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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10281#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 15 consensus length = 1105 fasta sequence
[AATTCGGCACGAGGCGGCGGATCAATTGCACAGTCGACTTCCTGGTATATCAGAGACAGCAAAAATATTCGCAGGTGTTGATGTTACAAGGGATCCCATTCCAGTGTTACCAACCGTCCACTATAATATGGGTGGAATCCCTACAAACTATAAAGGACAGGTGTTGGCATATGATCCGGTTGCTAAGAAAGGTAAGGTTGTTCCTGGACTGTATGCTGCTGGCGAAGCTGCTTCCGCATCGGTTCACGGCGCTAATAGACTAGGTGCCAACTCACTACTTGACATTGTTGTATTTGGTCGTGCATGTGCGCTTGACATTGCTGCAAAAAATAAGCCTGGAGATGCAGGTCCAGAGTTAAAACCAGATACTGGAGAGGCCTCCATCGCTAACTATGAAAAACTCCGGACCGCAAATGGAAGTTATCCAATTGCACAAGTTCGGTTAGACATG-CAGCGAAC-AATG-CAAGAGTATGCTGCAGTATTTCGTGATGGTCCTACTCTCAAAGAGGGCTGTAAAAAAATGTATGATTTATATGCTTCTCGAATGAATGATTTAAAAGTTAGTGATCGCAGTAAAATATGGAATAGTGATCTAATGGAAGCATTAGAATTACAGAATCTGATGCTAAATGCTTTACAGACTATTGTTGGAGCTGAAGCCCGTAAAGAATCGCGTGGTGCTCATGCACGTGAAGATTTTCCTAATCGAGTAGATGAATTAGACTACTCTAAACCTATTGATGGACAAAAACCCAAGCCATTTGAAGAACATTGGCGAAAACATACTCTATCTTATCAGGATGTTAAAACTGGTGCTGTAAAATTGGAATATCGTCCTGTAATTGATGCCACCTTGGATGCTAAGAGCTGTCCATCTGTCCCTCCAAAACTACGCACTTATTAGCATACTTATTGCTTAGGATGAATTTTTCAAATGTGTAGCTTAATCAACTGAA-GAACTTCTTCCAATCATATTCAAAATAACTT-CGATATTACCTTTTTACACTATTTACTTGTTGTTATAACTTATCTGTGAATGCTTTTGTTTAAATATCATTTTCAATAAAACATCTCTTTACCAAATGTAAA----AAAAAAAAAAAAAAAA]
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[+] EMBL CD127506 [ CCATTCCAGTGTTACCAACCGTCCACTATAATATGGGTGGAATCCCTACAAACTATAAAGGACAGGTGTTGGCATATGATCCGGTTGCTAAGAAAGGTAAGGTTGTTCCTGGACTGTATGCTGCTGGCGAAGCTGCTTCCGCATCGGTTCACGGCGCTAATAGACTAGGTGCCAACTCACTACTTGACATTGTTGTATTTGGTCGTGCATGTGCGCTTGACATTGCTGCAAAAAATAAGCCTGGAGATGCAGGTCCAGAGTTAAAACCAGATACTGGAGAGGCCTCCATCGCTAACTATGAAAAACTCCGGACCGCAAATGGAAGTTATCCAATTGCACAAGTTCGGTTAGACATG CAGCGAAC AATG CAAGAGTATGCTGCAGTATTTCGTGATGGTCCTACTCTCAAAGAGGGCTGTAAAAAAATGTATGATTTATATGCTTCTCGAATGAATGATTTAAAAGTTAGTGATCGCAGTAAAATATGGAATAGTGATCTAATGGAAGCATTAGAATTACAGAATCTGATGCTAAATGCTTTACAGACTATTGTTGGAGCTGAAGCCCGTAAAGAATCGCGTGGTGCTCATGCACGTGAAGATTTTCCTAATCGAGTAGATGAATTAG ]
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[-] EMBL AI976465 [ ATATGCTTCTCGAATGAATGATTTAAAAGTTAGTGATCGCAGTAAAATATGGAATAGTGATCTAATGGAAGCATTAGAATTACAGAATCTGATGCTAAATGCTTTACAGACTATTGTTGGAGCTGAAGCCCGTAAAGAATCGCGTGGTGCTCATGCACGTGAAGATTTTCCTAATCGAGTAGATGAATTAGACTACTCTAAACCTATTGATGGACAAAAACCCAAGCCATTTGAAGAACATTGGCGAAAACATACTCTATCTTATCAGGATGTTAAAACTGGTGCTGTAAAATTGGAATATCGTCCTGTAATTGATGCCACCTTGGATGCTAAGAGCTGTCCATCTGTCCCTCCAAAACTACGCACTTATTAGCATACTTATTGCTTAGGATGAATTTTTCAAATGTGTAGCTTAATCAACTGAA GAACTTCTTCCAATCATATTCAAAATAACTT CGATATTACCTTTTTACACTATTTACTTGTTGTTATAACTTATCTGTGAATGCTTTTGTTTAAATATCATTTTCAATAAAACATCTCTTTAC ]
[+] EMBL AI111034 [ ATCGCAGTAAAATATGGAATAGTGATCTAATGGAAGCATTAGAATTACAGAATCT ATGCTAAATGCTTTACAGACTATTGTTGGAGCTGAAGCCCGTAAAGAATCGCGTGGTGCTCATGCACGTGAAGATTTTCCTAATCGAGTAGATGAATTAGACTACTCTAAACCTATTGATGGACAAAAACCCAAGCCATTTGAAGAACATTGGCGAAAACATACTCTATCTTATCAGGATGTTAAAACTGGTGCTGTAAAATTGGAATATCGTCCTGTAATTGATGCCACCTTGGATGCTAAGAGCTGTCCATCTGTCCCTCCAAAACTACNCACTTATTAGCATACTTATTGCTTAGGATGAATTTTTCAAATGTGTAGCTTAATCAACTGAANAAACTTCTTCCAATCATATTCAAAATAACTTCCGATNTTACCTTTTTACACTATTTNCTTGTTGTTATAACTTATCTGT ]
[+] EMBL AI110977 [ ATCGCAGTAAAATATGGAATAGTGATCTAATGGAAGCATTAGAATTACAGAATCT ATGCTAAATGCTTTACAGACTATTGTTGGAGCTGAAGCCCGTAAAGAATCGCGTGGTGCTCATGCACGTGAAGATTTTCCTAATCGAGTANATGAATTAGACTACTCTAAACCTATTGATGGACAAAAACCCAAGCCATTTGAAGAACATTGGCGAAAACATACTCTATCTTATCAGGATGTTAAAACTGGTGCTGTAAAATTGGAATATCGTCCTGTAATTGATGCCACCTTGGATGCTAAGAGCTGTCCATCTGTCCCTCCAAAACTACGCACTTATTAGCATACTTATTGCTTAGGATGAATTTTTCAAATGTGTAGCTTAATCAACTGAA GAACTTCTTCCAATCATATTCAAAATAACTT CGATATTACCTTTTTACACTATTTACTTGTTGTTATAACTTATCTGTGAATGCTTTTGTTTAAATATCATTTTCAATAAAACA ]
[-] EMBL AI395450 [ GAATCGCGTGGTGCTCATGCACGTGAAGATTTTCCTAATCGAGTAGATGAATTAGACTACTCTAAACCTATTGATGGACAAAAACCCAAGCCATTTGAAGAACATTGGCGAAAACATACTCTATCTTATCAGGATGTTAAAACTGGTGCTGTAAAATTGGAATATCGTCCTGTAATTGATGCCACCTTGGATGCTAAGAGCTGTCCATCTGTCCCTCCAAAACTACGCACTTATTAGCATACTTATTGCTTAGGATGAATTTTTCAAATGTGTAGCTTAATCAACTGAA GAACTTCTTCCAATCATATTCAAAATAACTT CGATATTACCTTTTTACACTATTTACTTGTTGTTATAACTTATCTGTGAATGCTTTTGTTTAAATATCATTTTCAATAAAACATCTCTTTACCAAATGTAAA AAAAAAAAAAAAAA ]
[-] EMBL AI976591 [ GTGGTGCTCATGCACGTGAAGATTTTCCTAATCGAGTAGATGAATTAGACTACTCTAAGCCTATTGATGGACAAAAACGCGAGCCATTTGAAGAACATTGGCGAAAACATACTCTATCTTATCAGGATGTTAAAACTGGTGCTGTAAAATTGGAATATCGTCCTGTAATTGATGCCACCTTGGATGCTAAGAGCTGTCCATCTGTCCCTCCAAAACTACGCACTTATTAGCATACTTATTGCTTAGGATGAATTTTTCAAATGTGTAGCTTAATCAACTGAA GAACTTCTTCCAATCATATTCAAAATAACTT CGATATTACCTTTTTACACTATTTACTTGTTGTTATAACTTATCTGTGAATGCTTTTGTTTAAATATCATTTTCAATAAAACATCTCTTTACCAA ]
[-] EMBL AI394891 [ tTTGGCG AAACCTACTCTATCTTATCAGGATGTTAAAACTGGTGCTGTAAAATTGGAATATCGTCCTGTAATTGATGCCACCTTGGATGCTAAGAGCTGTCCATCTGTCCCTCCAAAACTACGCACTTATTAGCATACTTATTGCTTAGGATGAATTTTTCAAATGTGTAGCTTAATCAACTGAA GAACTTCTTCCAATCATATTCAAAATAACTT CGATATTACCTTTTTACACTATTTACTTGTTGTTATAACTTATCTGTGAATGCTTTTGTTTAAATATCATTTTCAATAAAACATCTCTTTACCAAATGTATACTTGAAAAAAAAAAAAAAAA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||