cluster # 10156

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Schistosoma mansoni
cluster # 10156 cluster # 10156 Sequences # 14 consensus # 2

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consensus_10156#0 length = 764 sequences # 12

consensus_10156#1 length = 401 sequences # 2

consensusID : consensus_10156#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 12
consensus length = 764
fasta sequence

                              [TCCAGGCCAANAATTTGGCACGAGGAGACCATCAGCTTCTGTTGATATTAACGTTGGTCGTGCGATAGTCGATCGAGCCGACGATTACACTCTTCACAGCGGTCATCAGAATGATTTGGGTTTAATAACTATTGATTTATCGTCTTCTTTAGATCACCTGTTCAACTGGAATGTAAAACAGCTGTTTTTATATCTTTCTGCAGAATACAAGTCCGCAGATAACAAACTAAATCAAGTTGTTTTGTGGGACAAAATCATTAAGCGTGGATCAAAAGCTGAACTGGTGTACAAAAAAATGAC-CTCAAAGTATTATTTTTGGGATGATGGCTACGGATTAATTGGCAATAACAATGTCACCTTG-ACTTTGTCTTGGAATACTATTCCTAACATTGGTTGGCTCACTTTCGATACTG-GTAATGGTTACCACTCGTTTTCATTTCCCAGTCAATACGTCAATATTAAGTAGTGGATTCCCCTAGCGTGATTCACTGCGACCCCT-GTATTATA-AAATGTTCGTATGCTCGT-TAGTAATGACCAGCCAGAATTGATATAGTTTTCTTT-GTTAACATATGTATTAAAACTAACTTTTTTACATTATTTTGCTTAAAAACATAAATGTACGACACATAT-GCTGTCGACATATTATG-AAATGTACAATCCAGTTTTTGTTGAACTAGCCTCTTCGTAATGACTATC-GTTTCACTGAG-CCAGCAGCAGTGCTGGATATGTAACATGTGATAAATAAAATGTTTGGGAATGCCTTA]

[+] EMBL CD081074             [TCCAGGCCAANAATTTGGCACGAGGAGACCATCAGCTTCTGTTGATATTAACGTTGGTCGTGCGATAGTCGATCGAGCCGACGATTACACTCTTCACAGCGGTCATCAGAATGATTTGGGTTTAATAACTATTGATTTATCGTCTTCTTTAGATCACCTGTTCAACTGGAATGTAAAACAGCTGTTTTTATATCTTTCTGCAGAATACAAGTCCGCAGATAACAAACTAAATCAAGTTGTTTTGTGGGACAAAATCATTAAGCGTGGATCAAAAGCTGAACTGGTGTACAAAAAAATGAC CTCAAAGTATTATTTTTGGGATGATGGCTACGGATTAATTGGCAATAACAATGTCACCTTG ACTTTGTCTTGGAATACTATTCCTAACATTGGTTGGCTCACTTTCGATACTG GTAATGGTTACCACTCGTTTTCATTTCCCAGTCAATACGTCAATATTAAGTAGTGGATTCCCCTAGCGTGATTCACTGCGACCCCT GTATTATA AAATGTTCGTATGCTCGT TAGTAATGACCAGCCAGAATTGATATAGTTTTCTTT GTTAACATATGTATTAAAACTAACTTTTTTACATTATTTTGCTTAAAAACATAAATGTACGACACATAT GCTGTCGACATATTATG AAATGTACAATCCAGTTTTTGTTGAACTAGCCTCTTCGTAATGACTATC GTTTCACTGAG CCAGCAGCAGTGCTGGATATGTAACATGTGANTAATAAAATGTTTG           ]
[+] EMBL AI977200             [                                             TATTAACGTTGGTCGTGCGATAGTCGATCGAGCCGACGATTACACTCTTCACAGCGGTCATCAGAATGATTTGGGTTTAATAACTATTGATTTATCGTCTTCTTTAGATCACCTGTTCAACTGGAATGTAAAACAGCTGTTTTTATATCTTTCTGCAGAATACAAGTCCGCAGATAACAAACTAAATCAAGTTGTTTTGTGGGACAAAATCATTAAGCGTGGATCAAAAGCTGAACTGGTGTACAAAAAAATGAC CTCAAAGTATTATTTTTGGGATGATGGCTACGGATTAATTGGCAATAACAATGTCACCTTG ACTTTGTCTTGGAATACTATTCCTAACATTGGTTGGCTCACTTTCGATACTG GTAATGGTTACCACTCGTTTTCATTTCCCAGTCAATACGTCAATATTAAGTAGTGGATTCCCCTAGCGTGATTCACTGCGACCCCT GTATTATA AAATGTTCGTATGCTCGT TAGTAATGACCAGCCAGAATTGATATAGTTTTCTTT GTTAACATATGTATTAAAACTAAC TTTTTACATTATTTTGCTTAAAAACATAAATGTACGACACATAT GCTGTCGACA                                                                                                                               ]
[+] EMBL AI977423             [                                             TATTAACGTTGGTCGTGCGATAGTCGATCGAGCCGACGATTACACTCTTCACAGCGGTCATCAGAATGATTTGGGTTTAATAACTATTGATTTATCGTCTTCTTTAGATCACCTGTTCAACTGGAATGTAAAACAGCTGTTTTTATATCTTTCTGCAGAATACAAGTCCGCAGATAACAAACTAAATCAAGTTGTTTTGTGGGACAAAATCATTAAGCGTGGATCAAAAGCTGAACTGGTGTACAAAAAAATGAC CTCAAAGTATTATTTTTGGGATGATGGCTACGGATTAATTGGCAATAACAATGTCACCTTG ACTTTGTCTTGGAATACTATTCCTAACATTGGTTGGCTCACTTTCGATACTGTGGAAGGGTTACCACTCGTTTTCATTTCCCAGTCAATACGTCAATATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD074896             [                                                                                                CAGCGGTCATCAGAATGATTTGGGTTTAATAACTATTGATTTATCGTCTTCTTTAGATCACCTGTTCAACTGGAATGTAAAACAGCTGTTTTTATATCTTTCTGCAGAATACAAGTCCGCAGATAACAAACTAAATCAAGTTGTTTTGTGGGACAAAATCATTAAGCGTGGATCAAAAGCTGAACTGGTGTACAAAAAAATGAC CTCAAAGTATTATTTTTGGGATGATGGCTACGGATTAATTGGCAATAACAATGTCACCTTG ACTTTGTCTTGGAATACTATTCCTAACATTGGTTGGCTCACTTTCGATACTG GTAATGGTTACCACTCGTTTTCATTTCCCAGTCAATACGTCAATATTAAGTAGTGGATTCCCCTAGCGTGATTCACTGCGACCCCT GTATTATA AAATGTTCGTATGCTCGT TAGTAATGACCAGCCAGAATTGATATAGTTTTCTTT GTTAACATATGTATTAAAACTAACTTTTTTACATTATTTTGCTTAAAAACATAAATGTACGACACATAT GCTGTCGACATATTATG AAATGTACAATCCAGTTTTTGTTGAACTAGCCTCTTCGTAATGACTATC GTTTCACTGAG CCAGCAGCAGTGCTGGATATGTAACATGTGATAAATAAAATGTTTGG          ]
[+] EMBL CD130553             [                                                                                                                                                              TGTTCAACTGGAATGT AAACAGCTGTTTTTATATCTTTCTGCAGAATACAAGTCCGCAGATAACAAACTAAATCAAGTTGTTTTGTGGGACAAAATCATTAAGCGTGGATCAAAAGCTGAACTGGTGTACAAAAAAATGACNCTCAAAGTATTATTTTTGGGATGATGGCTACGGATTAATTGGCAATAACAATGTCACCTTG ACTTTGTCTTGGAATACTATTCCTAACATTGGTTGGCTCACTTTCGATACTG GTAATGGTTACCACTCGTTTTCATTTCCCAGTCAATACGTCAATATTAAGTAGTGGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD121841             [                                                                                                                                                                                                              ACAAGTCCTCAGATAACAAACTAAATCAAGTTGTTTTGTGGGACAAAATCATTAGGCGTGGGTCAAAAGCTGAACTGGTTTACAAAAAAATGAC CTCAAAGTATTATTTTTGGGATGATGGCTACGGATTAATTGGCAATGACAATGTCACCTTG GCTTTGTCTTGGAATACTATTCCTAACATTGGTTGGCTCACTTTCGATACTG GTAATGGCTACCACTCGTTTTCATTTCCCAGTCAATACGTCAATATTAAGTAGCGGATTCCCCTAGCGTGATTCACTGCGACCCCT GTATTATA AAATGTTCGTATGCTCGT TAGTAATGACCAGCCAGAATTGATATAGTTTTCTTT GTTAACATATGTATTAAAACTAACTTTTTTACATTATTTTGCTTAAAAACATAAATGTACGACACATAT GCTGTCGACATATTATG AAATGTACAATCCAGTTTT                                                                                                    ]
[+] EMBL CD121986             [                                                                                                                                                                                                                        AGAT ACAAACTAAATCAAGTTGTTTTGTGGGACAAAATCATTAAGCGTGGATCAAAAGCTGAACTGGTGTACAAAAAAATGAC CTCAAAGTATTATTTTTGGGATGATGGCTACGGATTAATTGGCAATAACAATGTCACCTTG ACTTTGTCTTGGAATACTATTCCTAACATTGGTTGGCTCACTTTCGATACTG GTAATGGTTACCACTCGTTTTCATTTCCCAGTCAATACGTCAATATTAAGTAGTGGATTCCCCTAGCGTGATTCACTGCGACCCCT GTATTATA AAATGTTCGTATGCTCGT TAGTAATGACCAGCCAGAATTGATATAGTTTTCTTT GTTAACATATGTATTAAAACTAACTTTTTTACATTATTTTGCTTAAAAACATAAATGTTAGACACATAT GCTGTCGACCTATTATG AATTGTTC ATCCAGTTTTgt                                                                                                  ]
[+] EMBL BG930575             [                                                                                                                                                                                                                                                                           gTCAAAAGCTGAACTGGTTTACAAAAAAATGAC CTCAAAGTATTATTTTTGGGATGATGGCTACGGATTAATTGGCAATGACAATGTCACCTTG GCTTTGTCTTGGAATACTATTCCTAACATTGGTTGGCTCACTTTCGATACTG GTAATGGTTACCACTCGTTTTCATTTCCCAGTCAATACGTCAATATTAAGTAGCGGATTCCCCTAGCGTGATTCACTGCGA                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL SM847                [                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AATGAN CTCAANGTATTATTTCNGGGATGATGGCTACGGATTAATTGGCAATGACAATGTCACCTTG ACTTTGTCTTGGAATACTATTCCTAACATTGGTTGGCTCACTTTCGATACTG GTAATGGTTACCACTCGTTTTCATTTCCCAGTCAATACGTCAATATTAAGTAGTGGATTCCCCTAGCGTGATTCACTGCGACCCCTGGTATTATA AAATGTNCGTATGCTCGTNTAGTNATGACCAGCCAGAATTGATATAGTTTTCTTT GTTAACATATGTATCAAAACTAACTTTTCTACATTATTNCGNTTANNANCATAAATGTACGACACATATGGCTGNCGACATNTTATGAAAATGTACAANCCAGTNTCGGTTGAACTAGCCTCTTCGCAATGACTATCGGTTTCACTGAGCCCAGCAGCAGNGCTGGAT                                       ]
[+] EMBL SM785                [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTGGGATGATGGCTACGGATTAATTGGCAATGACAATGTCACCTTGNACTTTGTCTTGGAATACTATTCCTAACATTGGTTGGCTCACTTTCGATACTG GTAATGGTTACCACTCGTTTTCATTTCCCAGTCAATACGTCAATATTAAGTAGTGGATTCCCCTAGCGTGATTCACTGCGACCCCT GTATTATA AAATGTTCGTATGCTCGT TAGTAATGACCAGCCAGAATTGATATAGTTTTCTTTGGTTAACATATGTATTAAAACTAACTTTNTTACATTATTTTGCTTAAAAACATAAATGTACGACACATAT GCTGTCGACATATTATG AAATGTACAATCCAGTT                                                                                                      ]
[+] EMBL CD082877             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ggGGTT CCACTCGTTTTCATTTCCCAGTCAATACGTCAATATTAAGTAGCGGATTCCCCTAGCGTGATTCACTGCGACCCCT GTATTATATAAATGTTCGTATGCTCGT TAGTAATGACCAGCCAGAATTGATATAGTTTTCTTT GTTAACATATGTATTAAAACTAACTTTTTTACATTATTTTGCTTAAAAACATAAATGTACGACACATAT GCTGTCGACATATTATG AAATGTACAATCCAGTTTTTGTTGAACTAGCCTCTTCGTAATGACTATC GTTTCACTGAG CCAGCAGCAGTGCTGGATATGTAACATGTGATAAATAAAATGTTTGG          ]
[+] EMBL SM58075              [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gaGAACTAGCCTCTTCGTAATGACTATC GTTTCACTGAG CCAGCAGCAGTGCTGGATATGTAACATGTGATAAATAAAATGTTTGGGAATGCCTTA]




>consensus_10156#0
TCCAGGCCAANAATTTGGCACGAGGAGACCATCAGCTTCTGTTGATATTAACGTTGGTCG
TGCGATAGTCGATCGAGCCGACGATTACACTCTTCACAGCGGTCATCAGAATGATTTGGG
TTTAATAACTATTGATTTATCGTCTTCTTTAGATCACCTGTTCAACTGGAATGTAAAACA
GCTGTTTTTATATCTTTCTGCAGAATACAAGTCCGCAGATAACAAACTAAATCAAGTTGT
TTTGTGGGACAAAATCATTAAGCGTGGATCAAAAGCTGAACTGGTGTACAAAAAAATGAC
CTCAAAGTATTATTTTTGGGATGATGGCTACGGATTAATTGGCAATAACAATGTCACCTT
GACTTTGTCTTGGAATACTATTCCTAACATTGGTTGGCTCACTTTCGATACTGGTAATGG
TTACCACTCGTTTTCATTTCCCAGTCAATACGTCAATATTAAGTAGTGGATTCCCCTAGC
GTGATTCACTGCGACCCCTGTATTATAAAATGTTCGTATGCTCGTTAGTAATGACCAGCC
AGAATTGATATAGTTTTCTTTGTTAACATATGTATTAAAACTAACTTTTTTACATTATTT
TGCTTAAAAACATAAATGTACGACACATATGCTGTCGACATATTATGAAATGTACAATCC
AGTTTTTGTTGAACTAGCCTCTTCGTAATGACTATCGTTTCACTGAGCCAGCAGCAGTGC
TGGATATGTAACATGTGATAAATAAAATGTTTGGGAATGCCTTA

consensusID : consensus_10156#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 401
fasta sequence

                              [AGATCGTAACAACCTTCGGGGCAAAATGCATTCAATCATGACAAGATGTAGTACATTATTGACTCTCACTCTCACTGCGTATACTGCATTAATGTTGTTTTGTTTTCTGTCTACTGTAAGCATCAGACCATCAGCTTCTATTGATATCAACGTAGGTCGTGCGATAGTCGATCGAGCCGACGATTACACTCTTCACAGCGGTCATCAGAATGATTTGGGTTTAATAACTATTGATTTATCGTCTTCTTTAGATCACCTGTTCAACTGGAATGTAAAACAGCTGTTTTTATATCTTTCTGCAGAATACAAGTCCTCAGATAACAAACTAAATCAAGTTGTTTTGTGGGACAAAATCATTAGGCGTGGGTCAAAAGCTGAACTGGCTTACACAAAAATGACCT]

[+] EMBL CD186676             [AGATCGTAACAACCTTCGGGGCAAAATGCATTCAATCATGACAAGATGTAGTACATTATTGACTCTCACTCTCACTGCGTATACTGCATTAATGTTGTTTTGTTTTCTGTCTACTGTAAGCATCAGACCATCAGCTTCTATTGATATCAACGTAGGTCGTGCGATAGTCGATCGAGCCGACGATTACACTCTTCACAGCGGTCATCAGAATGATTTGGGTTTAATAACTATTGATTTATCGTCTTCTTTAGATCACCTGTTCAACTGGAATGTAAAACAGCTGTTTTTATATCTTTCTGCAGAATACAAGTCCTCAGATAACAAACTAAATCAAGTTGTTTTGTGGGACAAAATCATTAGGCGTGGGTCAAAAGCTGAA                      ]
[+] EMBL AI976417             [       AATAGCCTTCGGGGCAAAATGCATTCAATCATGACAAGATGTAGTACATTATTGACTCTCACTCTCACTGCGTATACTGCATTAATGCTGTTTTGTTTTCTGTCTACTGTAAGCATCAGACCATCAGCTTCTGTTGATATCAACGTTGGACGTGCGATAGTCGATCGAGCCGACGATTACACTCTTCACAGCGGTCATCAGAATGATTTGGGTTTAATAACTATTGATTTATCGACTTCTTTAGATCACCTGTTCAACTGTAATGTAAAACAGCTGTTTTTATATCTTTCTGCAGAATACACGTCCTGAGATAACAAACTAAATCAAGTTGTTTTGTGGGACAAAATCATTAGGCGTGGGTCAAAAGCTGAACTGGCTTACACAAAAATGACCT]




>consensus_10156#1
AGATCGTAACAACCTTCGGGGCAAAATGCATTCAATCATGACAAGATGTAGTACATTATT
GACTCTCACTCTCACTGCGTATACTGCATTAATGTTGTTTTGTTTTCTGTCTACTGTAAG
CATCAGACCATCAGCTTCTATTGATATCAACGTAGGTCGTGCGATAGTCGATCGAGCCGA
CGATTACACTCTTCACAGCGGTCATCAGAATGATTTGGGTTTAATAACTATTGATTTATC
GTCTTCTTTAGATCACCTGTTCAACTGGAATGTAAAACAGCTGTTTTTATATCTTTCTGC
AGAATACAAGTCCTCAGATAACAAACTAAATCAAGTTGTTTTGTGGGACAAAATCATTAG
GCGTGGGTCAAAAGCTGAACTGGCTTACACAAAAATGACCT

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10156#0      ------------------------------------------------------------
consensus_10156#1      AGATCGTAACAACCTTCGGGGCAAAATGCATTCAATCATGACAAGATGTAGTACATTATT 60
                                                                                   

consensus_10156#0      ---------------------------------------TCCAGGCCAANAATTTGGCAC 21
consensus_10156#1      GACTCTCACTCTCACTGCGTATACTGCATTAATGTTGTTTTGTTTTCTGTCTACTGTAAG 120
                                                              *      *       **  * 

consensus_10156#0      GAGGAGACCATCAGCTTCTGTTGATATTAACGTTGGTCGTGCGATAGTCGATCGAGCCGA 81
consensus_10156#1      CATCAGACCATCAGCTTCTATTGATATCAACGTAGGTCGTGCGATAGTCGATCGAGCCGA 180
                        *  *************** ******* ***** **************************

consensus_10156#0      CGATTACACTCTTCACAGCGGTCATCAGAATGATTTGGGTTTAATAACTATTGATTTATC 141
consensus_10156#1      CGATTACACTCTTCACAGCGGTCATCAGAATGATTTGGGTTTAATAACTATTGATTTATC 240
                       ************************************************************

consensus_10156#0      GTCTTCTTTAGATCACCTGTTCAACTGGAATGTAAAACAGCTGTTTTTATATCTTTCTGC 201
consensus_10156#1      GTCTTCTTTAGATCACCTGTTCAACTGGAATGTAAAACAGCTGTTTTTATATCTTTCTGC 300
                       ************************************************************

consensus_10156#0      AGAATACAAGTCCGCAGATAACAAACTAAATCAAGTTGTTTTGTGGGACAAAATCATTAA 261
consensus_10156#1      AGAATACAAGTCCTCAGATAACAAACTAAATCAAGTTGTTTTGTGGGACAAAATCATTAG 360
                       ************* ********************************************* 

consensus_10156#0      GCGTGGATCAAAAGCTGAACTGGTGTACAAAAAAATGACCTCAAAGTATTATTTTTGGGA 321
consensus_10156#1      GCGTGGGTCAAAAGCTGAACTGGCTTACACAAAAATGACCT------------------- 401
                       ****** ****************  **** ***********                   

consensus_10156#0      TGATGGCTACGGATTAATTGGCAATAACAATGTCACCTTGACTTTGTCTTGGAATACTAT 381
consensus_10156#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10156#0      TCCTAACATTGGTTGGCTCACTTTCGATACTGGTAATGGTTACCACTCGTTTTCATTTCC 441
consensus_10156#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10156#0      CAGTCAATACGTCAATATTAAGTAGTGGATTCCCCTAGCGTGATTCACTGCGACCCCTGT 501
consensus_10156#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10156#0      ATTATAAAATGTTCGTATGCTCGTTAGTAATGACCAGCCAGAATTGATATAGTTTTCTTT 561
consensus_10156#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10156#0      GTTAACATATGTATTAAAACTAACTTTTTTACATTATTTTGCTTAAAAACATAAATGTAC 621
consensus_10156#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10156#0      GACACATATGCTGTCGACATATTATGAAATGTACAATCCAGTTTTTGTTGAACTAGCCTC 681
consensus_10156#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10156#0      TTCGTAATGACTATCGTTTCACTGAGCCAGCAGCAGTGCTGGATATGTAACATGTGATAA 741
consensus_10156#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10156#0      ATAAAATGTTTGGGAATGCCTTA 764
consensus_10156#1      -----------------------