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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10101#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 13 consensus length = 834 fasta sequence
[AGACTACGCCGAAGGTTGTCTGCAGTAGTGTGTGTATTCTCAATGAATAATATCTAAGTAAATTCCCTCCAGATAACTACTTCACACCCGAAATTGAAGGAGCTGAGTACTTACTAATTTCTTTTCAGAAAATTATGAAGGATAACAATTGTTCATCTCGCTGTCGTTGTATATGCCAATCCGATTCTGATGTAAACAATAAGAATGGTATAGTTACCAATGGTAAAACGCTACTAGCTACAAACCACACGTCTTCTAAACTGAAACCAAATACTATAACAGATA-TCTACATAAATTGTATGTTATTAGC-ATGTATTTTAATAACTATCTTTGTATTTTCTCGACCATTCAC-AGAACATTTTATAATACGTTTA-ATATTTGGTGAATCTTTAAATTATTGTAATTATACATATGTACCTTC-AAAAAATAACTATCGTCGACCATATAAAATCTACAATTAACGCTAATATGATAAATTTTTTTTCTAATTAGCAAGAATATCGTTGTTATTTTTTGTTTTTG-TTTTTTTCATTTCGATGCCTTTCTTCCTAAACCGATTCACATCTTCCTATTTATAACAAATTGTATTTGGTAATATAGTGAAGCAATAATATAATTGAAGAGTGATATATGCA-TATTTTTGTATTTTCCTTTAACACCATACTCAACATAGTAACAAATACATACCCATCTCATATCTACCTGTTATTTTTTAC-AAAAAACTNTATTATTTACCTAAACTTATGT-ATGATTNTGATNTGATATGATGNTAATCTTATTTACGAAATGAANTATTNTGNANNTTATTGAATGGTATTCTTTGTCATAAAGTAA]
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[+] EMBL CD080038 [ TCTGCAGTAGTGTGTGTATTCTCAATGAATAATATCTAAGTAAATTCCCTCCAGATAACTACTTCACACCCGAAATTGAAGGAGCTGAGTACTTACTAATTTCTTTTCAGAAAATTATGAAGGATAACAATTGTTCATCTCGCTGTCGTTGTATATGCCAATCCGATTCTGATGTAAACAATAAGAATGGTATAGTTACCAATGGTAAAACGCTACTAGCTACAAACCACACGTCTTCTAAACTGAAACCAAATACTATAACAGATA TCTACATAAATTGTATGTTATTAGC ATGTATTTTAATAACTATCTTTGTATTTTCTCGACCATTCAC AGAACATTTTATAATACGTTTA ATATTTGGTGAATCTTTAAATTATTGTAATTATACATATGTACCTTC AAAAAATAACTATCGTCGACCATATAAAATCTACAATTAACGCTAATATGATAAATTTTTTTTCTAATTAGCAAGATNATCGTTGTTATTTTTTGTTTTTG TTTTTTTCATTTCGATGCCTTTCTTCCTAAACCGATTCACATCTTCCTATTTATAACAAATTGTATTTGGTAATATAGTGAAGCAATAATATAATTGAAGAGTGATATATGCANTATTNTTGTATTTTCCTTTAACACCATACTCAACATAGTAACAAATACATACCCATCTCATATCTACCTGTTATTTTTTAC AAAAAACTNTATTATTTACCTAAACTTATGT ATGATTNTGATNTGATATGATGNTAATCTTATTTACGAAATGAANTATTNTGNANNTTATTGAATGGTATTCTTTGTCATAAAGTAA]
[+] EMBL AI975915 [ TAGTGTGTGTATTCTCAATGAATAATATCTAAGTAAATTCCCTCCAGATAACTACTTCACACCCGAAATTGAAGGAGCTGAGTACTTACTAATTTCTTTTCAGAAAATTATGAAGGATAACAATTGTTCATCTCGCTGTCGTTGTATATGCCAATCCGATTCTGATGTAAACAATAAGAATGGTATAGTTACCAATGGTAAAACGCTACTAGCTACAAACCACACGTTTTCTAAACTGAAACCAAATACTATAACACATA TCTACATAAATTGTATGTTATTAGC ATGTATTTTAATAACTATCTTTGTATTTTCTCGACCATTCAC AGAACATTTTATAATACGTTTA ATATTTGGTGAATCTTTAAATTATTGTAATTATACATATGTACCTTC AAAAAATAACTATTGTCGACCATATAAAATCTACAATTAACGCTAATA ]
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[-] EMBL AI067545 [ GTAAAACGCTACTAGCTACAAACCACACGTCTTCTAAACTGAAACCAAATACTATAACAGATA TCTACATAAATTGTATGTTATTAGC ATGTATTTTAATAACTATCTTTGTATTTTCTCGACCATTCAC AGAACATTTTATAATACGTTTA ATATTTGGTGAATCTTTAAATTATTGTAATTATACATATGTACCTTC AAAAAATAACTATCGTCGACCATATAAAATCTACAATTAACGCTAATATGATAAATTTTTTTTCTAATTAGCAAGAATATCGTTGTTATCTCTTGTTTATG TTTTTTTCATTTCGATGCCTTTCTTCCTAAACCGATTCACATCTTCCTATTTATAACAAATTGTATTTGGT ]
[+] EMBL CD126262 [ TTCTAAACTGAAACCAAATACTATAACAGATAGTTTACATTAATTGTATGTTATTAGCTATGTATTTTAATAACTATCTTTGTATTTTCTCGACCATTCACGAGAACATTTTATAATACGTTTAGATATTTGGTGAATCTTTAAATTATTGTAATTATACATATGTACCTTC AAAAAATAACTATCGTCGACCATATAAAATCTACAATTAACGCTAATATGATAAATTTTTTTTCTAATTAGCAAGAATATCGTTGTTATTTTTTGTTTTTGTTTTTTTTCATTTCGATGCCTTTCTTCCTAAACCGATTCACATCTTCCTATTTATAACAAATTGTATTTGGTAATATAGTGAAGCAATAATATAATTGAAGAGTGATATATGCA TATTTTTGTATTTTCCTTTAACACCATACTCAACATAGTAACAAAT ]
[-] EMBL CD075938 [ TAAACTGAAACCAAATACTATAACAGATA TCTACATAAATTGTATGTTATTAGC ATGTATTTTAATAACTATCTTTGTATTTTCTCGACCATTCAC AGAACATTTTATAATACGTTTA ATATTTGGTGAATCTTTAAATTATTGTAATTATACATATGTACCTTC AAAAAATAACTATCGTCGACCATATAAAATCTACAATTAACGCTAATATGATAAATTTTTTTTCTAATTAGCAAGAATATCGTTGTTATTTTTTGTTTTTG TTTTTTTCATTTCGATGCCTTTCTTCCTAAACCGATTCACATCTTCCTATTTATAACAAATTGTATTTGGTAATATAGTGAAGCAATAATATAATTGAAGAGTGATATATGCA TATTTTTGTATTTTCCTTTAACACCATACTCAACATAGTAACAAATACATACCCATCTCATATCTACCTGTTATTTTTTACAAAAAAACTTTATTATTTACCTAACTTTATGTAATGATTTTGATTTGATATGATGTTAATCTTAATTACGAAATGAA TAT ]
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[-] EMBL CD084470 [ TACATAAATTGTATGTTATTAGC ATGTATTTTAATAACTATCTTTGTATTTTCTCGACCATTCAC AGAACATTTTATAATACGTTTA ATATTTGGTGAATCTTTAAATTATTGTAATTATACATATGTCCCTTC AAAAAATAACTATCGTCGACCATATAACATCTACAATTAACGCTAATATGATAAATTTTTTTTCTAATTAGCAAGAATATCGTTGTTATTTTTTGTTTTTG TTTTTTT ]
[+] EMBL CD084464 [ AGC ATGGGTGGGGATAACTATCTTTGTATTTTCTCGACCATTCAC AGAACATTTTATAATACGTTTA ATATTTGGTGAAACTTTAAATTATTGTAATTATACATATGTACCTTC AAAAAATAACTATCGTCGACCATATAAAATCTACAATTAACGCTAATATGATAAATTTTTTTTCTAATTAGCAAGAATATCCGTGGTATTTTTTGTTTTTG GTTTTTAAATTTCGAGGCCTTcga ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||