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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10386#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 16 consensus length = 842 fasta sequence
[ATTGTGCAATAGTAGGTGTAGTAATACGCAGTCAG-AAACGATAATCGGGTTGACAATCTCACTTCAGTCA-ACCGAAAATAAGTGACTGCTATTAGTAAACGCTAAGAATTGGACGGTTGCATTTTTCATTGAGATTTGATGTAGAACAAATATCACAGTGGGTTTCACGACTTCTCATAGTAGAGTTCGATCCACGACAGCTTAACAGTACTGGTGTAGATGGAACTAAACTCCCCAGAAGGGAGGATGATGGTCGACTGTATGAGAAGCAAAGTGGACGAGAACGACCAGCAGCAACAGATGCGCTGCGAACATATACTGAAGATGGATAAGACGGGTATTTCTGAACATATTCCGAAATCCACGAGTTTGTTGGCTCCCAGTTGATATTGTTGTTTGAGCGAGAATGTGAAGCACCCAACCCAGATAGTTGCGGCACACTGCTAACTCTTGTTGACTTGTGGATGGTAGGAACGGGTTTTTCAGTTTTACTTAGTTCAATTGCCTTACTTTTCACAATACACTGTTTTGGCCCACATATTATAGATGACACTTTAGAGTTTACGGTATTCGTATGTGTAAAACTATTCAGCCTTTCTTTACGGCGAGCCTCAGCACGTATAGCAGAAGGATAAACATCTCGGTCTGACTTAACGTTGAAAGTTTTTCTAGCCCCCAACATAGGACCAGGAGAACTTCCGATAGCGTAAGGTACAAAAGCTTTGGGTTGTTCTATTGCCTTTATTTGGGGTTTTTGAGTTTGGGTACCGACGTCTGTTCTCTCAGTGGTCGAAACGCCGTCATTCTTTTCCTTCACCTGTGTAACATCATGCGGGCCTTCA]
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[+] EMBL CD127938 [ GTAGGTGTAGTAATACGCAGTTAGNAAACGATAATCGGGTTGACAATCTCACTTCAGTCA ACCG AAATAAGTGACTGCTATTAGTAAACGCTAAGAATTGGACGGTTGCATTTTTCATTGAGATTTGATGTAGAACAAATATCACAGTGGGTTTCACGACTTCTCATAGTAGAGTTCGATCCACGACAGCTTAACAGTACTGGTGTAGATGGAACTAAACTCCCCAGAAGGGAGGATGATGGTCGACTGTATGAGAAGCAAAGTGGACGAGAACGACCAGCAGCAACAGATGCGCTGCGAACATATACTGAAGATGGATAAGACGGGTATTTCTGAACATATTCCGAAATCCACGAGTTTGTTGGCTCCCAGTTGATATTGTTGTTTGAGCGAGAATGTGAAGCACCCAACCCAGATAGTTGCGGCACACTGCTAACTCTTGTTGACTTGTGGATGGTAGGAACGGGTTTTTCAGTTTTACT ]
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[+] EMBL CD178798 [ ACGCAGTCAG AAACGATAATCGGGTTGACAATCTCACTTCAGTCAGACCGAAAATAAGTGACTGCTATTAGTAAACGCTAAGAATTGGACGGTTGCATTTTTCATTGAGATTTGATGTAGAACAAATATCACAGTGGGTTTCACGACTTCTCATAGTAGAGTTCGATCCACGACAGCTTAACAGTACTGGTGTAGATGGAACTAAACTCCCCAGAAGGGAGGATGATGGTCGACTGTATGAGAAGCAAAGTGGACGAGAACGACCAGCAGCAACAGATGCGCTGCGAACATATACTGAAGATGGATAAGACGGGTATTTCTGAACATATTCCGAAATCCACGAGTTTGTAGGC ]
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[-] EMBL CD127282 [ GCAGTCAG AAACGATAATCGGGTTGACAATCTCACTTCAGTCA ACCGAAAATAAGTGACTGCTATTAGTAAACGCTAAGAATTGGACGGTTGCATTTTTCATTGAGATTTGATGTAGAACAAATATCACAGTGGGTTTCACGACTTCTCATAGTAGAGTTCGATCCACGACAGCTTAACAGTACTGGTGTAGATGGAACTAAACTCCCCAGAAGGGAGGATGATGGTCGACTGTATGAGAAGCAAAGTGGACGAGAACGACCAGCAGCAACAGATGCGCTGCGAACATATACTGAAGATGGATAAGACGGGTATTTCTGAACATATTCCGAAATCCACGAGTTTGTTGGCTCCCAGTTGATATTGTTGTTTGAGCGAGAATGTGAAGCACCCAACCCAGATAGTTGCGGCACACTGCTAACTCTTGTTGACTTGTGGATGGTAGGAACGGGTTTTTCAGTTATACTTAGTTCAATTACC TACTatgt ]
[-] EMBL CD127622 [ GCAGTCAG AAACGATAATCGGGTTGACAATCTCACTTCAGTCA ACCGAAAATAAGTGACTGCTATTAGTAAACGCTAAGAATTGGACGGTTGCATTTTTCATTGAGATTTGATGTAGAACAAATATCACAGTGGGTTTCACGACTTCTCATAGTAGAGTTCGATCCGCGACAGCTTAACAGTACTGGTGTAGATGGAACTAAACTCCCCAGAAGGGAGGATGATGGTCGACTGTATGAGAAGCAAAGTGGACGAGAACGACCAGCAGCAACAGATGCGCTGCGAACATATACTGAAGATGGATAAGACGGGTATTTCTGAACATATTCCGAAATCCACGAGTTTGTTGGCTCCCAGTTGATATTGTTGTTTGAGCGAGAATGTGAAGCACCCAACCCAGATAGTTGCGGCACACTGCTAACTCTTGTTGACTTGTGGATGGTAGGAACGGGTTTTTCAGTTTTACTT ]
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[+] EMBL CD060479 [ GTTGCGGCACACTGCTAACTCTTGTTGACTTGTGGATGGTAGGAACGGGTTTTTCAGTTTTACTTAGTTCAATTGCCTTACTTTTCACAATACACTGTTTTGGCCCACATATTTTAGATGACACTTTGGAGTTTACGGTATTCGTATGTGTAAAACTATTCAGCCTTTCTTTACGGCGAGCCTCAGCACGTATAGCAGAAGGATAAACATCTCGGTCTGACTTAACGTTGAAAGTTTTTCTAGCCCCCAACATAGGACCAGGAGAACTTCCGATAGCGTAAGGTACAAAAGCTTTGGGTTGTTCTATTGCCTTTATTTGGG ]
[+] EMBL CD122326 [ TTCAGTTTTACTTAGTTCAATTGCCTTACTTTTCACAATACACTGTTTTGGCCCACATATTATAGATGACACTTTAGAGTTTACGGTATTCGTATGTGTAAAACTATTCAGCCTTTCTTTACGGCGAGCCTCAGCACGTATAGCAGAAGGATAAACATCTCGGTCTGACTTAACGTTGAAAGTTTTTCTAGCCCCCAACATAGGACCAGGAGAACTTCCGATAGCGTAAGGTACAAAAGCTTTGGGTTGTTCTATTGCCTTTATTTGGGGTTTTTGAGTTTGGGTACCGACGTCTGTTCTCTCAGTGGTCGAAACGCCGTCATTCTTTTCCTTCACCTGTGTAACATCATGCGGGCCTTCA]
[+] EMBL CD179294 [ CAGAAGGATAAACATCTCGGTCTGACTTAACGTTGAAAGTTTTTCTAGCCCCCAACATAGGACCAGGAGAACTTCCGATAGCGTAAGGTACAAAAGCTTTGGGTTGTTCTATTGCCTTTATTTGGGGTTTTTGAGTTTGGGTACCGACGTCTGTTCTCTCAGTGGTCGAAACGCCGTCATTCTTTTCCTTCACCTGTGTAACATCATGCGGGCCT ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||