Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 10331 cluster # 10331       Sequences # 15       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10331#0 length = 594 sequences # 15  
consensusID : consensus_10331#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 15
consensus length = 594
fasta sequence 
                              [ATGTTATATTATTTTGTGATGTTTGCAACTTAGCCGTACATCAGGAATGTTATGGAGTTCCTTATGTCCCTGAAGGTCCTTGGTTGTGTCGTAAATGCCTTCACTCACCGAGTGAACCAGTTTCATGTGTCCTTTGTCCTAATAGAGGCGGTGCCTTC-AAAAAAACGACAGATGACCGATGGGCTCATGTAATATGTGGGTTATGGGTACCTGAAGTGATGTTTGCTAATCTGACGTTCCTTGAACCGCTTGAAGGCATCGACAGAATTGCTGCAGCCAGATGGCGTCTTCAGTGTTTCATTTGTAAACAACGCAATGTTGGTGCTTGTATACAGTGTCATAAATCTAGTTGTTATCGAGCATTTCATGTGACATGTGCACAGCATGCTGGATTGTATATGAAAATTGAGCATACAGATGATCCTGGAGATCTAGGAATCCGAAAGAGTGCGTTTTGCGATCAACATTGTCCGCCGGATCACTTTTCTAGTTCAAACAAAGGAATGTACGCTCATTCTGATTCTGATGGTCCTCAATCTCCTGAGCGAGCAGCTCGAATTCATCTCAGGAAAGCTCG-TANAATTNTAGCCGAAC]

[+] EMBL CD094495             [ATGTTATATTATTTTGTGATGTTTGCAACTTAGCCGTACATCAGGAATGTTATGGAGTTCCTTATGTCCCTGAAGGTCCTTGGTTGTGTCGTAAATGCCTTCACTCACCGAGTGAACCAGTTTCATGTGTCCTTTGTCCTAATAGAGGCGGTGCCTTC AAAAAAACGACAGATGACCGATGGGCTCATGTAATATGTGGGTTATGGGTACCTGAAGTGATGTTTGCTAATCTGACGTTCCTTGAACCGCTTGAAGGCATCGACAGAATTGCTGCAGCCAGATGGCGTCTTCAGTGTTTCATTTGTAAACAACGCAATGTTGGTGCTTGTATACAGTGTCATAAATCTAGTTGTTATCGAGCATTTCATGTGACATGTGCACAGCATGCTGGATTGTATATGAAAATTGAGCATACAGATGATCCTGGAGATCTAGGAATCCGAAAGAGTGCGTTTTGCGATCAACATTGTCCGCCGGATCACTTTTCTAGTTCAAACAAAGGAATGTACGCTCATTCTGATTCTGATGGTCCTCAATCTCCTGAGCGAGCAGCTCGAATTCATCTCAGGAAAGCTCG TANAATTNTAGCCGAAC]
[+] EMBL CD094501             [ATGTTATATTATTTTGTGATGTTTGCAACTTAGCCGTACATCAGGAATGTTATGGAGTTCCTTATGTCCCTGAAGGT CTTGGTTGTGTCGTAAATGCCTTCACTCACCGAGTGAACCAGTTCCATGTGTCCTTTGTCCTAATAGAGGCGGTGCCTTC AAAAAAACGACAGATGACCGATGGGCTCATGTAATATGTGGGTTATGGGTACCTGAAGTGATGTTTGCTAATCTGACGTTCCTTGAACCGCTTGAAGGCATCGACAGAATTGCTGCAGCCAGATGGCGTCTTCAGTGTTTCATTTGTAAACAACGCAATGTTGGTGCTTGTATACAGTGTCATAAATCTAGTTGTTATCGAGCATTTCATGTGACATGTGCACAGCATGCTGGATTGTATATGAAAATTGAGCATACAGATGATCCTGGAGATCTAGGAATCCGAAAGAGTGCGTTTTGCGATCAACATTGTCCGCCGGATCACTTTTCTAGTTCAAACAAAGGAATGTACGCTCATTCTGATTCTGATGGTCCTCAATCTCCTGAGCGAGCAGCTCGAATTCATCTCAGGAAAGCTCGNTA AATTtt        ]
[+] EMBL CD094835             [ATGTTATATTATTTTGTGATGTTTGCAACTTAGCCGTACATCAGGAATGTTATGGAGTTCCTTATGTCCCTGAAGGTCCTTGGTTGTGTCGTAAATGCCTTCACTCACCGAGTGAACCAGTTTCATGTGTCCTTTGTCCTAATAGAGGCGGTGCCTTC AAAAAAACGACAGATGACCGATGGGCTCATGTAATATGTGGGTTATGGGTACCTGAAGTGATGTTTGCTAATCTGACGTTCCTTGAACCGCTTGAAGGCATCGACAGAATTGCTGCAGCCAGATGGCGTCTTCAGTGTTTCATTTGTAAACAACGCAATGTTGGTGCTTGTATACAGTGTCATAAATCTAGTTGTTATCGAGCATTTCATGTGACATGTGCACAGCATGCTGGATTGTATATGAAAATTGAGCATACAGATGATCCTGGAGATCTAGGAATCCGAAAGAGTGCGTTTCGCGAT                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD094822             [ATGTTATATTATTTTGTGATGTTTGCAACTTAGCCGTACATCAGGAATGTTATGGAGTTCCTTATGTCCCTGAAGGTCCTTGGTTGTGTCGTAAATGCCTTCACTCACCGAGTGAACCAGTTTCATGTGTCCTTTGTCCTAATAGAGGCGGTGCCTTC AAAAAAACGACAGATGACCGATGGGCTCATGTAATATGTGGGTTATGGGTACCTGAAGTGATGTTTGCTAATCTGACGTTCCTTGAACCGCTTGAAGGCATCGACAGAATTGCTGCAGCCAGATGGCGTCTTCAGTGTTTCATTTGTAAACAACGCAATGTTGGTGCTTGTATACAGTGTCATAAATCTAGTTGTTATCGAGCATTTCATGTGACATGTGCACAGCATGCTGGATTGTATATGAAAATTGAGCATACAGATGATCCTGGAGATCTAGGAATCCGAAAGAGTGCGTTTTGCGAT                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD094997             [ATGTTATATTATTTTGTGATGTTTGCAACTTAGCCGTACATCAGGAATGTTATGGAGTTCCTTATGTCCCTGAAGGTCCTTGGTTGTGTCGTAAATGCCTTCACTCACCGAGTGAACCAGTTTCATGTGTCCTTTGTCCTAATAGAGGCGGTGCCTTC AAAAAAACGACAGATGACCGATGGGCTCATGTAATATGTGGGTTATGGGTACCTGAAGTGATGTTTGCTAATCTGACGTTCCTTGAACCGCTTGAAGGCATCGACAGAATTGCTGCAGCCAGATGGCGTCTTCAGTGTTTCATTTGTAAACAACGCAATGTTGGTGCTTGTATACAGTGTCATAAATCTAGTTGTTATCGAGCATTTCATGTGACATGTGCACAGCATGCTGGATTGTATATGAAAATTGAGCATACAGATGATCCTGGAGATCTGGGAATCCGAAAGAGTGCGTTTTGCGAT                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD095097             [ATGTTATATTGTTTTGTGATGTTTGCAACTTAGCCGTACATCAGGAATGTTATGGAGTTCCTTATGTCCCTGAAGGTCCTTGGTTGTGTCGTAAATGCCTTCACTCACCGAGTGAACCAGTTTCATGTGTCCTTTGTCCTAATAGAGGCGGTGCCTTC AAAAAAACGACAGATGACCGATGGGCTCATGTAATATGTGGGTTATGGGTACCTGAAGTGATGTTTGCTAATCTGACGTTCCTTGAACCGCTTGAAGGCATCGACAGAATTGCTGCAGCCAGATGGCGTCTTCAGTGTTTCATTTGTAAACAACGCAATGTTGGTGCTTGTATACAGTGTCATAAATCTAGTTGTTATCGAGCATTTCATGTGACATGTGCACAGCATGCTGGATTGTATATGAAAATTGAGCATACAGATGATCCTGGAGATCTAGGAATCCGAAAGAGTGCGTTTTGCGAT                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD094771             [ TGTTATATTATTTTGTGATGTTTGCAACTTAGCCGTACATCAGGAATGTTATGGAGTTCCTTATGTCCCTGAAGGTCCTTGGTTGTGTCGTAAATGCCTTCACTCACCGAGTGAACCAGTTTCATGTGTCCTTTGTCCTAATAGAGGCGGTGCCTTC AAAAAAACGACAGATGACCGATGGGCTCATGTAATATGTGGGTTATGGGTACCTGAAGTGATGTTTGCTAATCTGACGTTCCTCGAACCGCTTGAAGGCATCGACAGAATTGCTGCAGCCAGATGGCGTCTTCAGTGTTTCATTTGTAAACAACGCAATGTTGGTGCTTGTATACAGTGTCATAAATCTAGTTGTTATCGAGCATTTCATGTGACATGTGCACAGCATGCTGGATTGTATATGAAAATTGAGCATACAGATGATCCTGGAGATCTAGGAATCCGAAAGAGTGCGTTTCGCGATC                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD095223             [ TGTTATATTATTTTGTGATGTTTGCAACTTAGCCGTACATCAGGAATGTTATGGAGTTCCTTATGTCCCTGAAGGTCCTTGGTTGTGTCGTAAATGCCTTCACTCACCGAGTGAACCAGTTTCATGTGTCCTTTGTCCTAATAGAGGCGGTGCCTTC AAAAAAACGACAGATGACCGATGGGCTCATGTAATATGTGGGTTATGGGTACCTGAAGTGATGTTTGCTAATCTGACGTTCCTTGAACCGCTTGAAGGCATCGACAGAATTGCTGCAGCCAGATGGCGTCTTCAGTGTTTCATTTGTAAACAACGCAATGTTGGTGCTTGTATACAGTGTCATAAATCTAGTTGTTATCGAGCATTTCATGTGACATGTGCACAGCATGCTGGATTGTATATGAAAATTGAGCATGCAGGTGATCCTGGAGATCTAGGAATCCGAAAGAGTGCGTTTTGCGATC                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD095195             [ TGTTATATTATTTTGTGATGTTTGCAACTTAGCCGTACATCAGGAATGTTATGGAGTTCCTTATGTCCCTGAAGGTCCTTGGTTGTGTCGTAAATGCCTTCACTCACCGAGTGAACCAGTTTCATGTGTCCTTTGTCCTAATAGAGGCGGTGCCTTC AAAAAAACGACAGATGACCGATGGGCTCATGTAATATGTGGGTTATGGGTACCTGAAGTGATGTTTGCTAATCTGACGTTCCTTGAACCGCTTGAAGGCACCGACAGAATTGCTGCAGCCAGATGGCGTCTTCAGTGTTTCATTTGTAAACAACGCAATGTTGGTGCTTGTATACAGTGTCATAAATCTAGTTGTTATCGAGCATTTCATGTGACATGTGCACAGCATGCTGGATTGTATATGAAAATTGAGCATACAGATGATCCTGGAGATCTAGGGATCCGAAAGAGTGCGTTTTGCGATC                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD094782             [ TGTTATATTATTTTGTGATGTTTGCAACTTAGCCGTACATCAGGAATGTTATGGAGTTCCTTATGTCCCTGAAGGTCCTTGGTTGTGTCGTAAATGCCTTCACTCACCGAGTGAACCAGTTTCATGTGTCCTTTGTCCTAATAGAGGCGGTGCCTTC AAAAAAACGACAGATGACCGATGGGCTCATGTAATATGTGGGTTATGGGTACCTGAAGTGATGTTTGCTAATCTGACGTTCCTTGAACCGCTTGAAGGCATCGACAGAATTGCTGCAGCCAGATGGCGTCTTCAGTGTTTCATTTGTAAACAACGCAATGTTGGTGCTTGTATACAGTGTCATAAATCTAGTTGTTATCGAGCATTTCATGTGACATGTGCACAGCATGCTGGATTGTATATGAAAATTGAGCATACAGATGATCCTGGAGATCTAGGAATCCGAAAGAGTGCGTTTTGCGATC                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD094841             [ TGTTATATTATTTTGTGATGTTTGCAACTTAGCCGTACATCAGGAATGTTATGGAGTTCCTTATGTCCCTCAAGGTCCTTGGTTGTGTCGTAAATGCCTTCACTCTCCGAGTGAACCAGTTTCATGTGTCCTTTGTCCTAATAGAGGCGGTGCCTTC AAAAAAACGGCAGATGACCGATGGGCTCATGTAATATGTGGGTTATGGGTACCTCAAGTGATGTTTGCTAATCTGACGTTCCTTGAACCGCTTGAAGGCATCGACAGAATTGCTGCAGCCAGATGGCGTCTTCAGTGTTTCATTTGTAAACAACGCAATGTTGGTGCTTGTATACAGTGTCATAAATCTAGTTGTTATCGAGCATTTCATGTGACATGTGCACAGCATGTTGGATTGTATATGAAAATTGAGCATACAGATGATCCTGGAGATCTAGGAATCCGAAAGAGTGCGTTTTGCGATC                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD094877             [           TTTTGTGATGTTTGCAACTTAGCCGTACATCAGGAATGTTATGGAGTTCCTTATGTCCCTGAAGGTCCTTGGTTGTGTCGTAAATGCCTTCACTCACCGAGTGAACCAGTTTCATGTGTCCTTTGTCCTAATAGAGGCGGTGCCTTC AAAAAAACGACAGATGACCGATGGGCTCATGTAATATGTGGGTTATGGGTACCTGAAGTGATGTTTGCTAATCTGACGTTCCTTGAACCGCTTGAAGGCATCGACAGAATTGCTGCAGCCAGATGGCGTCTTCAGTGTTTCATTTGTAACCAACGCAATGTTGGTGCTTGTATACAGTGTCATAAATCTAGTTGTTATCGAGCATTTCATGTGACATGTGCACAGCATGCTGGATTGTATATGAAAATTGAGCATACAGATGATCCTGGAGATCTAGGAATCCGAAAGAGTGCGTTTCGCGATC                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD095350             [                                                                                 GGTTGTGTTGTAAATGCCTTCACTCACCGAGTGAACCAGTTTCATGTGTCCTTTGTCCTAATAGAGGCGGTGCCTTCAAAAAAAACGACAGATGACCGATGGGCTCATGTAATATGTGGGTTATGGGTACCTGAAGTGATGTTTGCTAATCTGACGTTCCTTGAACCGCTTGAAGGCATCGACAGAATTGCTGCAGCCAGATGGCGTCTTCAGTGTTTCATTTGTAAACAACGCAATGTTGGTGCTTGTATACAGTGTCATAAATCTAGTTGTTATCGAGCATTTCATGTGACATGTGCACAGCATGCTGGATTGTATATGAAAATTGAGCATACAGATGATCCTGGAGATCTAGGAATCCGAAAGAGTGCGTTTTGCGATC                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD115201             [                                                                                                                                                                                                                       AGTGATGTTTGCTAATCTGACGTTCCTTGAACCGCTTGAAGGCATCGACAGAATTGCTGCAGCCAGATGGCGTCTTCAGTGTTTCATTTGTAAACAACGCAATCTTGGTGCTTGTACACAGTGTCATAAATCTAGTTGTTATCGAGCATTTCATGTGACATGTGCACAGCATGCTGGATTGTATATGAAAATTGAGCATACAGATGATCCTGGAGATCTAGGAATCCGAAAGAGTGCGTTTTGCGATCAACATTGTCCGCCGAATCACTTTTCTAGTTCAAACAAAGGAATGTACGCTCATTCTGATTCTGATGGTCCTCAATCTCCTGAGCGAGCAGCTCGAATTCATCTCAGGAAAGCTCG TAAAA            ]
[-] EMBL CD095222             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TGTCATAAATATAGTTGTTATCTAGCATTTCATTTGACATGTGCACAGCATGCTGGATTGTATATGAAAATTGAGCATACAGATGATCCTGGAGATCTAGGAATCCGAAAGAGTGCGTTTTGCGATC                                                                                                                                     ]




>consensus_10331#0
ATGTTATATTATTTTGTGATGTTTGCAACTTAGCCGTACATCAGGAATGTTATGGAGTTC
CTTATGTCCCTGAAGGTCCTTGGTTGTGTCGTAAATGCCTTCACTCACCGAGTGAACCAG
TTTCATGTGTCCTTTGTCCTAATAGAGGCGGTGCCTTCAAAAAAACGACAGATGACCGAT
GGGCTCATGTAATATGTGGGTTATGGGTACCTGAAGTGATGTTTGCTAATCTGACGTTCC
TTGAACCGCTTGAAGGCATCGACAGAATTGCTGCAGCCAGATGGCGTCTTCAGTGTTTCA
TTTGTAAACAACGCAATGTTGGTGCTTGTATACAGTGTCATAAATCTAGTTGTTATCGAG
CATTTCATGTGACATGTGCACAGCATGCTGGATTGTATATGAAAATTGAGCATACAGATG
ATCCTGGAGATCTAGGAATCCGAAAGAGTGCGTTTTGCGATCAACATTGTCCGCCGGATC
ACTTTTCTAGTTCAAACAAAGGAATGTACGCTCATTCTGATTCTGATGGTCCTCAATCTC
CTGAGCGAGCAGCTCGAATTCATCTCAGGAAAGCTCGTANAATTNTAGCCGAAC

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)