCACGTAACGGCGAAAC ATACAACCGATTGTTGAAACTGAACATTCCATTTTAATATTGCCGTGTTGCAGTTTGAAGATATTTAAATTTTGTTTGTATATTTCGAGTCATGTTCTAGTTTTAATGTATATTAAAGAGGACAAAAAGAGTATGCTTAAATATGTATATGTAACTATTCATGTTAAATGTACTGTAAATTGTAATTTGAAGATTTATGTGGCCGGGTAAGGTTTGCAATAAAAGGTGA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Data build on Sat Aug 9 00:50:02 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) |