ViewVC Help
View File | Revision Log | Show Annotations | View Changeset | Root Listing
root/gclib/seqalign/itest.2line
(Generate patch)
# Line 1 | Line 1
1 < # v test:
2 <                                      ACTGCTAGACTATGACA
3 < ATCGTAGCTGTGCTAGTGCTGTGACCATAACCGACTCGACTGCTA
4 <
5 <
6 < # simple test:
7 <        ACTCT-CTGACTATGACA
8 < CATAACCGACTCGACTG-CTANC
9 <
10 < # simple test:
11 <                                                                                                                               TATGATGAACTATGACACTGATGCTGATG
12 < ACTCGTGATCGTGATCGTGACTGCTGTAGCTGCTAGTGCTGATCGTGCTAGTCGTAGTCGTGTGTAGCTGACTGACTGACTGTAGTGCGCTAGTGCTAGCCCTGCACTCGAACCGACTGCACTGAGCTATGNTG
1 > # current test:
2 >                                                                                                       GTACTCT-CTGAC-GAATCGTGCAGGGC
3 > ACTCGTGATCGTGATCGTGACTGCTGTAGCTGCTAGTGCTGATCGTGCTAGTCGTAGTCGTGTGTAGCTGACTGACTGACTGTAGTGCGCTAGTGCTAGCCGGGTACTCGACTG-CTGAATCNTGC
4  
5   #ctest
6        GGCGACAGCCT-TAGCATG-AGTAGACATACATA
7   CGGGTACTCGACTG-CTGTAGCATGCNGTAGTG
8  
18
9   # simple test:
10             ACTGC-CTGAACTATGACACTGATGCTGATG
11   CACTCGAACCGACTGCACTGA-CTATGA
# Line 24 | Line 14
14        GGCGACAGCCT-TAGCATG-AGTAGACATACATA
15   CGGGTACTCGACTG-CTGTAGCATGCNGTAGTG
16  
17 < # current test:
18 <                                                                                                       GTACTCT-CTGAC-GAATCGTGCAGGGC
19 < ACTCGTGATCGTGATCGTGACTGCTGTAGCTGCTAGTGCTGATCGTGCTAGTCGTAGTCGTGTGTAGCTGACTGACTGACTGTAGTGCGCTAGTGCTAGCCGGGTACTCGACTG-CTGAATCNTGC
17 > # simple test:
18 >                                                                                                                               TATGATGAACTATGACACTGATGCTGATG
19 > ACTCGTGATCGTGATCGTGACTGCTGTAGCTGCTAGTGCTGATCGTGCTAGTCGTAGTCGTGTGTAGCTGACTGACTGACTGTAGTGCGCTAGTGCTAGCCCTGCACTCGAACCGACTGCACTGAGCTATGNTG
20 >
21 > # v test:
22 > ATCGTAGCTGTGCTAGTGCTGTGACCATAACCGACTCGACTGCTA
23 > ATCGTAGCTGTG-TAGTGCTGTGACCATANCCGACTCGACTGCTA
24 >
25 > # v test:
26 >                                      ACTGCTAGACTATGACA
27 > ATCGTAGCTGTGCTAGTGCTGTGACCATAACCGACTCGACTGCTA
28 >
29 > # simple gap test:
30 >        ACTCT-CTGACTATGACA
31 > CATAACCGACTCGACTG-CTANC
32  
33  
34  

Diff Legend

Removed lines
+ Added lines
< Changed lines
> Changed lines