Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Takifugu rubripes
cluster # 2597 cluster # 2597       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2597#0 length = 578 sequences # 8  

consensusID : consensus_2597#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 578
fasta sequence
                              [GCCAAAAATTGGGTTCCGGGCCCCCCCCGGGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCATTTTTTTGTTGTTTTTTTATTTAAAAGCCATTTGTGTGAGATTTTCAGGCGGCACAACTGGCATAGTACAGTTTGAATGAATGCAGGCATGATAGAAACCTAAAGATGGAGTGTACGGGCGTAAAATATAGTCGTTGTGAACAAAAACGAGACACACTAACGCAACAGTAGAACGTTAAACTGTCTAATGTTGGTGCTGACAAATGGCTTCATTTCCTAATTTATCGACTTAAATCAAAAATATAAAGGCAACATTAGCTAAAACTAATTAATTTTTTTTTAAAAACCCAAGTCCATCAATTAAAAATCTACAGGAACTATTTGGCTACAGATTGCTGGGCCCAGCTGTGACTGCCATTCAGACGGGTAACCATGGCAACCTTGTGGGGGATAATTTTGTTTTTTGGCACTGAAGTTAAAAGTCTTAAAACAAAAACAGGAAGTGCTTTGCAGGTAAGAAAGAGTCACACAGGTAGAAATAAAGCCTGGGGCCGGCGTTTGCTCAGAAACGTTTTCGG]

[-] EMBL FR0056683            [GCCAAAAATTGGGTTCCGGGCCCCCCCCGGGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCATTTTTTTGTTGTTTTTTTATTTAAAAGCCATTTGTGTGAGATTTTCAGGCGGCACAACTGGCATAGTACAGTTTGAATGAATGCAGGCATGATAGAAACCTAAAGATGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CA332534             [                                                            TTTTTTTGTTGTTTTTTTATTTAAAAGCCATTTGTGTGAGATTTTCAGGCGGCACAACTGGCATAGTACAGTTTGAATGAATGCAGGCATGATAGAAACCTAAAGATGGAGTGTACGGGCGTAAAATATAGTCGTTGTGAACAAAAACGAGACACACTAACGCAACAGTAGAATGTTAAACTGTCTAATGTTGGTGCTGACAAATGGCTTCATTTCCTAATTTATCGACTTAAATCAAAAATATAAAGGCAACATTAGCTAAAACTAATTAATTTTTTTTTAAAAACCCAAGTCCGTCAATTAAAAATCTACAGGAACTATTTGGCTACAGATTGCTGGGCCCAGCTGTGACTGCCATTCAGACGGGTAACCATGGCAACCTTGTGGGGGATAATTTTGTTTTTTGGCACTGAAGTTAAAAGTCTTAAAACAAAA                                                                                   ]
[+] EMBL CA332177             [                                                              TTTTTGTTGTTTTTTTATTTAAAAGCCATTTGTGTGAGATTTTCAGGCGGCACAACTGGCATAGTACAGTTTGAATGAATGCAGGCATGATAGAAACCTAAAGATGGAGTGTACGGGCGTAAAATATAGTCGTTGTGAACAAAAACGAGACACACTAACGCAACAGTAGAACGTTAAACTGTCTAATGTTGGTGCTGACAAATGGCTTCATTTCCTAATTTATCGACTTAAATCAAAAATATAAAGGCAACATTAGCTAAAACTAATTAA  TTTTTTTAAAAACCCAAGTCCATCAATTAAAAATCTACAGGAACTATTTGGCTACAGATTGCTGGGCCCAGCTGTGACTGCCATTCAGACGGGTAACCATGGCAACCTTGTGGGGGATAATTTTGTTTTTTGGCACTGAAGTTAAAAGTCTTAAAACAAAAACA                                                                                ]
[+] EMBL CA331906             [                                                                 TTGGTGGTTTTTTATTTAAAAGCCATTTGTGTGAGATTTTCAGGCGGCACAACTGGCATAGTACAGTTTGAATGAATGCAGGCATGATAGAAACCTAAAGATGGAGTGTACGGGCGTAAAATATAGTCGTTGTGAACAAAAACGAGACACACTAACGCAACAGTAGAACGTTAAACTGTCTAATGTTGGTGCTGACAAATGGCTTCATTTCCTAATTTATCGACTTAAATCAAAAATATAAAGGCAACATTAGCTAAAACTAATTAATTTTTTTTTAAAAACCCAAGTCCATCAATTAAAAATCTACAGGAACTATTTGGCTACAGATTGCTGGGCCCAGCTGTGACTGCCATTCAGACGGGTAACCATGGCAACCTTGTGGGGGATAATTTTGTTTTTTGGCACTGAAGTTAAAAGTCTTAAAACAAAAACAGGAAGTGCTTTGCAGGTAA                                                             ]
[+] EMBL CA333003             [                                                                        TTTTTTATTTAAAAGCCATTTGTGTGAGATTTTCAGGCGGCACAACTGGCATAGTACAGTTTGAATGAATGCAGGCATGATAGAAACCTAAAGATGGAGTGTACGGGCGTAAAATATAGTCGTTGTGAACAAAAACGAGACACACTAACGCAACAGTAGAACGTTAAACTGTCTAATGTTGGTGCTGACAAATGGCTTCATTTCCTAATTTATCGACTTAAATCAAAAATATAAAGGCAACATTAGCTAAAACTAATTAATTTTTTTTCAAAAACCCAAGTCCATCAATTAAAAATCTACAGGAACTATTTGGCTACAGATTGCTGGGCCCAGCTGTGACTGCCATTCAGACGGGTAACCATGGCAACCTTGTGGGGGATAATTTTGTTTTTTGGCACTGAAGTTAAAAGTCTTAAAACAAAAACAGGAAGTG                                                                         ]
[+] EMBL CA331946             [                                                                       gTTTTTTATTTAAAAGCCATTTGTGTGAGATTTTCAGGCGGCACAACTGGCATAGTACAGTTTGAATGAATGCAGGCATGATAGAAACCTAAAGATGGAGTGTACGGGCGTAAAATATAGTCGTTGTGAACAAAAACGAGACACACTAACGCAACAGTAGAACGTTAAACTGTCTAATGTTGGTGCTGACAAATGGCTTCATTTCCTAATTTATCGACTTAAATCAAAAATATAAAGGCAACATTAGCTAAAACTAATTAATTTTTTTTTAAAAACCCAAGTCCATCAATTAAAAATCTACAGGAACTATTTGGCTACAGATTGCTGGGCCCAGCTGTGACTGCCATTCAGACGGGTAACCATGGCAACCTTGTGGGGGATAATTTTGTTTTTTGGCACTGAAGTTAAAAG                                                                                                ]
[+] EMBL CA332602             [                                                                          TTTTATTTAAAAGCCATTTGTGTGAGATTTTCAGGCGGCACAACTGGCATAGTACAGTTTGAATGAATGCAGGCATGATAGAAACCTAAAGATGGAGTGTACGGGCGTAAAATATAGTCGTTGTGAACAAAAACGAGACACACTAACGCAACAGTAGAATGTTAAACTGTCTAATGTTGGTGCTGACAAATGGCTTCATTTCCTAATTTATCGACTTAAATCAAAAATATAAAGGCAACATTAGCTAAAACTAATTAATTTTTTTTTAAAAACCCAAGTCCGTCAATTAAAAATCTACAGGAACTATTTGGCTACAGATTGCTGGGCCCAGCTGTGACTGCCATTCAGACGGGTAACCATGGCAACCTTGTGGGGGATAATTTTGTTTTTTGGCACTGAAGTTAAAAGTCTTAAAACAAAAACAGGAAGTGCT                                                                       ]
[-] EMBL CA845395             [                                                                                                                              TACAGTTTGAATGAATGCAGGCATGATAGAAACCTAAAGATGGAGTGTACGGGCGTAAAATATAGTCGTTGTGAACAAAAACGAGACACACTAACGCAACAGTAGAACGTTAAACTGTCTAATGTTGGTGCTGACAAATGGCTTCATTTCCTAATTTATCGACTTAAATCAAAAATATAAAGGCAACATTAGCTAAAACTAATTAA TTTTTTTTAAAAACCCAAGTCCATCAATTAAAAATCTACAGGAACTATTTGGCTACAGATTGCTGGGCCCAGCTGTGACTGCCATTCAGACGGGTAACCATGGCAACCTTGTGGGGGATAATTTTGTTTTTTGGCACTGAAGTTAAAAGTCTTAAAACAAAAACAGGAAGTGCTTTGCAGGTAAGAAAGAGTCACACAGGTAGAAATAAAGCCTGGGGCCGGCGTTTGCTCAGAAACGTTTTCGG]


>consensus_2597#0 GCCAAAAATTGGGTTCCGGGCCCCCCCCGGGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCA TTTTTTTGTTGTTTTTTTATTTAAAAGCCATTTGTGTGAGATTTTCAGGCGGCACAACTG GCATAGTACAGTTTGAATGAATGCAGGCATGATAGAAACCTAAAGATGGAGTGTACGGGC GTAAAATATAGTCGTTGTGAACAAAAACGAGACACACTAACGCAACAGTAGAACGTTAAA CTGTCTAATGTTGGTGCTGACAAATGGCTTCATTTCCTAATTTATCGACTTAAATCAAAA ATATAAAGGCAACATTAGCTAAAACTAATTAATTTTTTTTTAAAAACCCAAGTCCATCAA TTAAAAATCTACAGGAACTATTTGGCTACAGATTGCTGGGCCCAGCTGTGACTGCCATTC AGACGGGTAACCATGGCAACCTTGTGGGGGATAATTTTGTTTTTTGGCACTGAAGTTAAA AGTCTTAAAACAAAAACAGGAAGTGCTTTGCAGGTAAGAAAGAGTCACACAGGTAGAAAT AAAGCCTGGGGCCGGCGTTTGCTCAGAAACGTTTTCGG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Sat Aug 9 00:50:02 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)