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consensusID : consensus_11375#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 51 consensus length = 1893 fasta sequence
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[TGTTCAAGAGATACATTACGCACGTCCAACCAGCTCCTACTCTGACCTTTGGGTACTAAATTTGCATTTAATGGTTTGCAATTTTAACATCAATTATGTGACGAAAGACTAGAAGAAATCGATCTGGCAATAAAAAAAAGACTTGCATATAGATAGTTTTCTTACTAAACTAAAGTTGCTTAGAAGGTTTATTGGAAAAAATCAACACTATTTCAAGTGAAAAGTAATTAATTTGAGTCTCAAAGTGAACATCGACTCATTAGGATACTAGTAAATTCAGCTGATAATCTACCAATAGATCAAAACTTGAGGTCCGCATTTTACTACTACCAACAATTTATCTATTCTATAAAAGTGGTATACATATGAAATCAAACAATTTTTTTCTTAGATAGTTGACCTAAAAAGCTTCAAGTACCACAAATTATGACAATATTAAATTCATTTAGTATTGTTTGTTTGAATTTAAACTTCACCCCATCGCACAAGCAAGTGGCTATCAGGAATCAGTAGCTGAGTGGATAACACGATAGCATTTGGAGCAAAAGGTTCTGGGTTCGCATCGCAGAGTGAACATCAATTGTAGGACTCACGTGCATCCAACTGATGGGTCCCATATGGGATGAAATGGGCGTCTTGGATTCCACTGCAAATCATCATCCATCCCTACTTATAATGAGACTGACTTTTTGTCGTTTTTAGATGATAGGCAACCGGTTCGCACAAAATATGACTAGCTCCTAACTTGTAACATTTGGGTCACAATTTCAAACCCTAATGCACTCACTTCAGTTTTGACGACTAAATTACTTCAGTAGTTACAAACTGGAAAGGTTTTCGACTAAGAGTTCGTTAATGCTCTCGATTATCAAATTACATGAAATAAAAAGTTATAAGACTAGTCTTTAGTTGTGCATCACGTATTGGAGCTATTCATCTATCCAAGCTCATAAGTTGATAACAAAGTCTTTAAACTTCAGACT]
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[CGGTACTGGCCAGCAAACCTGATGGTTGGGAGATAACTTTAATCCACCCGTGTCTGTAGGGCAGAACATGTTAAATTACGGCTCCTTATGTCAAGTAGGTTGTCAC-GAACCAACGGCATGGATGCGAACTTATGCAAAATACCTCTTTAAATCGTGTTTAGAACGCTGAATTGGTTCCACTTCCTACGGAGTAATCCCATTACAAGCAAACTAGACAATTCGCTAAAGACAAAGCCCACTCCATACCCTATAAAATCTAAAAACAAAAAGAGGGTTCAAATAGCTTCGAAAAAAGGGAGACAACCATTTGTATCAGAATACTGTTTTTAGCACTTTATTTTATAAATACACATAATTCCATACTTTTTTCTGAACTACCTTCATTTATACAGTTCCTTATCCACTCATACCTTGTTCACACTTATTTTCCTTTAACACATTAGTATGCTCTTGCTTAATATGTACTTCAGTAACAGATAAATAGACTAAATGGTTATACCCTGACTATCCCTCCATGAATATTGTGTGCTCTGCTTTTCGTCCTTCCA]
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[AACTAATCTCTTTCATTCGTCGATCAACTTTTCTTAAATTTTTTTGTGTTTCACCATGTCTACGTTGTTCTGCTTCCAATTCTGTTTCTAATTCACGTACACGTTGTTCTAATTTACCCATTGCTTTACGACCATTTTTCATGGCACCTGATTCACTGTCTTCTAAACGAGCCATAAGTTCTTTTACTTGTATTTCAAGTTGTTTTCTAGCTTTTTCAACATGTTGTGTATGTTCTTGTTCTTGACGAATTTCTTCAAATACACGTGCGCTATCAAATGTACAAACAATCAGTTCATTCAGGGATAGAGGTGCTCATACATATCATTGTTTCACTTTTAATACGTTCTGGAATGATATGTCGATTCTCAATTCGTGATCCAATAACTCAGATATAA]
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[GTGGGTTCTGGGTAGTGGTGTCGGCTGGTATACTGCCTAATGAAGCGTTTAGTGAATGTTTAATAAAGGGCATCTGACAAAGGCTGGTTAATAAGCCTAGTGCTTCAGTGATGCCAAAATGGACGTAGCAATCACTGGCGGTGTGCATCGCATCCCGTTAAAATTGCTC]
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consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
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* * *
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* * * * * *
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* * *
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consensus_11375#3 ------------------------------------------------------------
consensus_11375#1 CAACTGATGGGTCCCATATGGGATGAAATGGGCGTCTTGGATTCCACTGCAAATCATCAT 660
consensus_11375#2 CCTTCCA----------------------------------------------------- 548
consensus_11375#0 GTACACTTGTTTTTCATAGAAATTGATTTGATTGATCAGGGATCGTTCGTCTGAGTTCAA 1008
consensus_11375#4 ------------------------------------------------------------
consensus_11375#3 ------------------------------------------------------------
consensus_11375#1 CCATCCCTACTTATAATGAGACTGACTTTTTGTCGTTTTTAGATGATAGGCAACCGGTTC 720
consensus_11375#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11375#0 CCAGGTTGTGGGATTTACTTACCCTAGATTGTGCAGAGTGTGATTCGATAATGTTGCTTG 1068
consensus_11375#4 ------------------------------------------------------------
consensus_11375#3 ------------------------------------------------------------
consensus_11375#1 GCACAAAATATGACTAGCTCCTAACTTGTAACATTTGGGTCACAATTTCAAACCCTAATG 780
consensus_11375#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11375#0 TATGTAAGTAGCAGTTGTCACAACGACATGAGAAGTGGGATATGACTGACTGCTCTAATG 1128
consensus_11375#4 ------------------------------------------------------------
consensus_11375#3 ------------------------------------------------------------
consensus_11375#1 CACTCACTTCAGTTTTGACGACTAAATTACTTCAGTAGTTACAAACTGGAAAGGTTTTCG 840
consensus_11375#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11375#0 TTGAGTGTATTGCGCCTGAATTGTAATGAAGTGTCTGTGGTGTTATACGTGATGTGATTG 1188
consensus_11375#4 ------------------------------------------------------------
consensus_11375#3 ------------------------------------------------------------
consensus_11375#1 ACTAAGAGTTCGTTAATGCTCTCGATTATCAAATTACATGAAATAAAAAGTTATAAGACT 900
consensus_11375#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11375#0 AGCGTTTGCCTGTCAAATGTTTCTGAACAAACTAGTGTTTGATAGCCATGAGGGACGTGG 1248
consensus_11375#4 ------------------------------------------------------------
consensus_11375#3 ------------------------------------------------------------
consensus_11375#1 AGTCTTTAGTTGTGCATCACGTATTGGAGCTATTCATCTATCCAAGCTCATAAGTTGATA 960
consensus_11375#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11375#0 ACGATGCCTAATATCGTTTAGTTTAGTATTGAGTGGTTCTGTCTAACTCGGTGTAGCTAC 1308
consensus_11375#4 ------------------------------------------------------------
consensus_11375#3 ------------------------------------------------------------
consensus_11375#1 ACAAAGTCTTTAAACTTCAGACT------------------------------------- 983
consensus_11375#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11375#0 TGAATGGGGATGTGTTCATGTCGGTTGTAGTTGGTTGTCGTCACTAGTGTAGTCACCAAT 1368
consensus_11375#4 ------------------------------------------------------------
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consensus_11375#1 ------------------------------------------------------------
consensus_11375#2 ------------------------------------------------------------
consensus_11375#0 AGTGTTATGTGAATAATGGATGTCAGACGGTTTGTGTATATGAACCAAAGTGTTGTTAGA 1428
consensus_11375#4 ------------------------------------------------------------
consensus_11375#3 ------------------------------------------------------------
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consensus_11375#0 TTAATGAAGGCAGGTATGTATGTGTTGAACATTTTGTCTTGGATTGTGCTGCTAGAGGAG 1488
consensus_11375#4 ------------------------------------------------------------
consensus_11375#3 ------------------------------------------------------------
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consensus_11375#0 TGTTAGATTTTCGCAAGAATTTGCATTATGCGTTCATATGTTTCACGTTAATCAGGAATT 1548
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consensus_11375#0 GTTTTGTTGGTGTATAAGTCGGCGGATTCGACACACGAGATCATGAGTAGATGGAGAGAG 1608
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consensus_11375#0 TGGAGAAAAGTATGTGTTTGTTCTACCGACTAATAGTTTGAGTGATGGTGTCGACCGCTT 1668
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consensus_11375#0 GTAAGCGTCGTGCAGTTTTCACTCGGGATCAATGTAGTAGAATGGTGTTAGTTGGTTGTC 1728
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| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||