These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Takifugu rubripes see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_2567#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 809 fasta sequence [CTTTCTTGTTTTCACAGCGGTTTCTGCCGTCTCTTCGTCGATGGTAGGAGGCTTTCAAGATGCGGATCCGAACGACGAACGAGTGAAAAACGCCCTGAACTTCGCTGTTGTTCAGCACAACAGAGCCTCCAACGACATGTACCTCAGCCAAGTGGCACAAGTGGTGAAGGTCCAGACTCAGGTTGTTTCTGGGATTAAATACGTCATAACTGCGAACATGGCAAGATCCGTGTGC-AGGAAGAGCGAAGCTCGGGAATTGTGTGAAATCCCGGAACATGCTCAGCCGTACCAGTGCACGTTCACCGTGTGGAGCAGACCATGGCTGAACCAGGTCCAACTGTTGAAGGAGACGTGTCCTCCTACAAATAACGTCTAATCAACATGGAAACTTTCTTGTGGATGAACCACAACAGTATTAATACACTATTTCTGCTTTGGCTGAACTGGGACTTTTAAAAGTTGTTTTCAGCATGAATTAGACTAAAATGATAGAGGTGTAACTTTTTGATACTAATATTACTAGCAGTAGTCTTCTGTTATCTACTTATGGAGTTAATTAAAATGATTTTAGATTATGTGTCCCTGAGTTTGTTATTATATTGGCCAAATAAAGCATATTTTTAAATTTGG-AAAAATTATGTTGAGAGGGGGAAAAATGCATTTGTTTGCAACATTTACCTATTGTTGGTTTAACATTTTTTAAAATACTCCTTTGTGTATATCTATACATGCATGTGGCATAATAAATAGCATTCATCGAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCCAAGGGGGGCCCCGGAACCAAGTTTTGGC] [+] EMBL CA330746 [CTTTCTTGTTTTCACAGCGGTTTCTGCCGTCTCTTCGTCGATGGTAGGAGGCTTTCAAGATGCGGATCCGAACGACGAACGAGTGAAAAACGCCCTGAACTTCGCTGTTGTTCAGCACAACAGAGCCTCCAACGACATGTACCTCAGCCAAGTGGCACAAGTGGTGAAGGTCCAGACTCAGGTTGTTTCTGGGATTAAATACGTCATAACTGCGAACATGGCAAGATCCGTGTGCTTTGAAGAGCGAAGCTCGGGAATTGTGTGAAATCCCGGAACATGCTCAGCCGTACCAGTGCACGTTCACCGTGTGGAGCAGACCATGGCTGAACCAGGTCCAACTGTTGAAGGAGACGTGTCCTCCTACAAATAACGTCTAATCAACATGGAAACTTTCTTGTGGATGAACCACAACAGTATTAATACACTATTTCTGCTTTGGCTGAACTGGGACTTTTAAAAGTTGTTTTCAGCATGAATTAGACTAAAATGATAGAGGTGTAACTTTTTGATACTAATATTACTAGCAGTAGTCTTCTGTTATCTACTTATGGAGTTAATTAAAATGATTTTAGATTATGTGTCCCTGAGT TTATTATATTGGCCAAATAAAGCATAT ] [+] EMBL CA845225 [ TCTTGTTTTCACAGCGGTTTCTGCCGTCTCTTCGTCGATGGTAGGAGGCTTTCAAGATGCGGATCCGAACGACGAACGAGTGAAAAACGCCCTGAACTTCGCTGTTGTTCAGCACAACAGAGCCTCCAACGACATGTACCTCAGCCAAGTGGCACAAGTGGTGAAGGTCCAGACTCAGGTTGTTTCTGGGATTAAATATGTCATAACTGCGAACATGGCAAGATCCGTGTGC AGGAAGAGCGAAGCTCGGGAATTGTGTGAAATCCCGGAACATGCTCAGCCGTACCAGTGCACGTTCACCGTGTGGAGCAGACCATGGCTGAACCAGGTCCAACTGTTGAAGGAGACGTGTCCTCCTACAAATAACGTCTAATCAACATGGAAACTTTCTTGTGGATGAACCACAACAGTATTAATACACTATTTCTGCTTTGGCTGAACTGGGACTTTTAAAAGTTGTTTTCAGCATGAATTAGA ] [-] EMBL CA588756 [ CTTGTTTTCACAGCGGTTTCTGCCGTCTCTTCGTCGATGGTAGGAGGCTTTCAAGATGCGGATCCGAACGACGAACGAGTGAAAAACGCCCTGAACTTCGCTGTTGTTCAGCACAACAGAGCCTCCAACGACATGTACCTCAGCCAAGTGGCACAAGTGGTGAAGGTCCAGACTCAGGTTGTTTCTGGGATTAAATATGTCATAACTGCGAACATGGCAAGATCCGTGTGC AGGAAGAGCGAAGCTCGGGAATTGTGTGAAATCCCGGAACATGCTCAGCCGTACCAGTGCACGTTCACCGTGTGGAGCAGACCATGGCTGAACCAGGTCCAACTGTTGAAGGAGACGTGTCCTCCTACAAATAACGTCTAATCAACATGGAAACTTTCTTGTGGATGAACCACAACAGTATTAATACACTATTTCTGCTTTGGCTGAACTGGGACTTTTAAAAGTTGTTTTCAGCATGAATTAGACTAAAATGATAGAGGTGTAACTTTTTGATACTAATATTACTAGCAGTAGTCTTCTGTTATCTACTTATGGAGTTAATTAAAATGATTTTAGATTATGTGTCCCTGAGTTTGTTATTATATTGGCCAAATAAAGCATATTTTTAAATT ] [+] EMBL FR0055412 [ CAGCGGTTTCTGCCGTCTCTTCGTCGATGGTAGGAGGCTTTCAAGATGCGGATCCGAACGACGAACGAGTGAAAAACGCCCTGAACTTCGCTGTTGTTCAGCACAACAGAGCCTCCAACGACATGTACCTCAGCCAAGTGGCACAAGTGGTGAAGGTCCAGACTCAGGTTGTTTCTGGGATTAAATACGTCATAACTGCGAACATGGCAAGATCCGTGTGC AGGAAGAGCGAAGCTCGGGAATTGTGTGAAATCCCGGAACATGCTCAGCCGTACCAGTGCACGTTCACCGTGTGGAGCAGACCATGGCTGAACCAGGTCCAACTGTTGAAGGAGACGTGTCCTCCTACAAGTGAGGTCTAATCAGCATG ] [+] EMBL FR0055483 [ ACGAGGCACATGGCAGGATCCGTGTGC AGGAAGAGCGAAGCTCGGGAATTGTGTGAAATCCCGGAACATGCTCAGCCGTACCAGTGCACGTTCACCGTGTGGAGCAGACCATGGCTGAACCAGGTCCAACTGTTGAAGGAGACGTGTCCTCCTACAAATAACGTCTAATCAGCATGGAAACTTTCTTGTGGATGAACCACAACAGTATTAATACACTATTTCTGCTTTGGGTGAACTGGGACTTTTAAAAGTTGTTTTCAGCATGAATTAGACTAAAATGATAGAGGTGTAACTTTTTGATACTAATATTACTAGCAGTAGTCTTCTGTTATCTACTTATGGAGTTAATTAAAATGATTTTAGATTATGTGTCCCTGAGTTTGTTATTATATTGGCCACATATAGCATATTTTTAAATTTGC GAGAATTATGTTGAGAGGGCGACAAGTGCATTTGTT ] [-] EMBL CA588882 [ CGAAGCTCGGGAATTGTGTGAAATCCCGGAACATGCTCAGCCGTACCAGTGCACGTTCACCGTGTGGAGCAGACCATGGCTGAACCAGGTCCAACTGTTGAAGGAGACGTGTCCTCCTACAAATAACGTCTAATCAACATGGAAACTTTCTTGTGGATGAACCACAACAGTATTAATACACTATTTCTGCTTTGGCTGAACTGGGACTTTTAAAAGTTGTTTTCAGCATGAATTAGACTAAAATGATAGAGGTGTAACTTTTTGATACTAATATTACTAGCAGTAGTCTTCTGTTATCTACTTATGGAGTTAATTAAAATGATTTTAGATTATGTGTCCCTGAGTTTGTTATTATATTGGCCAAATAAAGCATATTTTTAAATTTGG AAAAATTATGTTGAGAGGGGGAAAAATGCATTTGTTTGCAACATTTACCTATTATGG ] [+] EMBL FR0055335 [ AACGTCTAATCAACATGGAAACTTTCTTGTGGATGAACCACAACAGTATTAATACACTATTTCTGCTTTGGCTGAACTGGGACTTTTAAAAGTTGTTTTCAGCATGAATTAGACTAAAATGATAGAGGTGTAACTTTTTGATACTAATATTACTAGCAGTAGTCTTCTGTTATCTACTTATGGAGTTAATTAAAATGATTTTAGATTATGTGTCCCTGAGT TTATTATATTGGCCAAATAAAGCATATTTTTAAATTTGGAAAAAATTATGTTGAGAGGGGGAAAAATGCATTTGTTTGCAACATTTACCTATTGTTGGTTTAACATTTTTTAAAATACTCCTTTGTGTATATCTATACATGCATGTGGCATAATA ] [+] EMBL FR0057646 [ CCTATTGTTGGTTTAACATTTTTTAAAATACTCCTTTGTGTATATCTATACATGCATGTGGCATAATAAATAGCATTCATCGAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCCAAGGGGGGCCCCGGAACCAAGTTTTGGC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Data build on Sat Aug 9 00:50:02 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) |