Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 10096 cluster # 10096       Sequences # 13       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10096#0 length = 661 sequences # 13  
consensusID : consensus_10096#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 13
consensus length = 661
fasta sequence 
                              [GTCCTAAAGGTTATCCTGGCGAACAAGGACCACCAGGGCTAAGGGGTATGAAAGGTGATCCTGGACGAGATGGAGCTGATGGTCCTGTTGGAGAAAGAGGTCCATCAGGGGATTTCGGCCCACCAGGAATGCATGGTGAACATGGTGAGAGTGGAGAAACGGGTGAAAAAGGTGCAAAAGGTATTGCTGGTTGCCCTGGAGGAAAAGGTGATCCAGGTGAAAAAGGTGAACCTGGAAGACAGGGTATGGATGGTGACCGAGGACTGCCTGGTATAGATGGCGAACGTGGTGATCCTGGTGAATCTGGATTTGGGAGACGAGGACTACCAGGTCCGAAAGGAGAACCTGGTAATGTTGGTCCAAAAGGTGATGATGGAATTCAAGGTGAACGTGGTGATCCTGGATTGCCTGGATTAGAAGGAGACAGAGGTGAAGATGGTGACTTCGGTGTACCTGGTGAAGCTGGTGAGCCAGGAGAAAGTATCATTGACACTTATACACCAGTCAAAGGTGCTCCAGGCTCACCTGGAGATCCTGGAGATCCAGGCAGAAATTGTTCAGTTACCACA-TGGAAC-AGGCCG-AAAGCTCTAATTGGACCTCCTGGCGATCGAGGTGATACAGGTCCTAAAGGCTATCCAGGTTCTAAAGAAAGCCGCTTTCG]

[+] EMBL CD180957             [GTCCTAAAGGTTATCCTGGCGAACAAGGACCACCAGGGCTAAGGGGTATGAAAGGTGATCCTGGACGAGATGGAGCTGATGGTCCTGTTGGAGAAAGAGGTCCATCAGGGGATTTCGGCCCACCAGGAATGCATGGTGAACATGGTGAGAGTGGAGAAACGGGTGAAAAAGGTGCAAAAGGTATTGCTGGTTGCCCTGGAGGAAAAGGTGATCCAGGTGAAAAAGGTGAACCTGGAAGACAGGGTATGGATGGTGACCGAGGACTGCCTGGTATAGATGGCGAACGTGGTGATCCTGGTGAATCTGGATTTGGGAGACGAGGACTACCAc                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD180736             [                                             GTATGAAAGGTGATCCTGGACGAGATGGAGCTGATGGTCCTGTTGGAGAAAGAGGTCCATCAGGGGATTTCGGCCCACCAGGAATGCATGGTGAACATGGTGAGAGTGGAGAAACGGGTGAAAAAGGTGCAAAAGGTATTGCTGGTTGCCCTGGAGGAAAAGGTGATCCAGGTGAAAAAGGTGAACCTGGAAGACAGGGTATGGATGGTGACCGAGGACTGCCTGGTATAGATGGCGAACGTGGTGATCCTGGTGAATCTGGATTTGGGAGACGAGGACTACCAGGTCCGAAAGGAGAACCTGGTAATGTTGGTCCAAAAGGTGATGATGGAATTCAAGGTGAACGTGGTGATCCTGGATTGCCTGGATTANAAGGAGACAGAGGTGAAGATGGTGACTTCGGTGTA                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD181068             [                                             GTATGAAAGGTGATCCTGGACGAGATGGAGCTGATGGTCCTGTTGGAGAAAGAGGTCCATCAGGGGATTTCGGCCCACCAGGAATGCATGGTGAACATGGTGAGAGTGGAGAAACGGGTGAAAAAGGTGCAAAAGGTATTGCTGGTTGCCCTGGAGGAAAAGGTGATCCAGGTGAAAAAGGTGAACCTGGAAGACAGGGTATGGATGGTGACCGAGGACTGCCTGGTATAGATGGCGAACGTGGTGATCCTGGTGAATCTGGATTTGGGAGACGAGGACTACCAGGTCCGAAAGGAGAACCTGGTAATGTTGGTCCAAAAGGTGATGATGGAATTCAAGGTGAACGTGGTGATCCTGGATTGCCTGGATTANAAGGAGACAGAGGTGAAGATGGTGAC                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD180637             [                                             GTATGAAAGGTGATCCTGGACGAGATGGAGCTGATGGTCCTGTTGGAGAAAGAGGTCCATCAGGGGATTTCGGCCCACCAGGAATGCATGGTGAACATGGTGAGAGTGGAGAAACGGGTGAAAAAGGTGCAAAAGGTATTGCTGGTTGCCCTGGAGGAAAAGGTGATCCAGGTGAAAAAGGTGAACCTGGAAGACAGGGTATGGATGGTGACCGAGGACTGCCTGGTATAGATGGCGAACGTGGTGATCCTGGTGAATCTGGATTTGGGAGACGAGGACTACCAGGTCCGAAAGGAGAACCTGGTAATGTTGGTCCAAAAGGTGATGATGGAATTCAAGGTGAACGTGGTGATCCTGGATTGCCTGGATTAGAAGGAGACAGAGGTGAAGATGGTGAC                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD180688             [                                             GTATGAAAGGTGATCCTGGACGAGATGGAGCTGATGGTCCTGTTGGAGAAAGAGGTCCATCAGGGGATTTCGGCCCACCAGGAATGCATGGTGAACATGGTGAGAGTGGAGAAACGGGTGAAAAAGGTGCAAAAGGTATTGCTGGTTGCCCTGGAGGAAAAGGTGATCCAGGTGAAAAAGGTGAACCTGGAAGACAGGGTATGGATGGTGACCGAGGACTGCCTGGTATAGATGGCGAACGTGGTGATCCTGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD180945             [                                              TATGAAAGGTGATCCTGGACGAGATGGAGCTGATGGTCCTGTTGGAGAAAGAGGTCCATCAGGGGATTTCGGCCCACCAGGAATGCATGGTGAACATGGTGAGAGTGGAGAAACGGGTGAAAAAGGTGCAAAAGGTATTGCTGGTTGCCCTGGAGGAAAAGGTGATCCAGGTGAAAAAGGTGAACCTGGAAGACAGGGTATGGATGGTGACCGAGGACTGCCTGGTATAGATGGCGAACGTGGTGATCCTGGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD180972             [                                              TATGAAAGGTGATCCTGGACGAGATGGAGCTGATGGTCCTGTTGGAGAAAGAGGTCCATCAGGGGATTTCGGCCCACCAGGAATGCATGGTGAACATGGTGAGAGTGGAGAAACGGGTGAAAAAGGTGCAAAAGGTATTGCTGGTTGCCCTGGAGGAAAAGGTGATCCAGGTGAAAAAGGTGAACCTGGAAGACAGGGTATGGATGGTGACCGAGGACTGCCTGGTATAGATGGCGAACGTGGTGATCCTGGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD180802             [                                                                                                                                       GTGAACATGGTGAGAGTGGAGAAACGGGTGAAAAAGGTGCAAAAGGTATTGCTGGTTGCCCTGGAGGAAAAGGTGATCCAGGTGAAAAAGGTGAACCTGGAAGACAGGGTATGGATGGTGACCGAGGACTGCCTGGTATAGATGGCGAACGTGGTGATCCTGGTGAATCTGGATTTGGGAGACGAGGACTACCAGGTCCGAAAGGAGAACCTGGTAATGTTGGTCCAAAAGGTGATGATGGAATTCAAGGTGAACGTGGTGATCCTGGATTGCCTGGATTAGAAGGAGACAGAGGTGAAGATGGTGACTTCGGTGTA                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD180953             [                                                                                                                                       GTGAACATGGTGAGAGTGGATAAACGGGTGAAAAAGGTGCAAAAGGTATTGCTGGTTGCCCTGGAGGAAAAGGTGATCCAGGTGAAAAAGGTGAACCTGGAAGACATGGTATGGATGGTGACCGAGGACTGCCTGGTATATATGGCGAACGTGGTGATCCTGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD092856             [                                                                                                                                       GTGAACATGGNGAGAGTGGAGAAACGGGTGAAAAAGGTGCAAAAGGTATTGCTGGTTGCCCTGGAGGAAAAGGTGATCCAGGTGAAAAAGGTGAACCTGGAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD182096             [                                                                                                                                                                                                                  ATCCAGGTGAAAAAGGTGAACCTGGAAGACAGGGTATGGATGGTGACCGAGGACTGCCTGGTATAGATGGCGAACGTGGTGATCCTGGTGAATCTGGATTTGGGAGACGAGGACTACCAGGTCCGAAAGGAGAACCTGGTAATGTTGGTCCAAAAGGTGATGATGGAATTCAAGGTGAACGTGGTGATCCTGGATTGCCTGGATTAGAAGGAGACAGAGGCGAAGATGGTGACTTCGGTGTACCTGGTGAAGCTGGTGAGCCAGGAGAAAGTATCATTGACACTTATACACCAGTCAAAGGTGCTCCAGGCTCACCTGGAGATCCTGGAGATCCAGGCAGAAATTGNTCAGTTACCACA TGGAAC AGGNCG AAAGCTCTATTTGGA                                                                 ]
[+] EMBL CD130711             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATTCAAGGTGAACGTGGTGATCCTGGATTGCCTGGATTAGAAGGAGACAGAGGTGAAGATGGTGACTTCGGTGTACCTGGTGAAGCTGGTGAGCCAGGAGAAAGTATCATTGACACTTATACACCAGTCAAAGGTGCTCCAGGCTCACCTGGAGATCCTGGAGATCCAGGCAGAAATTGTTCAGTTACCACATTGGAACAAGGCCGAAAAGCTCTAATTGGACCTCCTGGCGATCGAGGTGATACAGGTCCTAAAGGCTATCCAGGTTCTAAAGAAAGCCGCTTTCG]
[+] EMBL CD182047             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CTGGATTGCCTGGATTAGAAGGAGACAGAGGTGAAGATGGTGACTTCGGTGTACCTGGTGAAGCTGGTGAGCCAGGAGAAAGTATCATTGACACTTATACACCAGTCAAAGGTGCTCCAGGCTCACCTGGAGATCCTGGAGATCCAGGCAGAAATTGTTCAGTTACCACATTGGAACAAGGCCGAAAAGCTCTAATTGGA                                                                 ]




>consensus_10096#0
GTCCTAAAGGTTATCCTGGCGAACAAGGACCACCAGGGCTAAGGGGTATGAAAGGTGATC
CTGGACGAGATGGAGCTGATGGTCCTGTTGGAGAAAGAGGTCCATCAGGGGATTTCGGCC
CACCAGGAATGCATGGTGAACATGGTGAGAGTGGAGAAACGGGTGAAAAAGGTGCAAAAG
GTATTGCTGGTTGCCCTGGAGGAAAAGGTGATCCAGGTGAAAAAGGTGAACCTGGAAGAC
AGGGTATGGATGGTGACCGAGGACTGCCTGGTATAGATGGCGAACGTGGTGATCCTGGTG
AATCTGGATTTGGGAGACGAGGACTACCAGGTCCGAAAGGAGAACCTGGTAATGTTGGTC
CAAAAGGTGATGATGGAATTCAAGGTGAACGTGGTGATCCTGGATTGCCTGGATTAGAAG
GAGACAGAGGTGAAGATGGTGACTTCGGTGTACCTGGTGAAGCTGGTGAGCCAGGAGAAA
GTATCATTGACACTTATACACCAGTCAAAGGTGCTCCAGGCTCACCTGGAGATCCTGGAG
ATCCAGGCAGAAATTGTTCAGTTACCACATGGAACAGGCCGAAAGCTCTAATTGGACCTC
CTGGCGATCGAGGTGATACAGGTCCTAAAGGCTATCCAGGTTCTAAAGAAAGCCGCTTTC
G

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)