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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10405#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 16 consensus length = 1137 fasta sequence
[TCCTTATTTCCAAACCCTGTCATCACAACCGACATACATGAGGCTGTGTCCTGACTGAGAATAGCTATGCCTTATGTGTTCGTTTCATTTTATCTAACAAAACTGTGTATGTATATACACAGTTGTACATACATATAGAGTAGATTTTGTATGTTGATGCTTTTTATATGAGTGTGTATTAGTATTGTTTGGGCTGTGTCGATTGGTTATGGCGAGTAGCCGTTCAGCTGCCCCGTGCATAGTTGATTCACGGTGGGTCGTTTCCTGCGGCTGAGATTGAATGGATGCACAGTTATACCTCTTGTCCATTACAGGGACTCGTTGGTTCCGACGTGCAGGCCACATGGGATGTTGATTTGCTAAGGTGCTTATGTCTTTCTTAGCAGTGTATTTGTATGTTTGTTTGTGATTGGCTTTGCTGTGTCTGTAGTCAGTCACATAGCTACTATACTGCATTGTTTACATTCGTGAATGATGTCGTTAGAGTAGCTGATATTTATGCAATGTATTTGATACGTGTGCGACAAAATGTTACCAGTGTGTTGTCT-GTTACATGAAACACCAGTGGTCAGTATGATT-TCAGG-TTTCATTGTGTACTT-TG-TTGG-NTATGTTAGTCATGTGAGTGTGCGAACTGAGCGAAGTAGAG-TTTTCTTTTATTATACTATGAAGACAGAATGAATTGTTTTACGTTGTGTGTATGTATGTGAATTT-CCTAGTAATTCAACTTTGTGCAGGAAGACATCAATTTGTTTGAAGCTTTATGTTTTTGTGAATATATATGCATATGAGAGTGAGTTGTTTTGAACGCTTGTTCACTTGTTGTGTAATTGTGTGTACGTAGATCTTTGAGTATAGTATATTGAATAGCCGTTCAGCTACTCCGTGTATATGTAATTCACGATGAGTCGTTTCCTGCGGCTGAGATTGAACGGATGCACTGCTATGCCTCTTGTCCATCACGTGGACTTGTTTGGTACGAATGCAGACGACATGTCACTTTAGTTATTTATCTTGTGCGTAACAGACATAAATTTTTTGGCTAGTCTTGTATGTGTTGAGCGTTGACGTTGATGGTGGATTTGAGATGGATTTTCGAGAAATAGATTTTGCGTTGGTCAATAAATCGTTGTGTTTAAA]
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[-] EMBL CD086397 [ ctTTATTTCCAAACCCTGTCATCACAACCGACATACATGAGGCTGTGTCCTGACTGAGAATAGCTATGCCTTATGTGTTCGTTTCATTTTATCTAACAAAACTGTGTATGTATATACACAGTTGTACATACATATAGAGTAGATTTTGTATGTTGATGCTTTTTATATGAGTGTGTATTAGTATTGTTTGGGCTGTGTCGATTGGTTATGGCGAGTAGCCGTTCAGCTGCCCCGTGCATAGTTGATTCACGGTGG ]
[-] EMBL CD192689 [ TCACAACCGACATACATGAGGCTGTGTCCTGACTGAGAATAGCTATGCCTTATGTGTTCGTTTCATTTTATCTAACAAAACTGTGTATGTATATACACAGTTGTACATACATATAGAGTAGATTTTGTATGTTGATGCTTTTTATATGAGTGTGTATTAGTATTGTTTGGGCTGTGTCGATTGGTTATGGCGAGTAGCCGTTCAGCTGCCCCGTGCATAGTTGATTCACGGTGGGTCGTTTCCTGCGGCTGAGATTGAATGGATGCACAGTTATACCTCTTGTCCATTACAGGGACTCGTTGGTTCCGACGTGCAG ]
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[+] EMBL CD111820 [ TTGATTCACGGTGGGTCGTTTCCTGCGGCTGAGATTGAATGGATGCACAGTTATACCTCTCGTCCATTACAGGGACTCGTTGGTTCCGACGTGCAGGCCACATGGGATGTTGATTTGCTAAGGTGCTTATGTCTTTCTTAGAAGTGTATTTGTATGTTTGTTTGTGATTGGCTTTGCTGTGTCTGTAGTCAGTCACATAGCTACTATACTGCATTGTTTACATTCGTGAATGATGTCGTTAGAGTAGCTGATATTTATGCAATGTATTTGATACGTGTGCGACAANATGTTACCAGTGTGTAGTCT GTTACATGAAACACCAGTGGTCAGTATGATTNNCAGG TTCAATGNGTACTT TGNTGGG NTATGTag ]
[+] EMBL CD148932 [ TTGATTCACGGTGGGTCGTTTCCTGCGGCTGAGATTGAATGGATGCACAGTTATACCTCTTGTCCATTACAGGGACTCGCTGGTTCCGACGTGCAGGCCACATGGGATGTTGATTTGCTAAGGTGCTTATGTCTTTCTTAGCAGTGTATTTGTATGTTTGTTTGTGATTGGCTTTGCTGTGTCTGTAGTCAGTCACATAGCTACTATACTGCATTGTTTACATTCCTGAATGATGTCGTTAGAGTAGCTGATATTT ]
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[-] EMBL CD118283 [ GG TTTCATTGTGGACTT GG TGGT ATATGTTAGTCATGTGAGTGTGCGAACTGAGCGAAG AAAGTTTTTCTTTTATTATCATATGAAGACAGAATGAATTGTTTACCGTGGTGTGTATGTATGTGAATTTCCCTAGTAATTCAACTTTGAGCAGGAAGACATCAATTTGTTGAAAGCTTTATGTTTTTGTGAATATATATGCATATGAGAGTGAGTTGTTTTGAACGCTTGTTCACTTGTTGTGTAATTGTGTGTACGTAGATCTTTGAGTATAGTATATTGAATAGCCGTTCAGCTACTCCGTGTATATGTAATTCACGATGAGTCGTTTCCTGCGGCTGAGATTGAACGGATGCACTGCTATGCCTCTTGTCCATCACGTGGACTTGTTTGGTACGAATGCAGACGACATGTCACTTTAGTTATTTATCTTGTGCGTAACAGACATAAATTTTTTGGCTAGTCTTGTATGTGTTGAGCGTTG ]
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[-] EMBL CD148789 [ TGTAATTGTGTGTACGTAGATCTTTGAGTATAGTATATTGAATAGCCGTTCAGCTACTCCGTGTATATGTAATTCACGATGAGTCGTTTCCTGCGGCTGAGATTGAACGGATGCACTGCTATGCCTCTTGTCCATCACGTGGACTTGTTTGGTACGAATGCAGACGACATGTCACTTTAGTTATTTATCTTGTGCGTAACAGACATAAATTTTTTGGCTAGTCTT ]
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clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||