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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10023#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 13 consensus length = 731 fasta sequence
[ACTCTTTGAGTCATGATTACATACGTCGGCGTCTTTAGTTGTTTGGTTACATTTCTACCATTCGTTCATATGGTTACTCTTGAACAAGCTATGTCAGATCCTGATAAATATATAAGATATGATACAGGTGATTTCAATATTGGAATGCATGTTGGACTTTCATTATTAATAAATTATGGAATTCTATCAACTGCAGTTTTATT-CATAGTTATAGTATCCAAAGCTCTTGGATATAAAAGGAAACGACACGGTTAGAAATAAAAGGTATTTTCATCTACGTGTTTGGATGTTA-TTTTTTTTTCTTCTGTTCAGTGTTATTTCTTTTCCTTTTACAACTTTAGTTTTGTTATACATATTGATTAGTAGTTGAAGTATTGGTTAATCTAATAAACAGAAATGAATGATTTCACGTTCCCCTTTTTTTTACCCAAATTTTCGTGATTATGTAATGAGTTCATATGTTATGTCTAG-TTTGTATTCCACTTGATGTAACTTACTTTGGAATGCCATATATAATTGGACGTCTGTACACATGCGCACACACACACACATACATACGTACCCACTCATGCGCGCACACACACTCACGCCCACAACTACATATACCCAGAAATGGAAAGAACTTTGTCAACATTGTTTTTTCTTGTTACTAATTATCAGAAACTTAATTATCATTATTATTGAATAAATATTAAAATTTGTAAAAAAATAACAATGTAAAAAAAAAAAAN]
[+] EMBL CD185705 [ACTCTTTGAGTCATGATTACATACGTCGGCGTCTTTAGTTGTTTGGTTACATTTCTACCATTCGTTCATATGGTTACTCTTGAACAAGCTATGTCAGATCCTGATAAATATATAAGATATGATACAGGTGATTTCAATATTGGAATGCATGTTGGTCTTTCATTATTAATAAATTATGGAATTCTATCGACTGCAGTTTTATT CATAGTTATAGTATCCAAAGCTCTTGGATATAAAAGGAAACGACACGGTTAGAAATAAAAGGTATTTTCATCTACGTGTTTGGATGTTATTTTTTTTTTCTTCTGTTCAGTGTTATTTCTTTTCCTTTTACAACTTTAGTTTTGTTATACATATTGATTAGTAGTTGAAGTATTGGTTTATCTAATAAACAGAAATGAATGATTTCACGTTCCCCTTTTTTTTACCCAAATTTTCGTGATTATGTAATGAGTTCATATGTTATGTCTAG TTTGTATTCCACTTGATGTAACTTACTTTGGAATGCCATATATAATTGGACGTCTGTACACATGCGCACACACACACACATACATACGTACCCACTCATGCGCGCACACACACTCACGCCCACA ]
[+] EMBL CD157577 [ACTCTTTGAGTCATGATTACATACGTCGGCGTCTTTAGTTGTTTGGTTACATTTCTACCATTCGTTCATATGGTTACTCTTGAACAAGCTATGTCA ]
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[+] EMBL CD183215 [ TCTTTGAGTCATGATTACATACGTCGGCGTCTTTAGTTGTTTGGTTACATTTCTACCATTCGTTCATATGGTTACTCTTGAACAAGCTATGTCAGATCCTGATAAATATATAAGATATGATACAGGTGATTTCAATATTGGAATGCATGTTGGACTTTCATTATTAATAAATTATGGAATTCTATCAACTGCAGTTTTATT CATAGTTATAGTATCCAAAGCTCTTGGATATAAAAGGAAACGACACGGTTAGAAATAAAAGGTATTTTCATCTACGTGTTTGGATGTTA TTTTTTTTCTTCTGTTCAGTGTTATTTCTTTTCCTTTTACAACTTTAGTTTTGTTATACATATTGATTAGTAGTTGAAGTATTGGTTAATCTAATAAACAGAAATGAATGATTTCACGTTCCCCTTTTTTTTACCCAAATTTTCGTGATTATGTAATGAGTTCATATGTTATGTCTAG TTTGGATTCCACTTGATGTAACTTACTTTGGAATGCCATATATAATTGGACGTCTGTACACATGCGCACACACACACACATACATACGTACCCACTCATGCGCGCACACACACTCACGCNCACAA ]
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[+] EMBL AA952766 [ TATTGCATAGTTATAGTATCCAAAGCTCTTGGATATAAAAGGAAACGACACGGTTAGAAATAAAAGGTATTTTCATCTACGTGTTTGGATGTTA TT ]
[-] EMBL CD200916 [ AAAAGGTATTTTCATCTACGTGTTTGGATGTTA TTTTTTTTTCTTCTGGTCAGTGTTATTTCTTTTCCTTTTACAACTTAAGTTTTGTTATACATATTGATTAGTAGTTGAAGTATTGGTTAATCTAATAAACAGAAATGAATGATTTCACGTTCCCC TTTTTTTACCCCAATTTTCGTGATTATGTAATGAGTTCATATGTTATGTCTAG TTTGTATTCCACCTGATGTAACTTACTTTGGAATGCCATATATAATTGGACGTGTGTACACATGCGCGCACACACACACATACATACGTGCCCACTCATGTGCGCGCACACAC ]
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[-] EMBL AI395297 [ cctTGTTCAGTGTTATTTCTTTTCCTTTTACAACGTTAGTTTTG TATACATATTGATTAGTAGTTGAGGTATTGGTTAATCTAATAAACAGAAATGATTGATTTCACGTTCCCCTTTTTTTTACCCAAATTTTCGTGATTATGTAATGAGTTCATATGTTATGTCTAG TTTGTATTCCACTTGATGTAACTTACTTTGGAATGCCATATATAATTGGACGTCTGTACACATGCGCACACACACACACATACATACGTACCCACTCATGCGCGCACACACACTCACGCCCACAACTACATATACCCAGAAATGGAAAGAACTTTGTCAACATTGTTTTTTCTTGTTACTAATTATCAGAAACTTAATTATCATTATTATTGAATAAATATTAAACTTTGTAAAAAAATAACAATGTAAAA ]
[-] EMBL AI067071 [ TTATACATATTGATTAGTAGTTGAAGTATTGGTTAATCTAGTAAACAGAAATGAATGATTTCACGTTCCCCTTTTTTTTACCCAAATTTTCGTGATTATGTAATGAGTTCATATGTTATGTCTAG TTTGTATTCCACTTGATGTAACTTACTTTGGAATGCCATATATAATTGGACGTCTGTACACATGCGCACACACACACACATACATACGTACCCACTCATGCGCGCACACACACTCACGCCCACAACTACATATACCCAGAAATGGAAAGAACTTTGTCAACATTGTTTTTTCTTGTTACTAATTATCAGAAACTTAATTATCA ]
[-] EMBL AI395562 [ tacaACATA TGGTTAGTAGTGGAAGTA TGGTTAATCTAATAAACAGGAATG ATGA TTCACGTT CCCTTTTTTTTACCCCAATTTTCGTGATTATGTAATGAGTTCATATGTTATGTCTAG TTTGTATCCCACTTGATGTAACTTACTTTGGAATGCCATATATAATTGGACGTCTGTACACATGCGCACACACACACACATACATACGTACCCACTCATGCGCGCACACACACTCACGCCCACAACTACATATACCCAGAAATGGAAAGAACTTTGTCAACATTGTTTTTTCTTGTTACTAATTATCAGAAACTTAATTATCATTATTATTGAATAAATATTAAAATTTGT AATCAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAN]
[-] EMBL AA999323 [ TTATGTCTAG TTTGTATCCCACTTGATGTAACTTACTTTGGAATGCCATTTATAATTGGACGTCTGTACACATGGGCACACACACACACATACATACGTACCCACTCATGGGCGCACACACAGTCACGCCCACAACTACATTTCCCCAGAAATGGAAAGAACTTTGTCAACATTGTTTTTTCTTGTTACTAATTATCAGAAACTTAATTATCATTATTATTGAATAAATATTAAAATT ]
[+] EMBL CD168956 [ GTCTAGCTTTGTATTCCACTTGATGTAACTTACTTTGGAATGCCATATATAATTGGACGTCTGTACACATGCGCACACACACACACAAACta ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||