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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10285#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 15 consensus length = 458 fasta sequence
[CCTCCTCGAAAAGAAACCAGATAAATAAGTAGAACAAAAACGGACTGGTGCATATAATAGAAGCTGTGAAAATTTCCCTCGTTTAAATCATAACCCAAATATAGAAACTGATAAGAATGTAGTAACAATATTATCATGTATATAAACAT-GTTTC-ATAAAAACTGCGGCGATAGTTGTAGTCTTAGAGTAGTAGTAATGGTAGTAATAGTAGTATATAAGAGATAATTCACAGCCATGTGGTAAATTATGGTTTAACTGATTGAATTTCAAAATAGTTAATAAGATGATTTGTAAAATTATACAAGATAGACAGATTTATTGTTTGTTGTTGTCGTCACCCATCAAAATAAACATGTTCAAAATGGAACAAATGAAGTAAAAAGTTAAAATGAGATGGAAGTAGATCTCACATATTAAAACAGAAAGAAAAATTGATAAAACGATAACTNTACTACTCA]
[-] EMBL CD143972 [CCTCCTCGAAAAGAAACCAGATAAATAAGTAGAACAAAAACGGACTGGTGCATATAATAGAAGCTGTGAAAATTTCCCTCGTTTAAATCATAACCCAAATATAGAAACTGATAAGAATGTAGTAACAATATTATCATGTATATAAACAT GTTTC ATAAAAACTGCGGCGATAGTTGTAGTCTTAGAGTAGTAGTAATGGTAGTAATAGTAGTATATAAGAGATAATTCACAGCCATGTGGTAAATTATGGTTTAACTGATTGAATTTCAAAATAGTTAATAAGATGATTTGTAAAATTATACAAGATAGACAGATTTATTGTTTGTTGTTGTCGTCACCCATCAAAATAAACATGTTCAAAATGG ]
[+] EMBL CD144030 [ CAGATAAATAAGTAGAACAAAAACGGACTGGTGCATATAATAGAAGCTGTGAAAATTTCCCTCGTTTAAATCATAACCCAAATATAGAAACTGATAAGAATGTAGTAACAATATTATCATGTATATAAACAT GTTTC ATAAAAACTGCGGCGATAGTTGTAGTCTTAGAGTAGTAGTAATGGTAGTAATAGTAGTATATAAGAGATAATTCACAGCCATGTGGTAAATTATGGTTTAACTGATTGAATTTCAAAATAGTTAATAAGATGATTTGTAAAATTATACAAGATAGACAGATTTATTGTTTGTTGTTGTCGTCACCCATCAAAATAAACATGTTCAAAATG ]
[-] EMBL CD143958 [ AGATAAATAAGTAGAACAAAAACGGACTGGTGCATATAATAGAAGCTGTGAAAATTTCCCTCGTTTAAATCATAACCCAAATATAGAAACTGATAAGAATGTAGTAACAATATTATCATGGAAATAAACATGGTTTCAATAAGAACTGCGGCGATAGTTGTAGTCTTAGAGTAGTAGTAATGGTAGTAATAGTAGTATATAAGAGATAATTCACAGCCATGTGGTAAATTATGGTTTAACTGATTGAATTTCAAAATAGTTAATAAGATGATTTGTAAAATTATACAAGATAGACAGATTTATTGTTTGTTGTTGTCGTCACCCATCAAAATAAACATGTTCAAAATGG ]
[-] EMBL CD144036 [ AGATAAATAAGTAGAACAAAAACGGACTGGTGCATATAATAGAAGCTGTGAAAATTTCCCTCGTTTAAATCATAACCCACATATAGAAACTGAAAAGAATGTAGTAACAATATTATCATGTATATAAACATGGTTTC ATAAAAACTGCGGCGATAGTTGTAGTCTTAGAGTAGTAGTAATGGTAGTAATAGTAGTATATAAGAGATAATTCACAGCCATGTGGTAAATTATGGTTTAACTGATTGAATTTCAAAATAGTTAATAAGATGATTTGTAAAATTATACAAGATAGACAGATCTATTGTTTGTTGTTGTCGTCACCCATCAAAATAAACATGTTCAAAATGG ]
[-] EMBL CD144033 [ AGATAAATAAGTAGAACAAAAACGGACTGGTGCATATAACAGAAGCTGTGAAAATTTCCCTCGTTTAAATCATAACCCAAATATAGAAACTGATAAGAATGTAGTAACAATATTATCATGTATATAAACAT GTTTC ATAAAAACTGCGGCGATAGTTGTAGTCTTAGAGTAGTAGTAATGGTAGTAATAGTAGTATATAAGAGATAATTCACAGCCATGTGGTAAATTATGGTTTAACTGATTGAATTTCAAAATAGTTAATAAGATGATTTGTAAAATTATACAAGATAGACAGATTTATTGTTTGTTGTTGTCGTCACCCATCAAAATAAACATGTTCAAAATGG ]
[-] EMBL CD143996 [ AGATAAATAAGTAGAACAAAAACGGACTGGTGCATATAATAGAAGCTGTGAAAATTTCCCTCGTTTAAATCATAACCCAAATATAGAAACTGATAAGAATGTAGTAACAATATTATCATGTATATAAACAT GTTTC ATAAAAACTGCGGCGATAGTTGTAGTCTTAGAGTAGTAGTAATGGTAGTAATAGTAGTATATAAGAGATAATTCACAGCCATGTGGTAAATTATGGTTTAACTGATTGAATTTCAAAATAGTTAGTAAGATGATTTGTAAAATTATACAAGATAGACAGATTTATTGTTTGTTGTTGTCGTCACCCATCAAAATAAACATGTTCAAAATGG ]
[-] EMBL CD143991 [ AGATAAATAAGTAGAACAAAAACGGACTGGTGCATATAATAGAAGCTGTGAAAATTTCCCTCGTTTAAATCATAACCCAAATATAGAAACTGATAAGAATGTAGTAACAATATTATCATGTATATAAACAT GTTTC ATAAAAACTGCGGCGATAGTTGTAGTCTTAGAGTAGTAGTAATGGTAGTAATAGTAGTATATAAGAGATAATTCACAGCCATGTGGTAAATTATGGTTTAACTGATTGAATTTCAAAATAGTTAATAAGATGATTTGTAAAATTATACAAGATAGACAGATTTATTGTTTGTTGTTGTCGTCACCCATCAAAATAAACATGTTCAAAATGG ]
[-] EMBL CD143993 [ AGATAAATAAGTAGAACAAAAACGGACTGGTGCATATAATAGAAGCTGTGAAAATTTCCCTCGTTTAAATCATAACCCAAATATAGAAACTGATAAGAATGTAGTAACAATATTATCATGTATATAAACAT GTTTC ATAAAAACTGCGGCGATAGTTGTAGTCTTAGAGTAGTAGTAATGGTAGTAATAGTAGTATATAAGAGATAATTCACAGCCATGTGGTAAATTATGGTTTAACTGATTGAATTTCAAAATAGTTAATAAGATGATTTGTAAAATTATACAAGATAGACAGATTTATTGTTTGTTGTTGTCGTCACCCATCAAAATAAACATGTTCAAAATGG ]
[-] EMBL CD143997 [ AGATAAATAAGTAGAACAAAAACGGACTGGTGCATATAATAGAAGCTGTGAAAATTTCCCTCGTTTAAATCATAACCCAAATATAGAAACTGATAAGAATGTAGTAACAATATTATCATGTATATAAACAT GTTTC ATAAAAACTGCGGCGATAGTTGTAGTCTTAGAGTAGTAGTAATGGTAGTAATAGTAGTATATAAGAGATAATTCACAGCCATGTGGTAAATTATGGTTTAACTGATTGAATTTCAAAATAGTTAATAAGATGATTTGTAAAATTATACAAGATAGACAGATTTATTGTTTGTTGTTGTCGTCACCCATCAAAATAAACATGTTCAAAATGG ]
[-] EMBL CD144007 [ AGATAAATAAGTAGAACAAAAACGGACTGGTGCATATAATAGAAGCTGTGAAAATTTCCCTCGTTTAAATCATAACCCAAATATAGAAACTGATAAGAATGTAGTAACAATATTATCATGTATATAAACAT GTTTC ATAAAAACTGCGGCGATAGTTGTAGTCTTAGAGTAGTAGTAATGGTAGTAATAGTAGTATATAAGAGATAATTCACAGCCATGTGGTAAATTATGGTTTAACTGATTGAATTTCAAAATAGTTAATAAGATGATTTGTAAAATTATACAAGATAGACAGATTTATTGTTTGTTGTTGTCGTCACCCATCAAAATAAACATGTTCAAAATGG ]
[-] EMBL CD144014 [ AGATAAATAAGTAGAACAAAAACGGACTGGTGCATATAATAGAAGCTGTGAAAATTTCCCTCGTTTAAATCATAACCCAAATATAGAAACTGATAAGAATGTAGTAACAATATTATCATGTATATAAACAT GTTTC ATAAAAACTGCGGCGATAGTTGTAGTCTTAGAGTAGTAGTAATGGTAGTAATAGTAGTATATAAGAGATAATTCACAGCCATGTGGTAAATTATGGTTTAACTGATTGAATTTCAAAATAGTTAATAAGATGATTTGTAAAATTATACAAGATAGACAGATTTATTGTTTGTTGTTGTCGTCACCCATCAAAATAAACATGTTCAAAATGG ]
[-] EMBL CD143979 [ AGATAAATAAGTAGAACAAAAACGGACTGGTGCATATAATAGAAGCTGTGAAAATTTCCCTCGTTTAAATCATAACCCAAATATAGAAACTGATAAGAATGTAGTAACAATATTATCATGTATATAAACAT GTTTC ATAAAAACTGCGGCGATAGTTGTAGTCTTAGAGTAGTAGTAATGGTAGTAATAGTAGTATATAAGAGATAATTCACAGCCATGTGGTAAATTATGGTTTAACTGATTGAATTTCAAAATAGTTAATAAGATGATTTGTAAAATTATACAAGATAGACAGATTTATTGTTTGTTGTTGTCGTCACCCATCAAAAT AACATGTTCAAAATGG ]
[-] EMBL CD144006 [ AGATAAATAAGTAGAACAAAAACGGACTGGTGCATATAATAGAAGCTGTGAAAATTTCCCTCGTTTAAATCATAACCCAAATATAGAAACTGATAAGAATGTAGTAACAACATTATCATGTATATAAACAT GTTTC ATAAAAACTGCGGCGATAGTTGTAGTCTTAGAGTAGTAGTAATGGTAGTAATAGTAGTATATAAGAGATAATTCACAGCCATGTGGTAAATTATGGTTTAACTGATTGAATTTCAAAATAGTTAATAAGATGATTTGTAAAATTATACAAGATAGACAGATTTATTGTTTGTTGTTGTCGTCACCCATCAAA ]
[-] EMBL CD144008 [ GGACTGGTGCATATAATAGAAGCTGTGAAAATTTCCCTCGTTTAAATCATAACCCAAATATAGAAACTGATAAGAATGTAGTAACAATATTATCATGTATATAAACAT GTTTC ATAAAAACTGCGGCGATAGTTGTAGTCTTAGAGTAGTAGTAATGGTAGTAATAGTAGTATATAAGAGATAATTCACAGCCATGTGGTAAATTATGGTTTAACTGATTGAATTTCAAAATAGTTAATAAGATGATTTGTAAAATTATACAAGATAGACAGATTTATTGTTTGTTGTTGTCGTCACCCATCAAAATAAACATGTTCAAAATGG ]
[+] EMBL CD077167 [ AGAAGCTGTGAAAATTTCCCTCGTTTAAATCATAACCCAAATATAGAAACTGATAAGAATGTAGTAACAATATTATCATGTATATAAACAT GTTTC ATAAAAACTGCGGCGATAGTTGTAGTCTTAGAGTAGTAGTAATGGTAGTAATAGTAGTATATAAGAGATAATTCACAGCCATGTGGTAAATTATGGTTTAACTGATTGAATTTCAAAATAGTTAATAAGATGATTTGTAAAATTATACAAGATAGACAGATTTATTGTTTGTTGTTGTCGTCACCCATCAAAATAAACATGTTCAAAATGGAACAAATGAAGTAAAAAGTTAAAATGAGATGGAAGTAGATCTCACATATTAAAACAGAAAGAAAAATTGATAAAACGATAACTNTACTACTCA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||