cluster # 10530

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Schistosoma mansoni
cluster # 10530 cluster # 10530 Sequences # 17 consensus # 3

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consensus_10530#0 length = 694 sequences # 12

consensus_10530#1 length = 465 sequences # 3
consensus_10530#2 length = 203 sequences # 2

consensusID : consensus_10530#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 12
consensus length = 694
fasta sequence

                              [GCAACGCATCTCAACACGCAAATAATTTAATGGGTGATTTACCAACACCTAGAAATATT-CGTGATGGATTTGAACCACGCCAAACGCCTCTATACTCAAATAATATGATGGGTGAATTGCCAGTACCTAGAAACACTCATACTGGATATGAACCGCGCCACTTATCTCCATATGGAAGTCGTTCAAATAATTTAATGGGGGATATACCAGACGCTAAGCTTGTTCGGGAAACTTATGAACCCCACTATATTCCTGTGAAATATAACCGTTCAAATAATTTATTGAACGTGTCAGAAACTAGAAATATTCGAGATAGATTTGAATCACGCCAAACGCCTCTATACTCAAATAATATGATGGGTGAATTGCCAGCACCTAGTTCTGTTTCTAGTAATGGAAACACATATTCATACTCTATTCCACAGCGTCCTAATTTGAAAATAATTCGAGACGAGGATACATATAACAGATATACGGATTAGAATAAAACATAAGATCATATTCATCAAAAATAATGCACCTTGGCAAATACACCAGAAATGATGGTGATTTATAATTAATAATACAGTAGAACTATAGAATATGAACAATCTTTATCTCAGTATAAACAAATTATTTTTTTTAATAATATTTAGTAATTTTTAGTTATATGTAAAATAAGATTTTGTTTGTATTCTGTATTAAATATAAAATA]

[-] EMBL CD143994             [GCAACGCATCTCAACACGCAAATAATTTAATGGGTGATTTACCAACACCTAGAAATATTCCGTGATGGATTTGAACCACGCCAAACGCCTCTATACTCAAATAATATGATGGGTGAATTGCCAGTACCTAGAAACACTCATACTGGATATGAACCGCGCCACTTATCTCCATATGGAAGTCGTTCAAATAATTTAATGGGGGATATACCAGACGCTAAGCTTGTTCGGGAAACTTATGAACCCCACTATATTCCCGTGAAATATAACCGTTCAAATAATTTATTGAACGTGTCAGAAACTAGAAATATTCGAGATAGATTTGAATCACGCCAAACGCCTCTATACTCAAATAATATGATGGGTGAATTGCCAGCACCTAGTTCTGTTTCTAGTAATGGAAACACATATTCATACTCTATTCCACAGCGTCCTAATTTGAAAAT                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD143986             [                      TAATTTAATGGGTGATTTACCAACACCTAGAAATATT CGTGATGGATTTGAACCACGCCAAACGCCTCTATACTCAAATAATATGATGGGTGAATTGCCAGTACCTAGAAACACTCATACTGGATATGAACCGCGCCACTTATCTCCATATGGAAGTCGTTCAAATAATTTAATGGGGGATATACCAGACGCTAAGCTTGTTCGGGAAACTTATGAACCCCACTATATTCCTGTGAAATATAACCGTTCAAATAATTTATTGAACGTGTCAGAAACTAGAAATATTCGAGATAGATTTGAATCACGCCAAACGCCTCTATACTCAAATAATATGATGGGTGAATTGCCAGCACCTAGTTCTGTTTCTAGTAATGGAAACACATATTCATACTCTATTCCACAGCGTCCTAATTTGAAAAT                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD144021             [                        ATTANATGGGTGATTTACCAACACCTAGANATATT CGCGATGGATTTGAACCACGCCAAACGCCTCTATACTCAAATAATATGATGGGTGAATTGCCAGTACCTAGAAACACTCATACTGGATATGAACCGCGCCACTTATCTCCATATGGAAGTCGTTCAAATAATTTAATGGGGGATATACCAGACGCTAAGCTTGTTCGGGCAACTTATGAACCCCACTATATTCCTGTGAAATATAACCGTTCAAATAATTTATTGAACGTGTCAGAAACTAGAAATATTCGAGATAGATTTGAATCACGCCAAACGCCTCTATACTCAAATAATATGATGGGTGAATTGCCAGCACCTAGTTCTGTTTCTAGTAATGGAAACACATATTCATACTCTATTCCACAGCGTCCTAATTTGAAAAT                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD143999             [                                   GATTTACCAACACCTAGAAATATT CGTGATGGATTTGAACCACGCCAAACGCCTCTATACTCAAATAATATGATGGGTGAATTGCCAGTACCTAGAAACACTCATACTGGATATGAACCGCGCCACTTATCTCCATATGGAAGTCGTTCAAATAATTTAATGGGGGATATACCAGACGCTAAGCTTGTTCGGGAAACTTATGAACCCCACTATATTCCTGTGGAATATAACCGTTCAAATAATTTATTGAACGTGTCAGAAACTAGAAATATTCGAGATAGATTTGAATCACGCCAAACGCCTCTATACTCAAATAATATGATGGGTGAATTGCCAGCACCTAGTTCTGTTTCTAGTAATGGAAACACATATTCATACTCTATTCCACAGCGTCCTAATTTGAAAAT                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD078345             [                                                                      TTGAACCACGCCAAACGCCTCTATACTCAAATAATATGATGGGTGAATTGCCAGTACCTAGAAACACTCATACTGGATATGAACCGCGCCACTTATCTCCATATGGAAGTCGTTCAAATAATTTAATGGGGGATATACCAGACGCTAAGCTTGTTCGGGAAACTTATGAACCCCACTATATTCCTGTGAAATATAACCGTTCAAATAATTTATTGAACGTGTCAGAAACTAGAAATATTCGAGATAGATTTGAATCACGCCAAACGCCTCTATACTCAAATAATATGATGGGTGAATTGCCAGCACCTAGTTCTGTTTCTAGTAATGGAAACACATATTCATACTCTATTCCACAGCGTCCTAATTTGAAAATAATTCGAGACGAGGATACATATAACAGATATACGGATTAGAATAAAACATAAGATCATATTCATCAAAAATAATGCACCTTGGCAAATACACCAGAAATGATGGTGATTTATAATTAATAATACAGTAGAACTATAGAATATGAACAATCTTTATCTCAGTATAAACAAATTATTTTTTTTAATAATATTTAGTAATTNTTAGTTATATGTAAAATAAGATTTTGTTTGTATTCTGTATTAAATATAAAAT ]
[+] EMBL CD078263             [                                                                      TTGAACCACGCCAAACGCCTCTATACTCAAATAATATGATGGGTGAATTGCCAGTACCTAGAAACACTCATACTGGATATGAACCGCGCCACTTATCTCCATATGGAAGTCGTTCAAATAATTTAATGGGGGATATACCAGACGCTAAGCTTGTTCGGGAAACTTATGAACCCCACTATATTCCTGTGAAATATAACCGTTCAAATAATTTATTGAACGTGTCAGAAACTAGAAATATTCGAGATAGATTTGAATCACGCCAAACGCCTCTATACTCAAATAATATGATGGGTGAATTGCCAGCACCTAGTTCTGTTTCTAGTAATGGAAACACATATTCATACTCTATTCCACAGCGTCCTAATTTGAAAATAATTCGAGACGAGGATACATATAACAGATATACGGATTAGAATAAAACATAAGATCATATTCATCAAAAATAATGCACCTTGGCAAATACACCAGAAATGATGGTGATTTATAATTAATAATACAGTAGAACTATAGAATATGAACAATCTTTATCTCAGTATAAACAAATTATTTTTTTTAATAATATTTAGTAATTTTTAGTTATATGTAAAATAAGATTNTGTTTGTATTCTGTATTAAATATAANAT ]
[-] EMBL CD072905             [                                                                                                                                                                        CCATATGGAAGTCGTTCAAATAATTTAATGGGGGATATACCAGACGGTAAGCTTGTTCGGGAAACTTATGAACCCCACTATATTCCTGTGAAATATAACCGTTCAAATAATTTATTGAACGTGTCAGAAACTAGAAATATTCGAGATAGATTTGAATCACGCCAAACGCCTCTATACTCAAATAATATGATGGGTGAATTGCCAGCACCTAGTTCTGTTTCTAGTAATGGAAACACATATTCATACTCTATTCCACAGCGTCCTAATTTGAAAATAATTCGAGACGAGGATACATATAACAGATATACGGATTAGAATAAAACATAAGATCATATTCATCAAAAATAATGCACCTTGGCAAATACACCAGAAATGATGGTGATTTATAATTAATAATACAGTAGAACTATAGAATATGAACAATCTTTATCTCAGTATAAACAAATTATTTTTTTTAATAATATTTAGTAATTTTTAGTTATATGTAAAATAAGATTTTGTTTGTATTCTGTATTAAATATAAAATA]
[-] EMBL CD143982             [                                                                                                                                                                                          AATAATTTAATGGGGGATATACCAGACGCTAAGCTTGTTCGGGAAACTTATGAACCCCACTATATTCCTGTGAAATATAACCGTTCAAATAATTTATTGAACGTGTCAGAAACTAGAAATATTCGAGATAGATTTGAAACACGCCAAACGCCTCTATACTCAAATAATATGATGGGTGAATTGCCAGCACCTAGTTCTGTTTCTAGTAATGGAAACACATATTCATACTCTATTCCACAGCGTCCTAATTTGAAAAT                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD144011             [                                                                                                                                                                                                                                                                                            GAACGTGTCAGAAACTAGAAATATTCGAGATAGATTTGAATCACGCCAAACGCCTCTATACTCAAATAATATGATGGGTGAATCGCCAGCACCTAGTTCTGTTTCTAGTAATGGAAACACATATTCATACTCTATTCCACAGCGTCATAATTTGAAAAT                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL AA559698             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATTCCACAGCGTCCTAATTTGAAAATAATTCGAGACGAGGATACATATAACAGATATACGGATTAGAATAAAACATAAGATCATATTCATCAAAAATAATGCACCTTGGCAAATACACCAGAAATGATGGTGATTTATAATTAATAATACAGTAGAACTATAGAATATGAACAATCTTTATCTCAGTATAAACAAATTATTTTTTTTAATAATATTTAGTAATTTTTAGTTATATGTAAAATAAGATTTTGTTTGTATNCTGTATTAAATATAAAAT ]
[-] EMBL AA917196             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   cttTTCTTCAAAATTAATGCACCTT GCAAAT CACCAGAAATGATGGTGATTTATAATTAATAAT CAGTAGAACTATAGAATATGAACAATCTTTATCTCAGTATAAACAAATTATTTTTTTTAATAATATTTAGTAATTTTTAGTTATATGTAAAATAAGATTTTGTTTGTATTCTGTATTAAATATAAAAT ]
[+] EMBL AA559654             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATCAAAAATAATGCACCTTGGCAAATACACCAGAAATGATGGTGATTTATAATTAATAATACAGTANAACTATAGAATATGAACAATCTTTATCTCAGTATAAACAAATTATTTTTTTTAATAATATTTAGTAATTTTTAGTTATATGTAAAATAANATTTTGTTTGTATNCTGTATTAAATATAAAAT ]




>consensus_10530#0
GCAACGCATCTCAACACGCAAATAATTTAATGGGTGATTTACCAACACCTAGAAATATTC
GTGATGGATTTGAACCACGCCAAACGCCTCTATACTCAAATAATATGATGGGTGAATTGC
CAGTACCTAGAAACACTCATACTGGATATGAACCGCGCCACTTATCTCCATATGGAAGTC
GTTCAAATAATTTAATGGGGGATATACCAGACGCTAAGCTTGTTCGGGAAACTTATGAAC
CCCACTATATTCCTGTGAAATATAACCGTTCAAATAATTTATTGAACGTGTCAGAAACTA
GAAATATTCGAGATAGATTTGAATCACGCCAAACGCCTCTATACTCAAATAATATGATGG
GTGAATTGCCAGCACCTAGTTCTGTTTCTAGTAATGGAAACACATATTCATACTCTATTC
CACAGCGTCCTAATTTGAAAATAATTCGAGACGAGGATACATATAACAGATATACGGATT
AGAATAAAACATAAGATCATATTCATCAAAAATAATGCACCTTGGCAAATACACCAGAAA
TGATGGTGATTTATAATTAATAATACAGTAGAACTATAGAATATGAACAATCTTTATCTC
AGTATAAACAAATTATTTTTTTTAATAATATTTAGTAATTTTTAGTTATATGTAAAATAA
GATTTTGTTTGTATTCTGTATTAAATATAAAATA

consensusID : consensus_10530#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 465
fasta sequence

                              [ATGTTGATATCAATGCATTTCCAAGAATTACACTACCAGATTTTATTCATTTGGTTTGTAGTGGATGTCTTATATGTGGTTTGTTGACTGAAGTTCTACTTTTTATTGTTTAATAACATGTTGCTATTTGTAGCTACCTTTCTAGTTGGCTATTTTTAAAATTTGATTTATGTA-TTT-TTTTTTAATAGAATCTAGTCATAATTAATCCAGTGCTCTTGTTTTCTTTTTCGTCCCCCTTTTTGTTGTTTAACTGTTTACAATGTGTATGTGATTGTAACAGTTAGTTTATTTCTTGGTTTGTTTCTTTGGTTTTATTTCACTACAGGCTTGTTCGGGAAACTTATGAACCCCACTATATTCCTGTGAAATATAACCGTTCAAATAATTTATTGAACGTGTCAGAAACTAGAAATATTCGAGATAGATTTGAATCACG-CCA-ACGCGGTC-ATACTCAAATAATATGAT]

[-] EMBL CD069154             [ATGTTGATATCAATGCATTTCCAAGAATTACACTACCAGATTTTATTCATTTGGTTTGTAGTGGATGTCTTATATGTGGTTTGTTGACTGAAGTTCTACTTTTTATTGTTTAATAACATGTTGCTATTTGTAGCTACCTTTCTAGTTGGCTATTTTTAAAATTTGATTTATGTA TTT TTTTTTAATAGAATCTAGTCATAATTAATCCAGTGCTCTTGTTTTCTTTTTCGTCCCCCTTTTTGTTGTTTAACTGTTTACAATGTGTATGTGATTGTAACAGTTAGTTTATTTCTTGGTTTGTTTCTTTGGTTTTATTTCACTACAGGCTTGTTCGGGAAACTTATGAACCCCACTATATTCCTGTGAAATATAACCGTTCAAATAATTTATTGAACGTGTCAGAGACTAGAAATATTCGAGATAGATTTGAATCACG TCACACGCGGTC Aa                ]
[-] EMBL CD069182             [              GCATTTCCAAGAATTACACTACCAGATTTTATTCATTTGGTTTGTAGTGGATGTCTTATATGTGGTTTGTTGACTGAAGTTCTACTTTTTATTGTTTAATAACATGTTGCTATTTGTAGCTACCTTTCTAGTTGGCTATTTTTAAAATTTGATTTATGTA TTT TTTTTTAATAGAATCTAGTCATAATTAATCCAGTGCTCTTGTTTTCTTTTTCGTCCCCCTTTTTGTTGTTTAACTGTTTACAATGTGTATGTGATTGTAACAGTTAGTTTATTTCTTGGTTTGTTTCTTTGGTTTTATTTCACTACAGGCTTGTTCGGGAAACTTATGAACCCCACTATATTCCTGTGAAATATAACCGTTCAAATAATTTATTGAACGTGTCAGAAACTAGAAATATTCGAGATAGATTTGAATCACGTCAA ACGCGGTC AT                ]
[-] EMBL CD069209             [                                                                                                                                                                     ATTTATGTACTTTGTCTTTTAATAGAATCTAGTCATAATTAATCCAGTGCTCTTGTTTTCTTTTTCGTCCCCCTTTTTGTTGTTTAACTGTTTACAATGTGTATGTGATTGTAACAGTTAGTTTATTTCTTGGTTTGTTTCTTTGGTTTTATTTCACTACAGGCTTGTTCGGGAAACTTATGAACCCCACTATATTCCTGTGAAATATAACCGTTCAAATAATTTATTGAACGTGTCAGAAACTAGAAATATTCGAGATAGATTTGAATCACG CCA ACGC CTCTATACTCAAATAATATGAT]




>consensus_10530#1
ATGTTGATATCAATGCATTTCCAAGAATTACACTACCAGATTTTATTCATTTGGTTTGTA
GTGGATGTCTTATATGTGGTTTGTTGACTGAAGTTCTACTTTTTATTGTTTAATAACATG
TTGCTATTTGTAGCTACCTTTCTAGTTGGCTATTTTTAAAATTTGATTTATGTATTTTTT
TTTAATAGAATCTAGTCATAATTAATCCAGTGCTCTTGTTTTCTTTTTCGTCCCCCTTTT
TGTTGTTTAACTGTTTACAATGTGTATGTGATTGTAACAGTTAGTTTATTTCTTGGTTTG
TTTCTTTGGTTTTATTTCACTACAGGCTTGTTCGGGAAACTTATGAACCCCACTATATTC
CTGTGAAATATAACCGTTCAAATAATTTATTGAACGTGTCAGAAACTAGAAATATTCGAG
ATAGATTTGAATCACGCCAACGCGGTCATACTCAAATAATATGAT

consensusID : consensus_10530#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 203
fasta sequence

                              [GTAAGTAAACTGATCTTTCTTCAAAATAGTCACCTTGCAAATCACCGAATGATGGTGATTTATAATTAATAATACAGTAGAACTATAGAATATGAACAATCTTTATCTCAGTATAAACAAATTATTTTTTTTAATAATATTTAGTAATTTTTAGTTATATGTAAAATAAGATTTTGTTTGTATTCTGTATTAAATATAAAATA]

[-] EMBL AA917168             [GTAAGTAAACTGATCTTTCTTCAAAATAGTCACCTTGCAAATCACCGAATGATGGTGATTTATAATTAATAATACAGTAGAACTATAGAATATGAACAATCTTTATCTCAGTATAAACAAATTATTTTTTTTAATAATATTTAGTAATTTTTAGTTATATGTAAAATAAGATTTTGTTTGTATTCTGTATTAAATATAAAATA]
[-] EMBL AA917197             [GTAAGTAAACTGATCTTTCTTCAAAATAGTCACCTTGCAAATCACCGAATGATGGTGATTTATAATTAATAATACAGTAGAACTATAGAATATGAACAATCTTTATCTCAGTATAAACAAATTATTTTTTTTAATAATATTTAGTAATTTTTAGTTATATGTAAAATAAGATTTTGTTTGTATTCTGTATTAAATATAAAATA]




>consensus_10530#2
GTAAGTAAACTGATCTTTCTTCAAAATAGTCACCTTGCAAATCACCGAATGATGGTGATT
TATAATTAATAATACAGTAGAACTATAGAATATGAACAATCTTTATCTCAGTATAAACAA
ATTATTTTTTTTAATAATATTTAGTAATTTTTAGTTATATGTAAAATAAGATTTTGTTTG
TATTCTGTATTAAATATAAAATA

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10530#0      GCAACGCATCTCAACACGCAAATAATTTAATGGGTGATTTACCAACACCTAGAAATATTC 60
consensus_10530#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10530#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10530#0      GTGATGGATTTGAACCACGCCAAACGCCTCTATACTCAAATAATATGATGGGTGAATTGC 120
consensus_10530#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10530#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10530#0      CAGTACCTAGAAACACTCATACTGGATATGAACCGCGCCACTTATCTCCATATGGAAGTC 180
consensus_10530#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10530#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10530#0      GTTCAAATAATTTAATGGGGGATATACCAGACGCTAAGCTTGTTCGGGAAACTTATGAAC 240
consensus_10530#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10530#1      ----------------------------------------------------ATGTTGAT 8
                                                                                   

consensus_10530#0      CCCACTATATTCCTGTGAAATATAACCGTTCAAATAATTTATTGAACGTGTCAGAAACTA 300
consensus_10530#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10530#1      ATCAATGCATTTCCAAGAATTACACTACCAGATTTTATTCATTTGGTTTGTAGTGGATGT 68
                                                                                   

consensus_10530#0      GAAATATTCGAGATAG-ATTTGAATCACGCCAAACGCCTCTATACTCAAATAATATGATG 359
consensus_10530#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10530#1      CTTATATGTGGTTTGTTGACTGAAGTTCTACTTTTTATTGTTTAATAACATGTTGCTATT 128
                                                                                   

consensus_10530#0      GGTGAATTGCCAGCACCTAGTTCTGTTTCTAGTAATGGAAACACATATTCATACTCTATT 419
consensus_10530#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10530#1      TGTAGCTACCTTTCTAGTTGG-CTATTTTTAAAATTTGATTTATGTATTTTTTTTTAATA 187
                                                                                   

consensus_10530#0      CCACAGCGTCCTAATTTGAAAATAATTCGAGACGAGGATACATATAACAGATATACGGAT 479
consensus_10530#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10530#1      GAATCTAGTCATAATTAATCCAGTGCTCTTGTTTTCTTTTTCGTCCCCCTTTTTGTTGTT 247
                                                                                   

consensus_10530#0      TAGAATAAAA-CATAAGATCATATTCATCAAAAATAATGCACCTTGGCAAATACACCAGA 538
consensus_10530#2      -------GTA-AGTAAACTGATCTTTCTTCAAAATAGT-CACCTTG-CAAAT-CACCG-- 47
consensus_10530#1      TAACTGTTTACAATGTGTATGTGATTGTAACAGTTAGTTTATTTCTTGGTTTGTTTCTTT 307
                                *   *       *  *  *   *  ** *  *  *       *    *   

consensus_10530#0      AATGATGGTGATTTATAA-----TTAATAATACAGTAGAACTATAGAATATGAACAATCT 593
consensus_10530#2      AATGATGGTGATTTATAA-----TTAATAATACAGTAGAACTATAGAATATGAACAATCT 102
consensus_10530#1      GGTTTTATTTCACTACAGGCTTGTTCGGGAAACTTATGAACCCCACTATATTCCTGTGAA 367
                         *  *  *    ** *      **    * **    ****   *  ****         

consensus_10530#0      TTATCTCAGTATAAACAAATTATTTTTTTTAATAATATTTAGTAATTTTT-AGTTATATG 652
consensus_10530#2      TTATCTCAGTATAAACAAATTATTTTTTTTAATAATATTTAGTAATTTTT-AGTTATATG 161
consensus_10530#1      ATATAACCGTTCAAATAATTTATTGAACGTGTCAGAAACTAGAAATATTCGAGATAGATT 427
                        ***  * **  *** ** *****     *   *  *  *** *** **  ** ** ** 

consensus_10530#0      TAAAATAAGATTTTGTTTGTATTCTGTATTAAATATAAAATA 694
consensus_10530#2      TAAAATAAGATTTTGTTTGTATTCTGTATTAAATATAAAATA 203
consensus_10530#1      TGAATCACGCCAACGCGGTCATACTCAAATAA-TATGAT--- 465
                       * **  * *     *     ** **  * *** *** *