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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10438#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 16 consensus length = 1563 fasta sequence
[ANNTTATAATNCAATNCAATAAAAATGGTCCTCTCTTCATCTAGCATANCAGTCAAACGAAAAGGAGTCGAAAAAAACNAGATAAGTANCGAGTAAAAAAAACTAGTGAATAAAAGTTAATCACAGCTATTTGATTATGAAGAAGCTGAGTAAAGGTAAGTTAGCAACAAAACAGAAATAACTAAAGATTTTTAGATTAGATCTTGTGTACCCGTATAAAAAGATTGTTAGCCTAAAAAGCAACCGTAATCATAAAAATTCACATAAATCCTCTTCTTTTGACAATATAAGCTAGATAGCTGAAAACAAACTCATAGCAGTGATTGTTGCTGTTATTGAGATACTGGTGGAAACATTAGGGACGATGAACAAAACGTATTTTCCCCTATTGTTGATGCTGGCATAAATATATTAGTAGGTGTACAAAGTGGACCAGGGATAATAGATGGTACGACAGACATTGGATGATTAACAAAAGCGGATGAGGTTGGCGGTGTTGTTGGACGAAATGGAAGTATGGAAGGTGTAAAAGAACTAGTAGTTGGATTAGTGACAGAAATTTGTTTACGATGAGCTCGTCCCTGTATATTTGAATATTGTTGTTTTTGCGTTTGTAAATAATTTCCAGCGGTATTTGAAAACTCTTGTGACATACAAACAGAGATTTGTGGAGATATATATTTTTGAGTTAAACAGTCAGAGGGGATATGAGATGATAGTGGATCTGCAGAGGATTAAAGCTGACTAATTGGTGCCTGGTAGTACGAATCGGTAACCATAGTTTGTATATAATGAGTATTATTATCATTGGTAGTGGTAAGAATGACTGGGGGAGGTGTCATGTATGATAAGGATGGTGACAGTTGACCTTGAATATTGGAAATCGTGGAAATAGAAGAAACAGTACTAGCTACAGCAGTTGTAGCAAGATAAGGTTGATTTTGGTTGATAGCAGATAAGGAAACCAAATGATCGAATTGTTGAGATGCAGACATTTGATGACCACTATTTACATTTTCAAAAGAATCACCTATTACAGAAGGTGGATTAGGCACAGAATGAACAGAAGTTGAGCCGGCAGAAGTAAGAGAAGGTGATAATGCTCTTACATGGATTGTATTTTGAGGCATATTCTTTTGACCAGGCATTATAGGAGCTATACCTTTTTCGGAATATGCTTCTGTTAGTATAAATAACACAGTGTCCACTGAATCCCAATAGGTTGCATGACTTGTAAGAGCAAAAAGGTACTCATTGAAACTTTCCAAAGTAGCTTCCTGTAAAACATAATCCATACGTCTACCTTGATTAAGTCGACTGTTAAAAGATAAATCCTGAGTTGTTAAATTACGATAAGTTGTTGTAACAACATCATTACGATTGTCAGTGATATTACAAACATTTTCATAATCTTCTAGTCCATCCTCATTTGAACTGCTACCACAAGTATATGCAGTGGAAACAGATCCTAATTCATCGGGGGCACTAATAAATTTATGAGCCAATGCAAATTCATGTAGACTGCGCCAAGTAGATTGAACTGAATTGTAAAATTTACTTTTT]
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[+] EMBL CD124350 [ AGGGACGATGAACAAGACGTATTTTCCCCTATTGTTGATGCTGGCATAAATTTATTAGTAGGTGTACAAAGTGGACCAGGGATAATAGATGGTACGACAGACATTGGATGATTAACAAAAGCGGATGAGGTTGGCGGTGTTGTTGGACGAAATGGAAGTATGGAAGGTGTAAAAGAACTAGTAGTTGGATTAGTGACAGAAATTTGTTTACGATGAGCTCGTCCC ]
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[+] EMBL CD124478 [ AGGGACGATGAACAAAACGTATTTTCCCCTATTGTTGATGCTGGCATAAATATATTAGTAGGTGTACAAAGTGGACCAGGGATAATAGATGGTACGACAGACATTGGATGATTAACAAAAGCGGATGAGGTTGGCGGTGTTGTTGGACGAAATGGAAGTATGGAAGGTGTAAAAGAACTAGTAGTTGGATTAGTGACAGAAATTTGTTTACGATGAGCTCGTCCC ]
[+] EMBL CD124357 [ AGGGACGATGAACAAAACGTATTTTCCCCTATTGTTGATGCTGGCGTAAATATATTAGTAGGTGTACAAAGTGGACCAGGGATAATAGATGGTACGACAGACATTGGATGATTAACAAAAGCGGATGAGGTTGGCGGTGTTGTTGGACGAAATGGAAGTATGGAATGTGTAAAAGAACTAGTAGTTGGATTAGTGACAGAAATTTGTTTACGATGAGCTCGTCCC ]
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[+] EMBL CD152960 [ GATATATATTTTTGAGTTAAACAGTCAGAGGGGATATGAGATGATAGTGGATCTGCAGAGGAATAAAGCTGACTAATTGGTGCCTGGTAGTACGAATCGGTAACCATAGTTTGTATATAATGAGTATTATTATCATTGGTAGTGGTAAGAATGACTGGGGGAGGTGTCATGTATGATAAGGATGGTGGCAGTTGACCTTGAATATTGGAAATCGTGGAAATAGAAGAAACAGTACTAGCTACAGCAGTTGTAGCAAGATAAGGTTGATTTTGGTTGATAGCAGATAAGGAAACCAAATGATCGAATTGTTGAGATGCAGACATTTGATGACCACTATTTACATTTTCAAAAGAATCACCTATTACAGAAGGTGGATTAGGCACAGAATGAACAGAAGTTGAGCCGGCAGAAGTAAGAGAAGGTGATAATGCTCTTACATGGATTGTATTTTGAGGCATATTCTTTTGACCAGGCATTATAGGAGCTATACCTTTTTCGGAATATGCTTCTGTTAGTATAAATAACACAGTGTCCACTGAATCCCAATAGGGTGC ]
[-] EMBL CD186396 [ TGGGGGAGGTGTCATGTATGATAAGGATGGTGACAGTTGACCTTGAATATTGGAAATCGTGGAAATAGAAGAAACAGTACTAGCTACAGCAGTTGTAGCAAGATAAGGTTGATTCTGGTTGATAGCAGATAAGGAAACCAAATGATCGAATTGTTGAGATGCAGACATTTGATGACCACTATTTACATTTTCAAAAGAATCACCTATTACAGAAGGTGGATTAGGCACAGAATGAACAGAAGTTGAGCCGGCAGAAGTAAGAGAAGGTGATAATGCTCTTACATGGATTGTATTTTGAGGCATATTCTTTTGACCAGGCATTATAGGAGCTATACCTTTTTCGGAATATGCTTCTGTTAGTATAAATAACACAGTGTCC ]
[-] EMBL CD095632 [ GAACAGAAGTTGAGCCGGCAGAAGTAAGAGAAGGTGATAATGCTCTTACATGGATTGTATTTTGAGGCATATTCTTTTGACCAGGCATTATAGGAGCTATACCTTTTTCGGAACATGCTTCTGTTAGTATAAATAACACAGTGTCCACTGAATCCCAATAGGTTGCATGACTTGTAAGAGCAAAAAGGTACTCATTGAAACTTTCCAAAGTAGCTTCCTGTAAAACATAATCCATACGTCTACCTTGATTAAGTCGACTGTTAAAAGATAAATCCTGAGTTGTTAAATTACGATAAGTTGTTGTAACAACATCATTACGATTGTCAGTGATATTACAAACA ]
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[+] EMBL CD161307 [ AAGTAAGAGAAGGTGATAATGCTCTTACATGGATTGTATTTTGAGGCATATTCTTTTGACCAGGCATTAAAGGAGCTATACCTTTTTCGGAATATGCTTCTGTTAGTATAAATAACACAGTGTCCACTGAATCCCAATAGGTTGCATGACTTGTAAGAGCAAAAAGGTACTCATTGAAACTTTCCAAAGTAGCTTCCTGTAAAACATAATCCATACGTCTACCTTGATTAAGTCGACTGTTAAAAGATAAATCCTGAGTTGTTAAATTACGATAAGTTGTTGTAACAACATCATTACGATTGTCAGTGATATTACAAACATTTTCATAATCTTCTAGTCCATCCTCATTTGAACTGCTACCACAAGTATATGCAGTGGAAACAGATCCTAATTCATCGGGGGCACTAATAAATTTATGAGCCAATGCAAATTCATGTAGACTGCGCCAAGTAGATTGAACTGAATTGTAAAATTTACTTTTT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||