cluster # 1488

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Schistosoma mansoni
cluster # 1488 cluster # 1488 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1488#0 length = 554 sequences # 2

consensusID : consensus_1488#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 554
fasta sequence

                              [AAATTATAATATTGTTTCTTCTATTCAAAGATAAAGTCTTATCACAGTTAAACATTTTTACAAAATTTCATTTAAACAAAAAAAACCAAATGGCAAATTGAAAAGAATAAAGGATGGATGATAAATGATAGAGTAGTTTGTTTTGTTTTTTCTTGTTATTTATACTTTTGAAGTTGATTTAGACGAGTTAAAAAATCCACAATAAACTATACAACTACGTAATAATAAATAGAGAAATATACAAATAGAACATAAGAGTAAAATACTAACAAGTAAATAATCTGAATTTATTAAGTCTAGTTTATCTTTAAAATGTGTTGAATAACTTAAACTAAATGGGATGCCAGATGGTAAATACGTTGATCCTTTAACATGTATTAAACGATTTGTAAATGCGTTGAATATATCTTGATTTGAATTTCCGTCTTGATTATTATCATCTTCTATCAGCTTTGGAAGTGAAGTGTATGATCTGACCAAAAAAACTTTCCATATAATAGGCATTGAGGCCGACAAATATCCTTCTACATACCCTGTGGGGACGAAAAATGCTC]

[+] EMBL CD077120             [AAATTATAATATTGTTTCTTCTATTCAAAGATAAAGTCTTATCACAGTTAAACATTTTTACAAAATTTCATTTAAACAAAAAAAACCAAATGGCAAATTGAAAAGAATAAAGGATGGATGATAAATGATAGAGTAGTTTGTTTTGTTTTTTCTTGTTATTTATACTTTTGAAGTTGATTTAGACGAGTTAAAAAATCCACAATAAACTATACAACTACGTAATAATAAATAGAGAAATATACAAATAGAACATAAGAGTAAAATACTAACAAGTAAATAATCTGAATTTATTAAGTCTAGTTTATCTTTAAAATGTGTTGAATAACTTAAACTAAATGGGATGCCAGATGGTAAATACGTTGATCCTTTAACATGTATTAAACGATTTGTAAATGCGT                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD169443             [                                                                                                                                TAGAGTAGTTTGTTTTGTTTTTTCTTGTTATTTATACTTTTGAAGTTGATTTAGACGAGTTAAAAAATCCACAATAAACTATACAACTACGTAATAATAAATAGAGAAATATACAAATAGAACATAAGAGTAAAATACTAACAAGTAAATAATCTGAATTTATTAAGTCTAGTTTATCTTTAAAATGTGTTGAATAACTTAAACTAAATGGGATGCCAGATGGTAAATACGTTGATCCTTTAACATGTATTAAACGATTTGTAAATGCGTTGAATATATCTTGATTTGAATTTCCGTCTTGATTATTATCATCTTCTATCAGCTTTGGAAGTGAAGTGTATGATCTGACCAAAAAAACTTTCCATATAATAGGCATTGAGGCCGACAAATATCCTTCTACATACCCTGTGGGGACGAAAAATGCTC]




>consensus_1488#0
AAATTATAATATTGTTTCTTCTATTCAAAGATAAAGTCTTATCACAGTTAAACATTTTTA
CAAAATTTCATTTAAACAAAAAAAACCAAATGGCAAATTGAAAAGAATAAAGGATGGATG
ATAAATGATAGAGTAGTTTGTTTTGTTTTTTCTTGTTATTTATACTTTTGAAGTTGATTT
AGACGAGTTAAAAAATCCACAATAAACTATACAACTACGTAATAATAAATAGAGAAATAT
ACAAATAGAACATAAGAGTAAAATACTAACAAGTAAATAATCTGAATTTATTAAGTCTAG
TTTATCTTTAAAATGTGTTGAATAACTTAAACTAAATGGGATGCCAGATGGTAAATACGT
TGATCCTTTAACATGTATTAAACGATTTGTAAATGCGTTGAATATATCTTGATTTGAATT
TCCGTCTTGATTATTATCATCTTCTATCAGCTTTGGAAGTGAAGTGTATGATCTGACCAA
AAAAACTTTCCATATAATAGGCATTGAGGCCGACAAATATCCTTCTACATACCCTGTGGG
GACGAAAAATGCTC

clustalw multiple alignements is not computed in this case