cluster # 1702

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Schistosoma mansoni
cluster # 1702 cluster # 1702 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1702#0 length = 496 sequences # 2

consensusID : consensus_1702#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 496
fasta sequence

                              [ACACGTAGACCCAAAACTTTTTATCTGCAGAGTCATATTCTCCTTTGTTTGGGAATCAAACGTGGGATTTTCTATTAAGCAGTTGACAAACAACCACATATGATTCTTTATTTGAAAAGGTTTGATCTGGACACCAGATTTTCCGGACTTTTTTTAACGATATCCATTAACTTGTTTACGATTTGATCACTCACATAATTAATATGTGTTCCGCCTTTGGTAGTTGCAATGCTGTTAACAAAACTGACTTGCTGAAATCCGGTGTTGCTAACTGCTACTGCTACCTGCCAACGCTGGTTGACCGCTTCATATACAACCTTAACACTGTCTGCGTCGTCTTTGTTGGGTTTGATAAAAAGGTTCACGTAGTCTACAAAATTCTTAATGGGTAATCTTTTGCCATTAAGGAAAACTTTAATTCCATTACAAGTTGCAGCCATGTCATATGCCCGACGAGTAAAAAGAGATACCGTATCTTGTTCTAGCTCGTTCATAC]

[+] EMBL CD168452             [ACACGTAGACCCAAAACTTTTTATCTGCAGAGTCATATTCTCCTTTGTTTGGGAATCAAACGTGGGATTTTCTATTAAGCAGTTGACAAACAACCACATATGATTCTTTATTTGAAAAGGTTTGATCTGGACACCAGATTTTCCGGACTTTTTTTAACGATATCCATTAACTTGTTTACGATTTGATCACTCACATAATTAATATGTGTTCCGCCTTTGGTAGTTGCAATGCTGTTAACAAAACTGACTTGCTGAAATCCGGTGTTGCTAACTGCTACTGCTACCTGCCAACGCTGGTTGACCGCTTCATATACAACCTTAACACTGTCTGCGTCGTCTTTGTTGGGTTTGATAAAAAGGTTCACGTAGTCTACAAAATTCTTAATGGGTAATCTTTTGCCATTAAGGAAAACTTTAATTCCATTACAAGTTGCAGCCATGTCATATGCCCG                                            ]
[-] EMBL CD163879             [                                                                                                                                                                                                                                                                  CCGGTGTTGCTAACTGCTACTGCTACCTGCCAACGCTGGTTGACCGCTTCATATACAACCTTAACACTGTCTGCGTCGTCTTTGTTGGGTTTGATAAAAAGGTTCACGTAGTCTACAAAATTCTTAATGGGTAATCTTTTGCCATTAAGGAAAACTTTAATTCCATTACAAGTTGCAGCCATGTCATATGCCCGACGAGTAAAAAGAGATACCGTATCTTGTTCTAGCTCGTTCATAC]




>consensus_1702#0
ACACGTAGACCCAAAACTTTTTATCTGCAGAGTCATATTCTCCTTTGTTTGGGAATCAAA
CGTGGGATTTTCTATTAAGCAGTTGACAAACAACCACATATGATTCTTTATTTGAAAAGG
TTTGATCTGGACACCAGATTTTCCGGACTTTTTTTAACGATATCCATTAACTTGTTTACG
ATTTGATCACTCACATAATTAATATGTGTTCCGCCTTTGGTAGTTGCAATGCTGTTAACA
AAACTGACTTGCTGAAATCCGGTGTTGCTAACTGCTACTGCTACCTGCCAACGCTGGTTG
ACCGCTTCATATACAACCTTAACACTGTCTGCGTCGTCTTTGTTGGGTTTGATAAAAAGG
TTCACGTAGTCTACAAAATTCTTAATGGGTAATCTTTTGCCATTAAGGAAAACTTTAATT
CCATTACAAGTTGCAGCCATGTCATATGCCCGACGAGTAAAAAGAGATACCGTATCTTGT
TCTAGCTCGTTCATAC

clustalw multiple alignements is not computed in this case