cluster # 3558

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Schistosoma mansoni
cluster # 3558 cluster # 3558 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_3558#0 length = 801 sequences # 2

consensusID : consensus_3558#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 801
fasta sequence

                              [ACAAATAAGTTCATTTGATGGGATAAACGGTTCGACTTATGATGATTGAGACAAGAGGTTTTAACAAATATTTTGTTAAGTGATAGAAGGGTAAACGTTTCTTTGCTCCTTTAACGACATTTAAATACTAAACTAAAAACCATCCCATTTTTAATCAGTATAAGTGTATTTCAAGTCATTGTCCTACTGACTGATGTGATTATCGTGAACCAATCTTTGAAGTCAATATTTTGTATCAATTCTTACTATTTGCATACTTATTTTCTCATTTATTGCAACCTTTTTCAGAGGATAAAATCGGAATCTATCTTTTTTTAAAATGTCGTTGTACATCCGTGTACTTCCGGCGTTCTCTTTGGAATCTGAATAGTTGATACTATAAATTCCAGCAATAACTCTGAGTCCTGAAAGTGGGGAGATATTCGACATTATGGGGCTCACTGTTCAATATATCTCTCGCAGGCCAAAACTTTTGATCACGTTTCATAATTTAACCAATTAAGATTGGATTATTTTCACACTTTATGGTATCACTGAGAAATTTTCGCTCATCACGAAAACCGGGATTTGAGGTTAGGGTTAATGTATCGCTAACTCTCTTTGGGATTTGTAGCAATAGAGTATTTTAGAAGATGAATGTCATGAAATACCTAAATTTTCTAGTACGTAACATATGAAATTCGATTATGTTNTAGATAATGATCGACAGTGAAATCCAAGACTCATTTAGGTTCTATTTGAAACTCACCGGGGTTGATTTTAATTCATTCTACAGGTAATGTTCACATTAAGATTTAATCT]

[-] EMBL CD196883             [ACAAATAAGTTCATTTGATGGGATAAACGGTTCGACTTATGATGATTGAGACAAGAGGTTTTAACAAATATTTTGTTAAGTGATAGAAGGGTAAACGTTTCTTTGCTCCTTTAACGACATTTAAATACTAAACTAAAAACCATCCCATTTTTAATCAGTATAAGTGTATTTCAAGTCATTGTCCTACTGACTGATGTGATTATCGTGAACCAATCTTTGAAGTCAATATTTTGTATCAATTCTTACTATTTGCATACTTATTTTCTCATTTATTGCAACCTTTTTCAGAGGATAAAATCGGAATCTATCTTTTTTTAAAATGTCGTTGTACATCCGTGTACTTCCGGCGTTCTCTTTGGAATCTGAATAGTTGATACTATAAATTCCAGCAATAACTCTGAGTCCTGAAAGTGGGGAGATATTCGACATTATGGGGCTCACTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD122338             [                                                                                                                                                                    TGTATTTCAAGTCATTGTCCTACTGACTGATGTGATTATCGTGAACCAATCTTTGAAGTCAATATTTTGTATCAATTCTTACTATTTGCATACTTATTTTCTCATTTATTGCAACCTTTTTCAGAGGATAAAATCGGAGTCTATCTTTTTTTAAAATGTCGTTGTACATCCGTGTACTTCCGGCGTTCTCTTTGGAATCTGAATAGTTGATACTATAAATTCCAGCAATAACTCTGAGTCCTGAAAGTGGGGAGATATTCGACATTATGGGGCTCACTGTTCAATATATCTCTCGCAGGCCAAAACTTTTGATCACGTTTCATAATTTAACCAATTAAGATTGGATTATTTTCACACTTTATGGTATCACTGAGAAATTTTCGCTCATCACGAAAACCGGGATTTGAGGTTAGGGTTAATGTATCGCTAACTCTCTTTGGGATTTGTAGCAATAGAGTATTTTAGAAGATGAATGTCATGAAATACCTAAATTTTCTAGTACGTAACATATGAAATTCGATTATGTTNTAGATAATGATCGACAGTGAAATCCAAGACTCATTTAGGTTCTATTTGAAACTCACCGGGGTTGATTTTAATTCATTCTACAGGTAATGTTCACATTAAGATTTAATCT]




>consensus_3558#0
ACAAATAAGTTCATTTGATGGGATAAACGGTTCGACTTATGATGATTGAGACAAGAGGTT
TTAACAAATATTTTGTTAAGTGATAGAAGGGTAAACGTTTCTTTGCTCCTTTAACGACAT
TTAAATACTAAACTAAAAACCATCCCATTTTTAATCAGTATAAGTGTATTTCAAGTCATT
GTCCTACTGACTGATGTGATTATCGTGAACCAATCTTTGAAGTCAATATTTTGTATCAAT
TCTTACTATTTGCATACTTATTTTCTCATTTATTGCAACCTTTTTCAGAGGATAAAATCG
GAATCTATCTTTTTTTAAAATGTCGTTGTACATCCGTGTACTTCCGGCGTTCTCTTTGGA
ATCTGAATAGTTGATACTATAAATTCCAGCAATAACTCTGAGTCCTGAAAGTGGGGAGAT
ATTCGACATTATGGGGCTCACTGTTCAATATATCTCTCGCAGGCCAAAACTTTTGATCAC
GTTTCATAATTTAACCAATTAAGATTGGATTATTTTCACACTTTATGGTATCACTGAGAA
ATTTTCGCTCATCACGAAAACCGGGATTTGAGGTTAGGGTTAATGTATCGCTAACTCTCT
TTGGGATTTGTAGCAATAGAGTATTTTAGAAGATGAATGTCATGAAATACCTAAATTTTC
TAGTACGTAACATATGAAATTCGATTATGTTNTAGATAATGATCGACAGTGAAATCCAAG
ACTCATTTAGGTTCTATTTGAAACTCACCGGGGTTGATTTTAATTCATTCTACAGGTAAT
GTTCACATTAAGATTTAATCT

clustalw multiple alignements is not computed in this case