|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10831#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 793 fasta sequence
[GATCACATCCTCTTTTCTTCTCTACAGGCGAGTTCAAAATGCAGAAACGAACTGAGTACCAGTGACGTACAGATTTTCTCAGTAAGTCATCAATTCTTGGGAGTAGTGTCTACAACTTTAATTGGCTAATTCAAGGGAACACTACGCTAACAGACCACTAGAGAGGATAAATATAGGCCGTCAGTCTTTTCTTCAATACGCAGTTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTG-AAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTCTGTTGTTTTTTTTAATTAATCAAGCATTTCATTGTTTTCCACATTGGAAAGAAAATTGTTAGAATCATTTAATGTTTGCTGCTTTACTTGTATATACATAGATTTTATATATAAAACANATATTAAACCATTTTACGTTGTCTTGTTTTATGCTAATGATCGG]
[+] EMBL CD131997 [GATCACATCCTCTTTTCTTCTCTACAGGCGAGTTCAAAATGCAGAAACGAACTGAGTACCAGTGACGTACAGATTTTCTCAGTAAGTCATCAATTCTTGGGAGTAGTGTCTACAACTTTAATTGGCTAATTCAAGGGAACACTACGCTAACAGACCACTAGAGAGGATAAATATAGGCCGTCAGTCTTTTCTTCAATACGCAGTTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTG AAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGA ]
[+] EMBL CD131398 [ GTTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTCTGTTGTTTTTTTTAATTAATCAAGCATTTCATTGTTTTCCACATTGGAAAGAAAATTGTTAGAATCATTTAATGTTTGCTGCTTTACTTGTATATACATAGATTTTATATATAAAACANATATTAAACCATTTTACGTTGTCTTGTTTTATGCTAATGATCGG]
consensusID : consensus_10831#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 20 consensus length = 519 fasta sequence
[ANGCGGCCGCCNTTTTTTTCAATACGCAGTTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTTGTCTTGTTATATTTCCGAGTGACTTATTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAGAACTGTTC]
[-] EMBL CD185348 [ANGCGGCCGCCTTTTTTTTCAATACGCAGTTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTTGTCTTGTTATATTTCCGAGTGACTTATTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAGAACTGTTC]
[-] EMBL CD185568 [ NTTTTTTTCAATACGCAGTTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGCTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTTGTCTTGTTATATTTCCGAGTGACTTATTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAGAACTGTTC]
[-] EMBL CD131570 [ NTTTTTTTCAATACGCAGTTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTTGTCTTGTTATATTTCCGAGTGACTTATTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAGAACTGTTC]
[-] EMBL CD131708 [ TTTTTTTCAATACGCAGTTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTTGTCTTGTTATATTTCCGAGTGACTTATTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAGAACTGTTC]
[-] EMBL CD131645 [ TTTTTTTCAATACGCAGTTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTTGTCTTGTTATATTTCCGAGTGACTTATTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAGAACTGTTC]
[+] EMBL CD185317 [ GCAGTTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTCACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGAGTTTTTTGTCTTGTTATATTTCCGAGTGACTTATTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAGAACTGTT ]
[+] EMBL CD185265 [ GTTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTTGTCTTGTTATATTTCCGAGTGACTTATTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAAAACTGTT ]
[+] EMBL CD131364 [ GTTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTTGTCTTGTTATATTTCCGAGTGACTTATTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAGAACTGTT ]
[+] EMBL CD131413 [ GTTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTTGTCTTGTTATATTTCCGAGTGACTTATTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAGAACTGTT ]
[+] EMBL CD133851 [ GTTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGTTTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTCGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCACTATTTAGGGGTTTTTTGTCTTGTTATATTTCCGAGTGACTTATTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAAAACTGTT ]
[-] EMBL CD131699 [ TTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTTGTCTTGTTATATTTCCGAGTGACTTATTCTCAGCGTTAAAATCAAAGACCCTAGAACTGTTC]
[-] EMBL CD133732 [ TTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTNTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTTGTCTTGTTATATTCCCGAGTGACTTATTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAGAACTGTTC]
[-] EMBL CD131360 [ TTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTAGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTTGTCTTGTTATATTTCCGAGTGACTTATTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAGAACTGTTC]
[-] EMBL CD131696 [ TTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTTGTCTTGTTATATTTCCGAGTGACTTATTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAGAACTGTTC]
[-] EMBL CD185114 [ TTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATTAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTTGTCTTGTTATATTTCCGAGTGACTTATTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAGAACTGTTC]
[-] EMBL CD131606 [ TTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTTGTCTTGTTATATTTCCGAGTGACTTGTTCTCAGCGTTAAAATCAAGAACCCTAGAACTGTTC]
[-] EMBL CD133768 [ TTCAAAG TTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTTGTCTTGTTATATTCCCGAGTGACTTATTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAGAACTGTTC]
[-] EMBL CD131290 [ TTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTTGTCTTGTTATATTTCCGAGTGACTTATTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAGAACCGTT ]
[+] EMBL CD131430 [ TTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAGAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACGTGACTCAAGGCAATATTTAGGGG TTTTTGTCTTGTTATATTTCCGAGTGACTTATTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAGAACTGTT ]
[-] EMBL CD133731 [ ACCGACAAAACAAGTTTATATTGCCTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACATGATTTACTTAATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATAGAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATAACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTACATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTTGTCTTGTTATATTTCCGAGTGACTTATTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAGAACTGTTC]
consensusID : consensus_10831#2 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 498 fasta sequence
[ATACGCAGTTCAAAGTTTGGAAGCATATGACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACCGCCCCTTTTTTGTGACTCATTTCTTGGTCCTCTACTCAACATCTTTTTTGTGAGGCATTTACACATTTATTCACTTCTATCATCGCAAATATGTGTACTTCTCCGGTACAACAGAACCAGCATACACGTGGAATAATATCAAGTAATTCAAACTCTCAAGATGTTCAGGAAACAGAAGTGTTACGAAGTAATGTATTGCGAACAAAGTTAGCGAATAAACTGGGAAAGTTCAAAAGTAGAAAATTAGTAAGACGTGGGACATTCGGAAGTGATAAAAAAAGTTTGATTTTTATCCATCATAATGATT]
[-] EMBL CD131505 [ATACGCAGTTCAAAGTTTGGAAGCATATGACCGACAAAACAAGTTTATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGAATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCTATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACCGCCCCTTTTTTGTGACTCATTTCTTGGTCCTCTACTCAACATCTTTTTTGTGAGGCATTTACACATTTATTCACTTCTATCATCGCAAATATGTGTACTTCTCCGGTACAACAGAACCAGCATACACGTGGAATAATATCAAGTAATTCAAACTCTCAAGATGTTCAGGAAACAGAAGTGTTACGAAGTAATGTATTGCGAACAAAGTTAGCGAATAAACTGGGAAAGTTCAAAAGTAGAAAATTAGTAAGACGTGGGACATTCGGAAGTGATAAAAAAAGTTTGATTTTTATCCATCATAATGATT]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
consensus_10831#0 GATCACATCCTCTTTTCTTCTCTACAGGCGAGTTCAAAATGCAGAAACGAACTGAGTACC 60
consensus_10831#1 ------------------------------------------------------------
consensus_10831#2 ------------------------------------------------------------
consensus_10831#0 AGTGACGTACAGATTTTCTCAGTAAGTCATCAATTCTTGGGAGTAGTGTCTACAACTTTA 120
consensus_10831#1 ------------------------------------------------------------
consensus_10831#2 ------------------------------------------------------------
consensus_10831#0 ATTGGCTAATTCAAGGGAACACTACGCTAACAGACCACTAGAGAGGATAAATATAGGCCG 180
consensus_10831#1 ------------------------------------------------------ANGCGG 6
consensus_10831#2 ------------------------------------------------------------
consensus_10831#0 TCAGTCTTTTCTTCAATACGCAGTTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTT 240
consensus_10831#1 CCGCCNTTTTTTTCAATACGCAGTTCAAAGTTTGGAAGCATATTACCGACAAAACAAGTT 66
consensus_10831#2 ---------------ATACGCAGTTCAAAGTTTGGAAGCATATGACCGACAAAACAAGTT 45
**************************** ****************
consensus_10831#0 TATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGA 300
consensus_10831#1 TATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGA 126
consensus_10831#2 TATATTGCTTTAAAGAAAATCAGTCTTAAGGCAATGACTTACAGTTAATAAATCTTAGGA 105
************************************************************
consensus_10831#0 ATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCT 360
consensus_10831#1 ATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCT 186
consensus_10831#2 ATGGTCCAAACACTCTGCTTCCACTATAAACCATTAACGAGACTACAGATTATTGTATCT 165
************************************************************
consensus_10831#0 ATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTA 420
consensus_10831#1 ATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACAAAACCCACTGATGTCCCTAAACGTGATTTACTTA 246
consensus_10831#2 ATTTGAGAACTTATGTATCCTTGACCGC-CCCTTTTTTGTGACTCATTTCTTGGTCCTCT 224
************************* *** * *** ** * * **
consensus_10831#0 ATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATA 480
consensus_10831#1 ATACAACGAAAACGAAAAATGGGTGACAATGTCAAGTCACAAACTCATCACAGATTAATA 306
consensus_10831#2 ACTCAAC----ATCTTTTTTGTGAGGCATTTACA---CATTTATTCACTTCTA--TCATC 275
* **** * ** * * ** * ** ** * *** * * **
consensus_10831#0 GAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATA 540
consensus_10831#1 GAAAATACGTAAGAATGTCTACATACATAAGGAACGGAAGGTGGTAACCGAGTAAAAATA 366
consensus_10831#2 GCAAATATGTGTACTTCTCCG-GTACAACAGAACCAGCATACAC--GTGGAATAATATCA 332
* ***** ** * ** **** ** * * * * ** *** * *
consensus_10831#0 ACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAA-TTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTA 599
consensus_10831#1 ACCTACACACAAATATTTTGTTATCTTGAAAATTATATTGAAGAGTACAAAAGTTCTGTA 426
consensus_10831#2 AGTAATTCA-AACTCTCAAGATGTTCAGGAAACAGAAGTGTTACGAAGTAATGTATTGCG 391
* * ** ** * * * * * * ** * ** * * ** ** **
consensus_10831#0 CATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTTCTGTTGTTTTTTTTAATTAATCAAGCATTT 659
consensus_10831#1 CATGACTCAAGGCAATATTTAGGGGTTTTT----TGTCTTGTTATATTT-CCGAGTGACT 481
consensus_10831#2 AACAAAGTTAGCGAATAAACTGGGAAAGTTC---AAAAGTAGAAAATTAGTAAGACGTGG 448
* * ** **** *** ** * ***
consensus_10831#0 CATTGTTTTCCACATTGGAAAGAAAATTGTTAGAATCATTTAATGTTTGCTGCTTTACTT 719
consensus_10831#1 TA---TTCTCAGCGTTAAAATCAAAAACCCTAGAACTGTTC------------------- 519
consensus_10831#2 GA---CATTCGGAAGTGATAAAAAAAGTTTGATTTTTATCCATCATAATGATT------- 498
* ** * * **** * *
consensus_10831#0 GTATATACATAGATTTTATATATAAAACANATATTAAACCATTTTACGTTGTCTTGTTTT 779
consensus_10831#1 ------------------------------------------------------------
consensus_10831#2 ------------------------------------------------------------
consensus_10831#0 ATGCTAATGATCGG 793
consensus_10831#1 --------------
consensus_10831#2 --------------
|
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||