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Takifugu rubripes
cluster # 2567 cluster # 2567       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2567#0 length = 809 sequences # 8  

consensusID : consensus_2567#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 809
fasta sequence
                              [CTTTCTTGTTTTCACAGCGGTTTCTGCCGTCTCTTCGTCGATGGTAGGAGGCTTTCAAGATGCGGATCCGAACGACGAACGAGTGAAAAACGCCCTGAACTTCGCTGTTGTTCAGCACAACAGAGCCTCCAACGACATGTACCTCAGCCAAGTGGCACAAGTGGTGAAGGTCCAGACTCAGGTTGTTTCTGGGATTAAATACGTCATAACTGCGAACATGGCAAGATCCGTGTGC-AGGAAGAGCGAAGCTCGGGAATTGTGTGAAATCCCGGAACATGCTCAGCCGTACCAGTGCACGTTCACCGTGTGGAGCAGACCATGGCTGAACCAGGTCCAACTGTTGAAGGAGACGTGTCCTCCTACAAATAACGTCTAATCAACATGGAAACTTTCTTGTGGATGAACCACAACAGTATTAATACACTATTTCTGCTTTGGCTGAACTGGGACTTTTAAAAGTTGTTTTCAGCATGAATTAGACTAAAATGATAGAGGTGTAACTTTTTGATACTAATATTACTAGCAGTAGTCTTCTGTTATCTACTTATGGAGTTAATTAAAATGATTTTAGATTATGTGTCCCTGAGTTTGTTATTATATTGGCCAAATAAAGCATATTTTTAAATTTGG-AAAAATTATGTTGAGAGGGGGAAAAATGCATTTGTTTGCAACATTTACCTATTGTTGGTTTAACATTTTTTAAAATACTCCTTTGTGTATATCTATACATGCATGTGGCATAATAAATAGCATTCATCGAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCCAAGGGGGGCCCCGGAACCAAGTTTTGGC]

[+] EMBL CA330746             [CTTTCTTGTTTTCACAGCGGTTTCTGCCGTCTCTTCGTCGATGGTAGGAGGCTTTCAAGATGCGGATCCGAACGACGAACGAGTGAAAAACGCCCTGAACTTCGCTGTTGTTCAGCACAACAGAGCCTCCAACGACATGTACCTCAGCCAAGTGGCACAAGTGGTGAAGGTCCAGACTCAGGTTGTTTCTGGGATTAAATACGTCATAACTGCGAACATGGCAAGATCCGTGTGCTTTGAAGAGCGAAGCTCGGGAATTGTGTGAAATCCCGGAACATGCTCAGCCGTACCAGTGCACGTTCACCGTGTGGAGCAGACCATGGCTGAACCAGGTCCAACTGTTGAAGGAGACGTGTCCTCCTACAAATAACGTCTAATCAACATGGAAACTTTCTTGTGGATGAACCACAACAGTATTAATACACTATTTCTGCTTTGGCTGAACTGGGACTTTTAAAAGTTGTTTTCAGCATGAATTAGACTAAAATGATAGAGGTGTAACTTTTTGATACTAATATTACTAGCAGTAGTCTTCTGTTATCTACTTATGGAGTTAATTAAAATGATTTTAGATTATGTGTCCCTGAGT   TTATTATATTGGCCAAATAAAGCATAT                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CA845225             [   TCTTGTTTTCACAGCGGTTTCTGCCGTCTCTTCGTCGATGGTAGGAGGCTTTCAAGATGCGGATCCGAACGACGAACGAGTGAAAAACGCCCTGAACTTCGCTGTTGTTCAGCACAACAGAGCCTCCAACGACATGTACCTCAGCCAAGTGGCACAAGTGGTGAAGGTCCAGACTCAGGTTGTTTCTGGGATTAAATATGTCATAACTGCGAACATGGCAAGATCCGTGTGC AGGAAGAGCGAAGCTCGGGAATTGTGTGAAATCCCGGAACATGCTCAGCCGTACCAGTGCACGTTCACCGTGTGGAGCAGACCATGGCTGAACCAGGTCCAACTGTTGAAGGAGACGTGTCCTCCTACAAATAACGTCTAATCAACATGGAAACTTTCTTGTGGATGAACCACAACAGTATTAATACACTATTTCTGCTTTGGCTGAACTGGGACTTTTAAAAGTTGTTTTCAGCATGAATTAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CA588756             [    CTTGTTTTCACAGCGGTTTCTGCCGTCTCTTCGTCGATGGTAGGAGGCTTTCAAGATGCGGATCCGAACGACGAACGAGTGAAAAACGCCCTGAACTTCGCTGTTGTTCAGCACAACAGAGCCTCCAACGACATGTACCTCAGCCAAGTGGCACAAGTGGTGAAGGTCCAGACTCAGGTTGTTTCTGGGATTAAATATGTCATAACTGCGAACATGGCAAGATCCGTGTGC AGGAAGAGCGAAGCTCGGGAATTGTGTGAAATCCCGGAACATGCTCAGCCGTACCAGTGCACGTTCACCGTGTGGAGCAGACCATGGCTGAACCAGGTCCAACTGTTGAAGGAGACGTGTCCTCCTACAAATAACGTCTAATCAACATGGAAACTTTCTTGTGGATGAACCACAACAGTATTAATACACTATTTCTGCTTTGGCTGAACTGGGACTTTTAAAAGTTGTTTTCAGCATGAATTAGACTAAAATGATAGAGGTGTAACTTTTTGATACTAATATTACTAGCAGTAGTCTTCTGTTATCTACTTATGGAGTTAATTAAAATGATTTTAGATTATGTGTCCCTGAGTTTGTTATTATATTGGCCAAATAAAGCATATTTTTAAATT                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL FR0055412            [              CAGCGGTTTCTGCCGTCTCTTCGTCGATGGTAGGAGGCTTTCAAGATGCGGATCCGAACGACGAACGAGTGAAAAACGCCCTGAACTTCGCTGTTGTTCAGCACAACAGAGCCTCCAACGACATGTACCTCAGCCAAGTGGCACAAGTGGTGAAGGTCCAGACTCAGGTTGTTTCTGGGATTAAATACGTCATAACTGCGAACATGGCAAGATCCGTGTGC AGGAAGAGCGAAGCTCGGGAATTGTGTGAAATCCCGGAACATGCTCAGCCGTACCAGTGCACGTTCACCGTGTGGAGCAGACCATGGCTGAACCAGGTCCAACTGTTGAAGGAGACGTGTCCTCCTACAAGTGAGGTCTAATCAGCATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL FR0055483            [                                                                                                                                                                                                                ACGAGGCACATGGCAGGATCCGTGTGC AGGAAGAGCGAAGCTCGGGAATTGTGTGAAATCCCGGAACATGCTCAGCCGTACCAGTGCACGTTCACCGTGTGGAGCAGACCATGGCTGAACCAGGTCCAACTGTTGAAGGAGACGTGTCCTCCTACAAATAACGTCTAATCAGCATGGAAACTTTCTTGTGGATGAACCACAACAGTATTAATACACTATTTCTGCTTTGGGTGAACTGGGACTTTTAAAAGTTGTTTTCAGCATGAATTAGACTAAAATGATAGAGGTGTAACTTTTTGATACTAATATTACTAGCAGTAGTCTTCTGTTATCTACTTATGGAGTTAATTAAAATGATTTTAGATTATGTGTCCCTGAGTTTGTTATTATATTGGCCACATATAGCATATTTTTAAATTTGC GAGAATTATGTTGAGAGGGCGACAAGTGCATTTGTT                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CA588882             [                                                                                                                                                                                                                                                    CGAAGCTCGGGAATTGTGTGAAATCCCGGAACATGCTCAGCCGTACCAGTGCACGTTCACCGTGTGGAGCAGACCATGGCTGAACCAGGTCCAACTGTTGAAGGAGACGTGTCCTCCTACAAATAACGTCTAATCAACATGGAAACTTTCTTGTGGATGAACCACAACAGTATTAATACACTATTTCTGCTTTGGCTGAACTGGGACTTTTAAAAGTTGTTTTCAGCATGAATTAGACTAAAATGATAGAGGTGTAACTTTTTGATACTAATATTACTAGCAGTAGTCTTCTGTTATCTACTTATGGAGTTAATTAAAATGATTTTAGATTATGTGTCCCTGAGTTTGTTATTATATTGGCCAAATAAAGCATATTTTTAAATTTGG AAAAATTATGTTGAGAGGGGGAAAAATGCATTTGTTTGCAACATTTACCTATTATGG                                                                                                                          ]
[+] EMBL FR0055335            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AACGTCTAATCAACATGGAAACTTTCTTGTGGATGAACCACAACAGTATTAATACACTATTTCTGCTTTGGCTGAACTGGGACTTTTAAAAGTTGTTTTCAGCATGAATTAGACTAAAATGATAGAGGTGTAACTTTTTGATACTAATATTACTAGCAGTAGTCTTCTGTTATCTACTTATGGAGTTAATTAAAATGATTTTAGATTATGTGTCCCTGAGT   TTATTATATTGGCCAAATAAAGCATATTTTTAAATTTGGAAAAAATTATGTTGAGAGGGGGAAAAATGCATTTGTTTGCAACATTTACCTATTGTTGGTTTAACATTTTTTAAAATACTCCTTTGTGTATATCTATACATGCATGTGGCATAATA                                                                ]
[+] EMBL FR0057646            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CCTATTGTTGGTTTAACATTTTTTAAAATACTCCTTTGTGTATATCTATACATGCATGTGGCATAATAAATAGCATTCATCGAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCCAAGGGGGGCCCCGGAACCAAGTTTTGGC]


>consensus_2567#0 CTTTCTTGTTTTCACAGCGGTTTCTGCCGTCTCTTCGTCGATGGTAGGAGGCTTTCAAGA TGCGGATCCGAACGACGAACGAGTGAAAAACGCCCTGAACTTCGCTGTTGTTCAGCACAA CAGAGCCTCCAACGACATGTACCTCAGCCAAGTGGCACAAGTGGTGAAGGTCCAGACTCA GGTTGTTTCTGGGATTAAATACGTCATAACTGCGAACATGGCAAGATCCGTGTGCAGGAA GAGCGAAGCTCGGGAATTGTGTGAAATCCCGGAACATGCTCAGCCGTACCAGTGCACGTT CACCGTGTGGAGCAGACCATGGCTGAACCAGGTCCAACTGTTGAAGGAGACGTGTCCTCC TACAAATAACGTCTAATCAACATGGAAACTTTCTTGTGGATGAACCACAACAGTATTAAT ACACTATTTCTGCTTTGGCTGAACTGGGACTTTTAAAAGTTGTTTTCAGCATGAATTAGA CTAAAATGATAGAGGTGTAACTTTTTGATACTAATATTACTAGCAGTAGTCTTCTGTTAT CTACTTATGGAGTTAATTAAAATGATTTTAGATTATGTGTCCCTGAGTTTGTTATTATAT TGGCCAAATAAAGCATATTTTTAAATTTGGAAAAATTATGTTGAGAGGGGGAAAAATGCA TTTGTTTGCAACATTTACCTATTGTTGGTTTAACATTTTTTAAAATACTCCTTTGTGTAT ATCTATACATGCATGTGGCATAATAAATAGCATTCATCGAAAAAAAAAAAAAAAAAACCC CAAGGGGGGCCCCGGAACCAAGTTTTGGC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Sat Aug 9 00:50:02 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)