cluster # 10399

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 10399 cluster # 10399 Sequences # 16 consensus # 9

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_10399#0 length = 768 sequences # 3
consensus_10399#1 length = 645 sequences # 2
consensus_10399#2 length = 598 sequences # 2
consensus_10399#3 length = 562 sequences # 4

consensus_10399#4 length = 471 sequences # 1
consensus_10399#5 length = 424 sequences # 1
consensus_10399#6 length = 407 sequences # 1
consensus_10399#7 length = 335 sequences # 1
consensus_10399#8 length = 272 sequences # 1

consensusID : consensus_10399#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 768
fasta sequence

                              [CGACTGCTATAACTATAGCTTTAAGTTTTCAGCATTATTTTTGGAAAGCCTCAGGTCGTACCTCAGGGTGCTGTTGCAGTTGACGATGATTTGTGTGGTCAAATAGGCTTAAATATAATGCGAGAAAACAAAGGGAATGCTGTTGATGCGATGGTATCTGATTGGACAAGGACGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGAC-AGGACGGTGTTCTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTTAATTGTGTCGAGTGATAAGAGAGTTTGTTGGTGATATTGATGGCGATAGAGTGGTGATGGGTGACGGTTGAAGTATGCGGTGATGGTGATAATTTATAAGCGATGTGTTTGAATCGGAATAGCGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTAAATTGTGTCGAGTGATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTTAATTGTGTCGAGTGATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGNNAC-AGGACGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTG]

[+] EMBL CD060146             [CGACTGCTATAACTATAGCTTTAAGTTTTCAGCATTATTTTTGGAAAGCCTCAGGTCGTACCTCAGGGTGCTGTTGCAGTTGACGATGATTTGTGTGGTCAAATAGGCTTAAATATAATGCGAGAAAACAAAGGGAATGCTGTTGATGCGATGGTATCTGATTGGACAAGGACGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGAC AGGACGGTGTTCTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTTAATTGTGTCGAGTGATAAGAGAGTTTGTTGGTGATATTGATGGCGATAGAGTGGTGATGGGTGACG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD153925             [                                                                                                                                                                                                                                 TTGGACAAGGACGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTTAATTGTGTCGAGTGATAAAAGAGTTTGTTGGTGATATTGATGGCGATAGAGTGGTGATGGGTGACGGTTGAAGTATGCGGTGATGGTGATAATTTATAAGCGATGTGTTTGAATCGGAATAGCGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTAAATTGTGTCGAGTGATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTTAATTGTGTCGAGTGATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGNNAC AGGACGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTG]
[+] EMBL CD115747             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TATTGATGGCGATAGAGTGGTGATGGGTGACGATTGAAGTTTGCGGTGATGGCGATAATTTATAAGCGATGTGTTTGAATCGGAATAGCGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTGGCTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTGGTTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTG GACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATT  ]




>consensus_10399#0
CGACTGCTATAACTATAGCTTTAAGTTTTCAGCATTATTTTTGGAAAGCCTCAGGTCGTA
CCTCAGGGTGCTGTTGCAGTTGACGATGATTTGTGTGGTCAAATAGGCTTAAATATAATG
CGAGAAAACAAAGGGAATGCTGTTGATGCGATGGTATCTGATTGGACAAGGACGGTGTTC
TGTTGAGTGTTACGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACAGGACGGTG
TTCTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGT
TAATTGTGTCGAGTGATAAGAGAGTTTGTTGGTGATATTGATGGCGATAGAGTGGTGATG
GGTGACGGTTGAAGTATGCGGTGATGGTGATAATTTATAAGCGATGTGTTTGAATCGGAA
TAGCGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTG
AGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTAAATTGTG
TCGAGTGATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATG
GTGTTCTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGG
CGTTAATTGTGTCGAGTGATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATT
GNNACAGGACGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTG

consensusID : consensus_10399#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 645
fasta sequence

                              [TGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTGGTTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTGGTTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTGGTTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTGGTTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATANAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGNACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGNTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTGGTTGTGGCGCT-ATTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATATAGTTC]

[+] EMBL CD154239             [TGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTGGTTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTGGTTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTGGTTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTGGTTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATANAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGNACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGNTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTGGTTGTGGCGCT ATTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATATAGTT ]
[+] EMBL CD115876             [                                                                                     CTAATTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATAATGGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACGAGCTGGTTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTGGTTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTGGTTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATATAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGCACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGCAACGAGAGTTGGCGTGATTTGGTGTTCGT CCAACTGGTTGTGGCGCTAATTGTGTCGAGTGATAAAAGATTAAATATtacgc]




>consensus_10399#1
TGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTG
GTGTTTGTACGAACTGGTTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATAATAG
TTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTT
GGTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTGGTTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATAAAAGA
GTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTG
TTACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTGGTTGTGGCGCTAATTATGTCGA
GTAATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGT
TCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTGGTTGTGGCGCT
AATTATGTCGAGTAATANAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGNAC
GAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGNTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTG
GTTGTGGCGCTATTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATATAGTTC

consensusID : consensus_10399#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 598
fasta sequence

                              [GGTTGTGGCGTTAATTGTGTCGAGTGATAAAAGAGTTAGTTGGTGATATTGATGGCGATAGAGTGGTGATGGGTGACGGTTGAAGTATGCGGTGATGGTGATAATTTATAAGCGATGTGTTTGAATCGGAATAGCGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTTAATTATGTCGAGTGGTAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAATGGTGGTGACTGACTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTAAATTGCGTCGAGTGATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAATGGTGGTGACTGACTGGACGAGGATGGTGCTGTGTTGAGTGTAACGTAAATAATAGTTGTGTAATGGTGGTGACTGACTGGACGAGGATGGTGCTGTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTAAATTGCGTCGAGTGATAAAAGAGTTTGTTGGTGATATTGATGACGATAGAGTGGTGATGGGTGACGAATGAAGTATGCGGTGAGCTCAAGAG]

[-] EMBL CD142950             [GGTTGTGGCGTTAATTGTGTCGAGTGATAAAAGAGTTAGTTGGTGATATTGATGGCGATAGAGTGGTGATGGGTGACGGTTGAAGTATGCGGTGATGGTGATAATTTATAAGCGATGTGTTTGAATCGGAATAGCGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTTAATTATGTCGAGTGGTAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAATGGTGGTGACTGACTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTAAATTGCGTCGAGTGATAAAAGAGTAA                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD128906             [                                                                                                                                              GGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTAAATTGCGTCGAGTGATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGCCGAGGACGGTGTTCTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTTAATTGTGTCGAGTGATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAATGGTGGTGACTGACTGGACGAGGATGGTGCTGTGTTGAGTGTAACGTAAATAATAGTTGTGTAATGGTGGTGACTGACTGGACGAGGATGGTGCTGTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTAAATTGCGTCGAGTGATAAAAGAGTTTGTTGGTGATATTGATGACGATAGAGTGGTGATGGGTGACGAATGAAGTATGCGGTGAGCTCAAGAG]




>consensus_10399#2
GGTTGTGGCGTTAATTGTGTCGAGTGATAAAAGAGTTAGTTGGTGATATTGATGGCGATA
GAGTGGTGATGGGTGACGGTTGAAGTATGCGGTGATGGTGATAATTTATAAGCGATGTGT
TTGAATCGGAATAGCGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTT
AATTATGTCGAGTGGTAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAATGGTGGTGACTGACTGGAC
GAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTG
GTTGTGGCGTAAATTGCGTCGAGTGATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAATGGTGGTG
ACTGACTGGACGAGGATGGTGCTGTGTTGAGTGTAACGTAAATAATAGTTGTGTAATGGT
GGTGACTGACTGGACGAGGATGGTGCTGTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGG
TGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTAAATTGCGTCGAGTGATAAAAGAGTTTGTTGGTGA
TATTGATGACGATAGAGTGGTGATGGGTGACGAATGAAGTATGCGGTGAGCTCAAGAG

consensusID : consensus_10399#3
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 562
fasta sequence

                              [CCACGAGACGACGAACTTTACAGAACCCAGCAAGCTAATCTCTAATGCACAGATCAAAACTTTGAAGTTCTGATTATTTTCCGTTCGAAGAGGTTTAAGTAAATATAACAGTAGTTTTATTGAGACTTATCTATGTGCATCTTGAAATTAATGTGTTATGGGTAGTGAACATCACTCAGTTATATAGGTAGGATTAAACTATACTGCCGAGCCAATCAGAAGCTTTCGCTGGTTTTCAAGTTCACGGCGCTAAGTTCGGTACCTGATGCTTACGTACGGTCGGTTTACAGAGGTTTTTAGGGAAGGCGTGATAATTTAGCGTCTACAATAGAAGTGATCATAAGATTCTGGCGCGAAATTCAATTATCCATTTGGATAGATAGAGTTTTGGCATTATAGCTGATGTCAGTTCGTGATGAAAACCCTAAGTATAATTCCTAGCCTTAATCATGAACTGTAAATCATAATTTGAATTCTTCACACAGGTTTATAAACCTCATTTGGTCTTAGTTATTATGTTGACACTCTCAGAGTCACTCTAGCGTCGCTCAAAGGTTGTCCA]

[+] EMBL CD093708             [CCACGAGACGACGAACTTTACAGAACCCAGCAAGCTAATCTCTAATGCACAGATCAAAACTTTGAAGTTCTGATTATTTTCCGTTCGAAGAGGTTTAAGTAAATATAACAGTAGTTTTATTGAGACTTATCTATGTGCATCTTGAAATTAATGTGTTATGGGTAGTGAACATCACTCAGTTATATAGGTAGGATTAAACTATACTGCCGAGCCAATCAGAAGCTTTCGCTGGTTTTCAAGTTCACGGCGCTAAGTTCGGTACCTGATGCTTACGTACGGTCGGTTTACAGAGGTTTTTAGGGAAGGCGTGATAATTTAGCGTCTACAATAGAAGTGATCATAAGATTCTGGCGCGAAATTCAATTATCCATTTGGATAGATAGAGTTTTGGCATTATAGCTGATGTCAGTTCGTGATGAAAACCCTAAGTATAATTCCTAGCCTTAATCATGAACTGTAAATCATAATTTGAATTCTTCACACAGGTTTATAAACCTCATTTGGTCTTAGTTATTATGTTGACACTCTCAGAGTCACTCTAGCGTCGCTCAAAGGTTGTCCA]
[+] EMBL CD093716             [CCACGAGACGACGAACTTTACAGAACCCAGCAAGCTAATCTCTAATGCACAGATCAAAACTTTGAAGTTCTGATTATTTTCCGTTCGAAGAGGTTTAAGTAAATATAACAGTAGTTTTATTGAGACTTATCTATGTGCATCTTGAAATTAATGTGTTATGGGTAGTGAACATCACTCAGTTATATAGGTAGGATTAAACTATACTGCCGAGCCAATCAGAAGCTTTCGCTGGTTTTCAAGTTCACGGCGCTAAGTTCGGTACCTGATGCTTACGTACGGTCGGTTTACAGAGGTTTTTAGGGAAGGCGTGATAATTTAGCGTCTACAATAGAAGTGATCATAAGATTCTGGCGCGAAATTCAATTATCCATTTGGATAGATAGAGTTTTGGCATTATAGCTGATGTCAGTTCGTGATGAAAACCCTAAGTATAATTCCTAGCCTTAATCATGAACTGTAAATCATAATTTGAATTCTTCACACAGGTTTATAAACCTCATTTGGTCTTAGTTATTATGTTGACACTCTCAGAGTCACTCTAGCGTCGCTCAAAGGTTGTCCA]
[+] EMBL CD093633             [ctACGAGACGACGAACTTTACAGAACCCAGCAAGCTAATCTCTAATGCACAGATCAAAACTTTGAAGTTCTGATTATTTTCCGTTCGAAGAGGTTTAAGTAAATATAACAGTAGTTTTATTGAGACTTATCTATGTGCATCTTGAAATTAATGTGTTATGGGTAGTGAACATCACTCAGTTATATAGGTAGGATTAAACTATACTGCCGAGCCAATCAGAAGCTTTCGCTGGTTTTCAAGTTCACGGCGCTAAGTTCGGTACCTGATGCTTACGTACGGTCGGTTTACAGAGGTTTTTAGGGAAGGCGTGATAATTTAGCGTCTACAATANAAGTGATCATAAGATTCTGGCGCGAAATTCAATTATCCATTTGGATAGATAGAGTTTTGGCATTATAGCTGATGTCANTTCGTGATGAAAACCCTAAGTATAATTCCTAACCTTAATCATGAACTGTAAATCATAATTTGAATTCTTCACACAGGTTTATAAACC                                                                  ]
[+] EMBL CD093679             [                  tgCAGAACCCAGCAAGCTAATCTCTAATGCACAGATCAAAACTTTGAAGTTCTGATTATTTTCCGTTCGAAGAGGTTTAAGTAAATATAACAGTAGTTTTATTGAGACTTACCTATGTGCATCTTGAAATTAATGTGTTATGGGTAGTGAACATCACTCAGTTATATAGGTAGGATTAAACTATACTGCCGAGCCAATCAGAAGCTTTCGCTGGTTTTCAAGTTCACGGCGCTAAGTTCGGTACCTGATGCTTACGTACGGTCGGTTTACAGAGGTTTTTAGGGAAGGCGTGATAATTTAGCGTCTACAATAGAAGTGATCATAAGATTCTGGCGCGAAATTCAATTATCCATTTGGATAGATAGAGTTTTGGCATTATAGCTGATGTCAGTTCGTGATGAAAACCCTAAGTATAATTCCTAGCCTTAATCATGAACTGTAAATCATAATTTGAATTCTTCACACAGGTTTATAAACCTCATTTGGTCTTAGTTATTATGTTGACACTCTCAGAGTCACTCTAGCGTCGCTCAAAGGTTGTCC ]




>consensus_10399#3
CCACGAGACGACGAACTTTACAGAACCCAGCAAGCTAATCTCTAATGCACAGATCAAAAC
TTTGAAGTTCTGATTATTTTCCGTTCGAAGAGGTTTAAGTAAATATAACAGTAGTTTTAT
TGAGACTTATCTATGTGCATCTTGAAATTAATGTGTTATGGGTAGTGAACATCACTCAGT
TATATAGGTAGGATTAAACTATACTGCCGAGCCAATCAGAAGCTTTCGCTGGTTTTCAAG
TTCACGGCGCTAAGTTCGGTACCTGATGCTTACGTACGGTCGGTTTACAGAGGTTTTTAG
GGAAGGCGTGATAATTTAGCGTCTACAATAGAAGTGATCATAAGATTCTGGCGCGAAATT
CAATTATCCATTTGGATAGATAGAGTTTTGGCATTATAGCTGATGTCAGTTCGTGATGAA
AACCCTAAGTATAATTCCTAGCCTTAATCATGAACTGTAAATCATAATTTGAATTCTTCA
CACAGGTTTATAAACCTCATTTGGTCTTAGTTATTATGTTGACACTCTCAGAGTCACTCT
AGCGTCGCTCAAAGGTTGTCCA

consensusID : consensus_10399#4
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 471
fasta sequence

                              [GTTTAAATCGGAATAGCGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGCCGAGGACGGTGTTCTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGCGGCGTAAATTGTGTCGAGTGATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGCCGAGGACGGTGTTCTGTTGAGTGTAACGTTTGTTGGTGATATTGATGACGATAGAGTGGTGATGGGTGACGGTTGAAGTATGCGGTGATGGTGATAATTTATAAGCGATGTGTTTAAATCGGAATAGCGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGCCGAGGACGGTGTTCTGTTGAGTGTAACGTAAATAATAGTTGTGTAATGGTGGTGACTGACTGGACGAGGATGGTGCTGTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCA]

[-] EMBL CD168666             [GTTTAAATCGGAATAGCGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGCCGAGGACGGTGTTCTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGCGGCGTAAATTGTGTCGAGTGATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGCCGAGGACGGTGTTCTGTTGAGTGTAACGTTTGTTGGTGATATTGATGACGATAGAGTGGTGATGGGTGACGGTTGAAGTATGCGGTGATGGTGATAATTTATAAGCGATGTGTTTAAATCGGAATAGCGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGCCGAGGACGGTGTTCTGTTGAGTGTAACGTAAATAATAGTTGTGTAATGGTGGTGACTGACTGGACGAGGATGGTGCTGTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCA]




>consensus_10399#4
GTTTAAATCGGAATAGCGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGCCGAGGA
CGGTGTTCTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGC
GGCGTAAATTGTGTCGAGTGATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGA
TTGGCCGAGGACGGTGTTCTGTTGAGTGTAACGTTTGTTGGTGATATTGATGACGATAGA
GTGGTGATGGGTGACGGTTGAAGTATGCGGTGATGGTGATAATTTATAAGCGATGTGTTT
AAATCGGAATAGCGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGCCGAGGACGGT
GTTCTGTTGAGTGTAACGTAAATAATAGTTGTGTAATGGTGGTGACTGACTGGACGAGGA
TGGTGCTGTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCA

consensusID : consensus_10399#5
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 424
fasta sequence

                              [GGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTAAATTGCGTCGAGTGATAAAAGAGTTTGTTGTTGCTATCTGGGGACGACCGATCGGTGATGGGTGACGCTTCAGACTCTGCGATGATGATGATAACTTCATAATGACGATGTGATTTGGACTCGGAATTACGCATAGATTCACACTCTGTCAAACCGGTGCTGGGTGATTGGACGCGGACCGTATTTCATCGATTAGAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTAAATTGTGTCGAGTGATAAAAGAGTTTGTTGGTGATATTGATGACGATAGAGTGGTGATGGGTGACGAGTGAAGTATGCGGTGATGGTGATAATTTATAAGCGATGTGTTTGAATCGGAATAGCGTAAATAATAGTTGTGTAA]

[-] EMBL CD159726             [GGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTAAATTGCGTCGAGTGATAAAAGAGTTTGTTGTTGCTATCTGGGGACGACCGATCGGTGATGGGTGACGCTTCAGACTCTGCGATGATGATGATAACTTCATAATGACGATGTGATTTGGACTCGGAATTACGCATAGATTCACACTCTGTCAAACCGGTGCTGGGTGATTGGACGCGGACCGTATTTCATCGATTAGAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTAAATTGTGTCGAGTGATAAAAGAGTTTGTTGGTGATATTGATGACGATAGAGTGGTGATGGGTGACGAGTGAAGTATGCGGTGATGGTGATAATTTATAAGCGATGTGTTTGAATCGGAATAGCGTAAATAATAGTTGTGTAA]




>consensus_10399#5
GGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTAAATTGCGTCGAGTGATAAAAGA
GTTTGTTGTTGCTATCTGGGGACGACCGATCGGTGATGGGTGACGCTTCAGACTCTGCGA
TGATGATGATAACTTCATAATGACGATGTGATTTGGACTCGGAATTACGCATAGATTCAC
ACTCTGTCAAACCGGTGCTGGGTGATTGGACGCGGACCGTATTTCATCGATTAGAACGAG
AGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTAAATTGTGTCGAGTGATAA
AAGAGTTTGTTGGTGATATTGATGACGATAGAGTGGTGATGGGTGACGAGTGAAGTATGC
GGTGATGGTGATAATTTATAAGCGATGTGTTTGAATCGGAATAGCGTAAATAATAGTTGT
GTAA

consensusID : consensus_10399#6
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 407
fasta sequence

                              [GTAATAAAAGAGAGAGTTGGTGTGATNTGGTGTTTGTACGAGCTGGTTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATAAAAGAGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTGGTTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTGGTTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGTT]

[-] EMBL CD137189             [GTAATAAAAGAGAGAGTTGGTGTGATNTGGTGTTTGTACGAGCTGGTTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATAAAAGAGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTGGTTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTGGTTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGTT]




>consensus_10399#6
GTAATAAAAGAGAGAGTTGGTGTGATNTGGTGTTTGTACGAGCTGGTTGTGGCGCTAATT
ATGTCGAGTAATAAAAGAGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTGGTTGTGGC
GCTAATTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTG
GACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACGAA
CTGGTTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTG
GTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGTAAATAATAGTTGTGTAAC
GGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGTT

consensusID : consensus_10399#7
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 335
fasta sequence

                              [GGTGTTCTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATCTGGTGTTTGTACGACCTGGTTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAGCGGTGGTGTCTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGATATTGATGGCGATAGAGTGGTGATGGGTGACGATTGAAGTTTGCGGTGATGGCGATAATTTATAAGCGATGTGTTTGAATCGGAATAGCGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGTAAATAATAGTTGTGTAA]

[-] EMBL CD143219             [GGTGTTCTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATCTGGTGTTTGTACGACCTGGTTGTGGCGCTAATTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAGCGGTGGTGTCTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGATATTGATGGCGATAGAGTGGTGATGGGTGACGATTGAAGTTTGCGGTGATGGCGATAATTTATAAGCGATGTGTTTGAATCGGAATAGCGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGTAAATAATAGTTGTGTAA]




>consensus_10399#7
GGTGTTCTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATCTGGTGTTTGTACGACCTGGTTGTG
GCGCTAATTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAGCGGTGGTGTCTGAT
TGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGATATTGATGGCGATAGAG
TGGTGATGGGTGACGATTGAAGTTTGCGGTGATGGCGATAATTTATAAGCGATGTGTTTG
AATCGGAATAGCGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTG
TTCTGTTGAGTGTTACGTAAATAATAGTTGTGTAA

consensusID : consensus_10399#8
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 272
fasta sequence

                              [TGAATTATGCGGTGATGGTGATAATTTATAAGCGATGTGTTTGAATCGGAATAGCGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACAAGGACGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTTAATTGTGTCGAGTGATAAAAGAGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTTAATTGTGTCGAGTGATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAA]

[-] EMBL CD159892             [TGAATTATGCGGTGATGGTGATAATTTATAAGCGATGTGTTTGAATCGGAATAGCGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACAAGGACGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTTAATTGTGTCGAGTGATAAAAGAGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTTAATTGTGTCGAGTGATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAA]




>consensus_10399#8
TGAATTATGCGGTGATGGTGATAATTTATAAGCGATGTGTTTGAATCGGAATAGCGTAAA
TAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACAAGGACGGTGTTCTGTTGAGTGTTACG
AGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTTAATTGTGTCGAGTGAT
AAAAGAGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTTAATTGTGTC
GAGTGATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAA

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10399#0      CGACTGCTATAACTATAGCTTTAAGTTTTCAGCATTATTTTTGGAAAGCCTCAGGTCGTA 60
consensus_10399#8      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#6      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#4      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#7      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#5      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10399#0      CCTCAGGGTGCTGTTGCAGTTGACGATGATTTGTGTGGTCAAATAGGCTTAAATATAATG 120
consensus_10399#8      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#6      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#4      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#7      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#5      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10399#0      CGAGAAAACAAAGGGAATGCTGTTGATGCGATGGTATCTGATTGGACAAGGACGGTGTTC 180
consensus_10399#8      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#6      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#4      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#7      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#5      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10399#0      TGTTGAGTGTTACGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACAGGACGGTG 240
consensus_10399#8      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#6      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#4      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#7      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#5      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10399#0      TTCTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGT 300
consensus_10399#8      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#6      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#4      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#7      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#5      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10399#0      TAATTGTGTCGAGTGATAAGAGAGTTTGTTGGTGATATTGATGGCGATAGAGTGGTGATG 360
consensus_10399#8      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#1      -----------------TGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACG 43
consensus_10399#6      ------------------------------------------------GTAATAAAAGAG 12
consensus_10399#4      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#7      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#2      ------------------------------------------------------GGTTGT 6
consensus_10399#5      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#3      ---------------------------------CCACGAGACGACGAACTTTACAGAACC 27
                                                                                   

consensus_10399#0      GGTGACGGTTGAAGTATGCGGTGATGGTGATAATTTATAA---GCGATGTGTTTGAATCG 417
consensus_10399#8      ---------TGAATTATGCGGTGATGGTGATAATTTATAA---GCGATGTGTTTGAATCG 48
consensus_10399#1      AGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTGGTTGTGGCGCTAATTATG-TCGAGTAA 102
consensus_10399#6      AGAGTTGGTGTGATNTGGTGTTTGTACGAGCTGGTTGTGGCGCTAATTATG-TCGAGTAA 71
consensus_10399#4      -------------------------------------------------GT-TTAAATCG 10
consensus_10399#7      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#2      GGCGTTAATTGTGTCGAGTGATAAAAGAGTTAGTTGGTGATATTGATGGCGATAGAGTGG 66
consensus_10399#5      ------GGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGTAAATTGCG-TCGAGTGA 53
consensus_10399#3      CAGCAAGCTAATCTCTAATGCACAGATCAAAACTTTGAAGTTCTGATTATTTTCCGTTCG 87
                                                                                   

consensus_10399#0      GAATAGCGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTG 477
consensus_10399#8      GAATAGCGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACAAGGACGGTGTTCTG 108
consensus_10399#1      TAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGTGTTCTG 162
consensus_10399#6      TAAAAGAG---------------------------------------------------- 79
consensus_10399#4      GAATAGCGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGCCGAGGACGGTGTTCTG 70
consensus_10399#7      ---------------------------------------------------GGTGTTCTG 9
consensus_10399#2      TGATGGGTGACGGTTGAAGTATGCGGTGATGGTGATAATTTA--TAAGCGATGTGTTTGA 124
consensus_10399#5      TAAAAGAGTTTGTTGTTGCTATCT---GGGGACGACCGATCGGTGATGGGTGACGCTTCA 110
consensus_10399#3      AAGAGGTTTAAGTAAATATAACAGTAGTTTTATTGAGACTTATCTATGTGCATCTTGAAA 147
                                                                                   

consensus_10399#0      TTGA-GTGTAACGAG-AGTTGGTGTGATTTGGT---GTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGT 532
consensus_10399#8      TTGA-GTGTTACGAG-AGTTGGTGTGATTTGGT---GTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGT 163
consensus_10399#1      TTGA-GTGTTACGAG-AGTTGGTGTGATTTGGT---GTTTGTACGAACTGGTTGTGGCGC 217
consensus_10399#6      -------------AG-AGTTGGTGTGATTTGGT---GTTTGTACGAACTGGTTGTGGCGC 122
consensus_10399#4      TTGA-GTGTAACGAG-AGTTGGTGTGATTTGGT---GTTTGTACCAACTGGTTGCGGCGT 125
consensus_10399#7      TTGA-GTGTAACGAG-AGTTGGTGTGATCTGGT---GTTTGTACGACCTGGTTGTGGCGC 64
consensus_10399#2      ATCG-GAATAGCGAG-AGTTGGTGTGATTTGGT---GTTTGTACCAACTGGTTGTGGCGT 179
consensus_10399#5      GACT-CTGCGATGAT-GATGATAACTTCATAAT---GACGATGTGATTTGGACTCGGAAT 165
consensus_10399#3      TTAATGTGTTATGGGTAGTGAACATCACTCAGTTATATAGGTAGGATTAAACTATACTGC 207
                                         *             *        *   *              

consensus_10399#0      AAATTGTGTCGAG---TGATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATT 589
consensus_10399#8      TAATTGTGTCGAG---TGATAAAAGAG--------------------------------- 187
consensus_10399#1      TAATTATGTCGAG---TAATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATT 274
consensus_10399#6      TAATTATGTCGAG---TAATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATT 179
consensus_10399#4      AAATTGTGTCGAG---TGATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATT 182
consensus_10399#7      TAATTATGTCGAG---TAATAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAGCGGTGGTGTCTGATT 121
consensus_10399#2      TAATTATGTCGAG---TGGTAAAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAATGGTGGTGACTGACT 236
consensus_10399#5      TA--CGCATAGAT---TCACACTCTGTCAAAC-------------CGGTGCTGGGTGATT 207
consensus_10399#3      CGAGCCAATCAGAAGCTTTCGCTGGTTTTCAAGTTCACGGCGCTAAGTTCGGTACCTGAT 267
                               *       *                                           

consensus_10399#0      GGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATT-------------- 635
consensus_10399#8      -------------------------------AGAGTTGGTGTGATT-------------- 202
consensus_10399#1      GGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATT-------------- 320
consensus_10399#6      GGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATT-------------- 225
consensus_10399#4      GGCCGAGGACGGTGTTCTGTTGAGTGTAACGTTTGTTGGTGATATTGATGACGATAGAGT 242
consensus_10399#7      GGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGATATTGATGGCGATAGAGT 181
consensus_10399#2      GGACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATT-------------- 282
consensus_10399#5      GGACGCGGACCGTATTTCATCGATTAGAACGAGAGTTGGTGTGATT-------------- 253
consensus_10399#3      GCTTACGTACGGTCGGTTTACAGAGGTTTTTAGGGAAGGCGTGATAATTTAGCGTC---- 323
                                                         *  ** *  **               

consensus_10399#0      ---------TGGTGTTTGT-ACCAACTGGTTGTGGCGTTAATT--------GTGT---CG 674
consensus_10399#8      ---------TGGTGTTTGT-ACCAACTGGTTGTGGCGTTAATT--------GTGT---CG 241
consensus_10399#1      ---------TGGTGTTTGT-ACGAACTGGTTGTGGCGCTAATT--------ATGT---CG 359
consensus_10399#6      ---------TGGTGTTTGT-ACGAACTGGTTGTGGCGCTAATT--------ATGT---CG 264
consensus_10399#4      GGTGATGGGTGACGGTTGA-AGTATGCGGTGATGGTGATAATTTATAAGCGATGTGTTTA 301
consensus_10399#7      GGTGATGGGTGACGATTGA-AGTTTGCGGTGATGGCGATAATTTATAAGCGATGTGTTTG 240
consensus_10399#2      ---------TGGTGTTTGT-ACCAACTGGTTGTGGCGTAAATT--------GCGT---CG 321
consensus_10399#5      ---------TGGTGTTTGT-ACCAACTGGTTGTGGCGTAAATT--------GTGT---CG 292
consensus_10399#3      -------TACAATAGAAGTGATCATAAGATTCTGGCGCGAAATTCAATTATCCATTT-GG 375
                                        *  *      * *  *** *  ** *           *     

consensus_10399#0      AGTGATAAAAGAGTAA-ATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGNNACAGGACGGT 733
consensus_10399#8      AGTGATAAAAGAGTAA-ATAATAGTTGTGTAA---------------------------- 272
consensus_10399#1      AGTAATAAAAGAGTAA-ATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGT 418
consensus_10399#6      AGTAATAAAAGAGTAA-ATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGT 323
consensus_10399#4      AATCGGAATAGCGTAA-ATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGCCGAGGACGGT 360
consensus_10399#7      AATCGGAATAGCGTAA-ATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGGACGAGGATGGT 299
consensus_10399#2      AGTGATAAAAGAGTAA-ATAATAGTTGTGTAATGGTGGTGACTGACTGGACGAGGATGGT 380
consensus_10399#5      AGTGATAAAAGAGT----TTGTTGGTG-ATATTGATGACGATAGAGTGGTGATGGGTGAC 347
consensus_10399#3      ATAGATAGAGTTTTGGCATTATAGCTGATGTCAGTTCGTGATGAAAACCCTAAGTATAAT 435
                       *     *      *    *  * * **                                 

consensus_10399#0      GTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTG------------------------- 768
consensus_10399#8      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#1      GTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACGAACTGGTTGTGGCG 478
consensus_10399#6      GTTCTGTTGAGTGTTACG------------------------------------------ 341
consensus_10399#4      GTTCTGTTGAGTGTAACG------------------------------------------ 378
consensus_10399#7      GTTCTGTTGAGTGTTACG------------------------------------------ 317
consensus_10399#2      GCTGTGTTGAGTGTAACG------------------------------------------ 398
consensus_10399#5      GA-GTGAAGTATGCGGTGATGGTGATAATTTATAAGCG---------------------- 384
consensus_10399#3      TCCTAGCCTTAATCATGAACTGTAAATCATAATTTGAATT-------------------- 475
                                                                                   

consensus_10399#0      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#8      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#1      CTAATTATGTCGAGTAATANAAGAGTAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGN 538
consensus_10399#6      -------------------------TAAATAATAGTTGTGTAACGGTGGTGACTGATTGG 376
consensus_10399#4      -------------------------TAAATAATAGTTGTGTAATGGTGGTGACTGACTGG 413
consensus_10399#7      -------------------------TAAATAATAGTTGTGTAA----------------- 335
consensus_10399#2      -------------------------TAAATAATAGTTGTGTAATGGTGGTGACTGACTGG 433
consensus_10399#5      ---ATGTGTTTGAATCGGAATAGCGTAAATAATAGTTGTGTAA----------------- 424
consensus_10399#3      --------------CTTCACACAGGTTTATAAACCTCATTTGGTCTTAGTTATTATGTTG 521
                                                                                   

consensus_10399#0      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#8      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#1      ACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGAGAGTTGNTGTGATTTGGTGTTTGTACGAAC 598
consensus_10399#6      ACGAGGATGGTGTTCTGTTGAGTGTTACGTT----------------------------- 407
consensus_10399#4      ACGAGGATGGTGCTGTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCA-- 471
consensus_10399#7      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#2      ACGAGGATGGTGCTGTGTTGAGTGTAACGAGAGTTGGTGTGATTTGGTGTTTGTACCAAC 493
consensus_10399#5      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#3      ACACTCTCAGAGTCACTCTAGCGTCGCTCAAAGGTTGTCCA------------------- 562
                                                                                   

consensus_10399#0      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#8      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#1      TGGTTGTGGCGCTA-TTATGTCGAGTAATAAAAGAGTAAATATAGTTC------------ 645
consensus_10399#6      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#4      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#7      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#2      TGGTTGTGGCGTAAATTGCGTCGAGTGATAAAAGAGTTTGTTGGTGATATTGATGACGAT 553
consensus_10399#5      ------------------------------------------------------------
consensus_10399#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10399#0      ---------------------------------------------
consensus_10399#8      ---------------------------------------------
consensus_10399#1      ---------------------------------------------
consensus_10399#6      ---------------------------------------------
consensus_10399#4      ---------------------------------------------
consensus_10399#7      ---------------------------------------------
consensus_10399#2      AGAGTGGTGATGGGTGACGAATGAAGTATGCGGTGAGCTCAAGAG 598
consensus_10399#5      ---------------------------------------------
consensus_10399#3      ---------------------------------------------