cluster # 1220

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Schistosoma mansoni
cluster # 1220 cluster # 1220 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1220#0 length = 868 sequences # 2

consensusID : consensus_1220#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 868
fasta sequence

                              [CTCGAGGCCAAAAATTCGGCACGAGGTTCAAATCCCGGAAATAATGCTGTTATTCGTTTTAGTTATAATAATGACTTCGACAGTTGTATGCCAAGCATCGGACCAGAACTGCGTTGCTATCAATGCAACTCACTAACACAACCTCATTGTGCAGACTATTTTGATAATCGAACTTTTCCACTCGTCGCCTGTCCAAATGATGGAAGAAATTATTCTAGATGTGTCAAAATGATTCAAGAAATGTATCTAGATGGAAAATGGACTAGACGTTATTATAGAGATTGTGCTGTAACCGGTGTAATTGGTGCAGAAGATGGTCGTTGGTGTATAGATCGTTTGGGTACTTATCGTGTTAAAGTTCGATATTGTAATTGTAACAATAAAAATGGATGTAATTCAAGTACATTACTAACTGTTTCAACAACAACACACTATACTTTTATATTTACTGTATCTATATTTTACATTTATCGAATTCTTAAAGTATAGGCATTTAGATACAAGAAAATGTTTCAATTTCTTCTATTTTTTATTTATATGTTTATGCAATTGAAACGAATAACCTTTTTAAAAATAAAATAATAACTAGGTAATATTGAAATATGAATACAAACTTTCATCTCCATGGTGTCTATCAAGAACAAAANAAGATATCGATCATTGGAGAGAAACGAACTAGGAGGGTCAGTTACCTCATTATCATTCATTGATTCATTTTTATGCATGGTTACATCATATATATATATATATATATACATATATGGCTTGTTTTTCATTCTTGTATAAAACATATATTTTCTTTATTTTAAATTCACCTCCTTACTTACTGTTAATAGTGAAAAAGTGTATGTAAACAACGAATAATAAT]

[+] EMBL CD082650             [CTCGAGGCCAAAAATTCGGCACGAGGTTCAAATCCCGGAAATAATGCTGTTATTCGTTTTAGTTATAATAATGACTTCGACAGTTGTATGCCAAGCATCGGACCAGAACTGCGTTGCTATCAATGCAACTCACTAACACAACCTCATTGTGCAGACTATTTTGATAATCGAACTTTTCCACTCGTCGCCTGTCCAAATGATGGAAGAAATTATTCTAGATGTGTCAAAATGATTCAAGAAATGTATCTAGATGGAAAATGGACTAGACGTTATTATAGAGATTGTGCTGTAACCGGTGTAATTGGTGCAGAAGATGGTCGTTGGTGTATAGATCGTTTGGGTACTTATCGTGTTAAAGTTCGATATTGTAATTGTAACAATAAAAATGGATGTAATTCAAGTACATTACTAACTGTTTCAACAACAACACACTATACTTTTATATTTACTGTATCTATATTTTACATTTATCGAATTCTTAAAGTATAGGCATTTAGATACAAGAAAATGTTTCAATTTCTTCTATTTTTTATTTATATGTTTATGCAATTGAAACGAATAACCTTTTTAAAAATAAAATAATAACTAGGTAATATTGAAATATGAATACAAACTTTCATCTCCATGGTGTCTATCAAGAACAAAANAAGATATCGATCATTGGAGAGAAACG                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD076246             [                                                                                                                                                                                                                                                                               ATTATAGAGATTGTGCTGTAACCGGTGTAATTGGTGCAGAAGATGGTCGTTGGTGTATAGATCGTTTGGGTACTTATCGTGTTAAAGTTCGATATTGTAATTGTAACAATAAAAATGGATGTAATTCAAGTACATTACTAACTGTTTCAACAACAACACACTATACTTTTATATTTACTGTATCTATATTTTACATTTATCGAATTCTTAAAGTATAGGCATTTAGATACAAGAAAATGTTTCAATTTCTTCTATTTTTTATTTATATGTTTATGCAATTGAAACGAATAACCTTTTTAAAAATAAAATAATAACTAGGTAATATTGAAATATGAATACAAACTTTCATCTCCATGGTGTCTATCAAGAACAAAAAAAGATATCGATCATTGGAGAGAAACGAACTAGGAGGGTCAGTTACCTCATTATCATTCATTGATTCATTTTTATGCATGGTTACATCATATATATATATATATATATACATATATGGCTTGTTTTTCATTCTTGTATAAAACATATATTTTCTTTATTTTAAATTCACCTCCTTACTTACTGTTAATAGTGAAAAAGTGTATGTAAACAACGAATAATAAT]




>consensus_1220#0
CTCGAGGCCAAAAATTCGGCACGAGGTTCAAATCCCGGAAATAATGCTGTTATTCGTTTT
AGTTATAATAATGACTTCGACAGTTGTATGCCAAGCATCGGACCAGAACTGCGTTGCTAT
CAATGCAACTCACTAACACAACCTCATTGTGCAGACTATTTTGATAATCGAACTTTTCCA
CTCGTCGCCTGTCCAAATGATGGAAGAAATTATTCTAGATGTGTCAAAATGATTCAAGAA
ATGTATCTAGATGGAAAATGGACTAGACGTTATTATAGAGATTGTGCTGTAACCGGTGTA
ATTGGTGCAGAAGATGGTCGTTGGTGTATAGATCGTTTGGGTACTTATCGTGTTAAAGTT
CGATATTGTAATTGTAACAATAAAAATGGATGTAATTCAAGTACATTACTAACTGTTTCA
ACAACAACACACTATACTTTTATATTTACTGTATCTATATTTTACATTTATCGAATTCTT
AAAGTATAGGCATTTAGATACAAGAAAATGTTTCAATTTCTTCTATTTTTTATTTATATG
TTTATGCAATTGAAACGAATAACCTTTTTAAAAATAAAATAATAACTAGGTAATATTGAA
ATATGAATACAAACTTTCATCTCCATGGTGTCTATCAAGAACAAAANAAGATATCGATCA
TTGGAGAGAAACGAACTAGGAGGGTCAGTTACCTCATTATCATTCATTGATTCATTTTTA
TGCATGGTTACATCATATATATATATATATATATACATATATGGCTTGTTTTTCATTCTT
GTATAAAACATATATTTTCTTTATTTTAAATTCACCTCCTTACTTACTGTTAATAGTGAA
AAAGTGTATGTAAACAACGAATAATAAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case